MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006814	TGA	2	6	204761	204766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336550
4002	NC_006814	AACA	2	8	204784	204791	75 %	0 %	0 %	25 %	58336550
4003	NC_006814	GTC	2	6	204877	204882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336550
4004	NC_006814	GAT	2	6	204945	204950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336550
4005	NC_006814	AAAG	2	8	204965	204972	75 %	0 %	25 %	0 %	58336550
4006	NC_006814	GATAAG	2	12	205071	205082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58336550
4007	NC_006814	AAGATG	2	12	205207	205218	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58336550
4008	NC_006814	AAAG	2	8	205247	205254	75 %	0 %	25 %	0 %	58336550
4009	NC_006814	GAA	2	6	205281	205286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336550
4010	NC_006814	ATG	2	6	205385	205390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336551
4011	NC_006814	TAG	2	6	205434	205439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336551
4012	NC_006814	CAT	2	6	205465	205470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336551
4013	NC_006814	TGA	2	6	205513	205518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336551
4014	NC_006814	ATTC	2	8	205559	205566	25 %	50 %	0 %	25 %	58336551
4015	NC_006814	ATT	2	6	205580	205585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336551
4016	NC_006814	TAT	2	6	205697	205702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336551
4017	NC_006814	GATC	2	8	205774	205781	25 %	25 %	25 %	25 %	58336551
4018	NC_006814	GAA	2	6	205814	205819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336551
4019	NC_006814	AATT	2	8	205826	205833	50 %	50 %	0 %	0 %	58336551
4020	NC_006814	TAAA	2	8	205918	205925	75 %	25 %	0 %	0 %	58336552
4021	NC_006814	TAAT	2	8	205939	205946	50 %	50 %	0 %	0 %	58336552
4022	NC_006814	A	7	7	205948	205954	100 %	0 %	0 %	0 %	58336552
4023	NC_006814	A	6	6	206007	206012	100 %	0 %	0 %	0 %	58336552
4024	NC_006814	CTG	2	6	206137	206142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336552
4025	NC_006814	AAT	2	6	206193	206198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336552
4026	NC_006814	GTTTT	2	10	206221	206230	0 %	80 %	20 %	0 %	58336552
4027	NC_006814	CAG	2	6	206256	206261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336552
4028	NC_006814	TAG	2	6	206294	206299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336552
4029	NC_006814	A	7	7	206390	206396	100 %	0 %	0 %	0 %	58336552
4030	NC_006814	CA	3	6	206419	206424	50 %	0 %	0 %	50 %	58336552
4031	NC_006814	A	6	6	206734	206739	100 %	0 %	0 %	0 %	58336553
4032	NC_006814	CAA	2	6	206834	206839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336553
4033	NC_006814	GAA	2	6	206848	206853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336553
4034	NC_006814	AGA	2	6	206857	206862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336553
4035	NC_006814	TTA	2	6	206968	206973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336553
4036	NC_006814	AAT	2	6	207010	207015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336553
4037	NC_006814	CTG	2	6	207212	207217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336553
4038	NC_006814	CTT	2	6	207244	207249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336553
4039	NC_006814	TTGTT	2	10	207262	207271	0 %	80 %	20 %	0 %	58336553
4040	NC_006814	ATT	2	6	207350	207355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336553
4041	NC_006814	GTA	2	6	207391	207396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
4042	NC_006814	TCAGGT	2	12	207397	207408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58336553
4043	NC_006814	ACA	2	6	207459	207464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336553
4044	NC_006814	ATT	2	6	207492	207497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336553
4045	NC_006814	AGC	3	9	207621	207629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336553
4046	NC_006814	TAACT	2	10	207672	207681	40 %	40 %	0 %	20 %	58336553
4047	NC_006814	T	6	6	207761	207766	0 %	100 %	0 %	0 %	58336553
4048	NC_006814	TGAT	2	8	207902	207909	25 %	50 %	25 %	0 %	58336553
4049	NC_006814	TGA	2	6	207978	207983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
4050	NC_006814	ATC	2	6	208040	208045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336553
4051	NC_006814	ATG	3	9	208184	208192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
4052	NC_006814	TAT	2	6	208275	208280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336553
4053	NC_006814	AAAG	2	8	208309	208316	75 %	0 %	25 %	0 %	58336553
4054	NC_006814	AAG	2	6	208322	208327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336553
4055	NC_006814	GAT	2	6	208345	208350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
4056	NC_006814	ATG	2	6	208439	208444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
4057	NC_006814	GGC	2	6	208458	208463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336553
4058	NC_006814	AGA	2	6	208470	208475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336553
4059	NC_006814	TTG	2	6	208487	208492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336553
4060	NC_006814	A	7	7	208556	208562	100 %	0 %	0 %	0 %	58336553
4061	NC_006814	TTG	2	6	208571	208576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336553
4062	NC_006814	AAT	2	6	208642	208647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336553
4063	NC_006814	GAA	2	6	208711	208716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336553
4064	NC_006814	ATT	2	6	208720	208725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336553
4065	NC_006814	T	6	6	208770	208775	0 %	100 %	0 %	0 %	58336553
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4070	NC_006814	TTG	2	6	209000	209005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336553
4071	NC_006814	ATG	2	6	209014	209019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
4072	NC_006814	ATC	2	6	209066	209071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336553
4073	NC_006814	TGA	2	6	209154	209159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336553
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4089	NC_006814	TAC	2	6	210031	210036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336554
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4091	NC_006814	TAA	2	6	210087	210092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336554
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4094	NC_006814	ATG	2	6	210242	210247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336554
4095	NC_006814	TTTA	2	8	210249	210256	25 %	75 %	0 %	0 %	58336554
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4099	NC_006814	TGA	2	6	210389	210394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336554
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4105	NC_006814	ACTC	2	8	210719	210726	25 %	25 %	0 %	50 %	58336554
4106	NC_006814	TTG	2	6	210761	210766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336554
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4108	NC_006814	ACT	2	6	210793	210798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336554
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4110	NC_006814	GAA	2	6	210829	210834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336554
4111	NC_006814	ATG	2	6	210950	210955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336554
4112	NC_006814	GAAA	2	8	210961	210968	75 %	0 %	25 %	0 %	58336554
4113	NC_006814	GGT	2	6	211002	211007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336554
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4118	NC_006814	TGA	2	6	211140	211145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336554
4119	NC_006814	TAT	2	6	211515	211520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336555
4120	NC_006814	TAA	2	6	211583	211588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336555
4121	NC_006814	AGA	2	6	211679	211684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336555
4122	NC_006814	ATT	2	6	211744	211749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336555
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4124	NC_006814	TAG	2	6	211841	211846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336555
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4356	NC_006814	AATA	2	8	222050	222057	75 %	25 %	0 %	0 %	58336566
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4362	NC_006814	TCT	2	6	222402	222407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336566
4363	NC_006814	CGAAG	2	10	222459	222468	40 %	0 %	40 %	20 %	58336566
4364	NC_006814	AGC	2	6	222524	222529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336566
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4493	NC_006814	AATT	2	8	228354	228361	50 %	50 %	0 %	0 %	58336572
4494	NC_006814	GAA	2	6	228430	228435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336572
4495	NC_006814	GAA	3	9	228463	228471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336572
4496	NC_006814	AGA	2	6	228498	228503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336572
4497	NC_006814	TAA	2	6	228512	228517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336572
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4499	NC_006814	AAAG	2	8	228571	228578	75 %	0 %	25 %	0 %	58336572
4500	NC_006814	TGT	2	6	228588	228593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336572

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