MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 2614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	TTGTC	2	10	563	572	0 %	60 %	20 %	20 %	116326853
2	NC_008508	ACTCG	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	116326854
3	NC_008508	ACAAA	2	10	2272	2281	80 %	0 %	0 %	20 %	116326854
4	NC_008508	TTGAT	2	10	2305	2314	20 %	60 %	20 %	0 %	116326854
5	NC_008508	TTTTC	2	10	2803	2812	0 %	80 %	0 %	20 %	116326854
6	NC_008508	TTCCA	2	10	3502	3511	20 %	40 %	0 %	40 %	116326855
7	NC_008508	AAACT	2	10	3655	3664	60 %	20 %	0 %	20 %	116326855
8	NC_008508	TTTTC	2	10	4925	4934	0 %	80 %	0 %	20 %	116326856
9	NC_008508	GAAAT	2	10	7634	7643	60 %	20 %	20 %	0 %	116326857
10	NC_008508	AAGAA	2	10	8381	8390	80 %	0 %	20 %	0 %	116326858
11	NC_008508	TCGAT	2	10	9068	9077	20 %	40 %	20 %	20 %	116326859
12	NC_008508	GGATG	2	10	14292	14301	20 %	20 %	60 %	0 %	116326862
13	NC_008508	CAGCC	2	10	16439	16448	20 %	0 %	20 %	60 %	116326864
14	NC_008508	GATCG	2	10	16741	16750	20 %	20 %	40 %	20 %	116326864
15	NC_008508	TCTTT	2	10	16806	16815	0 %	80 %	0 %	20 %	116326864
16	NC_008508	AATCC	2	10	17160	17169	40 %	20 %	0 %	40 %	116326864
17	NC_008508	TATTT	2	10	18233	18242	20 %	80 %	0 %	0 %	116326865
18	NC_008508	TTTAG	2	10	19318	19327	20 %	60 %	20 %	0 %	116326866
19	NC_008508	TTTGA	2	10	21614	21623	20 %	60 %	20 %	0 %	116326868
20	NC_008508	CTTTT	2	10	21727	21736	0 %	80 %	0 %	20 %	116326868
21	NC_008508	ATTTC	2	10	22055	22064	20 %	60 %	0 %	20 %	116326869
22	NC_008508	CGGAT	2	10	22283	22292	20 %	20 %	40 %	20 %	116326869
23	NC_008508	CGTAT	2	10	23559	23568	20 %	40 %	20 %	20 %	116326869
24	NC_008508	CTTGC	2	10	23762	23771	0 %	40 %	20 %	40 %	116326869
25	NC_008508	TTTTC	2	10	23865	23874	0 %	80 %	0 %	20 %	116326869
26	NC_008508	CGAGC	2	10	30469	30478	20 %	0 %	40 %	40 %	116326872
27	NC_008508	CTTTT	2	10	30953	30962	0 %	80 %	0 %	20 %	116326872
28	NC_008508	TTACT	2	10	31763	31772	20 %	60 %	0 %	20 %	116326873
29	NC_008508	AATTC	2	10	34175	34184	40 %	40 %	0 %	20 %	116326875
30	NC_008508	TCCGA	2	10	34740	34749	20 %	20 %	20 %	40 %	116326875
31	NC_008508	AAGCG	2	10	35786	35795	40 %	0 %	40 %	20 %	116326876
32	NC_008508	CATTG	2	10	37037	37046	20 %	40 %	20 %	20 %	116326877
33	NC_008508	GCGCT	2	10	39648	39657	0 %	20 %	40 %	40 %	116326879
34	NC_008508	ATTTT	2	10	40526	40535	20 %	80 %	0 %	0 %	116326879
35	NC_008508	TTTTC	2	10	41288	41297	0 %	80 %	0 %	20 %	116326880
36	NC_008508	CCTTT	2	10	41665	41674	0 %	60 %	0 %	40 %	116326881
37	NC_008508	ATCGA	2	10	42493	42502	40 %	20 %	20 %	20 %	116326882
38	NC_008508	GATCG	2	10	46206	46215	20 %	20 %	40 %	20 %	116326886
39	NC_008508	ATTTT	2	10	48601	48610	20 %	80 %	0 %	0 %	116326887
40	NC_008508	GAAAG	2	10	54728	54737	60 %	0 %	40 %	0 %	116326891
41	NC_008508	GATTC	2	10	55485	55494	20 %	40 %	20 %	20 %	116326892
42	NC_008508	GCAAT	2	10	55876	55885	40 %	20 %	20 %	20 %	116326892
43	NC_008508	ATTTC	2	10	56313	56322	20 %	60 %	0 %	20 %	116326892
44	NC_008508	AAACG	2	10	56614	56623	60 %	0 %	20 %	20 %	116326892
45	NC_008508	GAAAA	2	10	57597	57606	80 %	0 %	20 %	0 %	116326893
46	NC_008508	TTTCA	2	10	57846	57855	20 %	60 %	0 %	20 %	116326893
