MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007576	ACA	2	6	164259	164264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427782
3002	NC_007576	ACA	2	6	164275	164280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427782
3003	NC_007576	AGG	2	6	164372	164377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81427782
3004	NC_007576	AT	3	6	164415	164420	50 %	50 %	0 %	0 %	81427782
3005	NC_007576	AAT	2	6	164563	164568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3006	NC_007576	GAA	2	6	164580	164585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427782
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3008	NC_007576	CTA	2	6	164632	164637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427782
3009	NC_007576	ACA	2	6	164647	164652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427782
3010	NC_007576	TGA	2	6	164772	164777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427782
3011	NC_007576	AAGT	2	8	164820	164827	50 %	25 %	25 %	0 %	81427782
3012	NC_007576	AAG	2	6	164835	164840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427782
3013	NC_007576	GGT	2	6	164869	164874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427782
3014	NC_007576	TGG	2	6	164880	164885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427782
3015	NC_007576	TTA	2	6	164951	164956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
3016	NC_007576	T	7	7	164982	164988	0 %	100 %	0 %	0 %	81427782
3017	NC_007576	TAG	2	6	165003	165008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427782
3018	NC_007576	ATG	2	6	165065	165070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427782
3019	NC_007576	ATA	2	6	165157	165162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3020	NC_007576	TAC	2	6	165228	165233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427782
3021	NC_007576	CAA	2	6	165241	165246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427782
3022	NC_007576	TCA	2	6	165343	165348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427782
3023	NC_007576	TA	3	6	165368	165373	50 %	50 %	0 %	0 %	81427782
3024	NC_007576	AATT	2	8	165426	165433	50 %	50 %	0 %	0 %	81427782
3025	NC_007576	CAC	2	6	165482	165487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427782
3026	NC_007576	AGA	2	6	165525	165530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427782
3027	NC_007576	A	6	6	165546	165551	100 %	0 %	0 %	0 %	81427782
3028	NC_007576	ATA	2	6	165719	165724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3029	NC_007576	TTC	2	6	165762	165767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427782
3030	NC_007576	ATT	2	6	165793	165798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
3031	NC_007576	TAA	2	6	165836	165841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3032	NC_007576	TGT	2	6	166011	166016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427782
3033	NC_007576	CAA	2	6	166039	166044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427782
3034	NC_007576	A	6	6	166108	166113	100 %	0 %	0 %	0 %	81427782
3035	NC_007576	A	6	6	166116	166121	100 %	0 %	0 %	0 %	81427782
3036	NC_007576	TAGAT	2	10	166128	166137	40 %	40 %	20 %	0 %	81427782
3037	NC_007576	CACTAA	2	12	166200	166211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	81427782
3038	NC_007576	ATT	2	6	166234	166239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
3039	NC_007576	GTTA	2	8	166285	166292	25 %	50 %	25 %	0 %	81427782
3040	NC_007576	GTGAG	2	10	166310	166319	20 %	20 %	60 %	0 %	81427782
3041	NC_007576	AATT	2	8	166349	166356	50 %	50 %	0 %	0 %	81427782
3042	NC_007576	GTG	2	6	166384	166389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427782
3043	NC_007576	TTA	2	6	166430	166435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
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3045	NC_007576	A	7	7	166492	166498	100 %	0 %	0 %	0 %	81427782
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3049	NC_007576	ATT	2	6	166700	166705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
3050	NC_007576	A	6	6	166718	166723	100 %	0 %	0 %	0 %	81427782
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3052	NC_007576	TAA	2	6	166839	166844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3053	NC_007576	TAA	2	6	166854	166859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3054	NC_007576	TTG	2	6	166940	166945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427782
3055	NC_007576	ACTAG	2	10	167020	167029	40 %	20 %	20 %	20 %	81427782
3056	NC_007576	TTC	2	6	167079	167084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427782
3057	NC_007576	GAA	2	6	167194	167199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427782
3058	NC_007576	ATT	2	6	167212	167217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
3059	NC_007576	TAT	2	6	167272	167277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
3060	NC_007576	TAC	2	6	167335	167340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427782
3061	NC_007576	GAT	2	6	167374	167379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427782
3062	NC_007576	TGA	2	6	167481	167486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427782
3063	NC_007576	TGAGTT	2	12	167523	167534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	81427782
3064	NC_007576	TTAAT	2	10	167555	167564	40 %	60 %	0 %	0 %	81427782
3065	NC_007576	TTA	2	6	167595	167600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427782
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3067	NC_007576	AAT	2	6	167747	167752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427782
3068	NC_007576	GCT	3	9	167849	167857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427783
3069	NC_007576	A	7	7	167960	167966	100 %	0 %	0 %	0 %	81427783
3070	NC_007576	TGG	3	9	168043	168051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427783
3071	NC_007576	A	6	6	168254	168259	100 %	0 %	0 %	0 %	81427783
3072	NC_007576	ATC	2	6	168268	168273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427783
3073	NC_007576	GTA	2	6	168279	168284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427783
3074	NC_007576	TGC	2	6	168385	168390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427783
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3079	NC_007576	CAAT	2	8	168502	168509	50 %	25 %	0 %	25 %	81427783
3080	NC_007576	GAT	2	6	168685	168690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427784
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3088	NC_007576	AGT	2	6	169187	169192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427785
3089	NC_007576	CAT	2	6	169380	169385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427785
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3091	NC_007576	AAT	2	6	169449	169454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427785
3092	NC_007576	CCGAT	2	10	169456	169465	20 %	20 %	20 %	40 %	81427785
3093	NC_007576	A	7	7	169542	169548	100 %	0 %	0 %	0 %	81427785
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3097	NC_007576	A	6	6	169734	169739	100 %	0 %	0 %	0 %	81427785
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3100	NC_007576	TAT	2	6	169797	169802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427785
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3103	NC_007576	CAG	2	6	170247	170252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427787
3104	NC_007576	ATG	2	6	170256	170261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427787
3105	NC_007576	ACA	2	6	170298	170303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427787
3106	NC_007576	CAT	2	6	170478	170483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427787
3107	NC_007576	GAT	2	6	170525	170530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427787
3108	NC_007576	GTT	2	6	170570	170575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427787
3109	NC_007576	ACA	2	6	170627	170632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427787
3110	NC_007576	GAT	2	6	170669	170674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427787
3111	NC_007576	CAAT	2	8	170703	170710	50 %	25 %	0 %	25 %	81427787
3112	NC_007576	CAG	2	6	170751	170756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427787
3113	NC_007576	ATG	2	6	170775	170780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427787
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3117	NC_007576	TCATTA	2	12	170852	170863	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	81427787
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3119	NC_007576	TGC	2	6	170896	170901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427787
3120	NC_007576	TTGG	2	8	170931	170938	0 %	50 %	50 %	0 %	81427787
3121	NC_007576	TA	3	6	171021	171026	50 %	50 %	0 %	0 %	81427787
3122	NC_007576	ATA	2	6	171043	171048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427787
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3496	NC_007576	GAT	2	6	189625	189630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427806
3497	NC_007576	CAA	2	6	189664	189669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427806
3498	NC_007576	AC	3	6	190121	190126	50 %	0 %	0 %	50 %	81427806
3499	NC_007576	CTT	2	6	190137	190142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427806
3500	NC_007576	GAA	3	9	190330	190338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427806

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