MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008012	T	6	6	445	450	0 %	100 %	0 %	0 %	94972344
2	NC_008012	A	6	6	520	525	100 %	0 %	0 %	0 %	94972344
3	NC_008012	T	7	7	618	624	0 %	100 %	0 %	0 %	94972344
4	NC_008012	A	8	8	976	983	100 %	0 %	0 %	0 %	94972344
5	NC_008012	T	8	8	1032	1039	0 %	100 %	0 %	0 %	94972344
6	NC_008012	A	6	6	1140	1145	100 %	0 %	0 %	0 %	94972344
7	NC_008012	T	6	6	1809	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	94972345
8	NC_008012	T	7	7	2205	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	94972346
9	NC_008012	T	6	6	2818	2823	0 %	100 %	0 %	0 %	94972347
10	NC_008012	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	94972347
11	NC_008012	T	6	6	3426	3431	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
12	NC_008012	A	7	7	3779	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
13	NC_008012	A	6	6	3984	3989	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
14	NC_008012	T	6	6	4019	4024	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
15	NC_008012	T	6	6	4032	4037	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
16	NC_008012	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
17	NC_008012	A	6	6	4169	4174	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
18	NC_008012	A	6	6	4506	4511	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
19	NC_008012	A	6	6	4833	4838	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
20	NC_008012	T	7	7	4905	4911	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
21	NC_008012	T	6	6	4919	4924	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
22	NC_008012	A	7	7	4944	4950	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
23	NC_008012	A	6	6	5143	5148	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
24	NC_008012	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
25	NC_008012	A	7	7	5225	5231	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
26	NC_008012	A	7	7	5883	5889	100 %	0 %	0 %	0 %	94972349
27	NC_008012	A	6	6	5945	5950	100 %	0 %	0 %	0 %	94972349
28	NC_008012	A	6	6	5979	5984	100 %	0 %	0 %	0 %	94972349
29	NC_008012	T	6	6	6013	6018	0 %	100 %	0 %	0 %	94972349
30	NC_008012	T	6	6	6100	6105	0 %	100 %	0 %	0 %	94972349
31	NC_008012	T	6	6	6280	6285	0 %	100 %	0 %	0 %	94972349
32	NC_008012	T	8	8	6909	6916	0 %	100 %	0 %	0 %	94972350
33	NC_008012	A	7	7	7193	7199	100 %	0 %	0 %	0 %	94972350
34	NC_008012	T	7	7	7222	7228	0 %	100 %	0 %	0 %	94972350
35	NC_008012	T	6	6	7470	7475	0 %	100 %	0 %	0 %	94972351
36	NC_008012	T	6	6	7490	7495	0 %	100 %	0 %	0 %	94972351
37	NC_008012	A	6	6	7709	7714	100 %	0 %	0 %	0 %	94972351
38	NC_008012	T	7	7	7723	7729	0 %	100 %	0 %	0 %	94972351
39	NC_008012	A	6	6	8499	8504	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
40	NC_008012	A	7	7	8676	8682	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
41	NC_008012	A	7	7	8836	8842	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
42	NC_008012	A	6	6	9103	9108	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
43	NC_008012	T	6	6	9109	9114	0 %	100 %	0 %	0 %	94972352
44	NC_008012	A	6	6	9287	9292	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
45	NC_008012	A	6	6	9310	9315	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
46	NC_008012	A	6	6	9447	9452	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
47	NC_008012	T	7	7	9453	9459	0 %	100 %	0 %	0 %	94972352
48	NC_008012	A	8	8	9477	9484	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
49	NC_008012	T	8	8	9725	9732	0 %	100 %	0 %	0 %	94972353
