MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 4244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008014	ATA	2	6	95489	95494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972453
2003	NC_008014	TGA	2	6	95596	95601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972453
2004	NC_008014	GTA	2	6	95604	95609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972453
2005	NC_008014	GTG	2	6	95610	95615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972453
2006	NC_008014	ATT	2	6	95647	95652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972453
2007	NC_008014	A	7	7	95682	95688	100 %	0 %	0 %	0 %	94972453
2008	NC_008014	AAT	2	6	95701	95706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972453
2009	NC_008014	T	6	6	95742	95747	0 %	100 %	0 %	0 %	94972453
2010	NC_008014	ATT	2	6	95762	95767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972453
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2012	NC_008014	ACAT	2	8	95805	95812	50 %	25 %	0 %	25 %	94972453
2013	NC_008014	AT	4	8	95834	95841	50 %	50 %	0 %	0 %	94972453
2014	NC_008014	TA	3	6	95847	95852	50 %	50 %	0 %	0 %	94972453
2015	NC_008014	ATT	2	6	95873	95878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972453
2016	NC_008014	GCTT	2	8	96219	96226	0 %	50 %	25 %	25 %	94972454
2017	NC_008014	CTA	2	6	96369	96374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972454
2018	NC_008014	T	6	6	96472	96477	0 %	100 %	0 %	0 %	94972454
2019	NC_008014	TAT	2	6	96479	96484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972454
2020	NC_008014	TTA	2	6	96492	96497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972454
2021	NC_008014	TGT	2	6	96668	96673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972454
2022	NC_008014	ATT	2	6	96701	96706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972454
2023	NC_008014	ATA	2	6	96725	96730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972454
2024	NC_008014	GT	3	6	96862	96867	0 %	50 %	50 %	0 %	94972454
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2051	NC_008014	TA	7	14	97912	97925	50 %	50 %	0 %	0 %	94972454
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2059	NC_008014	TACT	2	8	99862	99869	25 %	50 %	0 %	25 %	94972455
2060	NC_008014	GCA	2	6	99877	99882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972455
2061	NC_008014	CCAA	2	8	99908	99915	50 %	0 %	0 %	50 %	94972455
2062	NC_008014	TA	3	6	99935	99940	50 %	50 %	0 %	0 %	94972455
2063	NC_008014	TCC	2	6	99995	100000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972455
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2066	NC_008014	CCAT	2	8	100082	100089	25 %	25 %	0 %	50 %	94972455
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2070	NC_008014	AGCCT	2	10	100195	100204	20 %	20 %	20 %	40 %	94972455
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2072	NC_008014	TGA	2	6	100236	100241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972455
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2077	NC_008014	AG	3	6	100458	100463	50 %	0 %	50 %	0 %	94972455
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2082	NC_008014	ACTTC	2	10	100663	100672	20 %	40 %	0 %	40 %	94972455
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2112	NC_008014	TCTT	2	8	101387	101394	0 %	75 %	0 %	25 %	94972455
2113	NC_008014	GATA	2	8	101453	101460	50 %	25 %	25 %	0 %	94972455
2114	NC_008014	TAC	2	6	101476	101481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972455
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2119	NC_008014	A	8	8	101576	101583	100 %	0 %	0 %	0 %	94972455
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2125	NC_008014	AAG	2	6	102190	102195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972456
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2127	NC_008014	ACTT	2	8	102308	102315	25 %	50 %	0 %	25 %	94972456
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