MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008504	TAT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
2	NC_008504	TAT	2	6	147	152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
3	NC_008504	TTA	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
4	NC_008504	TCT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326541
5	NC_008504	ATT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
6	NC_008504	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
7	NC_008504	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326541
8	NC_008504	TAA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326541
9	NC_008504	TGT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326541
10	NC_008504	ACG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326542
11	NC_008504	CAA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326542
12	NC_008504	GAA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326542
13	NC_008504	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
14	NC_008504	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
15	NC_008504	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326543
16	NC_008504	TGG	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326543
17	NC_008504	AGG	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326543
18	NC_008504	TAT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
19	NC_008504	GGT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326544
20	NC_008504	TCA	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326544
21	NC_008504	TAT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
22	NC_008504	AAG	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
23	NC_008504	AAG	2	6	7410	7415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
24	NC_008504	ATT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326544
25	NC_008504	GAA	2	6	7796	7801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
26	NC_008504	ATA	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326544
27	NC_008504	GAA	2	6	7885	7890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
28	NC_008504	AAG	2	6	7938	7943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
29	NC_008504	AGA	2	6	7966	7971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
30	NC_008504	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
31	NC_008504	GAA	2	6	8206	8211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326544
32	NC_008504	AGG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326545
33	NC_008504	AGG	2	6	8348	8353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326545
34	NC_008504	TAT	3	9	8399	8407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326545
35	NC_008504	TAA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326545
36	NC_008504	TAT	2	6	8714	8719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326545
37	NC_008504	CTA	2	6	8918	8923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326546
38	NC_008504	AGA	2	6	9232	9237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326546
39	NC_008504	AGA	2	6	9391	9396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326546
40	NC_008504	TGG	2	6	9416	9421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326546
41	NC_008504	GAT	2	6	9439	9444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.