MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 5

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008507	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326646
2	NC_008507	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
3	NC_008507	TCA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326646
4	NC_008507	CAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326646
5	NC_008507	ATG	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326646
6	NC_008507	TGT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326646
7	NC_008507	CAA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326646
8	NC_008507	GAA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
9	NC_008507	AAT	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326646
10	NC_008507	GAA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
11	NC_008507	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326646
12	NC_008507	CCT	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326647
13	NC_008507	GAT	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326647
14	NC_008507	ATA	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326647
15	NC_008507	TCA	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326647
16	NC_008507	TGT	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326647
17	NC_008507	TAT	2	6	2317	2322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326647
18	NC_008507	TTA	2	6	2461	2466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326648
19	NC_008507	TGA	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326648
20	NC_008507	TTA	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326648
21	NC_008507	TTC	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326648
22	NC_008507	AAG	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326648
23	NC_008507	TCA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
24	NC_008507	CAT	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
25	NC_008507	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326648
26	NC_008507	ATC	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
27	NC_008507	TCT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326648
28	NC_008507	AGA	2	6	3311	3316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
29	NC_008507	ATT	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
30	NC_008507	TTA	2	6	3400	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
31	NC_008507	TAA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
32	NC_008507	TAA	2	6	3632	3637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
33	NC_008507	AAT	2	6	3648	3653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
34	NC_008507	GAA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
35	NC_008507	GAA	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
36	NC_008507	ACA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326649
37	NC_008507	TAA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
38	NC_008507	GTT	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326649
39	NC_008507	ATA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
40	NC_008507	CTA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326649
41	NC_008507	ATT	2	6	3912	3917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
42	NC_008507	ATG	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326649
43	NC_008507	CTA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326649
44	NC_008507	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
45	NC_008507	ATC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326650
46	NC_008507	ATT	2	6	4381	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
47	NC_008507	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326650
48	NC_008507	ACC	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326650
49	NC_008507	CAG	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326650
50	NC_008507	TTC	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326650
51	NC_008507	GAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326650
52	NC_008507	AAT	2	6	4741	4746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326650
53	NC_008507	TTA	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
54	NC_008507	TCC	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326650
55	NC_008507	ATT	2	6	5026	5031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
56	NC_008507	TTG	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326650
57	NC_008507	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
58	NC_008507	TGG	2	6	5246	5251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326651
59	NC_008507	TCA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
60	NC_008507	TAA	2	6	5290	5295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
61	NC_008507	TAG	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
62	NC_008507	ATC	2	6	5327	5332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
63	NC_008507	ATC	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
64	NC_008507	AAT	2	6	5396	5401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
65	NC_008507	AAC	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326651
66	NC_008507	AAT	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
67	NC_008507	TCT	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
68	NC_008507	GTT	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326651
69	NC_008507	ATA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
70	NC_008507	ATC	3	9	5741	5749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
71	NC_008507	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
72	NC_008507	ATA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
73	NC_008507	CAG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326651
74	NC_008507	TCA	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
75	NC_008507	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
76	NC_008507	TAG	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
77	NC_008507	TCT	3	9	6297	6305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
78	NC_008507	AAT	2	6	6325	6330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
79	NC_008507	TTA	2	6	6357	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
80	NC_008507	AAT	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
81	NC_008507	TAA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
82	NC_008507	ATC	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
83	NC_008507	TAA	2	6	6496	6501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
84	NC_008507	TTC	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
85	NC_008507	CTG	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326651
86	NC_008507	ACT	2	6	6770	6775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
87	NC_008507	AAT	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
88	NC_008507	TAT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
89	NC_008507	GGA	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326651
90	NC_008507	ATA	2	6	6891	6896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
91	NC_008507	CTT	2	6	6910	6915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
92	NC_008507	CAT	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
93	NC_008507	ATC	3	9	6953	6961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
94	NC_008507	TCA	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
95	NC_008507	CAT	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
96	NC_008507	GAA	2	6	7379	7384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326651
97	NC_008507	AAT	2	6	7403	7408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
98	NC_008507	TCT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
99	NC_008507	TCA	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
100	NC_008507	TGT	2	6	7665	7670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326651
101	NC_008507	ATG	2	6	7672	7677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
102	NC_008507	AGT	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
103	NC_008507	ATA	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
104	NC_008507	AAG	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326651
105	NC_008507	TCA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
106	NC_008507	TTA	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
107	NC_008507	ACT	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
108	NC_008507	TTC	2	6	8441	8446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
109	NC_008507	CAT	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
110	NC_008507	CAT	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
111	NC_008507	CAT	2	6	8569	8574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
112	NC_008507	TGC	2	6	8630	8635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326651
113	NC_008507	TCA	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
114	NC_008507	GAA	2	6	8711	8716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326651
115	NC_008507	TCA	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
116	NC_008507	TGA	2	6	8747	8752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
117	NC_008507	CTT	2	6	8881	8886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
118	NC_008507	TCA	2	6	8922	8927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
119	NC_008507	ATA	2	6	8931	8936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
120	NC_008507	CTT	2	6	8956	8961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
121	NC_008507	AAC	2	6	9005	9010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326651
122	NC_008507	ATT	2	6	9191	9196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
123	NC_008507	ATC	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
124	NC_008507	ATA	2	6	9587	9592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
125	NC_008507	CAA	2	6	9610	9615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326651
126	NC_008507	ATC	2	6	9887	9892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
127	NC_008507	CCA	2	6	9931	9936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326652
128	NC_008507	TTC	3	9	9985	9993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326652
129	NC_008507	TTC	2	6	10027	10032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326652
130	NC_008507	CGA	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326652
131	NC_008507	TCC	2	6	10070	10075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326652
132	NC_008507	GTT	3	9	10155	10163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326652
133	NC_008507	TTC	2	6	10258	10263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326652
134	NC_008507	TTA	2	6	10433	10438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326652
135	NC_008507	TAT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326652
136	NC_008507	TTC	2	6	10637	10642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326653
137	NC_008507	CTT	2	6	10696	10701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326653
138	NC_008507	CTT	2	6	10707	10712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326653
139	NC_008507	GTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326653
140	NC_008507	CTT	2	6	10882	10887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326653
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.