47	NC_008508	TTTGA	2	10	62222	62231	20 %	60 %	20 %	0 %	116326896
48	NC_008508	CTTTT	2	10	62335	62344	0 %	80 %	0 %	20 %	116326896
49	NC_008508	CGGAA	2	10	65023	65032	40 %	0 %	40 %	20 %	116326897
50	NC_008508	TGGTT	2	10	66260	66269	0 %	60 %	40 %	0 %	116326898
51	NC_008508	ATCTT	2	10	66298	66307	20 %	60 %	0 %	20 %	116326898
52	NC_008508	CATTC	2	10	68373	68382	20 %	40 %	0 %	40 %	116326900
53	NC_008508	TTTGA	2	10	68407	68416	20 %	60 %	20 %	0 %	116326900
54	NC_008508	CTTTT	2	10	68520	68529	0 %	80 %	0 %	20 %	116326900
55	NC_008508	CAAGG	2	10	69816	69825	40 %	0 %	40 %	20 %	116326901
56	NC_008508	TTCAA	2	10	70635	70644	40 %	40 %	0 %	20 %	116326902
57	NC_008508	GAATT	2	10	73388	73397	40 %	40 %	20 %	0 %	116326905
58	NC_008508	TCAAA	2	10	73731	73740	60 %	20 %	0 %	20 %	116326905
59	NC_008508	ATAAA	2	10	74124	74133	80 %	20 %	0 %	0 %	116326906
60	NC_008508	TCATT	2	10	74576	74585	20 %	60 %	0 %	20 %	116326907
61	NC_008508	GAAGT	2	10	76158	76167	40 %	20 %	40 %	0 %	116326908
62	NC_008508	AAATC	2	10	76732	76741	60 %	20 %	0 %	20 %	116326909
63	NC_008508	AAGTA	2	10	76829	76838	60 %	20 %	20 %	0 %	116326909
64	NC_008508	TAAAA	2	10	78478	78487	80 %	20 %	0 %	0 %	116326910
65	NC_008508	GAAAA	2	10	79368	79377	80 %	0 %	20 %	0 %	116326911
66	NC_008508	TCAAA	2	10	79482	79491	60 %	20 %	0 %	20 %	116326911
67	NC_008508	TATAA	2	10	83679	83688	60 %	40 %	0 %	0 %	116326912
68	NC_008508	ATCTT	2	10	83711	83720	20 %	60 %	0 %	20 %	116326912
69	NC_008508	TCGGA	2	10	85657	85666	20 %	20 %	40 %	20 %	116326913
70	NC_008508	CCTGT	2	10	86011	86020	0 %	40 %	20 %	40 %	116326913
71	NC_008508	TTTCC	2	10	86252	86261	0 %	60 %	0 %	40 %	116326913
72	NC_008508	TTTGA	2	10	87108	87117	20 %	60 %	20 %	0 %	116326913
73	NC_008508	GTTTT	3	15	87437	87451	0 %	80 %	20 %	0 %	116326913
74	NC_008508	TTGAT	2	10	89413	89422	20 %	60 %	20 %	0 %	116326916
75	NC_008508	AGAAA	2	10	93762	93771	80 %	0 %	20 %	0 %	116326918
76	NC_008508	TTTTG	2	10	93842	93851	0 %	80 %	20 %	0 %	116326918
77	NC_008508	ATTTT	2	10	101279	101288	20 %	80 %	0 %	0 %	116326925
78	NC_008508	GAAGA	2	10	101496	101505	60 %	0 %	40 %	0 %	116326925
79	NC_008508	ATCTT	2	10	101756	101765	20 %	60 %	0 %	20 %	116326925
80	NC_008508	AAAGA	2	10	103476	103485	80 %	0 %	20 %	0 %	116326928
81	NC_008508	CAATT	2	10	104993	105002	40 %	40 %	0 %	20 %	116326930
82	NC_008508	GAAAA	2	10	107687	107696	80 %	0 %	20 %	0 %	116326931
83	NC_008508	TTAAA	2	10	109066	109075	60 %	40 %	0 %	0 %	116326932
84	NC_008508	GGATC	2	10	111517	111526	20 %	20 %	40 %	20 %	116326934
85	NC_008508	CTTTC	2	10	112805	112814	0 %	60 %	0 %	40 %	116326935
86	NC_008508	ATTCT	2	10	115882	115891	20 %	60 %	0 %	20 %	116326937
87	NC_008508	TCGAT	2	10	116205	116214	20 %	40 %	20 %	20 %	116326937
88	NC_008508	AAAAG	2	10	116458	116467	80 %	0 %	20 %	0 %	116326937
89	NC_008508	TTTTC	2	10	117049	117058	0 %	80 %	0 %	20 %	116326938
90	NC_008508	GATAA	2	10	118574	118583	60 %	20 %	20 %	0 %	116326938
91	NC_008508	TCATT	2	10	119248	119257	20 %	60 %	0 %	20 %	116326939
92	NC_008508	TTGAA	2	10	121018	121027	40 %	40 %	20 %	0 %	116326942
93	NC_008508	AAAAT	2	10	121583	121592	80 %	20 %	0 %	0 %	116326942
94	NC_008508	ATCGA	2	10	121790	121799	40 %	20 %	20 %	20 %	116326942
