MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008505	GAAT	2	8	34808	34815	50 %	25 %	25 %	0 %	116326576
502	NC_008505	TTTTG	2	10	34822	34831	0 %	80 %	20 %	0 %	116326576
503	NC_008505	ACA	2	6	34867	34872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326576
504	NC_008505	GTC	2	6	34876	34881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326576
505	NC_008505	A	6	6	34921	34926	100 %	0 %	0 %	0 %	116326576
506	NC_008505	T	6	6	34940	34945	0 %	100 %	0 %	0 %	116326576
507	NC_008505	ATC	2	6	34960	34965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326576
508	NC_008505	ATC	2	6	34983	34988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326576
509	NC_008505	AT	3	6	35041	35046	50 %	50 %	0 %	0 %	116326576
510	NC_008505	TCGT	2	8	35049	35056	0 %	50 %	25 %	25 %	116326576
511	NC_008505	ACA	2	6	35071	35076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326576
512	NC_008505	TAA	2	6	35109	35114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326576
513	NC_008505	T	6	6	35119	35124	0 %	100 %	0 %	0 %	116326576
514	NC_008505	TAT	2	6	35307	35312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326577
515	NC_008505	T	6	6	35340	35345	0 %	100 %	0 %	0 %	116326577
516	NC_008505	T	6	6	35353	35358	0 %	100 %	0 %	0 %	116326577
517	NC_008505	CT	3	6	35386	35391	0 %	50 %	0 %	50 %	116326577
518	NC_008505	ACT	2	6	35405	35410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326577
519	NC_008505	TCTT	2	8	35414	35421	0 %	75 %	0 %	25 %	116326577
520	NC_008505	TTC	2	6	35743	35748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326578
521	NC_008505	TA	3	6	35758	35763	50 %	50 %	0 %	0 %	116326578
522	NC_008505	CGT	2	6	35832	35837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326578
523	NC_008505	TA	3	6	35905	35910	50 %	50 %	0 %	0 %	116326578
524	NC_008505	GCT	2	6	36021	36026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326578
525	NC_008505	TTTC	2	8	36038	36045	0 %	75 %	0 %	25 %	116326578
526	NC_008505	TCT	2	6	36166	36171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326578
527	NC_008505	GTA	2	6	36222	36227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326578
528	NC_008505	GTA	2	6	36296	36301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326578
529	NC_008505	AAT	2	6	36314	36319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326578
530	NC_008505	T	6	6	36326	36331	0 %	100 %	0 %	0 %	116326578
531	NC_008505	GAA	2	6	36650	36655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326579
532	NC_008505	TGT	2	6	36664	36669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326579
533	NC_008505	A	8	8	36674	36681	100 %	0 %	0 %	0 %	116326579
534	NC_008505	TTA	2	6	36684	36689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326579
535	NC_008505	TGCAGT	2	12	36745	36756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116326579
536	NC_008505	ATT	2	6	36824	36829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326579
537	NC_008505	AGC	2	6	36835	36840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326579
538	NC_008505	GTT	2	6	36896	36901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326579
539	NC_008505	AAT	2	6	36938	36943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326579
540	NC_008505	TGG	2	6	37063	37068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326579
541	NC_008505	AAC	2	6	37073	37078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326579
542	NC_008505	TGG	2	6	37084	37089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326579
543	NC_008505	AGA	2	6	37100	37105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326579
544	NC_008505	TGA	2	6	37144	37149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326579
545	NC_008505	ATT	2	6	37211	37216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326579
546	NC_008505	TTTGA	2	10	37238	37247	20 %	60 %	20 %	0 %	116326579
547	NC_008505	CAT	2	6	37268	37273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326579
548	NC_008505	CAT	2	6	37286	37291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326579
549	NC_008505	A	7	7	37427	37433	100 %	0 %	0 %	0 %	116326579
550	NC_008505	AAT	2	6	37457	37462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326579
551	NC_008505	TCG	2	6	37483	37488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326579
552	NC_008505	GAC	2	6	37498	37503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326579
553	NC_008505	AT	3	6	37531	37536	50 %	50 %	0 %	0 %	116326579
554	NC_008505	A	6	6	37596	37601	100 %	0 %	0 %	0 %	116326579
555	NC_008505	ATTT	2	8	37719	37726	25 %	75 %	0 %	0 %	116326579
556	NC_008505	GAT	2	6	37751	37756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326579
557	NC_008505	GAA	2	6	37811	37816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326579
558	NC_008505	ACT	2	6	37860	37865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326579
559	NC_008505	TAT	2	6	38060	38065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326579
560	NC_008505	ACTT	2	8	38070	38077	25 %	50 %	0 %	25 %	116326579
561	NC_008505	A	6	6	38135	38140	100 %	0 %	0 %	0 %	116326579
562	NC_008505	GCA	2	6	38213	38218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326579
563	NC_008505	AAAC	2	8	38282	38289	75 %	0 %	0 %	25 %	116326579
564	NC_008505	TAAAA	2	10	38315	38324	80 %	20 %	0 %	0 %	116326579
565	NC_008505	T	7	7	38400	38406	0 %	100 %	0 %	0 %	116326580
