MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007576	TTG	2	6	245034	245039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427862
4502	NC_007576	ATTT	2	8	245161	245168	25 %	75 %	0 %	0 %	81427862
4503	NC_007576	AT	3	6	245175	245180	50 %	50 %	0 %	0 %	81427862
4504	NC_007576	ATTG	2	8	245187	245194	25 %	50 %	25 %	0 %	81427862
4505	NC_007576	G	6	6	245212	245217	0 %	0 %	100 %	0 %	81427862
4506	NC_007576	GAT	2	6	245266	245271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427862
4507	NC_007576	AGT	2	6	245277	245282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427862
4508	NC_007576	TTG	2	6	245322	245327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427862
4509	NC_007576	ACC	2	6	245342	245347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427862
4510	NC_007576	ACA	2	6	245373	245378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427862
4511	NC_007576	GAA	2	6	245584	245589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427863
4512	NC_007576	T	7	7	245641	245647	0 %	100 %	0 %	0 %	81427863
4513	NC_007576	TGG	2	6	245658	245663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427863
4514	NC_007576	TTCTCG	2	12	245667	245678	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	81427863
4515	NC_007576	TAA	2	6	245740	245745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427863
4516	NC_007576	GGT	2	6	245773	245778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427863
4517	NC_007576	AATT	2	8	245808	245815	50 %	50 %	0 %	0 %	81427863
4518	NC_007576	TGC	2	6	245884	245889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427863
4519	NC_007576	TTTAT	2	10	245913	245922	20 %	80 %	0 %	0 %	81427863
4520	NC_007576	ATG	2	6	245948	245953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427863
4521	NC_007576	CAAC	2	8	246008	246015	50 %	0 %	0 %	50 %	81427863
4522	NC_007576	AAG	2	6	246065	246070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427863
4523	NC_007576	TCAG	2	8	246079	246086	25 %	25 %	25 %	25 %	81427863
4524	NC_007576	AAC	2	6	246231	246236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427863
4525	NC_007576	A	6	6	246245	246250	100 %	0 %	0 %	0 %	81427863
4526	NC_007576	ATTA	2	8	246510	246517	50 %	50 %	0 %	0 %	81427864
4527	NC_007576	CAC	2	6	246535	246540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427864
4528	NC_007576	TTG	2	6	246602	246607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427864
4529	NC_007576	ACA	2	6	246610	246615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427864
4530	NC_007576	TA	3	6	246674	246679	50 %	50 %	0 %	0 %	81427864
4531	NC_007576	TTC	2	6	246697	246702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427864
4532	NC_007576	TTC	2	6	246799	246804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427864
4533	NC_007576	GTTAC	2	10	246823	246832	20 %	40 %	20 %	20 %	81427864
4534	NC_007576	CAA	2	6	246833	246838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427864
4535	NC_007576	GTT	2	6	246853	246858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427864
4536	NC_007576	CAA	2	6	246911	246916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427864
4537	NC_007576	TCA	2	6	246950	246955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427864
4538	NC_007576	TGA	2	6	246960	246965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427864
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4541	NC_007576	ATA	2	6	247017	247022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427864
4542	NC_007576	TAA	2	6	247209	247214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427865
4543	NC_007576	GAA	2	6	247219	247224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427865
4544	NC_007576	AAT	2	6	247225	247230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427865
4545	NC_007576	ATG	2	6	247251	247256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427865
4546	NC_007576	ATG	2	6	247268	247273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427865
4547	NC_007576	TGC	2	6	247321	247326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427865
4548	NC_007576	ATG	2	6	247389	247394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427865
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4550	NC_007576	GCA	2	6	247445	247450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427865
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4552	NC_007576	A	6	6	247512	247517	100 %	0 %	0 %	0 %	81427865
4553	NC_007576	ATC	2	6	247535	247540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427865
4554	NC_007576	GCA	2	6	247613	247618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427865
4555	NC_007576	AGT	2	6	247654	247659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427865
4556	NC_007576	CCAT	2	8	247836	247843	25 %	25 %	0 %	50 %	81427865
4557	NC_007576	TGT	2	6	247861	247866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427865
4558	NC_007576	CTT	2	6	247879	247884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427865
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4560	NC_007576	CTC	2	6	247920	247925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81427865
4561	NC_007576	TGAT	2	8	247956	247963	25 %	50 %	25 %	0 %	81427865
4562	NC_007576	ACT	2	6	247976	247981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427865
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4564	NC_007576	CG	3	6	248022	248027	0 %	0 %	50 %	50 %	81427865
4565	NC_007576	AAG	2	6	248176	248181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427866
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4573	NC_007576	T	6	6	248460	248465	0 %	100 %	0 %	0 %	81427866
4574	NC_007576	CAG	2	6	248466	248471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427866
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4578	NC_007576	TCGC	2	8	248695	248702	0 %	25 %	25 %	50 %	81427866
4579	NC_007576	ATC	2	6	248722	248727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427866
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4587	NC_007576	AAT	2	6	248904	248909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427866
4588	NC_007576	CCA	2	6	249044	249049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427866
4589	NC_007576	TAA	2	6	249075	249080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427866
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4591	NC_007576	TTG	2	6	249175	249180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427866
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4595	NC_007576	TGG	2	6	249519	249524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427867
4596	NC_007576	TGA	2	6	249578	249583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427867
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4599	NC_007576	TAAT	2	8	249794	249801	50 %	50 %	0 %	0 %	81427867
4600	NC_007576	ATGT	2	8	249880	249887	25 %	50 %	25 %	0 %	81427867
4601	NC_007576	CGT	2	6	249913	249918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427867
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4603	NC_007576	GCA	2	6	250021	250026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427867
4604	NC_007576	ATT	2	6	250123	250128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427867
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4606	NC_007576	GCT	2	6	250246	250251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427867
4607	NC_007576	TCA	2	6	250285	250290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427867
4608	NC_007576	A	6	6	250335	250340	100 %	0 %	0 %	0 %	81427867
4609	NC_007576	A	6	6	250369	250374	100 %	0 %	0 %	0 %	81427868
4610	NC_007576	TTA	2	6	250388	250393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427868
4611	NC_007576	ATG	2	6	250397	250402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427868
4612	NC_007576	TGG	2	6	250461	250466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427868
4613	NC_007576	TAG	2	6	250706	250711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427868
4614	NC_007576	TTA	2	6	250765	250770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427868
4615	NC_007576	TTG	2	6	250847	250852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427868
4616	NC_007576	TTA	2	6	250871	250876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427868
4617	NC_007576	GGC	2	6	250882	250887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427868
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4622	NC_007576	ATT	2	6	251194	251199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427869
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4997	NC_007576	TTG	2	6	271911	271916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427891
4998	NC_007576	CTAT	2	8	271944	271951	25 %	50 %	0 %	25 %	81427891
4999	NC_007576	TGC	2	6	271954	271959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427891
5000	NC_007576	TGG	2	6	271999	272004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427891

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