MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008506	TAA	2	6	32706	32711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326634
502	NC_008506	A	8	8	32720	32727	100 %	0 %	0 %	0 %	116326634
503	NC_008506	GAAA	2	8	32771	32778	75 %	0 %	25 %	0 %	116326634
504	NC_008506	CAA	2	6	32786	32791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326634
505	NC_008506	ACAA	2	8	32891	32898	75 %	0 %	0 %	25 %	116326634
506	NC_008506	AAAGA	2	10	32920	32929	80 %	0 %	20 %	0 %	116326634
507	NC_008506	CAAA	2	8	32932	32939	75 %	0 %	0 %	25 %	116326634
508	NC_008506	AAC	2	6	33052	33057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326634
509	NC_008506	CAAGAA	2	12	33100	33111	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116326634
510	NC_008506	AAG	2	6	33140	33145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326634
511	NC_008506	TAAA	2	8	33170	33177	75 %	25 %	0 %	0 %	116326634
512	NC_008506	CAA	2	6	33325	33330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326634
513	NC_008506	CA	3	6	33341	33346	50 %	0 %	0 %	50 %	116326634
514	NC_008506	TGA	2	6	33389	33394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326634
515	NC_008506	AAG	2	6	33413	33418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326634
516	NC_008506	AAAG	2	8	33466	33473	75 %	0 %	25 %	0 %	116326634
517	NC_008506	CGA	2	6	33489	33494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326634
518	NC_008506	A	6	6	33499	33504	100 %	0 %	0 %	0 %	116326634
519	NC_008506	TAC	2	6	33565	33570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326634
520	NC_008506	AAC	2	6	33576	33581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326634
521	NC_008506	AGCA	2	8	33610	33617	50 %	0 %	25 %	25 %	116326634
522	NC_008506	TGAA	2	8	33620	33627	50 %	25 %	25 %	0 %	116326634
523	NC_008506	GAA	2	6	33679	33684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326634
524	NC_008506	AGT	2	6	33687	33692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326634
525	NC_008506	CAA	2	6	33737	33742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326634
526	NC_008506	GCTT	2	8	33749	33756	0 %	50 %	25 %	25 %	116326634
527	NC_008506	AGA	2	6	33768	33773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326634
528	NC_008506	CACT	2	8	33780	33787	25 %	25 %	0 %	50 %	116326634
529	NC_008506	AATG	2	8	33844	33851	50 %	25 %	25 %	0 %	116326634
530	NC_008506	GCAA	2	8	33881	33888	50 %	0 %	25 %	25 %	116326634
531	NC_008506	A	7	7	33947	33953	100 %	0 %	0 %	0 %	116326634
532	NC_008506	GAA	2	6	33958	33963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326634
533	NC_008506	A	7	7	33962	33968	100 %	0 %	0 %	0 %	116326634
534	NC_008506	CTA	2	6	33969	33974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326634
535	NC_008506	CAA	2	6	33978	33983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326634
536	NC_008506	AAT	2	6	33988	33993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326634
537	NC_008506	GAA	3	9	34080	34088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326634
538	NC_008506	GTT	2	6	34188	34193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326635
539	NC_008506	TTC	2	6	34249	34254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326635
540	NC_008506	TA	3	6	34264	34269	50 %	50 %	0 %	0 %	116326635
541	NC_008506	CGT	2	6	34338	34343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326635
542	NC_008506	TA	3	6	34411	34416	50 %	50 %	0 %	0 %	116326635
543	NC_008506	GCT	2	6	34527	34532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326635
544	NC_008506	TTTC	2	8	34544	34551	0 %	75 %	0 %	25 %	116326635
545	NC_008506	TCT	2	6	34672	34677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326635
546	NC_008506	GTA	2	6	34728	34733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326635
547	NC_008506	GTA	2	6	34802	34807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326635
548	NC_008506	AAT	2	6	34820	34825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326635
549	NC_008506	T	6	6	34832	34837	0 %	100 %	0 %	0 %	116326635
550	NC_008506	ACA	2	6	35333	35338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326636
551	NC_008506	AGTC	2	8	35339	35346	25 %	25 %	25 %	25 %	116326636
552	NC_008506	CAAAGG	2	12	35428	35439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116326636
553	NC_008506	AT	3	6	35494	35499	50 %	50 %	0 %	0 %	116326636
554	NC_008506	G	7	7	35530	35536	0 %	0 %	100 %	0 %	116326636
555	NC_008506	TATT	2	8	35549	35556	25 %	75 %	0 %	0 %	116326636
556	NC_008506	AT	3	6	35602	35607	50 %	50 %	0 %	0 %	116326636
557	NC_008506	GCT	2	6	35609	35614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326636
