MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	CT	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	116329557
2	NC_008509	GA	3	6	456	461	50 %	0 %	50 %	0 %	116329557
3	NC_008509	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	116329557
4	NC_008509	CT	3	6	901	906	0 %	50 %	0 %	50 %	116329558
5	NC_008509	CT	3	6	1311	1316	0 %	50 %	0 %	50 %	116329558
6	NC_008509	TA	3	6	1714	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	116329558
7	NC_008509	TC	3	6	6231	6236	0 %	50 %	0 %	50 %	116329561
8	NC_008509	AT	3	6	8294	8299	50 %	50 %	0 %	0 %	116329563
9	NC_008509	TC	3	6	8417	8422	0 %	50 %	0 %	50 %	116329563
10	NC_008509	TG	3	6	8498	8503	0 %	50 %	50 %	0 %	116329563
11	NC_008509	CA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	0 %	50 %	116329564
12	NC_008509	TA	3	6	8905	8910	50 %	50 %	0 %	0 %	116329564
13	NC_008509	GA	3	6	8993	8998	50 %	0 %	50 %	0 %	116329564
14	NC_008509	AG	3	6	9096	9101	50 %	0 %	50 %	0 %	116329565
15	NC_008509	GT	3	6	9598	9603	0 %	50 %	50 %	0 %	116329565
16	NC_008509	AC	3	6	11207	11212	50 %	0 %	0 %	50 %	116329566
17	NC_008509	CT	3	6	12775	12780	0 %	50 %	0 %	50 %	116329568
18	NC_008509	CG	3	6	12881	12886	0 %	0 %	50 %	50 %	116329568
19	NC_008509	TA	3	6	14590	14595	50 %	50 %	0 %	0 %	116329569
20	NC_008509	AG	3	6	15918	15923	50 %	0 %	50 %	0 %	116329571
21	NC_008509	TC	3	6	15928	15933	0 %	50 %	0 %	50 %	116329571
22	NC_008509	AG	3	6	16292	16297	50 %	0 %	50 %	0 %	116329571
23	NC_008509	AG	3	6	16380	16385	50 %	0 %	50 %	0 %	116329571
24	NC_008509	TC	3	6	16695	16700	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
25	NC_008509	GA	3	6	16754	16759	50 %	0 %	50 %	0 %	116329572
26	NC_008509	TC	3	6	16823	16828	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
27	NC_008509	AG	3	6	17216	17221	50 %	0 %	50 %	0 %	116329572
28	NC_008509	CT	3	6	17633	17638	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
29	NC_008509	CT	3	6	18336	18341	0 %	50 %	0 %	50 %	116329573
30	NC_008509	TA	3	6	18383	18388	50 %	50 %	0 %	0 %	116329573
31	NC_008509	AC	3	6	20600	20605	50 %	0 %	0 %	50 %	116329575
32	NC_008509	GA	4	8	21378	21385	50 %	0 %	50 %	0 %	116329576
33	NC_008509	GA	3	6	21847	21852	50 %	0 %	50 %	0 %	116329576
34	NC_008509	AT	3	6	23129	23134	50 %	50 %	0 %	0 %	116329577
35	NC_008509	TC	3	6	23292	23297	0 %	50 %	0 %	50 %	116329577
36	NC_008509	GA	3	6	23405	23410	50 %	0 %	50 %	0 %	116329577
37	NC_008509	GA	3	6	23505	23510	50 %	0 %	50 %	0 %	116329577
38	NC_008509	GA	3	6	24165	24170	50 %	0 %	50 %	0 %	116329578
39	NC_008509	AT	3	6	24250	24255	50 %	50 %	0 %	0 %	116329579
40	NC_008509	AG	3	6	24788	24793	50 %	0 %	50 %	0 %	116329579
41	NC_008509	TC	3	6	25924	25929	0 %	50 %	0 %	50 %	116329580
42	NC_008509	AC	3	6	25971	25976	50 %	0 %	0 %	50 %	116329580
43	NC_008509	CT	3	6	25990	25995	0 %	50 %	0 %	50 %	116329580
44	NC_008509	AT	3	6	27789	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	116329581
45	NC_008509	TC	3	6	27985	27990	0 %	50 %	0 %	50 %	116329581
46	NC_008509	CT	3	6	28089	28094	0 %	50 %	0 %	50 %	116329581
47	NC_008509	AG	3	6	30468	30473	50 %	0 %	50 %	0 %	116329582
48	NC_008509	GT	3	6	30873	30878	0 %	50 %	50 %	0 %	116329582
49	NC_008509	AT	3	6	30918	30923	50 %	50 %	0 %	0 %	116329582
50	NC_008509	AT	3	6	32516	32521	50 %	50 %	0 %	0 %	116329584
51	NC_008509	CT	3	6	33136	33141	0 %	50 %	0 %	50 %	116329585
52	NC_008509	CT	3	6	33660	33665	0 %	50 %	0 %	50 %	116329586
53	NC_008509	CG	3	6	34406	34411	0 %	0 %	50 %	50 %	116329586
54	NC_008509	TG	3	6	34705	34710	0 %	50 %	50 %	0 %	116329587
55	NC_008509	AG	3	6	34798	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	116329587
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60	NC_008509	CT	3	6	38828	38833	0 %	50 %	0 %	50 %	116329591
61	NC_008509	AG	3	6	41509	41514	50 %	0 %	50 %	0 %	116329593
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64	NC_008509	AT	3	6	47229	47234	50 %	50 %	0 %	0 %	116329597
65	NC_008509	CT	3	6	47450	47455	0 %	50 %	0 %	50 %	116329597
66	NC_008509	TA	3	6	49068	49073	50 %	50 %	0 %	0 %	116329599
67	NC_008509	GA	3	6	49138	49143	50 %	0 %	50 %	0 %	116329599
68	NC_008509	AG	3	6	50727	50732	50 %	0 %	50 %	0 %	116329600
69	NC_008509	TA	3	6	51408	51413	50 %	50 %	0 %	0 %	116329601
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71	NC_008509	TA	3	6	53624	53629	50 %	50 %	0 %	0 %	116329602
72	NC_008509	AT	3	6	54627	54632	50 %	50 %	0 %	0 %	116329603
73	NC_008509	TA	3	6	54662	54667	50 %	50 %	0 %	0 %	116329603
74	NC_008509	TC	3	6	55110	55115	0 %	50 %	0 %	50 %	116329604
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110	NC_008509	GT	3	6	85742	85747	0 %	50 %	50 %	0 %	116329625
111	NC_008509	TA	3	6	92810	92815	50 %	50 %	0 %	0 %	116329626
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113	NC_008509	AT	3	6	93507	93512	50 %	50 %	0 %	0 %	116329626
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.