MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 4244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008014	GTTGT	2	10	119970	119979	0 %	60 %	40 %	0 %	94972463
2502	NC_008014	TGA	2	6	120067	120072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972463
2503	NC_008014	ACC	2	6	120118	120123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972463
2504	NC_008014	TGC	2	6	120157	120162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972463
2505	NC_008014	TGC	2	6	120190	120195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972463
2506	NC_008014	CCA	2	6	120230	120235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972463
2507	NC_008014	TTG	2	6	120298	120303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972463
2508	NC_008014	TGC	2	6	120343	120348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972463
2509	NC_008014	ACC	2	6	120361	120366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972463
2510	NC_008014	ATC	2	6	120434	120439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972463
2511	NC_008014	CAGG	2	8	120481	120488	25 %	0 %	50 %	25 %	94972463
2512	NC_008014	ACA	2	6	120517	120522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972463
2513	NC_008014	ACT	2	6	120562	120567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972463
2514	NC_008014	CCA	2	6	120638	120643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972463
2515	NC_008014	TCC	2	6	120649	120654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972463
2516	NC_008014	TGA	2	6	120659	120664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972463
2517	NC_008014	ACC	2	6	120667	120672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972463
2518	NC_008014	TACCAT	2	12	120711	120722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972463
2519	NC_008014	A	8	8	120762	120769	100 %	0 %	0 %	0 %	94972463
2520	NC_008014	GTAATA	2	12	120771	120782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94972463
2521	NC_008014	TTGT	2	8	120789	120796	0 %	75 %	25 %	0 %	94972463
2522	NC_008014	T	7	7	120852	120858	0 %	100 %	0 %	0 %	94972463
2523	NC_008014	TGTA	2	8	120868	120875	25 %	50 %	25 %	0 %	94972463
2524	NC_008014	TA	4	8	120900	120907	50 %	50 %	0 %	0 %	94972463
2525	NC_008014	ATA	2	6	120950	120955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972463
2526	NC_008014	AGA	2	6	122033	122038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
2527	NC_008014	CCT	2	6	122094	122099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972464
2528	NC_008014	AGG	2	6	122152	122157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972464
2529	NC_008014	ACG	2	6	122162	122167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972464
2530	NC_008014	TGAT	2	8	122194	122201	25 %	50 %	25 %	0 %	94972464
2531	NC_008014	CTG	3	9	122248	122256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972464
2532	NC_008014	CTT	2	6	122274	122279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972464
2533	NC_008014	GAATG	2	10	122285	122294	40 %	20 %	40 %	0 %	94972464
2534	NC_008014	ATAC	2	8	122330	122337	50 %	25 %	0 %	25 %	94972464
2535	NC_008014	AATATA	2	12	122347	122358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972464
2536	NC_008014	CAA	2	6	122383	122388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972464
2537	NC_008014	GCA	2	6	122415	122420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972464
2538	NC_008014	ATGGA	2	10	122443	122452	40 %	20 %	40 %	0 %	94972464
2539	NC_008014	TAC	2	6	122474	122479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972464
2540	NC_008014	AAG	2	6	122493	122498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
2541	NC_008014	TCT	2	6	122607	122612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972464
2542	NC_008014	A	8	8	122648	122655	100 %	0 %	0 %	0 %	94972464
2543	NC_008014	ACA	2	6	122663	122668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972464
2544	NC_008014	AAG	2	6	122776	122781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
2545	NC_008014	GAA	2	6	122823	122828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
2546	NC_008014	CGTG	2	8	122904	122911	0 %	25 %	50 %	25 %	94972464
2547	NC_008014	AGG	2	6	123049	123054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972464
2548	NC_008014	TTA	2	6	123094	123099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972464
2549	NC_008014	AAG	2	6	123105	123110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
2550	NC_008014	AAT	2	6	123118	123123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972464
2551	NC_008014	GCA	2	6	123221	123226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972465
2552	NC_008014	TGGC	2	8	123262	123269	0 %	25 %	50 %	25 %	94972465
2553	NC_008014	AGTA	2	8	123370	123377	50 %	25 %	25 %	0 %	94972465
2554	NC_008014	GAT	2	6	123398	123403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972465
2555	NC_008014	TA	3	6	123414	123419	50 %	50 %	0 %	0 %	94972465
2556	NC_008014	GCA	2	6	123446	123451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972465
2557	NC_008014	TGA	2	6	123463	123468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972465
2558	NC_008014	CTT	2	6	123482	123487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972465
2559	NC_008014	ACA	2	6	123500	123505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972465
2560	NC_008014	T	7	7	123526	123532	0 %	100 %	0 %	0 %	94972465
2561	NC_008014	AAC	2	6	123580	123585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972465
2562	NC_008014	TGT	5	15	123628	123642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972465
2563	NC_008014	TTG	2	6	123665	123670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972465
2564	NC_008014	GTTC	2	8	123833	123840	0 %	50 %	25 %	25 %	94972465
