MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 53673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008508	AC	3	6	101604	101609	50 %	0 %	0 %	50 %	116326925
1502	NC_008508	ATCTT	2	10	101756	101765	20 %	60 %	0 %	20 %	116326925
1503	NC_008508	T	6	6	101772	101777	0 %	100 %	0 %	0 %	116326926
1504	NC_008508	AGA	2	6	101887	101892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326926
1505	NC_008508	AAGCCA	2	12	101955	101966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116326926
1506	NC_008508	GTA	2	6	102097	102102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326926
1507	NC_008508	A	8	8	102102	102109	100 %	0 %	0 %	0 %	116326926
1508	NC_008508	AAAT	2	8	102112	102119	75 %	25 %	0 %	0 %	116326926
1509	NC_008508	ATA	2	6	102128	102133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326926
1510	NC_008508	A	6	6	102711	102716	100 %	0 %	0 %	0 %	116326927
1511	NC_008508	GAA	2	6	102731	102736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326927
1512	NC_008508	TTC	2	6	102755	102760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326927
1513	NC_008508	CGA	2	6	102776	102781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326927
1514	NC_008508	CAAC	2	8	102877	102884	50 %	0 %	0 %	50 %	116326927
1515	NC_008508	GATC	2	8	102953	102960	25 %	25 %	25 %	25 %	116326927
1516	NC_008508	GAT	2	6	102963	102968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326927
1517	NC_008508	GAAT	2	8	103020	103027	50 %	25 %	25 %	0 %	116326927
1518	NC_008508	T	6	6	103049	103054	0 %	100 %	0 %	0 %	116326928
1519	NC_008508	TTCT	2	8	103087	103094	0 %	75 %	0 %	25 %	116326928
1520	NC_008508	T	6	6	103139	103144	0 %	100 %	0 %	0 %	116326928
1521	NC_008508	TCA	2	6	103207	103212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326928
1522	NC_008508	T	9	9	103247	103255	0 %	100 %	0 %	0 %	116326928
1523	NC_008508	A	7	7	103275	103281	100 %	0 %	0 %	0 %	116326928
1524	NC_008508	GAA	2	6	103379	103384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326928
1525	NC_008508	GAC	2	6	103400	103405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326928
1526	NC_008508	GAC	2	6	103429	103434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326928
1527	NC_008508	AAAGA	2	10	103476	103485	80 %	0 %	20 %	0 %	116326928
1528	NC_008508	A	6	6	103519	103524	100 %	0 %	0 %	0 %	116326928
1529	NC_008508	A	6	6	103533	103538	100 %	0 %	0 %	0 %	116326928
1530	NC_008508	A	9	9	103614	103622	100 %	0 %	0 %	0 %	116326928
1531	NC_008508	T	8	8	103786	103793	0 %	100 %	0 %	0 %	116326929
1532	NC_008508	CTT	2	6	103869	103874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326929
1533	NC_008508	A	6	6	103890	103895	100 %	0 %	0 %	0 %	116326929
1534	NC_008508	CGA	2	6	103918	103923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326929
1535	NC_008508	T	7	7	103942	103948	0 %	100 %	0 %	0 %	116326929
1536	NC_008508	T	6	6	103978	103983	0 %	100 %	0 %	0 %	116326929
1537	NC_008508	TAT	2	6	104030	104035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326929
1538	NC_008508	CAA	2	6	104160	104165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326929
1539	NC_008508	CCT	2	6	104179	104184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326929
1540	NC_008508	CTTT	2	8	104283	104290	0 %	75 %	0 %	25 %	116326929
1541	NC_008508	ACCGGA	2	12	104343	104354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326929
1542	NC_008508	ATT	2	6	104367	104372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326929
1543	NC_008508	T	6	6	104416	104421	0 %	100 %	0 %	0 %	116326929
1544	NC_008508	TCAA	2	8	104491	104498	50 %	25 %	0 %	25 %	116326929
1545	NC_008508	ATGG	2	8	104550	104557	25 %	25 %	50 %	0 %	116326929
1546	NC_008508	T	6	6	104560	104565	0 %	100 %	0 %	0 %	116326929
1547	NC_008508	TTA	2	6	104570	104575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326929
1548	NC_008508	T	6	6	104610	104615	0 %	100 %	0 %	0 %	116326929
1549	NC_008508	GAG	2	6	104691	104696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326929
1550	NC_008508	A	6	6	104704	104709	100 %	0 %	0 %	0 %	116326929
1551	NC_008508	CAATT	2	10	104993	105002	40 %	40 %	0 %	20 %	116326930
1552	NC_008508	AGG	2	6	105033	105038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326930
1553	NC_008508	T	6	6	105045	105050	0 %	100 %	0 %	0 %	116326930
1554	NC_008508	A	7	7	105176	105182	100 %	0 %	0 %	0 %	116326930
1555	NC_008508	A	6	6	105223	105228	100 %	0 %	0 %	0 %	116326930
1556	NC_008508	A	6	6	105230	105235	100 %	0 %	0 %	0 %	116326930
1557	NC_008508	ATTTTG	2	12	105276	105287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116326930
1558	NC_008508	A	6	6	106882	106887	100 %	0 %	0 %	0 %	116326931
1559	NC_008508	T	7	7	107002	107008	0 %	100 %	0 %	0 %	116326931
1560	NC_008508	AT	3	6	107048	107053	50 %	50 %	0 %	0 %	116326931
1561	NC_008508	CTT	2	6	107250	107255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326931
1562	NC_008508	GGC	2	6	107332	107337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326931
