MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 2840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	TGT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962709
2	NC_007930	TTC	2	6	127	132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962709
3	NC_007930	AGA	2	6	215	220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962709
4	NC_007930	ATA	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962709
5	NC_007930	ACA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962709
6	NC_007930	CAA	3	9	298	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962709
7	NC_007930	CAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962709
8	NC_007930	GAA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962709
9	NC_007930	TGT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962709
10	NC_007930	ATT	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962709
11	NC_007930	CAA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962710
12	NC_007930	ATG	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962710
13	NC_007930	TAA	2	6	1325	1330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962710
14	NC_007930	GTT	2	6	1333	1338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962710
15	NC_007930	AAC	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962710
16	NC_007930	AAT	2	6	1510	1515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962710
17	NC_007930	ATT	3	9	1524	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
18	NC_007930	AAT	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962710
19	NC_007930	GAA	2	6	1764	1769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962710
20	NC_007930	ATT	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
21	NC_007930	AAG	2	6	1811	1816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962710
22	NC_007930	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
23	NC_007930	ATC	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962710
24	NC_007930	GAT	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962710
25	NC_007930	TAT	2	6	2027	2032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962710
26	NC_007930	TAT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962711
27	NC_007930	ATC	2	6	5500	5505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962711
28	NC_007930	AGA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
29	NC_007930	TTC	2	6	5657	5662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962711
30	NC_007930	CCA	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962711
31	NC_007930	ATT	2	6	5768	5773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962711
32	NC_007930	TTC	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962711
33	NC_007930	TTG	2	6	5844	5849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962711
34	NC_007930	AAG	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
35	NC_007930	AGA	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
36	NC_007930	TGA	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962711
37	NC_007930	GAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962711
38	NC_007930	TGG	2	6	6123	6128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90962712
39	NC_007930	TGA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962712
40	NC_007930	ATA	2	6	6299	6304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962712
41	NC_007930	AAG	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962712
42	NC_007930	AAT	3	9	7036	7044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962713
43	NC_007930	AGT	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962713
44	NC_007930	AAG	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962713
45	NC_007930	TGT	2	6	7515	7520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962713
46	NC_007930	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962713
47	NC_007930	GTT	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962713
48	NC_007930	AAC	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962713
49	NC_007930	AGT	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962714
50	NC_007930	CAT	2	6	8412	8417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962714
51	NC_007930	ATA	2	6	8515	8520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962714
52	NC_007930	AGC	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962715
53	NC_007930	GTT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
54	NC_007930	CAC	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962715
55	NC_007930	GCT	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90962715
56	NC_007930	TTG	2	6	9117	9122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
57	NC_007930	TTG	2	6	9140	9145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
58	NC_007930	TCT	2	6	9202	9207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962715
59	NC_007930	AAT	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
60	NC_007930	AGA	2	6	9279	9284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962715
61	NC_007930	ATT	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962715
62	NC_007930	TAA	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
63	NC_007930	AAG	2	6	9608	9613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962715
64	NC_007930	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
65	NC_007930	TCT	2	6	9700	9705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962715
66	NC_007930	ACA	2	6	9730	9735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962715
67	NC_007930	GCT	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90962715
68	NC_007930	GTT	2	6	9971	9976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
69	NC_007930	ATA	2	6	9991	9996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
70	NC_007930	ATT	2	6	10056	10061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962715
71	NC_007930	CAT	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
72	NC_007930	TAA	2	6	10137	10142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
73	NC_007930	AAT	2	6	10279	10284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
74	NC_007930	CAT	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
75	NC_007930	ATC	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
76	NC_007930	CCA	2	6	10371	10376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962715
77	NC_007930	TGA	2	6	10405	10410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962715
78	NC_007930	CAA	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962715
79	NC_007930	TAA	2	6	10476	10481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
80	NC_007930	ATA	2	6	10587	10592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962715
81	NC_007930	AGT	2	6	10764	10769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962715
82	NC_007930	TCA	2	6	10885	10890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
83	NC_007930	GTT	2	6	10943	10948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962715
84	NC_007930	AAG	2	6	10973	10978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962715
85	NC_007930	CAT	2	6	10989	10994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
86	NC_007930	ATC	2	6	11079	11084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962715
87	NC_007930	ATT	2	6	11284	11289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962715
88	NC_007930	ATT	2	6	12142	12147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962716
89	NC_007930	GCA	2	6	12354	12359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962716
90	NC_007930	TTA	2	6	12438	12443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962716
91	NC_007930	AGT	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962716
92	NC_007930	AAT	2	6	12522	12527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962716
93	NC_007930	CTT	2	6	12592	12597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90962716
94	NC_007930	AAT	2	6	12685	12690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962716
95	NC_007930	ACA	2	6	12942	12947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962716
96	NC_007930	ATT	2	6	12962	12967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962716
97	NC_007930	CAT	2	6	13280	13285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962717
98	NC_007930	TAA	2	6	13291	13296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962717
99	NC_007930	ATT	2	6	13362	13367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962717
100	NC_007930	TAA	2	6	13390	13395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962717
101	NC_007930	GTT	2	6	13428	13433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962717
102	NC_007930	ATT	2	6	13493	13498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962717
103	NC_007930	TGA	2	6	13517	13522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962717
104	NC_007930	TGT	2	6	13530	13535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962717
105	NC_007930	AGA	2	6	13538	13543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962717
106	NC_007930	CCA	2	6	13590	13595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90962717
107	NC_007930	GGC	2	6	13607	13612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90962717
108	NC_007930	TAA	2	6	13744	13749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962717
109	NC_007930	AGC	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962718
110	NC_007930	AGT	2	6	14207	14212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962718
111	NC_007930	AGA	2	6	14213	14218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962718
112	NC_007930	ATA	2	6	14245	14250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962718
113	NC_007930	TTG	2	6	14389	14394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962718
114	NC_007930	TGA	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962718
115	NC_007930	TCA	2	6	14601	14606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90962718
116	NC_007930	CAA	3	9	14611	14619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962718
117	NC_007930	GCT	2	6	14787	14792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90962718
118	NC_007930	ATG	2	6	14793	14798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962718
119	NC_007930	GAA	2	6	14904	14909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962718
120	NC_007930	ACA	2	6	14970	14975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90962718
121	NC_007930	CAG	2	6	14983	14988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962718
122	NC_007930	TTA	2	6	14989	14994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90962718
123	NC_007930	GGT	2	6	15021	15026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90962718
124	NC_007930	GCA	2	6	15033	15038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962718
125	NC_007930	GAC	2	6	15093	15098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90962718
126	NC_007930	AAG	2	6	15099	15104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962718
127	NC_007930	TTG	2	6	15106	15111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90962718
128	NC_007930	GAA	2	6	15483	15488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90962719
129	NC_007930	ATA	2	6	15496	15501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962719
130	NC_007930	AAT	2	6	15552	15557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90962719
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132	NC_007930	TAG	2	6	15593	15598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90962719
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