MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 52654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	CTT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
2	NC_008510	ACA	2	6	45	50	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329800
3	NC_008510	TTC	2	6	206	211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
4	NC_008510	TCCGAC	2	12	281	292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116329800
5	NC_008510	CGA	2	6	516	521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329800
6	NC_008510	TCA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329800
7	NC_008510	TTGTC	2	10	563	572	0 %	60 %	20 %	20 %	116329800
8	NC_008510	GAA	2	6	576	581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329800
9	NC_008510	TCG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116329800
10	NC_008510	ACA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329800
11	NC_008510	TTC	2	6	701	706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
12	NC_008510	GAA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329800
13	NC_008510	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
14	NC_008510	TCT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
15	NC_008510	GA	3	6	907	912	50 %	0 %	50 %	0 %	116329800
16	NC_008510	CTT	2	6	933	938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
17	NC_008510	ACC	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116329800
18	NC_008510	TCGA	2	8	1049	1056	25 %	25 %	25 %	25 %	116329800
19	NC_008510	TCT	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
20	NC_008510	TTC	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329800
21	NC_008510	GA	3	6	1402	1407	50 %	0 %	50 %	0 %	116329800
22	NC_008510	T	8	8	1582	1589	0 %	100 %	0 %	0 %	116329800
23	NC_008510	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329800
24	NC_008510	CCG	2	6	1685	1690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116329800
25	NC_008510	CCTC	2	8	1701	1708	0 %	25 %	0 %	75 %	116329800
26	NC_008510	GCC	2	6	1729	1734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116329800
27	NC_008510	CTC	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116329800
28	NC_008510	CTA	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329800
29	NC_008510	A	7	7	1879	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	116329800
30	NC_008510	ATC	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329800
31	NC_008510	ACC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116329801
32	NC_008510	GGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116329801
33	NC_008510	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329801
34	NC_008510	ATA	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116329801
35	NC_008510	ACTCG	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	116329801
36	NC_008510	ACAAA	2	10	2272	2281	80 %	0 %	0 %	20 %	116329801
37	NC_008510	AGA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329801
38	NC_008510	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	116329801
39	NC_008510	TTGAT	2	10	2305	2314	20 %	60 %	20 %	0 %	116329801
40	NC_008510	ACG	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329801
41	NC_008510	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329801
42	NC_008510	GAT	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329801
43	NC_008510	CGG	2	6	2531	2536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329801
44	NC_008510	TGA	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329801
45	NC_008510	TTC	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329801
46	NC_008510	AAG	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329801
47	NC_008510	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329801
48	NC_008510	TTTTC	2	10	2803	2812	0 %	80 %	0 %	20 %	116329801
49	NC_008510	A	6	6	2891	2896	100 %	0 %	0 %	0 %	116329801
50	NC_008510	TTC	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329801
51	NC_008510	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329801
52	NC_008510	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329802
53	NC_008510	T	6	6	3035	3040	0 %	100 %	0 %	0 %	116329802
54	NC_008510	TCC	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116329802
55	NC_008510	TCT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329802
56	NC_008510	CGGA	2	8	3097	3104	25 %	0 %	50 %	25 %	116329802
57	NC_008510	TTA	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329802
58	NC_008510	TAT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329802
59	NC_008510	AGA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329802
60	NC_008510	GTTG	2	8	3295	3302	0 %	50 %	50 %	0 %	116329802
61	NC_008510	TTCG	2	8	3304	3311	0 %	50 %	25 %	25 %	116329802
62	NC_008510	TTA	2	6	3399	3404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329802
63	NC_008510	GAA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329802
64	NC_008510	CAT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329802
65	NC_008510	AC	3	6	3463	3468	50 %	0 %	0 %	50 %	116329802
66	NC_008510	TTCCA	2	10	3502	3511	20 %	40 %	0 %	40 %	116329802
67	NC_008510	A	7	7	3534	3540	100 %	0 %	0 %	0 %	116329802
68	NC_008510	AGG	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116329802
