MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008498	TAA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334868
2	NC_008498	AAG	2	6	782	787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334868
3	NC_008498	ACT	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334868
4	NC_008498	TCA	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334868
5	NC_008498	CAA	2	6	849	854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334868
6	NC_008498	ACC	2	6	919	924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334868
7	NC_008498	AAT	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334868
8	NC_008498	CTG	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334868
9	NC_008498	TTC	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334868
10	NC_008498	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334869
11	NC_008498	ATT	2	6	1904	1909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334869
12	NC_008498	TTA	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334869
13	NC_008498	TCT	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
14	NC_008498	ATC	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334869
15	NC_008498	ATT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334869
16	NC_008498	CCA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334869
17	NC_008498	ATC	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334869
18	NC_008498	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334869
19	NC_008498	GAA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334869
20	NC_008498	TAA	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334869
21	NC_008498	TCT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
22	NC_008498	CTT	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
23	NC_008498	CTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334869
24	NC_008498	CAT	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334870
25	NC_008498	ATC	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334870
26	NC_008498	CTT	2	6	3127	3132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334870
27	NC_008498	TGT	2	6	3197	3202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334870
28	NC_008498	TGG	2	6	3560	3565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
29	NC_008498	GCA	2	6	3594	3599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334871
30	NC_008498	CTG	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334871
31	NC_008498	TTA	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334871
32	NC_008498	TGG	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
33	NC_008498	TGG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
34	NC_008498	AAG	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334871
35	NC_008498	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334871
36	NC_008498	ATT	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334871
37	NC_008498	TGA	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334871
38	NC_008498	CGA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334871
39	NC_008498	ATC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334871
40	NC_008498	CAA	2	6	4799	4804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334871
41	NC_008498	GGT	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334871
42	NC_008498	TCG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334871
43	NC_008498	CTT	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334871
44	NC_008498	CAA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334871
45	NC_008498	GAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334871
46	NC_008498	TGA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334872
47	NC_008498	TGC	2	6	5263	5268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334872
48	NC_008498	GCA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334872
49	NC_008498	CCA	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334872
50	NC_008498	TGC	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334873
51	NC_008498	TCA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334873
52	NC_008498	CAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
53	NC_008498	AAG	2	6	7391	7396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334874
54	NC_008498	CAA	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
55	NC_008498	CGT	2	6	7529	7534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334874
56	NC_008498	CAA	2	6	7540	7545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
57	NC_008498	CAG	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334874
58	NC_008498	GAC	2	6	7593	7598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334874
59	NC_008498	AAC	2	6	7603	7608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
60	NC_008498	CAA	2	6	7620	7625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334874
61	NC_008498	GAC	2	6	7774	7779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334874
62	NC_008498	TAG	2	6	8194	8199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334875
63	NC_008498	TGT	2	6	8210	8215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
64	NC_008498	TCT	2	6	8227	8232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334875
65	NC_008498	TCA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334875
66	NC_008498	TCT	2	6	8253	8258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334875
67	NC_008498	GCC	2	6	8260	8265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116334875
68	NC_008498	AGT	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334875
69	NC_008498	AAT	2	6	8312	8317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334875
70	NC_008498	CTT	2	6	8347	8352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334875
71	NC_008498	ATC	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334875
72	NC_008498	TGG	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334875
73	NC_008498	TGT	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
74	NC_008498	AAG	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334875
75	NC_008498	TGT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
76	NC_008498	TGA	3	9	8631	8639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334875
77	NC_008498	GTC	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334875
78	NC_008498	TCA	2	6	9121	9126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334875
79	NC_008498	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334875
80	NC_008498	GAA	2	6	10004	10009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334876
81	NC_008498	ATC	2	6	10092	10097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334876
82	NC_008498	ATG	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334876
83	NC_008498	CAG	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334876
84	NC_008498	TCT	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334876
85	NC_008498	TCT	2	6	10379	10384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334876
86	NC_008498	CCA	2	6	10407	10412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116334876
87	NC_008498	ATA	2	6	10449	10454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334876
88	NC_008498	GTT	2	6	10490	10495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334876
89	NC_008498	TGG	2	6	10547	10552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334876
90	NC_008498	AGA	2	6	11209	11214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334877
91	NC_008498	AAG	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334877
92	NC_008498	CAA	2	6	11264	11269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334877
93	NC_008498	GAG	2	6	11390	11395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116334877
94	NC_008498	ATG	2	6	11445	11450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334877
95	NC_008498	TCG	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334877
96	NC_008498	ACG	2	6	11720	11725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334877
97	NC_008498	AAG	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334877
98	NC_008498	GAA	2	6	12129	12134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334878
99	NC_008498	TTA	2	6	12177	12182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334878
100	NC_008498	ACT	2	6	12255	12260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334878
101	NC_008498	AGG	2	6	12288	12293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116334878
102	NC_008498	TAC	2	6	12393	12398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334878
103	NC_008498	CAA	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334878
104	NC_008498	ATT	2	6	12589	12594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334878
105	NC_008498	TGG	2	6	12640	12645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334878
106	NC_008498	ATC	2	6	12647	12652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334878
107	NC_008498	ATA	2	6	12653	12658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334878
108	NC_008498	TAA	2	6	12704	12709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334878

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.