2565	NC_008014	GGA	2	6	123908	123913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972465
2566	NC_008014	CTTGGT	2	12	123920	123931	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94972465
2567	NC_008014	AAG	2	6	123942	123947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972465
2568	NC_008014	GTT	2	6	123959	123964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972465
2569	NC_008014	CAA	2	6	124050	124055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972465
2570	NC_008014	ATTG	2	8	124058	124065	25 %	50 %	25 %	0 %	94972465
2571	NC_008014	TTGG	2	8	124069	124076	0 %	50 %	50 %	0 %	94972465
2572	NC_008014	TGA	2	6	124149	124154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972466
2573	NC_008014	ATCA	2	8	124192	124199	50 %	25 %	0 %	25 %	94972466
2574	NC_008014	ACC	2	6	124260	124265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972466
2575	NC_008014	TTC	2	6	124268	124273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972466
2576	NC_008014	TAG	2	6	124280	124285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972466
2577	NC_008014	CGT	2	6	124331	124336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972466
2578	NC_008014	GTC	2	6	124438	124443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972466
2579	NC_008014	AGCAT	2	10	124533	124542	40 %	20 %	20 %	20 %	94972466
2580	NC_008014	TGT	2	6	124557	124562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972467
2581	NC_008014	AGA	2	6	124570	124575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972467
2582	NC_008014	TGG	2	6	124636	124641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972467
2583	NC_008014	TGT	2	6	124666	124671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972467
2584	NC_008014	GA	3	6	124707	124712	50 %	0 %	50 %	0 %	94972467
2585	NC_008014	TTG	2	6	124769	124774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972467
2586	NC_008014	AGC	2	6	124780	124785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972467
2587	NC_008014	ACA	2	6	124928	124933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972467
2588	NC_008014	ACA	2	6	124957	124962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972467
2589	NC_008014	TAT	2	6	125135	125140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972467
2590	NC_008014	CTT	2	6	125174	125179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972467
2591	NC_008014	TTA	2	6	125399	125404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972468
2592	NC_008014	TTA	2	6	125470	125475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972468
2593	NC_008014	TTTGGT	2	12	125476	125487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972468
2594	NC_008014	CATG	2	8	125517	125524	25 %	25 %	25 %	25 %	94972468
2595	NC_008014	CAG	2	6	125588	125593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972468
2596	NC_008014	GAT	2	6	125680	125685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972468
2597	NC_008014	TTG	2	6	125729	125734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972468
2598	NC_008014	TCT	2	6	125836	125841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972468
2599	NC_008014	GTG	2	6	125876	125881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972468
2600	NC_008014	AGC	2	6	125904	125909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972468
2601	NC_008014	ACA	2	6	125956	125961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972468
2602	NC_008014	AAC	2	6	126020	126025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972468
2603	NC_008014	GT	3	6	126038	126043	0 %	50 %	50 %	0 %	94972468
2604	NC_008014	CTT	2	6	126158	126163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972468
2605	NC_008014	TGC	2	6	126165	126170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972468
2606	NC_008014	AGA	3	9	126183	126191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972468
2607	NC_008014	TAT	2	6	126228	126233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972468
2608	NC_008014	CA	3	6	126264	126269	50 %	0 %	0 %	50 %	94972468
2609	NC_008014	AAG	2	6	126272	126277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972468
2610	NC_008014	GTG	2	6	126290	126295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972468
2611	NC_008014	GTT	2	6	126325	126330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972468
2612	NC_008014	ACT	2	6	126390	126395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972468
2613	NC_008014	ATT	2	6	126422	126427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972468
2614	NC_008014	GAA	2	6	126556	126561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972468
2615	NC_008014	TTG	2	6	126587	126592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972468
2616	NC_008014	CTG	2	6	126635	126640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972468
2617	NC_008014	GCAG	2	8	126667	126674	25 %	0 %	50 %	25 %	94972468
2618	NC_008014	TAA	2	6	126691	126696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972468
2619	NC_008014	CAA	2	6	127032	127037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972469
2620	NC_008014	ACA	2	6	127040	127045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972469
2621	NC_008014	GTAC	2	8	127058	127065	25 %	25 %	25 %	25 %	94972469
2622	NC_008014	TGT	2	6	127138	127143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972469
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2624	NC_008014	TGC	2	6	127219	127224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972469
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2999	NC_008014	A	8	8	147671	147678	100 %	0 %	0 %	0 %	94972488
3000	NC_008014	G	6	6	147693	147698	0 %	0 %	100 %	0 %	94972488

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