558	NC_008506	CGAG	2	8	35657	35664	25 %	0 %	50 %	25 %	116326636
559	NC_008506	A	6	6	35672	35677	100 %	0 %	0 %	0 %	116326636
560	NC_008506	TTTA	2	8	35760	35767	25 %	75 %	0 %	0 %	116326636
561	NC_008506	GTC	2	6	35786	35791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326636
562	NC_008506	TTA	2	6	35799	35804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326636
563	NC_008506	ATT	2	6	35824	35829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326636
564	NC_008506	GTT	2	6	35830	35835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326636
565	NC_008506	TGTT	2	8	35901	35908	0 %	75 %	25 %	0 %	116326636
566	NC_008506	G	6	6	35937	35942	0 %	0 %	100 %	0 %	116326636
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568	NC_008506	ATT	2	6	36032	36037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326636
569	NC_008506	GATGAA	2	12	36110	36121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116326636
570	NC_008506	T	7	7	36178	36184	0 %	100 %	0 %	0 %	116326636
571	NC_008506	CAT	2	6	36246	36251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326636
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573	NC_008506	ATT	2	6	36340	36345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326636
574	NC_008506	ATTC	2	8	36421	36428	25 %	50 %	0 %	25 %	116326636
575	NC_008506	ATT	2	6	36503	36508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326636
576	NC_008506	CA	3	6	36536	36541	50 %	0 %	0 %	50 %	116326636
577	NC_008506	TCT	2	6	36573	36578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326636
578	NC_008506	ATT	2	6	36610	36615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326636
579	NC_008506	ATG	2	6	36617	36622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326636
580	NC_008506	GATTG	2	10	36721	36730	20 %	40 %	40 %	0 %	116326636
581	NC_008506	T	7	7	36748	36754	0 %	100 %	0 %	0 %	116326636
582	NC_008506	TCG	2	6	36813	36818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326636
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585	NC_008506	A	6	6	36869	36874	100 %	0 %	0 %	0 %	116326636
586	NC_008506	AATT	2	8	36882	36889	50 %	50 %	0 %	0 %	116326636
587	NC_008506	TGA	2	6	36921	36926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326637
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589	NC_008506	ACAA	2	8	37130	37137	75 %	0 %	0 %	25 %	116326637
590	NC_008506	A	6	6	37158	37163	100 %	0 %	0 %	0 %	116326637
591	NC_008506	TTA	2	6	37337	37342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326637
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593	NC_008506	TTC	2	6	37525	37530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326638
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595	NC_008506	CGT	2	6	37614	37619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326638
596	NC_008506	TA	3	6	37687	37692	50 %	50 %	0 %	0 %	116326638
597	NC_008506	GCT	2	6	37803	37808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326638
598	NC_008506	TTTC	2	8	37820	37827	0 %	75 %	0 %	25 %	116326638
599	NC_008506	TCT	2	6	37948	37953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326638
600	NC_008506	GTA	2	6	38004	38009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326638
601	NC_008506	GTA	2	6	38078	38083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326638
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608	NC_008506	TCA	2	6	38801	38806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326639
609	NC_008506	CTT	2	6	38845	38850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326639
610	NC_008506	T	6	6	38855	38860	0 %	100 %	0 %	0 %	116326639
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612	NC_008506	ATT	3	9	38965	38973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326639
613	NC_008506	T	6	6	38972	38977	0 %	100 %	0 %	0 %	116326639
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616	NC_008506	TGT	2	6	39165	39170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326639
617	NC_008506	AG	3	6	39177	39182	50 %	0 %	50 %	0 %	116326639
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621	NC_008506	T	7	7	39422	39428	0 %	100 %	0 %	0 %	116326639
622	NC_008506	T	7	7	39465	39471	0 %	100 %	0 %	0 %	116326639
623	NC_008506	ATT	2	6	39547	39552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326640
624	NC_008506	ATC	2	6	39642	39647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326640
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628	NC_008506	AAT	2	6	40106	40111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326640
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