MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007576	ACGA	2	8	218736	218743	50 %	0 %	25 %	25 %	81427835
4002	NC_007576	TAA	2	6	218760	218765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427835
4003	NC_007576	AAT	2	6	218965	218970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427836
4004	NC_007576	ATC	2	6	219013	219018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427836
4005	NC_007576	GAC	2	6	219072	219077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427836
4006	NC_007576	AAGAT	2	10	219116	219125	60 %	20 %	20 %	0 %	81427836
4007	NC_007576	GTT	2	6	219160	219165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427836
4008	NC_007576	GTT	2	6	219230	219235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427836
4009	NC_007576	AG	3	6	219237	219242	50 %	0 %	50 %	0 %	81427836
4010	NC_007576	GGA	2	6	219260	219265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81427836
4011	NC_007576	CAG	2	6	219269	219274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427836
4012	NC_007576	ATA	2	6	219334	219339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427836
4013	NC_007576	ACT	2	6	219462	219467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427837
4014	NC_007576	GTT	2	6	219514	219519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427837
4015	NC_007576	AAT	2	6	219545	219550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427837
4016	NC_007576	TAA	3	9	219715	219723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427837
4017	NC_007576	TGA	2	6	219757	219762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427837
4018	NC_007576	CG	3	6	219780	219785	0 %	0 %	50 %	50 %	81427837
4019	NC_007576	ATTA	2	8	219790	219797	50 %	50 %	0 %	0 %	81427837
4020	NC_007576	CAA	2	6	219888	219893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427837
4021	NC_007576	TCA	2	6	220074	220079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427838
4022	NC_007576	AGC	2	6	220088	220093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427838
4023	NC_007576	ATT	2	6	220103	220108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427838
4024	NC_007576	AGCA	2	8	220109	220116	50 %	0 %	25 %	25 %	81427838
4025	NC_007576	GTT	2	6	220128	220133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427838
4026	NC_007576	TCG	2	6	220142	220147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427838
4027	NC_007576	TCGGT	2	10	220259	220268	0 %	40 %	40 %	20 %	81427838
4028	NC_007576	TA	3	6	220282	220287	50 %	50 %	0 %	0 %	81427838
4029	NC_007576	ATATCA	2	12	220357	220368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	81427838
4030	NC_007576	CAA	2	6	220416	220421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427838
4031	NC_007576	AAG	2	6	220534	220539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427838
4032	NC_007576	AGA	2	6	220658	220663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427838
4033	NC_007576	AGA	2	6	220685	220690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427838
4034	NC_007576	ACCA	2	8	220720	220727	50 %	0 %	0 %	50 %	81427838
4035	NC_007576	ACA	2	6	220769	220774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427838
4036	NC_007576	ATA	2	6	221080	221085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427839
4037	NC_007576	GGT	2	6	221210	221215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427839
4038	NC_007576	TCA	2	6	221222	221227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427839
4039	NC_007576	TGC	2	6	221255	221260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427839
4040	NC_007576	GAT	2	6	221375	221380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427839
4041	NC_007576	CTT	2	6	221392	221397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427839
4042	NC_007576	ATTG	2	8	221426	221433	25 %	50 %	25 %	0 %	81427839
4043	NC_007576	GC	3	6	221457	221462	0 %	0 %	50 %	50 %	81427839
4044	NC_007576	AAGCCA	2	12	221491	221502	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	81427839
4045	NC_007576	AAG	2	6	221569	221574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427839
4046	NC_007576	TCA	2	6	221588	221593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427839
4047	NC_007576	ACGAAG	2	12	221664	221675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	81427839
4048	NC_007576	TTC	2	6	221766	221771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427839
4049	NC_007576	CTTA	2	8	221881	221888	25 %	50 %	0 %	25 %	81427839
4050	NC_007576	ATA	2	6	221902	221907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427839
4051	NC_007576	ACG	2	6	221916	221921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427839
4052	NC_007576	CAATG	2	10	221986	221995	40 %	20 %	20 %	20 %	81427839
4053	NC_007576	GAT	2	6	222000	222005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427839
4054	NC_007576	ATG	2	6	222033	222038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427839
4055	NC_007576	CAT	2	6	222106	222111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427839
4056	NC_007576	TAA	2	6	222164	222169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427839
4057	NC_007576	CTG	2	6	222172	222177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427839
4058	NC_007576	CGA	2	6	222257	222262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427839
4059	NC_007576	CCA	2	6	222299	222304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427839
4060	NC_007576	TAT	2	6	222374	222379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427839
4061	NC_007576	AAC	2	6	222394	222399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427839
4062	NC_007576	CAA	3	9	222453	222461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427839
4063	NC_007576	TTC	2	6	222462	222467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427839
4064	NC_007576	TTG	2	6	222537	222542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427839
4065	NC_007576	TGAC	2	8	222544	222551	25 %	25 %	25 %	25 %	81427839
4066	NC_007576	CGA	2	6	222665	222670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427839
4067	NC_007576	TAC	2	6	222718	222723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427839
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4069	NC_007576	GAA	2	6	222851	222856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427839
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4071	NC_007576	TTC	2	6	222900	222905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427839
4072	NC_007576	CAAC	2	8	222951	222958	50 %	0 %	0 %	50 %	81427839
4073	NC_007576	ATG	2	6	222967	222972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427839
4074	NC_007576	AGC	2	6	223025	223030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427839
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4078	NC_007576	TGA	2	6	223111	223116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427839
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4081	NC_007576	GAC	2	6	223226	223231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427839
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4088	NC_007576	AAAAG	2	10	223577	223586	80 %	0 %	20 %	0 %	81427839
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4095	NC_007576	TGG	2	6	223944	223949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427840
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4102	NC_007576	GTTA	2	8	224220	224227	25 %	50 %	25 %	0 %	81427840
4103	NC_007576	GGT	2	6	224230	224235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427840
4104	NC_007576	CTA	2	6	224248	224253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427840
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4106	NC_007576	ATT	2	6	224293	224298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427840
4107	NC_007576	ACCA	2	8	224325	224332	50 %	0 %	0 %	50 %	81427840
4108	NC_007576	CA	3	6	224331	224336	50 %	0 %	0 %	50 %	81427840
4109	NC_007576	CA	3	6	224340	224345	50 %	0 %	0 %	50 %	81427840
4110	NC_007576	ATT	2	6	224383	224388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427840
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4112	NC_007576	TAG	2	6	224447	224452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427840
4113	NC_007576	AAG	2	6	224483	224488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427840
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4115	NC_007576	AAC	2	6	224498	224503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427840
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4118	NC_007576	TTC	2	6	224563	224568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427840
4119	NC_007576	GGT	2	6	224673	224678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427840
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4121	NC_007576	TG	3	6	224774	224779	0 %	50 %	50 %	0 %	81427840
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4248	NC_007576	CAT	2	6	232218	232223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427848
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4494	NC_007576	TTG	2	6	244738	244743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427862
4495	NC_007576	AGT	2	6	244809	244814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427862
4496	NC_007576	TTGGT	2	10	244848	244857	0 %	60 %	40 %	0 %	81427862
4497	NC_007576	GTT	2	6	244864	244869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427862
4498	NC_007576	CTT	2	6	244948	244953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427862
4499	NC_007576	TGGT	2	8	244960	244967	0 %	50 %	50 %	0 %	81427862
4500	NC_007576	TTG	2	6	245003	245008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427862

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