MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006814	ACA	2	6	156421	156426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336510
3002	NC_006814	TGG	2	6	156460	156465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336510
3003	NC_006814	AATT	2	8	156546	156553	50 %	50 %	0 %	0 %	58336510
3004	NC_006814	AC	3	6	156675	156680	50 %	0 %	0 %	50 %	58336510
3005	NC_006814	CAAG	2	8	156682	156689	50 %	0 %	25 %	25 %	58336510
3006	NC_006814	TTA	2	6	156699	156704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336510
3007	NC_006814	A	6	6	156740	156745	100 %	0 %	0 %	0 %	58336510
3008	NC_006814	AGAAA	2	10	156830	156839	80 %	0 %	20 %	0 %	58336510
3009	NC_006814	CAT	2	6	156840	156845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336510
3010	NC_006814	TGA	2	6	156855	156860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336510
3011	NC_006814	CAC	2	6	156879	156884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336510
3012	NC_006814	GAC	2	6	156918	156923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336510
3013	NC_006814	TAA	2	6	156937	156942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336510
3014	NC_006814	AAATGA	2	12	156949	156960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58336510
3015	NC_006814	TGA	2	6	156991	156996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336510
3016	NC_006814	AGA	3	9	157030	157038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3017	NC_006814	CTG	2	6	157074	157079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336510
3018	NC_006814	AATC	2	8	157126	157133	50 %	25 %	0 %	25 %	58336510
3019	NC_006814	AGA	2	6	157156	157161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3020	NC_006814	CTG	2	6	157170	157175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336510
3021	NC_006814	ATC	2	6	157191	157196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336510
3022	NC_006814	TCA	2	6	157209	157214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336510
3023	NC_006814	AAG	2	6	157221	157226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3024	NC_006814	TGA	2	6	157291	157296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336510
3025	NC_006814	GAG	2	6	157323	157328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336510
3026	NC_006814	TTG	2	6	157404	157409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336510
3027	NC_006814	A	6	6	157410	157415	100 %	0 %	0 %	0 %	58336510
3028	NC_006814	GTT	2	6	157448	157453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336510
3029	NC_006814	GAA	2	6	157482	157487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3030	NC_006814	TTA	2	6	157501	157506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336510
3031	NC_006814	ATA	2	6	157515	157520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336510
3032	NC_006814	AGA	2	6	157555	157560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3033	NC_006814	AGA	2	6	157593	157598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3034	NC_006814	GAA	2	6	157601	157606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336510
3035	NC_006814	A	6	6	157719	157724	100 %	0 %	0 %	0 %	58336511
3036	NC_006814	ATG	2	6	157744	157749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336511
3037	NC_006814	TTTA	2	8	157828	157835	25 %	75 %	0 %	0 %	58336511
3038	NC_006814	ATT	2	6	157914	157919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3039	NC_006814	GTC	2	6	157924	157929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336511
3040	NC_006814	GCCTTG	2	12	157969	157980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336511
3041	NC_006814	GCT	2	6	158004	158009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336511
3042	NC_006814	TGGC	2	8	158015	158022	0 %	25 %	50 %	25 %	58336511
3043	NC_006814	GGC	2	6	158061	158066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336511
3044	NC_006814	A	6	6	158105	158110	100 %	0 %	0 %	0 %	58336511
3045	NC_006814	ATT	2	6	158283	158288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3046	NC_006814	TAT	2	6	158366	158371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3047	NC_006814	TCT	2	6	158380	158385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336511
3048	NC_006814	TCT	2	6	158483	158488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336511
3049	NC_006814	ATT	2	6	158508	158513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3050	NC_006814	TTA	2	6	158608	158613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3051	NC_006814	CAC	2	6	158722	158727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336511
3052	NC_006814	ATCA	2	8	158753	158760	50 %	25 %	0 %	25 %	58336511
3053	NC_006814	TGG	2	6	158761	158766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336511
3054	NC_006814	ATT	2	6	158795	158800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3055	NC_006814	TGG	2	6	158801	158806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336511
3056	NC_006814	ATT	2	6	158811	158816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3057	NC_006814	ATT	3	9	158856	158864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3058	NC_006814	ATG	2	6	158868	158873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336511
3059	NC_006814	ATT	2	6	158874	158879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336511
3060	NC_006814	TGA	2	6	158881	158886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336511
3061	NC_006814	TA	3	6	158905	158910	50 %	50 %	0 %	0 %	58336511
3062	NC_006814	TAA	2	6	159012	159017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336512
3063	NC_006814	GTG	3	9	159029	159037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336512
3064	NC_006814	A	6	6	159223	159228	100 %	0 %	0 %	0 %	58336512
3065	NC_006814	GAA	2	6	159252	159257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3066	NC_006814	TA	3	6	159269	159274	50 %	50 %	0 %	0 %	58336512
3067	NC_006814	CGT	2	6	159295	159300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336512
3068	NC_006814	GCT	2	6	159382	159387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336512
3069	NC_006814	ATTT	2	8	159389	159396	25 %	75 %	0 %	0 %	58336512
3070	NC_006814	TTCATT	2	12	159402	159413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58336512
3071	NC_006814	GAA	2	6	159444	159449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3072	NC_006814	TTC	2	6	159464	159469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336512
3073	NC_006814	TAC	3	9	159501	159509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336512
3074	NC_006814	GCT	2	6	159523	159528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336512
3075	NC_006814	GAA	2	6	159549	159554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3076	NC_006814	CAAT	2	8	159556	159563	50 %	25 %	0 %	25 %	58336512
