MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 4244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008014	TAG	2	6	48909	48914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1002	NC_008014	AGT	3	9	48922	48930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1003	NC_008014	AGTTT	2	10	48932	48941	20 %	60 %	20 %	0 %	94972435
1004	NC_008014	AGAA	2	8	48948	48955	75 %	0 %	25 %	0 %	94972435
1005	NC_008014	TCA	2	6	48970	48975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1006	NC_008014	GTT	2	6	49006	49011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972435
1007	NC_008014	ACT	2	6	49104	49109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1008	NC_008014	CCT	2	6	49114	49119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972435
1009	NC_008014	TCA	2	6	49120	49125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1010	NC_008014	TGA	2	6	49128	49133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1011	NC_008014	GTG	3	9	49163	49171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972435
1012	NC_008014	TAA	2	6	49176	49181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1013	NC_008014	TGA	2	6	49182	49187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1014	NC_008014	ATC	2	6	49188	49193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1015	NC_008014	TCC	2	6	49278	49283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972435
1016	NC_008014	A	9	9	49284	49292	100 %	0 %	0 %	0 %	94972435
1017	NC_008014	AAC	2	6	49301	49306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972435
1018	NC_008014	TGG	2	6	49344	49349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972435
1019	NC_008014	CCT	2	6	49367	49372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972435
1020	NC_008014	AGT	2	6	49402	49407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1021	NC_008014	CATC	2	8	49423	49430	25 %	25 %	0 %	50 %	94972435
1022	NC_008014	TCC	2	6	49464	49469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972435
1023	NC_008014	CAT	2	6	49495	49500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1024	NC_008014	TCT	2	6	49510	49515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972435
1025	NC_008014	TCT	2	6	49534	49539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972435
1026	NC_008014	TCA	2	6	49552	49557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1027	NC_008014	GTA	3	9	49577	49585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1028	NC_008014	TTC	2	6	49589	49594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972435
1029	NC_008014	AGT	2	6	49603	49608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1030	NC_008014	GAT	2	6	49645	49650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1031	NC_008014	GTAAAC	2	12	49676	49687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94972435
1032	NC_008014	TAC	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1033	NC_008014	TGG	2	6	49776	49781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972435
1034	NC_008014	AGT	2	6	49816	49821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1035	NC_008014	TAT	2	6	49824	49829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972435
1036	NC_008014	AGA	2	6	49836	49841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972435
1037	NC_008014	TAA	3	9	49860	49868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1038	NC_008014	TAA	2	6	49902	49907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1039	NC_008014	GAA	2	6	49921	49926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972435
1040	NC_008014	TCA	2	6	49935	49940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1041	NC_008014	GGA	2	6	49951	49956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972435
1042	NC_008014	ATC	2	6	49962	49967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1043	NC_008014	AGC	2	6	49975	49980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972435
1044	NC_008014	TC	3	6	49989	49994	0 %	50 %	0 %	50 %	94972435
1045	NC_008014	ATG	2	6	50063	50068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1046	NC_008014	TAA	2	6	50091	50096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1047	NC_008014	ATA	2	6	50111	50116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1048	NC_008014	TGA	2	6	50118	50123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1049	NC_008014	GAT	2	6	50179	50184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1050	NC_008014	TAA	2	6	50208	50213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1051	NC_008014	ATA	2	6	50228	50233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1052	NC_008014	TGA	3	9	50235	50243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1053	NC_008014	GAT	2	6	50296	50301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1054	NC_008014	TAA	2	6	50325	50330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1055	NC_008014	TGA	2	6	50343	50348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1056	NC_008014	TAA	2	6	50391	50396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972435
1057	NC_008014	TGG	2	6	50409	50414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972435
1058	NC_008014	AAG	2	6	50544	50549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972435
1059	NC_008014	TCTA	2	8	50583	50590	25 %	50 %	0 %	25 %	94972435
1060	NC_008014	CAA	2	6	50710	50715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972435
1061	NC_008014	ACA	2	6	50761	50766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972435
