MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	CT	3	6	2281	2286	0 %	50 %	0 %	50 %	94972375
2	NC_008013	TA	3	6	3581	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	94972376
3	NC_008013	GT	3	6	5050	5055	0 %	50 %	50 %	0 %	94972377
4	NC_008013	AT	3	6	5117	5122	50 %	50 %	0 %	0 %	94972377
5	NC_008013	AT	3	6	5153	5158	50 %	50 %	0 %	0 %	94972377
6	NC_008013	AT	3	6	5897	5902	50 %	50 %	0 %	0 %	94972377
7	NC_008013	GA	3	6	6077	6082	50 %	0 %	50 %	0 %	94972377
8	NC_008013	GT	3	6	6920	6925	0 %	50 %	50 %	0 %	94972377
9	NC_008013	AT	3	6	9199	9204	50 %	50 %	0 %	0 %	94972378
10	NC_008013	AT	4	8	10430	10437	50 %	50 %	0 %	0 %	94972379
11	NC_008013	TA	4	8	12427	12434	50 %	50 %	0 %	0 %	94972379
12	NC_008013	TC	3	6	12484	12489	0 %	50 %	0 %	50 %	94972379
13	NC_008013	TG	3	6	13212	13217	0 %	50 %	50 %	0 %	94972380
14	NC_008013	AT	3	6	13335	13340	50 %	50 %	0 %	0 %	94972380
15	NC_008013	AT	3	6	13799	13804	50 %	50 %	0 %	0 %	94972380
16	NC_008013	AT	3	6	14049	14054	50 %	50 %	0 %	0 %	94972380
17	NC_008013	TA	3	6	14270	14275	50 %	50 %	0 %	0 %	94972380
18	NC_008013	TA	3	6	14430	14435	50 %	50 %	0 %	0 %	94972380
19	NC_008013	CA	3	6	14646	14651	50 %	0 %	0 %	50 %	94972380
20	NC_008013	AT	3	6	14903	14908	50 %	50 %	0 %	0 %	94972381
21	NC_008013	AT	3	6	15192	15197	50 %	50 %	0 %	0 %	94972381
22	NC_008013	AT	7	14	16200	16213	50 %	50 %	0 %	0 %	94972382
23	NC_008013	AT	3	6	16301	16306	50 %	50 %	0 %	0 %	94972382
24	NC_008013	AT	3	6	17303	17308	50 %	50 %	0 %	0 %	94972383
25	NC_008013	TA	3	6	17472	17477	50 %	50 %	0 %	0 %	94972383
26	NC_008013	TG	3	6	17503	17508	0 %	50 %	50 %	0 %	94972383
27	NC_008013	TA	3	6	17574	17579	50 %	50 %	0 %	0 %	94972383
28	NC_008013	TA	3	6	18744	18749	50 %	50 %	0 %	0 %	94972385
29	NC_008013	AT	3	6	19574	19579	50 %	50 %	0 %	0 %	94972386
30	NC_008013	AT	3	6	19636	19641	50 %	50 %	0 %	0 %	94972386
31	NC_008013	CA	3	6	20110	20115	50 %	0 %	0 %	50 %	94972386
32	NC_008013	AT	3	6	20130	20135	50 %	50 %	0 %	0 %	94972386
33	NC_008013	TA	3	6	20559	20564	50 %	50 %	0 %	0 %	94972386
34	NC_008013	CA	3	6	20773	20778	50 %	0 %	0 %	50 %	94972387
35	NC_008013	CT	3	6	21155	21160	0 %	50 %	0 %	50 %	94972387
36	NC_008013	AT	4	8	21178	21185	50 %	50 %	0 %	0 %	94972387
37	NC_008013	TA	3	6	22483	22488	50 %	50 %	0 %	0 %	94972388
38	NC_008013	TC	3	6	22592	22597	0 %	50 %	0 %	50 %	94972389
39	NC_008013	TC	3	6	23788	23793	0 %	50 %	0 %	50 %	94972390
40	NC_008013	TA	3	6	24942	24947	50 %	50 %	0 %	0 %	94972391
41	NC_008013	TA	3	6	25114	25119	50 %	50 %	0 %	0 %	94972391
42	NC_008013	AT	3	6	25312	25317	50 %	50 %	0 %	0 %	94972391
43	NC_008013	AT	3	6	25450	25455	50 %	50 %	0 %	0 %	94972391
44	NC_008013	TC	3	6	25534	25539	0 %	50 %	0 %	50 %	94972391
45	NC_008013	AT	7	14	26489	26502	50 %	50 %	0 %	0 %	94972392
46	NC_008013	TA	3	6	27803	27808	50 %	50 %	0 %	0 %	94972393
47	NC_008013	TA	4	8	28244	28251	50 %	50 %	0 %	0 %	94972393
48	NC_008013	TA	3	6	28429	28434	50 %	50 %	0 %	0 %	94972393
49	NC_008013	AC	3	6	28484	28489	50 %	0 %	0 %	50 %	94972393
50	NC_008013	TA	4	8	28634	28641	50 %	50 %	0 %	0 %	94972393
51	NC_008013	AT	6	12	33724	33735	50 %	50 %	0 %	0 %	94972395
52	NC_008013	GA	3	6	34475	34480	50 %	0 %	50 %	0 %	94972395
53	NC_008013	TC	4	8	35741	35748	0 %	50 %	0 %	50 %	94972395
54	NC_008013	TC	3	6	35848	35853	0 %	50 %	0 %	50 %	94972395
55	NC_008013	AT	3	6	35896	35901	50 %	50 %	0 %	0 %	94972395
56	NC_008013	AT	3	6	35996	36001	50 %	50 %	0 %	0 %	94972395
57	NC_008013	CT	3	6	36004	36009	0 %	50 %	0 %	50 %	94972395
58	NC_008013	AT	3	6	36061	36066	50 %	50 %	0 %	0 %	94972395
59	NC_008013	AT	3	6	36246	36251	50 %	50 %	0 %	0 %	94972395
60	NC_008013	TA	3	6	37430	37435	50 %	50 %	0 %	0 %	94972396
61	NC_008013	AT	3	6	39345	39350	50 %	50 %	0 %	0 %	94972397

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.