MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008011	A	6	6	46769	46774	100 %	0 %	0 %	0 %	94986485
1002	NC_008011	GAA	2	6	46794	46799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986485
1003	NC_008011	TAA	2	6	46808	46813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986485
1004	NC_008011	TCT	2	6	46818	46823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986485
1005	NC_008011	TAA	2	6	46892	46897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986485
1006	NC_008011	AAC	2	6	46961	46966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986485
1007	NC_008011	TGAC	2	8	47104	47111	25 %	25 %	25 %	25 %	94986485
1008	NC_008011	TTG	2	6	47146	47151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986485
1009	NC_008011	AGT	2	6	47184	47189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986485
1010	NC_008011	GAA	2	6	47340	47345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986485
1011	NC_008011	AT	3	6	47372	47377	50 %	50 %	0 %	0 %	94986485
1012	NC_008011	AAC	2	6	47744	47749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986486
1013	NC_008011	AGT	2	6	47788	47793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986486
1014	NC_008011	AG	3	6	47806	47811	50 %	0 %	50 %	0 %	94986486
1015	NC_008011	TAG	2	6	47844	47849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986486
1016	NC_008011	TGT	2	6	47880	47885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986486
1017	NC_008011	T	6	6	47905	47910	0 %	100 %	0 %	0 %	94986486
1018	NC_008011	TCT	2	6	47950	47955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986486
1019	NC_008011	TTC	3	9	47958	47966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986486
1020	NC_008011	CAA	2	6	47975	47980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986486
1021	NC_008011	AAG	2	6	48018	48023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986486
1022	NC_008011	TTA	2	6	48066	48071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986486
1023	NC_008011	AGA	3	9	48081	48089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986486
1024	NC_008011	AGTA	2	8	48111	48118	50 %	25 %	25 %	0 %	94986486
1025	NC_008011	AGC	2	6	48121	48126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986486
1026	NC_008011	AT	4	8	48134	48141	50 %	50 %	0 %	0 %	94986486
1027	NC_008011	CAGTT	2	10	48165	48174	20 %	40 %	20 %	20 %	94986486
1028	NC_008011	ACC	2	6	48246	48251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986486
1029	NC_008011	TGA	2	6	48312	48317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986486
1030	NC_008011	T	6	6	48320	48325	0 %	100 %	0 %	0 %	94986486
1031	NC_008011	TCTGAA	2	12	48328	48339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94986486
1032	NC_008011	AGA	2	6	48408	48413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986486
1033	NC_008011	ACC	3	9	48531	48539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986486
1034	NC_008011	AG	3	6	48550	48555	50 %	0 %	50 %	0 %	94986486
1035	NC_008011	TCT	2	6	48598	48603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986486
1036	NC_008011	TAA	2	6	48606	48611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986486
1037	NC_008011	TA	3	6	48754	48759	50 %	50 %	0 %	0 %	94986486
1038	NC_008011	ACA	3	9	48780	48788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986486
1039	NC_008011	AAG	2	6	48806	48811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986486
1040	NC_008011	AGG	2	6	48858	48863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986486
1041	NC_008011	ATTC	2	8	48919	48926	25 %	50 %	0 %	25 %	94986486
1042	NC_008011	GTA	2	6	48997	49002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986486
1043	NC_008011	AAC	2	6	49019	49024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986486
1044	NC_008011	GGT	2	6	49036	49041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986486
1045	NC_008011	AGG	2	6	49137	49142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986486
1046	NC_008011	GATAT	2	10	49211	49220	40 %	40 %	20 %	0 %	94986486
1047	NC_008011	CAG	2	6	49262	49267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986486
1048	NC_008011	TGA	2	6	49278	49283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986486
1049	NC_008011	AGG	2	6	49302	49307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986486
1050	NC_008011	A	6	6	49326	49331	100 %	0 %	0 %	0 %	94986486
1051	NC_008011	ACA	2	6	49356	49361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986486
1052	NC_008011	AGC	2	6	49362	49367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986486
1053	NC_008011	T	6	6	49371	49376	0 %	100 %	0 %	0 %	94986486
1054	NC_008011	AAT	2	6	49607	49612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986486
1055	NC_008011	TAT	2	6	49934	49939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986487
1056	NC_008011	ATAACG	2	12	49955	49966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94986487
1057	NC_008011	TTA	2	6	50002	50007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986487
1058	NC_008011	TATG	2	8	50008	50015	25 %	50 %	25 %	0 %	94986487
1059	NC_008011	GAT	3	9	50038	50046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986487
1060	NC_008011	GCA	3	9	50050	50058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986487
1061	NC_008011	CTCTT	2	10	50066	50075	0 %	60 %	0 %	40 %	94986487
1062	NC_008011	ATGAA	2	10	50165	50174	60 %	20 %	20 %	0 %	94986487
1063	NC_008011	TTC	2	6	50207	50212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986487
