MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007576	TTC	2	6	297958	297963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427914
5502	NC_007576	AGCG	2	8	298014	298021	25 %	0 %	50 %	25 %	81427914
5503	NC_007576	ACC	2	6	298083	298088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427914
5504	NC_007576	ATT	2	6	298159	298164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427914
5505	NC_007576	ATT	2	6	298180	298185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427914
5506	NC_007576	AGA	2	6	298287	298292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427914
5507	NC_007576	ATT	2	6	298326	298331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427914
5508	NC_007576	GGT	2	6	298381	298386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427914
5509	NC_007576	TTA	2	6	298408	298413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427914
5510	NC_007576	TTA	2	6	298468	298473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427914
5511	NC_007576	CGT	2	6	298498	298503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427914
5512	NC_007576	GAA	2	6	298534	298539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427914
5513	NC_007576	TGG	2	6	298575	298580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427914
5514	NC_007576	CAAA	2	8	298593	298600	75 %	0 %	0 %	25 %	81427914
5515	NC_007576	TGG	2	6	298611	298616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427914
5516	NC_007576	ACA	2	6	298633	298638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427914
5517	NC_007576	CAC	2	6	298661	298666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427914
5518	NC_007576	GGTT	2	8	298675	298682	0 %	50 %	50 %	0 %	81427914
5519	NC_007576	CAG	2	6	298769	298774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427914
5520	NC_007576	AGC	2	6	298821	298826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427914
5521	NC_007576	A	6	6	298973	298978	100 %	0 %	0 %	0 %	81427914
5522	NC_007576	AGT	2	6	299272	299277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427915
5523	NC_007576	TTA	2	6	299278	299283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427915
5524	NC_007576	GGT	2	6	299374	299379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427915
5525	NC_007576	TCG	2	6	299469	299474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427915
5526	NC_007576	CGG	2	6	299522	299527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427915
5527	NC_007576	GCCGT	2	10	299590	299599	0 %	20 %	40 %	40 %	81427915
5528	NC_007576	CGG	2	6	299640	299645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427915
5529	NC_007576	GTG	3	9	299661	299669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427915
5530	NC_007576	CAA	2	6	299728	299733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427915
5531	NC_007576	AAC	2	6	299816	299821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427915
5532	NC_007576	AAC	2	6	299883	299888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427915
5533	NC_007576	TTA	2	6	299902	299907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427915
5534	NC_007576	TTG	2	6	299921	299926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427915
5535	NC_007576	ACA	2	6	299929	299934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427915
5536	NC_007576	ATG	2	6	299947	299952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427915
5537	NC_007576	AGC	2	6	300000	300005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427915
5538	NC_007576	TGA	2	6	300036	300041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427915
5539	NC_007576	CGG	2	6	300122	300127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427915
5540	NC_007576	ATG	2	6	300163	300168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427916
5541	NC_007576	GGTCA	2	10	300202	300211	20 %	20 %	40 %	20 %	81427916
5542	NC_007576	GTG	2	6	300212	300217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427916
5543	NC_007576	TGT	2	6	300269	300274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427916
5544	NC_007576	GATTA	2	10	300335	300344	40 %	40 %	20 %	0 %	81427917
5545	NC_007576	GAT	2	6	300367	300372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427917
5546	NC_007576	AAG	2	6	300380	300385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427917
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5548	NC_007576	T	6	6	300436	300441	0 %	100 %	0 %	0 %	81427917
5549	NC_007576	TGGT	2	8	300530	300537	0 %	50 %	50 %	0 %	81427917
5550	NC_007576	GTTT	2	8	300608	300615	0 %	75 %	25 %	0 %	81427917
5551	NC_007576	CAA	2	6	300624	300629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427917
5552	NC_007576	TTG	2	6	300651	300656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427917
5553	NC_007576	GAA	2	6	300685	300690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427917
5554	NC_007576	AGA	2	6	300693	300698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427917
5555	NC_007576	ATG	2	6	300761	300766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427917
5556	NC_007576	AAC	2	6	300817	300822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427917
5557	NC_007576	TCAACT	2	12	300860	300871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427917
5558	NC_007576	AAC	2	6	301124	301129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427917
5559	NC_007576	CAA	2	6	301176	301181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427917
5560	NC_007576	TAA	2	6	301230	301235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427917
5561	NC_007576	ATA	2	6	301295	301300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427917
5562	NC_007576	GCG	2	6	301385	301390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427917
5563	NC_007576	A	6	6	301412	301417	100 %	0 %	0 %	0 %	81427917
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5570	NC_007576	CGG	2	6	302045	302050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427918
5571	NC_007576	ATT	2	6	302062	302067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427918
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5574	NC_007576	ACAA	2	8	302453	302460	75 %	0 %	0 %	25 %	81427920
5575	NC_007576	ATG	2	6	302465	302470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427920
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5591	NC_007576	GAC	2	6	303375	303380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427920
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5593	NC_007576	CAT	2	6	303504	303509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427920
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5606	NC_007576	ACAA	2	8	304242	304249	75 %	0 %	0 %	25 %	81427921
5607	NC_007576	T	6	6	304347	304352	0 %	100 %	0 %	0 %	81427921
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5611	NC_007576	CAAC	2	8	304805	304812	50 %	0 %	0 %	50 %	81427921
5612	NC_007576	AAG	2	6	304856	304861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427921
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5619	NC_007576	TTGA	2	8	305053	305060	25 %	50 %	25 %	0 %	81427921
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5993	NC_007576	TGT	2	6	330779	330784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427940
5994	NC_007576	GTT	2	6	330825	330830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427940
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5996	NC_007576	GTA	2	6	330893	330898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427940
5997	NC_007576	GTT	2	6	330909	330914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427940
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5999	NC_007576	CTTGTT	2	12	331008	331019	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	81427940
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