1062	NC_008014	AGCA	2	8	50790	50797	50 %	0 %	25 %	25 %	94972435
1063	NC_008014	A	7	7	50799	50805	100 %	0 %	0 %	0 %	94972435
1064	NC_008014	A	6	6	50815	50820	100 %	0 %	0 %	0 %	94972435
1065	NC_008014	GCA	2	6	50959	50964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972435
1066	NC_008014	ACAA	2	8	50973	50980	75 %	0 %	0 %	25 %	94972435
1067	NC_008014	GGA	2	6	51139	51144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972435
1068	NC_008014	ACT	2	6	51236	51241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972435
1069	NC_008014	AGT	2	6	51274	51279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1070	NC_008014	TAG	2	6	51332	51337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1071	NC_008014	AT	3	6	51366	51371	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
1072	NC_008014	CTT	2	6	51409	51414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972435
1073	NC_008014	TGA	2	6	51420	51425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972435
1074	NC_008014	AT	3	6	51582	51587	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
1075	NC_008014	TGGT	2	8	52065	52072	0 %	50 %	50 %	0 %	94972436
1076	NC_008014	GGA	2	6	52125	52130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972436
1077	NC_008014	AAG	2	6	52136	52141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972436
1078	NC_008014	ACA	2	6	52157	52162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972436
1079	NC_008014	ATTT	2	8	52196	52203	25 %	75 %	0 %	0 %	94972436
1080	NC_008014	CAT	2	6	52320	52325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972436
1081	NC_008014	CAG	2	6	52384	52389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972436
1082	NC_008014	CAA	2	6	52417	52422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972436
1083	NC_008014	AAT	2	6	52472	52477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972436
1084	NC_008014	A	6	6	52503	52508	100 %	0 %	0 %	0 %	94972436
1085	NC_008014	AT	3	6	52529	52534	50 %	50 %	0 %	0 %	94972436
1086	NC_008014	TGCTAT	2	12	52541	52552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94972436
1087	NC_008014	CAAT	2	8	52578	52585	50 %	25 %	0 %	25 %	94972436
1088	NC_008014	TTC	2	6	52646	52651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972436
1089	NC_008014	TCC	2	6	52655	52660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972436
1090	NC_008014	TTCA	2	8	52854	52861	25 %	50 %	0 %	25 %	94972436
1091	NC_008014	TAA	2	6	52877	52882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972436
1092	NC_008014	GAA	2	6	53001	53006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972436
1093	NC_008014	CCA	2	6	53046	53051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972436
1094	NC_008014	CTT	2	6	53085	53090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972436
1095	NC_008014	AGA	2	6	53093	53098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972436
1096	NC_008014	AAT	2	6	53114	53119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972436
1097	NC_008014	AAAT	2	8	53164	53171	75 %	25 %	0 %	0 %	94972436
1098	NC_008014	CA	4	8	53174	53181	50 %	0 %	0 %	50 %	94972436
1099	NC_008014	AC	3	6	53514	53519	50 %	0 %	0 %	50 %	94972437
1100	NC_008014	GAAA	2	8	53526	53533	75 %	0 %	25 %	0 %	94972437
1101	NC_008014	A	6	6	53531	53536	100 %	0 %	0 %	0 %	94972437
1102	NC_008014	TAA	2	6	53611	53616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972437
1103	NC_008014	GAC	2	6	53691	53696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972437
1104	NC_008014	T	7	7	53734	53740	0 %	100 %	0 %	0 %	94972437
1105	NC_008014	CTT	2	6	53744	53749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972437
1106	NC_008014	CTA	2	6	53817	53822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972437
1107	NC_008014	TTA	2	6	53831	53836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972437
1108	NC_008014	TGA	2	6	53890	53895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972437
1109	NC_008014	GTAA	2	8	53921	53928	50 %	25 %	25 %	0 %	94972437
1110	NC_008014	CTA	2	6	53937	53942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972437
1111	NC_008014	CCA	2	6	53972	53977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972437
1112	NC_008014	TGTAA	2	10	53978	53987	40 %	40 %	20 %	0 %	94972437
1113	NC_008014	CAA	2	6	54114	54119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972437
1114	NC_008014	ATA	2	6	54187	54192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972437
1115	NC_008014	TGTT	2	8	54206	54213	0 %	75 %	25 %	0 %	94972437
1116	NC_008014	GCT	2	6	54275	54280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972437
1117	NC_008014	TAA	2	6	54343	54348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972437
1118	NC_008014	GAA	2	6	54374	54379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972437
1119	NC_008014	ACT	2	6	54382	54387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972437
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1121	NC_008014	CAC	2	6	54630	54635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972437
1122	NC_008014	GGT	3	9	54641	54649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972437
1123	NC_008014	AGG	2	6	54658	54663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972437
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1125	NC_008014	TAG	2	6	54727	54732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972437
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