MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	AATC	2	8	642	649	50 %	25 %	0 %	25 %	116329557
2	NC_008509	CCAA	2	8	1054	1061	50 %	0 %	0 %	50 %	116329558
3	NC_008509	ATTT	2	8	1473	1480	25 %	75 %	0 %	0 %	116329558
4	NC_008509	TTCC	2	8	2468	2475	0 %	50 %	0 %	50 %	116329559
5	NC_008509	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	116329560
6	NC_008509	TTTC	2	8	3223	3230	0 %	75 %	0 %	25 %	116329560
7	NC_008509	ATGG	2	8	3257	3264	25 %	25 %	50 %	0 %	116329560
8	NC_008509	GATC	2	8	3502	3509	25 %	25 %	25 %	25 %	116329560
9	NC_008509	TATT	2	8	3658	3665	25 %	75 %	0 %	0 %	116329560
10	NC_008509	CGTT	2	8	3763	3770	0 %	50 %	25 %	25 %	116329560
11	NC_008509	CGCC	2	8	3784	3791	0 %	0 %	25 %	75 %	116329560
12	NC_008509	CCTT	2	8	3898	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	116329560
13	NC_008509	GGAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	75 %	0 %	116329560
14	NC_008509	TTCC	2	8	5031	5038	0 %	50 %	0 %	50 %	116329560
15	NC_008509	TTGG	2	8	5314	5321	0 %	50 %	50 %	0 %	116329560
16	NC_008509	GGAC	2	8	6058	6065	25 %	0 %	50 %	25 %	116329561
17	NC_008509	TTCG	2	8	6199	6206	0 %	50 %	25 %	25 %	116329561
18	NC_008509	TTGC	2	8	6321	6328	0 %	50 %	25 %	25 %	116329561
19	NC_008509	AATC	2	8	6363	6370	50 %	25 %	0 %	25 %	116329561
20	NC_008509	TTTC	2	8	7011	7018	0 %	75 %	0 %	25 %	116329562
21	NC_008509	AAAG	2	8	7421	7428	75 %	0 %	25 %	0 %	116329562
22	NC_008509	ACGA	2	8	8598	8605	50 %	0 %	25 %	25 %	116329563
23	NC_008509	GAAA	2	8	8869	8876	75 %	0 %	25 %	0 %	116329564
24	NC_008509	AATA	2	8	9453	9460	75 %	25 %	0 %	0 %	116329565
25	NC_008509	TGAT	2	8	9616	9623	25 %	50 %	25 %	0 %	116329565
26	NC_008509	TCTT	2	8	9668	9675	0 %	75 %	0 %	25 %	116329565
27	NC_008509	ATTT	2	8	9887	9894	25 %	75 %	0 %	0 %	116329565
28	NC_008509	CGAA	2	8	10494	10501	50 %	0 %	25 %	25 %	116329566
29	NC_008509	TAAG	2	8	10662	10669	50 %	25 %	25 %	0 %	116329566
30	NC_008509	GAAA	2	8	10697	10704	75 %	0 %	25 %	0 %	116329566
31	NC_008509	CAAA	2	8	10903	10910	75 %	0 %	0 %	25 %	116329566
32	NC_008509	ATCC	2	8	11043	11050	25 %	25 %	0 %	50 %	116329566
33	NC_008509	CAAA	2	8	11519	11526	75 %	0 %	0 %	25 %	116329566
34	NC_008509	TCAC	2	8	11856	11863	25 %	25 %	0 %	50 %	116329567
35	NC_008509	CGGA	2	8	11893	11900	25 %	0 %	50 %	25 %	116329567
36	NC_008509	AAAG	2	8	13146	13153	75 %	0 %	25 %	0 %	116329568
37	NC_008509	GATC	2	8	13606	13613	25 %	25 %	25 %	25 %	116329568
38	NC_008509	TCAT	2	8	14177	14184	25 %	50 %	0 %	25 %	116329569
39	NC_008509	TTTC	2	8	14299	14306	0 %	75 %	0 %	25 %	116329569
40	NC_008509	ATTC	2	8	14989	14996	25 %	50 %	0 %	25 %	116329570
41	NC_008509	GAAA	2	8	15191	15198	75 %	0 %	25 %	0 %	116329570
42	NC_008509	AAGG	2	8	15308	15315	50 %	0 %	50 %	0 %	116329570
43	NC_008509	AGGC	2	8	15444	15451	25 %	0 %	50 %	25 %	116329571
44	NC_008509	GAAT	2	8	15884	15891	50 %	25 %	25 %	0 %	116329571
45	NC_008509	TTGG	2	8	16300	16307	0 %	50 %	50 %	0 %	116329571
46	NC_008509	TTCG	2	8	16524	16531	0 %	50 %	25 %	25 %	116329572
47	NC_008509	AGAA	2	8	16789	16796	75 %	0 %	25 %	0 %	116329572