566	NC_008505	AATTG	2	10	38430	38439	40 %	40 %	20 %	0 %	116326580
567	NC_008505	TTTG	2	8	38458	38465	0 %	75 %	25 %	0 %	116326580
568	NC_008505	TAT	2	6	38476	38481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326580
569	NC_008505	TTC	2	6	38516	38521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326580
570	NC_008505	GTA	2	6	38543	38548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326580
571	NC_008505	TC	3	6	38661	38666	0 %	50 %	0 %	50 %	116326580
572	NC_008505	ATTG	2	8	38757	38764	25 %	50 %	25 %	0 %	116326580
573	NC_008505	TAAA	2	8	38809	38816	75 %	25 %	0 %	0 %	116326580
574	NC_008505	ATA	2	6	38861	38866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326580
575	NC_008505	TGT	2	6	38885	38890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326580
576	NC_008505	T	6	6	38893	38898	0 %	100 %	0 %	0 %	116326580
577	NC_008505	ATTT	2	8	38932	38939	25 %	75 %	0 %	0 %	116326580
578	NC_008505	CTT	2	6	39020	39025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326580
579	NC_008505	CTT	2	6	39041	39046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326580
580	NC_008505	AAT	3	9	39184	39192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326580
581	NC_008505	TATTT	2	10	40073	40082	20 %	80 %	0 %	0 %	116326581
582	NC_008505	CAAA	2	8	40100	40107	75 %	0 %	0 %	25 %	116326581
583	NC_008505	AAT	2	6	40156	40161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326581
584	NC_008505	TTC	2	6	40218	40223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326581
585	NC_008505	TGTC	2	8	40250	40257	0 %	50 %	25 %	25 %	116326581
586	NC_008505	GCA	2	6	40327	40332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326581
587	NC_008505	GCT	2	6	40360	40365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326581
588	NC_008505	CAGA	2	8	40442	40449	50 %	0 %	25 %	25 %	116326581
589	NC_008505	TTA	2	6	40474	40479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326581
590	NC_008505	ATC	2	6	40494	40499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326581
591	NC_008505	GTAA	2	8	40509	40516	50 %	25 %	25 %	0 %	116326581
592	NC_008505	CAAGTC	2	12	40628	40639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116326581
593	NC_008505	CAG	2	6	40640	40645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326581
594	NC_008505	T	6	6	40698	40703	0 %	100 %	0 %	0 %	116326581
595	NC_008505	CTT	2	6	40706	40711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326581
596	NC_008505	TATT	2	8	40712	40719	25 %	75 %	0 %	0 %	116326581
597	NC_008505	GAAC	2	8	40795	40802	50 %	0 %	25 %	25 %	116326581
598	NC_008505	TCA	3	9	40819	40827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326581
599	NC_008505	AGGA	2	8	40830	40837	50 %	0 %	50 %	0 %	116326581
600	NC_008505	AAT	2	6	40923	40928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326581
601	NC_008505	GCT	2	6	40946	40951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326581
602	NC_008505	TGG	2	6	41010	41015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326581
603	NC_008505	CATC	2	8	41087	41094	25 %	25 %	0 %	50 %	116326581
604	NC_008505	TTTGC	2	10	41122	41131	0 %	60 %	20 %	20 %	116326581
605	NC_008505	T	6	6	41176	41181	0 %	100 %	0 %	0 %	116326581
606	NC_008505	T	8	8	41208	41215	0 %	100 %	0 %	0 %	116326581
607	NC_008505	CCA	2	6	41299	41304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326581
608	NC_008505	ACG	2	6	41329	41334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326581
609	NC_008505	CAA	2	6	41393	41398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326581
610	NC_008505	T	6	6	41404	41409	0 %	100 %	0 %	0 %	116326581
611	NC_008505	T	7	7	41417	41423	0 %	100 %	0 %	0 %	116326581
612	NC_008505	CAA	2	6	41608	41613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326582
613	NC_008505	TGC	2	6	41630	41635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326582
614	NC_008505	CTT	2	6	41644	41649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326582
615	NC_008505	AACGTG	2	12	41678	41689	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116326582
616	NC_008505	CA	3	6	41726	41731	50 %	0 %	0 %	50 %	116326582
617	NC_008505	TGA	2	6	41836	41841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326582
618	NC_008505	TCC	2	6	41871	41876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326582
619	NC_008505	TAT	2	6	41938	41943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326582
620	NC_008505	CAT	2	6	41948	41953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326582
621	NC_008505	ACC	2	6	41966	41971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326582
622	NC_008505	ACG	2	6	42156	42161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326582
623	NC_008505	ATT	2	6	42452	42457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326583
624	NC_008505	TAA	2	6	42486	42491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326583
625	NC_008505	AGA	2	6	42541	42546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326583
626	NC_008505	AAT	2	6	42564	42569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326583
627	NC_008505	TGC	2	6	42576	42581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326583
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629	NC_008505	T	9	9	42635	42643	0 %	100 %	0 %	0 %	116326583
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