1563	NC_008508	TCC	2	6	107366	107371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326931
1564	NC_008508	T	6	6	107380	107385	0 %	100 %	0 %	0 %	116326931
1565	NC_008508	AGA	2	6	107398	107403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326931
1566	NC_008508	GTTT	2	8	107422	107429	0 %	75 %	25 %	0 %	116326931
1567	NC_008508	T	6	6	107462	107467	0 %	100 %	0 %	0 %	116326931
1568	NC_008508	TAT	2	6	107481	107486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326931
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1570	NC_008508	TG	3	6	107563	107568	0 %	50 %	50 %	0 %	116326931
1571	NC_008508	T	8	8	107578	107585	0 %	100 %	0 %	0 %	116326931
1572	NC_008508	AAT	2	6	107590	107595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326931
1573	NC_008508	T	7	7	107625	107631	0 %	100 %	0 %	0 %	116326931
1574	NC_008508	GAAAA	2	10	107687	107696	80 %	0 %	20 %	0 %	116326931
1575	NC_008508	AG	3	6	107697	107702	50 %	0 %	50 %	0 %	116326931
1576	NC_008508	CTT	2	6	107703	107708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326931
1577	NC_008508	TGA	2	6	107715	107720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326931
1578	NC_008508	T	9	9	107750	107758	0 %	100 %	0 %	0 %	116326931
1579	NC_008508	TCTT	2	8	107765	107772	0 %	75 %	0 %	25 %	116326931
1580	NC_008508	CTT	2	6	107805	107810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326931
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1582	NC_008508	ATCG	2	8	108860	108867	25 %	25 %	25 %	25 %	116326932
1583	NC_008508	GTT	2	6	108870	108875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326932
1584	NC_008508	TC	3	6	108891	108896	0 %	50 %	0 %	50 %	116326932
1585	NC_008508	GCC	2	6	108936	108941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326932
1586	NC_008508	ATCG	2	8	108965	108972	25 %	25 %	25 %	25 %	116326932
1587	NC_008508	T	6	6	109034	109039	0 %	100 %	0 %	0 %	116326932
1588	NC_008508	TTAAA	2	10	109066	109075	60 %	40 %	0 %	0 %	116326932
1589	NC_008508	CTC	2	6	109085	109090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326932
1590	NC_008508	TAC	2	6	109102	109107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326932
1591	NC_008508	A	6	6	109120	109125	100 %	0 %	0 %	0 %	116326932
1592	NC_008508	AATT	2	8	109141	109148	50 %	50 %	0 %	0 %	116326932
1593	NC_008508	GAAA	2	8	109190	109197	75 %	0 %	25 %	0 %	116326932
1594	NC_008508	AAAC	2	8	109251	109258	75 %	0 %	0 %	25 %	116326932
1595	NC_008508	ACG	2	6	109397	109402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326933
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1597	NC_008508	AACA	2	8	109427	109434	75 %	0 %	0 %	25 %	116326933
1598	NC_008508	CTT	2	6	109485	109490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326933
1599	NC_008508	TCGA	2	8	109541	109548	25 %	25 %	25 %	25 %	116326933
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1603	NC_008508	ACC	2	6	109670	109675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326933
1604	NC_008508	TCT	2	6	109703	109708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326933
1605	NC_008508	CGT	2	6	109753	109758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326933
1606	NC_008508	GA	3	6	109901	109906	50 %	0 %	50 %	0 %	116326933
1607	NC_008508	TTC	2	6	109981	109986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326933
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1609	NC_008508	TAA	2	6	110065	110070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326933
1610	NC_008508	AGA	2	6	110211	110216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326933
1611	NC_008508	CTTT	2	8	110310	110317	0 %	75 %	0 %	25 %	116326933
1612	NC_008508	TCAA	2	8	110463	110470	50 %	25 %	0 %	25 %	116326933
1613	NC_008508	AAG	2	6	110481	110486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326933
1614	NC_008508	TTC	2	6	110506	110511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326933
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1621	NC_008508	CGC	3	9	110854	110862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326933
1622	NC_008508	GTGG	2	8	110876	110883	0 %	25 %	75 %	0 %	116326933
1623	NC_008508	GAA	2	6	110922	110927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326933
1624	NC_008508	AAT	2	6	110957	110962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326933
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1626	NC_008508	GAT	2	6	110993	110998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326933
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1629	NC_008508	GAT	2	6	111181	111186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326933
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1998	NC_008508	TGA	2	6	134939	134944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326951
1999	NC_008508	TGAA	2	8	134951	134958	50 %	25 %	25 %	0 %	116326951
2000	NC_008508	CGC	2	6	134995	135000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326951

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