95	NC_008508	TTCTT	2	10	122111	122120	0 %	80 %	0 %	20 %	116326943
96	NC_008508	AATCC	2	10	122473	122482	40 %	20 %	0 %	40 %	116326944
97	NC_008508	TTCGT	2	10	124429	124438	0 %	60 %	20 %	20 %	116326945
98	NC_008508	TGATC	2	10	125720	125729	20 %	40 %	20 %	20 %	116326945
99	NC_008508	ATTCT	2	10	129180	129189	20 %	60 %	0 %	20 %	116326947
100	NC_008508	GAAAA	2	10	130028	130037	80 %	0 %	20 %	0 %	116326948
101	NC_008508	TCAAA	2	10	130142	130151	60 %	20 %	0 %	20 %	116326948
102	NC_008508	GAATG	2	10	130176	130185	40 %	20 %	40 %	0 %	116326948
103	NC_008508	AAGAC	2	10	132770	132779	60 %	0 %	20 %	20 %	116326949
104	NC_008508	CCCAA	2	10	135702	135711	40 %	0 %	0 %	60 %	116326952
105	NC_008508	AAAGA	2	10	135764	135773	80 %	0 %	20 %	0 %	116326952
106	NC_008508	TTCAC	2	10	135781	135790	20 %	40 %	0 %	40 %	116326952
107	NC_008508	GAGAT	2	10	136594	136603	40 %	20 %	40 %	0 %	116326953
108	NC_008508	AGGGA	2	10	137242	137251	40 %	0 %	60 %	0 %	116326954
109	NC_008508	ATAGA	2	10	137515	137524	60 %	20 %	20 %	0 %	116326954
110	NC_008508	CCAAG	2	10	138136	138145	40 %	0 %	20 %	40 %	116326954
111	NC_008508	ATTCA	2	10	138827	138836	40 %	40 %	0 %	20 %	116326955
112	NC_008508	TCGAA	2	10	138884	138893	40 %	20 %	20 %	20 %	116326955
113	NC_008508	AAAAT	2	10	140605	140614	80 %	20 %	0 %	0 %	116326955
114	NC_008508	CATTC	2	10	144230	144239	20 %	40 %	0 %	40 %	116326957
115	NC_008508	TTTGA	2	10	144264	144273	20 %	60 %	20 %	0 %	116326957
116	NC_008508	CTTTT	2	10	144377	144386	0 %	80 %	0 %	20 %	116326957
117	NC_008508	TTTTC	2	10	146636	146645	0 %	80 %	0 %	20 %	116326959
118	NC_008508	AAAAG	2	10	148974	148983	80 %	0 %	20 %	0 %	116326961
119	NC_008508	ACCGA	2	10	151561	151570	40 %	0 %	20 %	40 %	116326963
120	NC_008508	CCATA	2	10	152444	152453	40 %	20 %	0 %	40 %	116326964
121	NC_008508	TTACT	2	10	153540	153549	20 %	60 %	0 %	20 %	116326966
122	NC_008508	GGAAA	2	10	153942	153951	60 %	0 %	40 %	0 %	116326966
123	NC_008508	ATCGA	2	10	154404	154413	40 %	20 %	20 %	20 %	116326967
124	NC_008508	GGAAA	2	10	157948	157957	60 %	0 %	40 %	0 %	116326970
125	NC_008508	CATTC	2	10	160631	160640	20 %	40 %	0 %	40 %	116326971
126	NC_008508	TTTGA	2	10	160665	160674	20 %	60 %	20 %	0 %	116326971
127	NC_008508	CTTTT	2	10	160778	160787	0 %	80 %	0 %	20 %	116326971
128	NC_008508	AAATG	2	10	161534	161543	60 %	20 %	20 %	0 %	116326972
129	NC_008508	GTAAA	2	10	163029	163038	60 %	20 %	20 %	0 %	116326973
130	NC_008508	GAAAA	2	10	164556	164565	80 %	0 %	20 %	0 %	116326974
131	NC_008508	ACGTA	2	10	166891	166900	40 %	20 %	20 %	20 %	116326976
132	NC_008508	GAAGC	2	10	167456	167465	40 %	0 %	40 %	20 %	116326976
133	NC_008508	TTCCG	2	10	167924	167933	0 %	40 %	20 %	40 %	116326977
134	NC_008508	ACATT	2	10	174043	174052	40 %	40 %	0 %	20 %	116326979
135	NC_008508	AAAGG	2	10	178308	178317	60 %	0 %	40 %	0 %	116326981
136	NC_008508	GAAAT	2	10	180333	180342	60 %	20 %	20 %	0 %	116326983
137	NC_008508	CATTT	2	10	185456	185465	20 %	60 %	0 %	20 %	116326987
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177	NC_008508	AAGGC	2	10	246675	246684	40 %	0 %	40 %	20 %	116327034
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