MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 4650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008509	CTT	2	6	27857	27862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329581
502	NC_008509	GCG	2	6	27867	27872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329581
503	NC_008509	ATA	2	6	27894	27899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116329581
504	NC_008509	TTG	2	6	27908	27913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116329581
505	NC_008509	TC	3	6	27985	27990	0 %	50 %	0 %	50 %	116329581
506	NC_008509	TGT	2	6	28000	28005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116329581
507	NC_008509	A	6	6	28039	28044	100 %	0 %	0 %	0 %	116329581
508	NC_008509	CT	3	6	28089	28094	0 %	50 %	0 %	50 %	116329581
509	NC_008509	TAG	2	6	28134	28139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329581
510	NC_008509	T	6	6	28166	28171	0 %	100 %	0 %	0 %	116329581
511	NC_008509	CAA	2	6	28211	28216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329581
512	NC_008509	AGA	2	6	28217	28222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329581
513	NC_008509	T	8	8	28238	28245	0 %	100 %	0 %	0 %	116329581
514	NC_008509	TTA	2	6	28289	28294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329581
515	NC_008509	TCC	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116329581
516	NC_008509	CAA	2	6	28457	28462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329581
517	NC_008509	GAT	2	6	28574	28579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329581
518	NC_008509	T	6	6	29796	29801	0 %	100 %	0 %	0 %	116329582
519	NC_008509	GAA	2	6	29802	29807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329582
520	NC_008509	A	6	6	29827	29832	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
521	NC_008509	AGGA	2	8	29848	29855	50 %	0 %	50 %	0 %	116329582
522	NC_008509	TGGA	2	8	29950	29957	25 %	25 %	50 %	0 %	116329582
523	NC_008509	A	7	7	29960	29966	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
524	NC_008509	AAAT	2	8	30003	30010	75 %	25 %	0 %	0 %	116329582
525	NC_008509	AAAGAA	2	12	30048	30059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116329582
526	NC_008509	AAAC	2	8	30060	30067	75 %	0 %	0 %	25 %	116329582
527	NC_008509	A	6	6	30081	30086	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
528	NC_008509	AGA	2	6	30097	30102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329582
529	NC_008509	GAC	2	6	30136	30141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329582
530	NC_008509	TTC	2	6	30208	30213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329582
531	NC_008509	A	6	6	30224	30229	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
532	NC_008509	GAA	2	6	30274	30279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329582
533	NC_008509	A	7	7	30278	30284	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
534	NC_008509	TCGA	2	8	30308	30315	25 %	25 %	25 %	25 %	116329582
535	NC_008509	AAG	2	6	30320	30325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329582
536	NC_008509	A	6	6	30359	30364	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
537	NC_008509	A	8	8	30383	30390	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
538	NC_008509	T	6	6	30403	30408	0 %	100 %	0 %	0 %	116329582
539	NC_008509	AGGAA	2	10	30437	30446	60 %	0 %	40 %	0 %	116329582
540	NC_008509	AG	3	6	30468	30473	50 %	0 %	50 %	0 %	116329582
541	NC_008509	A	6	6	30569	30574	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
542	NC_008509	AAT	2	6	30621	30626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116329582
543	NC_008509	A	7	7	30647	30653	100 %	0 %	0 %	0 %	116329582
544	NC_008509	GAA	2	6	30659	30664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329582
545	NC_008509	T	7	7	30841	30847	0 %	100 %	0 %	0 %	116329582
546	NC_008509	GGA	2	6	30850	30855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116329582
547	NC_008509	AAG	2	6	30856	30861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329582
548	NC_008509	GT	3	6	30873	30878	0 %	50 %	50 %	0 %	116329582
549	NC_008509	AT	3	6	30918	30923	50 %	50 %	0 %	0 %	116329582
550	NC_008509	TAT	2	6	30925	30930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329582
551	NC_008509	GGA	2	6	31072	31077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116329583
552	NC_008509	AAG	2	6	31088	31093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329583
553	NC_008509	ATGT	2	8	31111	31118	25 %	50 %	25 %	0 %	116329583
554	NC_008509	T	8	8	31142	31149	0 %	100 %	0 %	0 %	116329583
555	NC_008509	A	6	6	31155	31160	100 %	0 %	0 %	0 %	116329583
556	NC_008509	TGA	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329583
557	NC_008509	T	7	7	31197	31203	0 %	100 %	0 %	0 %	116329583
558	NC_008509	GTT	2	6	31215	31220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116329583
559	NC_008509	ACA	2	6	31290	31295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329583
560	NC_008509	CTT	2	6	31381	31386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329583
561	NC_008509	GAA	2	6	31399	31404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329583
562	NC_008509	AAG	3	9	31987	31995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329584
563	NC_008509	A	7	7	32006	32012	100 %	0 %	0 %	0 %	116329584
564	NC_008509	CGA	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329584
565	NC_008509	CTT	2	6	32061	32066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329584
566	NC_008509	ACT	2	6	32165	32170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329584
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568	NC_008509	GGC	2	6	32251	32256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329584
569	NC_008509	CAAAAA	2	12	32270	32281	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116329584
570	NC_008509	TGC	2	6	32293	32298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116329584
571	NC_008509	TTC	2	6	32302	32307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329584
572	NC_008509	CTT	2	6	32313	32318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329584
573	NC_008509	TTC	2	6	32347	32352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329584
574	NC_008509	GAG	2	6	32391	32396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116329584
575	NC_008509	CGGTAA	2	12	32418	32429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116329584
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578	NC_008509	AAAAC	2	10	32652	32661	80 %	0 %	0 %	20 %	116329585
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599	NC_008509	CGG	2	6	33507	33512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116329586
600	NC_008509	GTT	2	6	33650	33655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116329586
601	NC_008509	CT	3	6	33660	33665	0 %	50 %	0 %	50 %	116329586
602	NC_008509	ATC	2	6	33677	33682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329586
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605	NC_008509	TTAC	2	8	33812	33819	25 %	50 %	0 %	25 %	116329586
606	NC_008509	CTT	2	6	33831	33836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329586
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611	NC_008509	CAA	2	6	34154	34159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116329586
612	NC_008509	GAA	2	6	34195	34200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329586
613	NC_008509	GGTT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	50 %	0 %	116329586
614	NC_008509	TCA	2	6	34374	34379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329586
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616	NC_008509	TG	3	6	34705	34710	0 %	50 %	50 %	0 %	116329587
617	NC_008509	GTA	2	6	34756	34761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329587
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619	NC_008509	AG	3	6	34798	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	116329587
620	NC_008509	A	6	6	34815	34820	100 %	0 %	0 %	0 %	116329587
621	NC_008509	TCA	2	6	34825	34830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329587
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627	NC_008509	TCT	2	6	35510	35515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329588
628	NC_008509	CCGA	2	8	35586	35593	25 %	0 %	25 %	50 %	116329588
629	NC_008509	A	7	7	35628	35634	100 %	0 %	0 %	0 %	116329588
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