MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 27329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	CAC	2	6	353	358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336355
2	NC_006814	GCT	2	6	439	444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336355
3	NC_006814	TGC	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336355
4	NC_006814	TGG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336355
5	NC_006814	TCA	2	6	549	554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336355
6	NC_006814	TAG	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336355
7	NC_006814	AAG	2	6	731	736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336355
8	NC_006814	TTC	2	6	739	744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336355
9	NC_006814	CCA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336355
10	NC_006814	TAG	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336355
11	NC_006814	AAG	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336355
12	NC_006814	ATT	2	6	1148	1153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336355
13	NC_006814	ACT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336355
14	NC_006814	ACT	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336356
15	NC_006814	GAA	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336356
16	NC_006814	ATT	2	6	1816	1821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
17	NC_006814	ATT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
18	NC_006814	AAT	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336356
19	NC_006814	ATT	2	6	1996	2001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
20	NC_006814	TCT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336356
21	NC_006814	ATT	2	6	2125	2130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
22	NC_006814	ATT	2	6	2203	2208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
23	NC_006814	TTA	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
24	NC_006814	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336356
25	NC_006814	AGA	3	9	2502	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336356
26	NC_006814	TTA	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
27	NC_006814	TTA	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336356
28	NC_006814	TAT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336357
29	NC_006814	AGA	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336357
30	NC_006814	ATT	2	6	3003	3008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336357
31	NC_006814	TCA	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336357
32	NC_006814	GGT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336357
33	NC_006814	AGA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336358
34	NC_006814	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336358
35	NC_006814	ATC	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336358
36	NC_006814	GAT	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336358
37	NC_006814	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336358
38	NC_006814	CAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336358
39	NC_006814	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336358
40	NC_006814	ACT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336358
41	NC_006814	GAT	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336358
42	NC_006814	GGC	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336358
43	NC_006814	TAC	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336358
44	NC_006814	ATA	2	6	4217	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336358
45	NC_006814	AAG	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336359
46	NC_006814	GGC	2	6	4373	4378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336359
47	NC_006814	CAC	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336359
48	NC_006814	GAT	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336359
49	NC_006814	GTC	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336359
50	NC_006814	TGG	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336359
51	NC_006814	CGG	2	6	4642	4647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336359
52	NC_006814	GTT	2	6	4694	4699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336359
53	NC_006814	AAC	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336359
54	NC_006814	TGA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336359
55	NC_006814	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336359
56	NC_006814	AAG	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336359
57	NC_006814	TAT	2	6	5046	5051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336359
58	NC_006814	TGA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336359
59	NC_006814	CTG	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336359
60	NC_006814	CTT	2	6	5419	5424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336359
61	NC_006814	TGC	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336359
62	NC_006814	ATT	2	6	5819	5824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336359
63	NC_006814	CTT	2	6	5864	5869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336359
64	NC_006814	GAA	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336359
65	NC_006814	AGG	2	6	6246	6251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336359
66	NC_006814	ATG	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
67	NC_006814	CGT	2	6	6402	6407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336360
68	NC_006814	AAG	2	6	6456	6461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336360
69	NC_006814	TTG	2	6	6472	6477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
70	NC_006814	TCA	2	6	6513	6518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336360
71	NC_006814	TGA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
72	NC_006814	ATG	2	6	6712	6717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
73	NC_006814	GTT	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
74	NC_006814	ACT	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336360
75	NC_006814	CAC	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336360
76	NC_006814	TGA	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
77	NC_006814	TGA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
78	NC_006814	TAA	2	6	7067	7072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336360
79	NC_006814	AAG	2	6	7086	7091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336360
80	NC_006814	TGA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
81	NC_006814	TGT	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
82	NC_006814	AAT	2	6	7215	7220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336360
83	NC_006814	TGG	2	6	7264	7269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336360
84	NC_006814	TTG	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
85	NC_006814	TAC	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336360
86	NC_006814	AAG	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336360
87	NC_006814	TGT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
88	NC_006814	ATA	2	6	7426	7431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336360
89	NC_006814	TGA	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
90	NC_006814	AGC	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336360
91	NC_006814	TGA	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
92	NC_006814	GTT	2	6	7737	7742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
93	NC_006814	GTG	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336360
94	NC_006814	AAG	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336360
95	NC_006814	TTC	2	6	8103	8108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336360
96	NC_006814	ACT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336360
97	NC_006814	CTG	3	9	8314	8322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336360
98	NC_006814	AGA	2	6	8348	8353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336360
99	NC_006814	TGT	2	6	8357	8362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336360
100	NC_006814	GTG	2	6	8461	8466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336360
101	NC_006814	TGA	2	6	8537	8542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336360
102	NC_006814	TTA	2	6	8554	8559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336360
103	NC_006814	TAT	2	6	8570	8575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336360
104	NC_006814	AAG	2	6	8993	8998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336361
105	NC_006814	GGT	2	6	9038	9043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336361
106	NC_006814	CGT	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336361
107	NC_006814	CTG	2	6	9135	9140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336361
108	NC_006814	TTG	2	6	9294	9299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336362
109	NC_006814	TAC	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336362
110	NC_006814	GTT	3	9	9557	9565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336362
111	NC_006814	GTG	2	6	9618	9623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336362
112	NC_006814	AAT	2	6	9635	9640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336362
113	NC_006814	TAA	2	6	9664	9669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336362
114	NC_006814	TGG	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336362
115	NC_006814	AAT	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336362
116	NC_006814	TAA	2	6	9709	9714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336362
117	NC_006814	TTC	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336362
118	NC_006814	TGA	3	9	9772	9780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336362
119	NC_006814	CAA	2	6	9828	9833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336363
120	NC_006814	AGA	2	6	9834	9839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336363
121	NC_006814	CGT	4	12	9846	9857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336363
122	NC_006814	CGT	2	6	9957	9962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336363
123	NC_006814	TAA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336363
124	NC_006814	GAT	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336364
125	NC_006814	ATT	2	6	10362	10367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336364
126	NC_006814	ATC	2	6	10541	10546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336364
127	NC_006814	GTT	2	6	10717	10722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336364
128	NC_006814	GAT	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336364
129	NC_006814	TGA	2	6	10944	10949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336364
130	NC_006814	TAG	2	6	11040	11045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336364
131	NC_006814	ATA	2	6	11048	11053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336364
132	NC_006814	GTT	2	6	11164	11169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336364
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251	NC_006814	ATA	2	6	20224	20229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336373
252	NC_006814	TAA	2	6	20278	20283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336373
253	NC_006814	TTG	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336373
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