69	NC_008510	AAG	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329802
70	NC_008510	A	6	6	3634	3639	100 %	0 %	0 %	0 %	116329802
71	NC_008510	AAACT	2	10	3655	3664	60 %	20 %	0 %	20 %	116329802
72	NC_008510	TCT	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329802
73	NC_008510	TCT	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329802
74	NC_008510	GAAA	2	8	3722	3729	75 %	0 %	25 %	0 %	116329802
75	NC_008510	TC	3	6	3809	3814	0 %	50 %	0 %	50 %	116329802
76	NC_008510	GGA	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116329803
77	NC_008510	A	7	7	4293	4299	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
78	NC_008510	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329803
79	NC_008510	GAAA	2	8	4407	4414	75 %	0 %	25 %	0 %	116329803
80	NC_008510	GCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329803
81	NC_008510	AAAT	2	8	4645	4652	75 %	25 %	0 %	0 %	116329803
82	NC_008510	AC	3	6	4689	4694	50 %	0 %	0 %	50 %	116329803
83	NC_008510	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329803
84	NC_008510	A	6	6	4725	4730	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
85	NC_008510	TCT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329803
86	NC_008510	ATGA	2	8	4773	4780	50 %	25 %	25 %	0 %	116329803
87	NC_008510	TCT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329803
88	NC_008510	GAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329803
89	NC_008510	CTT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329803
90	NC_008510	A	6	6	4891	4896	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
91	NC_008510	T	6	6	4908	4913	0 %	100 %	0 %	0 %	116329803
92	NC_008510	TTTTC	2	10	4925	4934	0 %	80 %	0 %	20 %	116329803
93	NC_008510	GAAA	2	8	4935	4942	75 %	0 %	25 %	0 %	116329803
94	NC_008510	CAA	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329803
95	NC_008510	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329803
96	NC_008510	ATTT	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	116329803
97	NC_008510	A	6	6	5196	5201	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
98	NC_008510	CTT	2	6	5211	5216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329803
99	NC_008510	T	7	7	5215	5221	0 %	100 %	0 %	0 %	116329803
100	NC_008510	A	6	6	5249	5254	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
101	NC_008510	A	8	8	5268	5275	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
102	NC_008510	ATT	2	6	5298	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329803
103	NC_008510	A	7	7	5360	5366	100 %	0 %	0 %	0 %	116329803
104	NC_008510	ACA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329803
105	NC_008510	GAA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329803
106	NC_008510	CTT	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329803
107	NC_008510	T	6	6	6705	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	116329804
108	NC_008510	TAT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329804
109	NC_008510	GAA	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329804
110	NC_008510	TTTC	2	8	6805	6812	0 %	75 %	0 %	25 %	116329804
111	NC_008510	AAC	2	6	6893	6898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329804
112	NC_008510	T	7	7	6906	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	116329804
113	NC_008510	AGA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329804
114	NC_008510	GAA	2	6	7039	7044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329804
115	NC_008510	ACGG	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	116329804
116	NC_008510	CTTC	2	8	7249	7256	0 %	50 %	0 %	50 %	116329804
117	NC_008510	GAT	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329804
118	NC_008510	GAA	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329804
119	NC_008510	GCG	2	6	7516	7521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329804
120	NC_008510	GAA	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329804
121	NC_008510	GAAAT	2	10	7634	7643	60 %	20 %	20 %	0 %	116329804
122	NC_008510	CGA	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329804
123	NC_008510	TCCG	2	8	7752	7759	0 %	25 %	25 %	50 %	116329804
124	NC_008510	GAA	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329805
125	NC_008510	T	8	8	7876	7883	0 %	100 %	0 %	0 %	116329805
126	NC_008510	GGAA	2	8	7898	7905	50 %	0 %	50 %	0 %	116329805
127	NC_008510	TCT	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329805
128	NC_008510	ATT	2	6	7999	8004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329805
129	NC_008510	TCAA	2	8	8095	8102	50 %	25 %	0 %	25 %	116329805
130	NC_008510	A	8	8	8111	8118	100 %	0 %	0 %	0 %	116329805
131	NC_008510	TCA	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329805
132	NC_008510	TTA	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329805
133	NC_008510	GGC	2	6	8184	8189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329805
134	NC_008510	CGG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329805
135	NC_008510	ATA	2	6	8266	8271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116329805
136	NC_008510	TAA	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116329805
137	NC_008510	AAGAA	2	10	8381	8390	80 %	0 %	20 %	0 %	116329805
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