MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008012	AT	3	6	687	692	50 %	50 %	0 %	0 %	94972344
2	NC_008012	AT	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	94972345
3	NC_008012	AT	3	6	1982	1987	50 %	50 %	0 %	0 %	94972346
4	NC_008012	AT	3	6	2105	2110	50 %	50 %	0 %	0 %	94972346
5	NC_008012	TA	3	6	2169	2174	50 %	50 %	0 %	0 %	94972346
6	NC_008012	TC	3	6	3728	3733	0 %	50 %	0 %	50 %	94972348
7	NC_008012	AT	3	6	3840	3845	50 %	50 %	0 %	0 %	94972348
8	NC_008012	TC	3	6	3915	3920	0 %	50 %	0 %	50 %	94972348
9	NC_008012	AT	3	6	4038	4043	50 %	50 %	0 %	0 %	94972348
10	NC_008012	GA	3	6	4609	4614	50 %	0 %	50 %	0 %	94972348
11	NC_008012	TA	3	6	4995	5000	50 %	50 %	0 %	0 %	94972348
12	NC_008012	TA	3	6	6308	6313	50 %	50 %	0 %	0 %	94972349
13	NC_008012	AT	3	6	6412	6417	50 %	50 %	0 %	0 %	94972349
14	NC_008012	AT	4	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	94972350
15	NC_008012	AT	3	6	7912	7917	50 %	50 %	0 %	0 %	94972351
16	NC_008012	AT	3	6	8641	8646	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
17	NC_008012	AT	3	6	8941	8946	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
18	NC_008012	AT	3	6	8995	9000	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
19	NC_008012	AT	3	6	9005	9010	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
20	NC_008012	AT	3	6	9070	9075	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
21	NC_008012	GT	3	6	9228	9233	0 %	50 %	50 %	0 %	94972352
22	NC_008012	AG	3	6	9497	9502	50 %	0 %	50 %	0 %	94972352
23	NC_008012	TA	4	8	9644	9651	50 %	50 %	0 %	0 %	94972353
24	NC_008012	AT	3	6	9677	9682	50 %	50 %	0 %	0 %	94972353
25	NC_008012	AT	3	6	10166	10171	50 %	50 %	0 %	0 %	94972353
26	NC_008012	AT	3	6	11025	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	94972354
27	NC_008012	TA	3	6	11244	11249	50 %	50 %	0 %	0 %	94972354
28	NC_008012	AT	3	6	11311	11316	50 %	50 %	0 %	0 %	94972354
29	NC_008012	AT	4	8	11447	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
30	NC_008012	TA	3	6	11698	11703	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
31	NC_008012	AT	3	6	11756	11761	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
32	NC_008012	AT	3	6	11976	11981	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
33	NC_008012	AT	3	6	12010	12015	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
34	NC_008012	TG	3	6	12688	12693	0 %	50 %	50 %	0 %	94972356
35	NC_008012	AT	7	14	12727	12740	50 %	50 %	0 %	0 %	94972356
36	NC_008012	TA	7	14	13681	13694	50 %	50 %	0 %	0 %	94972357
37	NC_008012	GT	3	6	13712	13717	0 %	50 %	50 %	0 %	94972357
38	NC_008012	AT	3	6	13770	13775	50 %	50 %	0 %	0 %	94972357
39	NC_008012	AT	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	94972357
40	NC_008012	TA	3	6	13979	13984	50 %	50 %	0 %	0 %	94972358
41	NC_008012	CA	3	6	14304	14309	50 %	0 %	0 %	50 %	94972358
42	NC_008012	TA	7	14	14579	14592	50 %	50 %	0 %	0 %	94972358
43	NC_008012	AT	3	6	14929	14934	50 %	50 %	0 %	0 %	94972358
44	NC_008012	AT	3	6	15520	15525	50 %	50 %	0 %	0 %	94972359
45	NC_008012	AT	3	6	15610	15615	50 %	50 %	0 %	0 %	94972359
46	NC_008012	TA	3	6	16019	16024	50 %	50 %	0 %	0 %	94972359
47	NC_008012	TC	3	6	16065	16070	0 %	50 %	0 %	50 %	94972360
48	NC_008012	AT	3	6	16173	16178	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
49	NC_008012	AT	3	6	16243	16248	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
50	NC_008012	AT	3	6	16782	16787	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
51	NC_008012	TA	3	6	17024	17029	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
52	NC_008012	TA	3	6	17787	17792	50 %	50 %	0 %	0 %	94972361
53	NC_008012	TA	3	6	18944	18949	50 %	50 %	0 %	0 %	94972364
54	NC_008012	TA	3	6	19364	19369	50 %	50 %	0 %	0 %	94972365
55	NC_008012	AT	3	6	20049	20054	50 %	50 %	0 %	0 %	94972366
56	NC_008012	CT	3	6	20132	20137	0 %	50 %	0 %	50 %	94972366
57	NC_008012	AT	4	8	20412	20419	50 %	50 %	0 %	0 %	94972366
58	NC_008012	TA	3	6	21204	21209	50 %	50 %	0 %	0 %	94972367
59	NC_008012	AT	4	8	21857	21864	50 %	50 %	0 %	0 %	94972367
60	NC_008012	GA	3	6	21870	21875	50 %	0 %	50 %	0 %	94972367
61	NC_008012	CT	3	6	22108	22113	0 %	50 %	0 %	50 %	94972368
62	NC_008012	TA	3	6	22550	22555	50 %	50 %	0 %	0 %	94972369
63	NC_008012	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	94972370
64	NC_008012	CT	3	6	23263	23268	0 %	50 %	0 %	50 %	94972370
65	NC_008012	TA	3	6	23346	23351	50 %	50 %	0 %	0 %	94972370
66	NC_008012	AT	3	6	23507	23512	50 %	50 %	0 %	0 %	94972370
67	NC_008012	AT	3	6	24841	24846	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
68	NC_008012	TA	3	6	25133	25138	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
69	NC_008012	AT	3	6	25273	25278	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
70	NC_008012	AT	3	6	25438	25443	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
71	NC_008012	GA	3	6	25536	25541	50 %	0 %	50 %	0 %	94972371

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.