48	NC_008509	CTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
49	NC_008509	ATTT	2	8	19786	19793	25 %	75 %	0 %	0 %	116329574
50	NC_008509	ATCA	2	8	19898	19905	50 %	25 %	0 %	25 %	116329574
51	NC_008509	GGAA	2	8	20005	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	116329574
52	NC_008509	GATT	2	8	21164	21171	25 %	50 %	25 %	0 %	116329575
53	NC_008509	TCCC	2	8	22009	22016	0 %	25 %	0 %	75 %	116329576
54	NC_008509	GGGA	2	8	22313	22320	25 %	0 %	75 %	0 %	116329576
55	NC_008509	GTTT	2	8	22839	22846	0 %	75 %	25 %	0 %	116329577
56	NC_008509	GATT	2	8	23161	23168	25 %	50 %	25 %	0 %	116329577
57	NC_008509	ATTG	2	8	23180	23187	25 %	50 %	25 %	0 %	116329577
58	NC_008509	TCAA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	116329577
59	NC_008509	AGAT	2	8	23817	23824	50 %	25 %	25 %	0 %	116329578
60	NC_008509	ACTT	2	8	24150	24157	25 %	50 %	0 %	25 %	116329578
61	NC_008509	TCAG	2	8	24295	24302	25 %	25 %	25 %	25 %	116329579
62	NC_008509	AGAA	2	8	26258	26265	75 %	0 %	25 %	0 %	116329580
63	NC_008509	AGGA	2	8	29848	29855	50 %	0 %	50 %	0 %	116329582
64	NC_008509	TGGA	2	8	29950	29957	25 %	25 %	50 %	0 %	116329582
65	NC_008509	AAAT	2	8	30003	30010	75 %	25 %	0 %	0 %	116329582
66	NC_008509	AAAC	2	8	30060	30067	75 %	0 %	0 %	25 %	116329582
67	NC_008509	TCGA	2	8	30308	30315	25 %	25 %	25 %	25 %	116329582
68	NC_008509	ATGT	2	8	31111	31118	25 %	50 %	25 %	0 %	116329583
69	NC_008509	TTCG	2	8	32173	32180	0 %	50 %	25 %	25 %	116329584
70	NC_008509	TGTT	2	8	32690	32697	0 %	75 %	25 %	0 %	116329585
71	NC_008509	CGAT	2	8	33762	33769	25 %	25 %	25 %	25 %	116329586
72	NC_008509	TTAC	2	8	33812	33819	25 %	50 %	0 %	25 %	116329586
73	NC_008509	GGTT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	50 %	0 %	116329586
74	NC_008509	CTTC	2	8	34899	34906	0 %	50 %	0 %	50 %	116329587
75	NC_008509	CCGA	2	8	35586	35593	25 %	0 %	25 %	50 %	116329588
76	NC_008509	CTAT	2	8	35758	35765	25 %	50 %	0 %	25 %	116329588
77	NC_008509	AAGG	2	8	36345	36352	50 %	0 %	50 %	0 %	116329589
78	NC_008509	AAAG	2	8	37031	37038	75 %	0 %	25 %	0 %	116329590
79	NC_008509	GAAA	2	8	37978	37985	75 %	0 %	25 %	0 %	116329591
80	NC_008509	CCTA	2	8	38147	38154	25 %	25 %	0 %	50 %	116329591
81	NC_008509	GATC	2	8	38335	38342	25 %	25 %	25 %	25 %	116329591
82	NC_008509	TCTT	2	8	39486	39493	0 %	75 %	0 %	25 %	116329592
83	NC_008509	CGGT	2	8	39914	39921	0 %	25 %	50 %	25 %	116329592
84	NC_008509	ACTT	2	8	39983	39990	25 %	50 %	0 %	25 %	116329592
85	NC_008509	TTGT	2	8	40012	40019	0 %	75 %	25 %	0 %	116329592
86	NC_008509	GGAA	2	8	40873	40880	50 %	0 %	50 %	0 %	116329593
87	NC_008509	ACGA	2	8	41685	41692	50 %	0 %	25 %	25 %	116329593
88	NC_008509	GTAA	2	8	41935	41942	50 %	25 %	25 %	0 %	116329593
89	NC_008509	TCGA	2	8	43161	43168	25 %	25 %	25 %	25 %	116329594
90	NC_008509	CGAT	2	8	45858	45865	25 %	25 %	25 %	25 %	116329595
91	NC_008509	TGAT	2	8	46538	46545	25 %	50 %	25 %	0 %	116329596
92	NC_008509	AAAG	2	8	46600	46607	75 %	0 %	25 %	0 %	116329596
93	NC_008509	AAAT	2	8	47012	47019	75 %	25 %	0 %	0 %	116329596
