MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 25719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	CAG	2	6	95	100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960991
2	NC_007929	ATT	2	6	161	166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960991
3	NC_007929	AAG	2	6	206	211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
4	NC_007929	ATA	3	9	317	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960991
5	NC_007929	TTC	2	6	327	332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960991
6	NC_007929	TGT	2	6	381	386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960991
7	NC_007929	GCA	3	9	412	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960991
8	NC_007929	GAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
9	NC_007929	CTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960991
10	NC_007929	CGG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90960991
11	NC_007929	AAG	2	6	614	619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
12	NC_007929	TAC	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
13	NC_007929	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
14	NC_007929	ATG	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960991
15	NC_007929	TCA	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
16	NC_007929	CAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960991
17	NC_007929	CTC	2	6	842	847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90960991
18	NC_007929	TTC	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960991
19	NC_007929	CTA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
20	NC_007929	AGC	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960991
21	NC_007929	TAT	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960991
22	NC_007929	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960991
23	NC_007929	ACT	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
24	NC_007929	CAT	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960992
25	NC_007929	ATC	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960992
26	NC_007929	GAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960992
27	NC_007929	TGC	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960992
28	NC_007929	AAG	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
29	NC_007929	GTT	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960992
30	NC_007929	CAA	2	6	1839	1844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960992
31	NC_007929	CAG	2	6	1857	1862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960992
32	NC_007929	GAA	2	6	1889	1894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
33	NC_007929	TTA	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960992
34	NC_007929	TAA	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960992
35	NC_007929	ATC	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960992
36	NC_007929	ATG	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960992
37	NC_007929	TTA	2	6	2130	2135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960992
38	NC_007929	ATT	2	6	2221	2226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960992
39	NC_007929	CTT	2	6	2241	2246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960992
40	NC_007929	AAT	2	6	2387	2392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960992
41	NC_007929	GAA	3	9	2468	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
42	NC_007929	AGA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
43	NC_007929	ATT	2	6	3135	3140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960993
44	NC_007929	TTG	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960993
45	NC_007929	TGG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960993
46	NC_007929	ATG	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960993
47	NC_007929	ATG	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960993
48	NC_007929	AAT	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960993
49	NC_007929	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960994
50	NC_007929	GAG	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90960994
51	NC_007929	TCA	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960994
52	NC_007929	TCG	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960994
53	NC_007929	AAT	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960994
54	NC_007929	ATG	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
55	NC_007929	ACA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960994
56	NC_007929	GAT	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
57	NC_007929	CAG	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960994
58	NC_007929	TGA	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
59	NC_007929	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960994
60	NC_007929	GAT	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
61	NC_007929	CAA	2	6	4362	4367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960994
62	NC_007929	AGA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960994
63	NC_007929	GAG	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90960994
64	NC_007929	GAA	3	9	4457	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
65	NC_007929	AAG	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
66	NC_007929	ATG	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
67	NC_007929	CAA	2	6	4575	4580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
68	NC_007929	CAT	2	6	4595	4600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960995
69	NC_007929	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
70	NC_007929	TGA	2	6	4654	4659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
71	NC_007929	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
72	NC_007929	GTC	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960995
73	NC_007929	GGT	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960995
74	NC_007929	TGG	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960995
75	NC_007929	CAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
76	NC_007929	GAT	2	6	4898	4903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
77	NC_007929	TGA	2	6	5113	5118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
78	NC_007929	AAG	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
79	NC_007929	GAA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
80	NC_007929	TGG	2	6	5161	5166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960995
81	NC_007929	CAA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
82	NC_007929	ATG	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
83	NC_007929	GTA	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
84	NC_007929	ATT	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
85	NC_007929	AAG	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
86	NC_007929	ATT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
87	NC_007929	CTG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960995
88	NC_007929	CAA	2	6	5871	5876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
89	NC_007929	GAA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
90	NC_007929	GAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
91	NC_007929	ATC	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960995
92	NC_007929	ACC	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90960995
93	NC_007929	GAT	2	6	6124	6129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
94	NC_007929	GAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
95	NC_007929	ATG	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
96	NC_007929	ACC	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90960995
97	NC_007929	TCG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960995
98	NC_007929	ATT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
99	NC_007929	AGA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
100	NC_007929	TCG	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960995
101	NC_007929	TAA	2	6	6391	6396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960995
102	NC_007929	TCG	2	6	6580	6585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960996
103	NC_007929	TTG	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960996
104	NC_007929	TAG	2	6	6750	6755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
105	NC_007929	TGC	3	9	6793	6801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960996
106	NC_007929	CAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960996
107	NC_007929	TGT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960996
108	NC_007929	GAC	2	6	6979	6984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960996
109	NC_007929	TGA	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
110	NC_007929	ACA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960996
111	NC_007929	TTG	2	6	7218	7223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960996
112	NC_007929	AAT	2	6	7394	7399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960996
113	NC_007929	ACT	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960996
114	NC_007929	TAC	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960996
115	NC_007929	AAG	3	9	7515	7523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960996
116	NC_007929	TCG	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960996
117	NC_007929	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960996
118	NC_007929	TGA	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
119	NC_007929	GCA	2	6	7787	7792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960996
120	NC_007929	GAA	2	6	7850	7855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960996
121	NC_007929	CTA	2	6	7856	7861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960996
122	NC_007929	TGA	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
123	NC_007929	GAA	3	9	7946	7954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960996
124	NC_007929	GTA	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
125	NC_007929	GTG	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960996
126	NC_007929	ATG	3	9	8061	8069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
127	NC_007929	GAC	2	6	8089	8094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960996
128	NC_007929	ATG	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
129	NC_007929	TAA	2	6	8400	8405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960996
130	NC_007929	GAT	2	6	8420	8425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960996
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132	NC_007929	TCA	2	6	8449	8454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960996
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