50	NC_008012	T	7	7	9924	9930	0 %	100 %	0 %	0 %	94972353
51	NC_008012	T	8	8	9962	9969	0 %	100 %	0 %	0 %	94972353
52	NC_008012	C	13	13	10925	10937	0 %	0 %	0 %	100 %	94972354
53	NC_008012	T	8	8	11157	11164	0 %	100 %	0 %	0 %	94972354
54	NC_008012	A	6	6	11206	11211	100 %	0 %	0 %	0 %	94972354
55	NC_008012	T	8	8	11284	11291	0 %	100 %	0 %	0 %	94972354
56	NC_008012	T	6	6	11322	11327	0 %	100 %	0 %	0 %	94972354
57	NC_008012	T	7	7	11387	11393	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
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61	NC_008012	T	8	8	11888	11895	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
62	NC_008012	A	6	6	11937	11942	100 %	0 %	0 %	0 %	94972355
63	NC_008012	T	6	6	12033	12038	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
64	NC_008012	T	7	7	12169	12175	0 %	100 %	0 %	0 %	94972356
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66	NC_008012	T	7	7	12242	12248	0 %	100 %	0 %	0 %	94972356
67	NC_008012	A	6	6	12359	12364	100 %	0 %	0 %	0 %	94972356
68	NC_008012	T	6	6	12376	12381	0 %	100 %	0 %	0 %	94972356
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70	NC_008012	A	7	7	12667	12673	100 %	0 %	0 %	0 %	94972356
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80	NC_008012	A	6	6	15303	15308	100 %	0 %	0 %	0 %	94972359
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102	NC_008012	A	6	6	19055	19060	100 %	0 %	0 %	0 %	94972364
103	NC_008012	A	6	6	19072	19077	100 %	0 %	0 %	0 %	94972364
104	NC_008012	A	6	6	19153	19158	100 %	0 %	0 %	0 %	94972364
105	NC_008012	T	6	6	19211	19216	0 %	100 %	0 %	0 %	94972364
106	NC_008012	A	6	6	19243	19248	100 %	0 %	0 %	0 %	94972364
107	NC_008012	T	6	6	19327	19332	0 %	100 %	0 %	0 %	94972365
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109	NC_008012	T	7	7	19571	19577	0 %	100 %	0 %	0 %	94972365
110	NC_008012	T	7	7	20067	20073	0 %	100 %	0 %	0 %	94972366
111	NC_008012	T	6	6	20316	20321	0 %	100 %	0 %	0 %	94972366
112	NC_008012	A	6	6	20851	20856	100 %	0 %	0 %	0 %	94972366
113	NC_008012	T	6	6	20905	20910	0 %	100 %	0 %	0 %	94972366
114	NC_008012	T	7	7	21052	21058	0 %	100 %	0 %	0 %	94972366
115	NC_008012	T	6	6	21409	21414	0 %	100 %	0 %	0 %	94972367
116	NC_008012	A	8	8	21442	21449	100 %	0 %	0 %	0 %	94972367
117	NC_008012	T	7	7	21710	21716	0 %	100 %	0 %	0 %	94972367
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121	NC_008012	T	7	7	23184	23190	0 %	100 %	0 %	0 %	94972370
122	NC_008012	A	6	6	23297	23302	100 %	0 %	0 %	0 %	94972370
123	NC_008012	T	6	6	23323	23328	0 %	100 %	0 %	0 %	94972370
124	NC_008012	A	7	7	23433	23439	100 %	0 %	0 %	0 %	94972370
125	NC_008012	T	6	6	23464	23469	0 %	100 %	0 %	0 %	94972370
126	NC_008012	A	6	6	23481	23486	100 %	0 %	0 %	0 %	94972370
127	NC_008012	T	6	6	23623	23628	0 %	100 %	0 %	0 %	94972370
128	NC_008012	A	6	6	23885	23890	100 %	0 %	0 %	0 %	94972370
129	NC_008012	T	6	6	24375	24380	0 %	100 %	0 %	0 %	94972371
130	NC_008012	T	6	6	24395	24400	0 %	100 %	0 %	0 %	94972371
131	NC_008012	T	7	7	25330	25336	0 %	100 %	0 %	0 %	94972371
132	NC_008012	G	6	6	25386	25391	0 %	0 %	100 %	0 %	94972371
133	NC_008012	T	6	6	25413	25418	0 %	100 %	0 %	0 %	94972371
134	NC_008012	T	6	6	25469	25474	0 %	100 %	0 %	0 %	94972371
135	NC_008012	T	6	6	25570	25575	0 %	100 %	0 %	0 %	94972371
136	NC_008012	A	6	6	25644	25649	100 %	0 %	0 %	0 %	94972371
137	NC_008012	A	6	6	26041	26046	100 %	0 %	0 %	0 %	94972372
138	NC_008012	T	7	7	26186	26192	0 %	100 %	0 %	0 %	94972372
139	NC_008012	A	6	6	26447	26452	100 %	0 %	0 %	0 %	94972372

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.