94	NC_008509	TTAC	2	8	47283	47290	25 %	50 %	0 %	25 %	116329597
95	NC_008509	GAAA	2	8	47436	47443	75 %	0 %	25 %	0 %	116329597
96	NC_008509	GAAC	2	8	47786	47793	50 %	0 %	25 %	25 %	116329597
97	NC_008509	AAAG	2	8	48316	48323	75 %	0 %	25 %	0 %	116329598
98	NC_008509	GCTC	2	8	48626	48633	0 %	25 %	25 %	50 %	116329598
99	NC_008509	TCGA	2	8	48863	48870	25 %	25 %	25 %	25 %	116329598
100	NC_008509	GCAA	2	8	49314	49321	50 %	0 %	25 %	25 %	116329599
101	NC_008509	GACG	2	8	49599	49606	25 %	0 %	50 %	25 %	116329599
102	NC_008509	TTCT	2	8	49889	49896	0 %	75 %	0 %	25 %	116329599
103	NC_008509	TTTC	2	8	51145	51152	0 %	75 %	0 %	25 %	116329601
104	NC_008509	ACGT	2	8	51270	51277	25 %	25 %	25 %	25 %	116329601
105	NC_008509	TCAA	2	8	53192	53199	50 %	25 %	0 %	25 %	116329602
106	NC_008509	AGAA	2	8	53431	53438	75 %	0 %	25 %	0 %	116329602
107	NC_008509	TCGT	2	8	53543	53550	0 %	50 %	25 %	25 %	116329602
108	NC_008509	GGAC	2	8	53859	53866	25 %	0 %	50 %	25 %	116329602
109	NC_008509	TGAG	2	8	53942	53949	25 %	25 %	50 %	0 %	116329602
110	NC_008509	TGTT	2	8	55140	55147	0 %	75 %	25 %	0 %	116329604
111	NC_008509	TTAC	2	8	55983	55990	25 %	50 %	0 %	25 %	116329606
112	NC_008509	GGAA	2	8	56522	56529	50 %	0 %	50 %	0 %	116329606
113	NC_008509	ATTT	2	8	56764	56771	25 %	75 %	0 %	0 %	116329606
114	NC_008509	TGAT	2	8	57596	57603	25 %	50 %	25 %	0 %	116329607
115	NC_008509	AGTG	2	8	57641	57648	25 %	25 %	50 %	0 %	116329607
116	NC_008509	TCTT	2	8	57916	57923	0 %	75 %	0 %	25 %	116329607
117	NC_008509	ATTT	2	8	60396	60403	25 %	75 %	0 %	0 %	116329609
118	NC_008509	CAAT	2	8	60756	60763	50 %	25 %	0 %	25 %	116329609
119	NC_008509	AAAG	2	8	61753	61760	75 %	0 %	25 %	0 %	116329610
120	NC_008509	TCGG	2	8	63687	63694	0 %	25 %	50 %	25 %	116329611
121	NC_008509	CGGG	2	8	64506	64513	0 %	0 %	75 %	25 %	116329612
122	NC_008509	TTCT	2	8	65854	65861	0 %	75 %	0 %	25 %	116329613
123	NC_008509	TTTG	2	8	66638	66645	0 %	75 %	25 %	0 %	116329614
124	NC_008509	TTTC	2	8	67377	67384	0 %	75 %	0 %	25 %	116329614
125	NC_008509	ATGT	2	8	67566	67573	25 %	50 %	25 %	0 %	116329614
126	NC_008509	TTGA	2	8	67733	67740	25 %	50 %	25 %	0 %	116329614
127	NC_008509	AGAA	2	8	68126	68133	75 %	0 %	25 %	0 %	116329615
128	NC_008509	TTCT	2	8	68188	68195	0 %	75 %	0 %	25 %	116329615
129	NC_008509	ATTT	2	8	68381	68388	25 %	75 %	0 %	0 %	116329615
130	NC_008509	GATT	2	8	68413	68420	25 %	50 %	25 %	0 %	116329615
131	NC_008509	ATTC	2	8	68585	68592	25 %	50 %	0 %	25 %	116329615
132	NC_008509	GAAA	3	12	68691	68702	75 %	0 %	25 %	0 %	116329615
133	NC_008509	GACG	2	8	69074	69081	25 %	0 %	50 %	25 %	116329615
134	NC_008509	CAAA	2	8	69131	69138	75 %	0 %	0 %	25 %	116329615
135	NC_008509	CTTT	2	8	69369	69376	0 %	75 %	0 %	25 %	116329615
136	NC_008509	TAAT	2	8	71583	71590	50 %	50 %	0 %	0 %	116329617
137	NC_008509	TATT	2	8	71788	71795	25 %	75 %	0 %	0 %	116329617
138	NC_008509	AAAT	2	8	72084	72091	75 %	25 %	0 %	0 %	116329617
139	NC_008509	GGTA	2	8	73361	73368	25 %	25 %	50 %	0 %	116329618
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