1064	NC_008011	TGG	2	6	50417	50422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986488
1065	NC_008011	TCT	2	6	50469	50474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986488
1066	NC_008011	GGT	2	6	50646	50651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986488
1067	NC_008011	TGA	2	6	50666	50671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986488
1068	NC_008011	CAG	2	6	50689	50694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1069	NC_008011	GCA	2	6	50715	50720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1070	NC_008011	TTC	2	6	50723	50728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986488
1071	NC_008011	TTC	3	9	50768	50776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986488
1072	NC_008011	GGA	2	6	50778	50783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1073	NC_008011	TAA	3	9	50849	50857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986488
1074	NC_008011	ATC	2	6	50930	50935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986488
1075	NC_008011	TCT	2	6	50940	50945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986488
1076	NC_008011	ATG	2	6	50974	50979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986488
1077	NC_008011	CTA	2	6	51091	51096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986488
1078	NC_008011	GAAG	2	8	51132	51139	50 %	0 %	50 %	0 %	94986488
1079	NC_008011	GGT	2	6	51141	51146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986488
1080	NC_008011	ATA	2	6	51151	51156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986488
1081	NC_008011	GTAG	2	8	51162	51169	25 %	25 %	50 %	0 %	94986488
1082	NC_008011	TGG	2	6	51176	51181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986488
1083	NC_008011	ATCAGG	2	12	51194	51205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94986488
1084	NC_008011	AGG	2	6	51221	51226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1085	NC_008011	GGA	3	9	51279	51287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1086	NC_008011	TGC	2	6	51296	51301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1087	NC_008011	TGG	2	6	51302	51307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986488
1088	NC_008011	GGA	2	6	51330	51335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1089	NC_008011	CTG	2	6	51346	51351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986488
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1091	NC_008011	GGA	2	6	51501	51506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1092	NC_008011	AGG	2	6	51521	51526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1093	NC_008011	AGG	2	6	51542	51547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1094	NC_008011	CTG	2	6	51559	51564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1095	NC_008011	GGA	2	6	51591	51596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1096	NC_008011	CTG	2	6	51607	51612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1097	NC_008011	AGC	2	6	51740	51745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1098	NC_008011	CAG	2	6	51763	51768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1099	NC_008011	TGT	2	6	51779	51784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986488
1100	NC_008011	AAG	2	6	51794	51799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986488
1101	NC_008011	AGG	2	6	51800	51805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1102	NC_008011	AGA	2	6	51806	51811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986488
1103	NC_008011	GAA	2	6	51829	51834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986488
1104	NC_008011	GGA	2	6	51906	51911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1105	NC_008011	AGC	2	6	51920	51925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1106	NC_008011	AGC	2	6	51929	51934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1107	NC_008011	AGC	2	6	51947	51952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1108	NC_008011	AGC	2	6	51965	51970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1109	NC_008011	CTA	2	6	51982	51987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986488
1110	NC_008011	CAG	2	6	51999	52004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986488
1111	NC_008011	TGG	2	6	52073	52078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986488
1112	NC_008011	GTA	2	6	52096	52101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986488
1113	NC_008011	TAA	2	6	52160	52165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986488
1114	NC_008011	ATGG	2	8	52184	52191	25 %	25 %	50 %	0 %	94986488
1115	NC_008011	GAT	2	6	52236	52241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986488
1116	NC_008011	ACTAC	2	10	52254	52263	40 %	20 %	0 %	40 %	94986488
1117	NC_008011	TAA	3	9	52265	52273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986488
1118	NC_008011	TGT	2	6	52325	52330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986488
1119	NC_008011	GTAT	2	8	52405	52412	25 %	50 %	25 %	0 %	94986488
1120	NC_008011	GGA	2	6	52425	52430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986488
1121	NC_008011	GTA	3	9	52432	52440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986488
1122	NC_008011	CTC	2	6	52448	52453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986488
1123	NC_008011	TGA	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986488
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