3077	NC_006814	TGGC	2	8	159578	159585	0 %	25 %	50 %	25 %	58336512
3078	NC_006814	AGT	2	6	159651	159656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336512
3079	NC_006814	ATC	2	6	159660	159665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336512
3080	NC_006814	AGA	2	6	159666	159671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3081	NC_006814	GATT	2	8	159744	159751	25 %	50 %	25 %	0 %	58336512
3082	NC_006814	CTT	2	6	159753	159758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336512
3083	NC_006814	GAAG	2	8	159759	159766	50 %	0 %	50 %	0 %	58336512
3084	NC_006814	ATT	2	6	159790	159795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336512
3085	NC_006814	TGA	2	6	159825	159830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336512
3086	NC_006814	AATG	2	8	159834	159841	50 %	25 %	25 %	0 %	58336512
3087	NC_006814	TGA	2	6	159852	159857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336512
3088	NC_006814	GAT	2	6	159870	159875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336512
3089	NC_006814	TAA	2	6	159888	159893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336512
3090	NC_006814	CAT	2	6	159929	159934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336512
3091	NC_006814	AGCA	2	8	159986	159993	50 %	0 %	25 %	25 %	58336512
3092	NC_006814	AGT	2	6	160023	160028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336512
3093	NC_006814	GAA	2	6	160060	160065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3094	NC_006814	A	6	6	160069	160074	100 %	0 %	0 %	0 %	58336512
3095	NC_006814	TGAT	2	8	160100	160107	25 %	50 %	25 %	0 %	58336512
3096	NC_006814	GAA	2	6	160147	160152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
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3098	NC_006814	AGC	2	6	160287	160292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336512
3099	NC_006814	GCCA	2	8	160362	160369	25 %	0 %	25 %	50 %	58336512
3100	NC_006814	TGCT	2	8	160380	160387	0 %	50 %	25 %	25 %	58336512
3101	NC_006814	CAG	2	6	160418	160423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336512
3102	NC_006814	TGG	2	6	160476	160481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336512
3103	NC_006814	GAA	2	6	160560	160565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3104	NC_006814	TGG	2	6	160567	160572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336512
3105	NC_006814	GAA	2	6	160576	160581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3106	NC_006814	AAG	2	6	160597	160602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3107	NC_006814	GGT	2	6	160699	160704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336512
3108	NC_006814	GAT	2	6	160741	160746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336512
3109	NC_006814	GAA	2	6	160749	160754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3110	NC_006814	AAG	2	6	160877	160882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336512
3111	NC_006814	GAT	2	6	161270	161275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336513
3112	NC_006814	TGGTG	2	10	161392	161401	0 %	40 %	60 %	0 %	58336513
3113	NC_006814	CTT	2	6	161488	161493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336513
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3115	NC_006814	GTA	2	6	161812	161817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336513
3116	NC_006814	ACAT	2	8	161822	161829	50 %	25 %	0 %	25 %	58336513
3117	NC_006814	ATAA	2	8	161852	161859	75 %	25 %	0 %	0 %	58336513
3118	NC_006814	ACC	2	6	161869	161874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336513
3119	NC_006814	ATG	2	6	161909	161914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336513
3120	NC_006814	GAA	2	6	161926	161931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336513
3121	NC_006814	CTT	2	6	161965	161970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336513
3122	NC_006814	AGA	2	6	161990	161995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336513
3123	NC_006814	TGG	2	6	161997	162002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336513
3124	NC_006814	TCA	2	6	162003	162008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336513
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3127	NC_006814	TAG	2	6	162249	162254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336513
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3132	NC_006814	AGT	2	6	162372	162377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336513
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3162	NC_006814	TTGA	2	8	164288	164295	25 %	50 %	25 %	0 %	58336515
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3228	NC_006814	GACT	2	8	167777	167784	25 %	25 %	25 %	25 %	58336518
3229	NC_006814	T	7	7	167835	167841	0 %	100 %	0 %	0 %	58336518
3230	NC_006814	CAT	2	6	167928	167933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336518
3231	NC_006814	TGC	2	6	167992	167997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336518
3232	NC_006814	AGCTTT	2	12	168004	168015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58336518
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3234	NC_006814	TAAA	2	8	168174	168181	75 %	25 %	0 %	0 %	58336518
3235	NC_006814	CAG	2	6	168186	168191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336518
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3237	NC_006814	TTC	2	6	168248	168253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336518
3238	NC_006814	TAG	2	6	168271	168276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336518
3239	NC_006814	A	6	6	168280	168285	100 %	0 %	0 %	0 %	58336518
3240	NC_006814	ATA	2	6	168314	168319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336518
3241	NC_006814	AAT	2	6	168355	168360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336518
3242	NC_006814	TCC	2	6	168386	168391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58336519
3243	NC_006814	ATA	2	6	168457	168462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336519
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3489	NC_006814	ATC	2	6	179819	179824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336528
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3492	NC_006814	AT	4	8	180055	180062	50 %	50 %	0 %	0 %	58336529
3493	NC_006814	TC	3	6	180079	180084	0 %	50 %	0 %	50 %	58336529
3494	NC_006814	TGAT	2	8	180203	180210	25 %	50 %	25 %	0 %	58336529
3495	NC_006814	ACA	2	6	180215	180220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336529
3496	NC_006814	GAGT	2	8	180269	180276	25 %	25 %	50 %	0 %	58336529
3497	NC_006814	TGAT	2	8	180284	180291	25 %	50 %	25 %	0 %	58336529
3498	NC_006814	ACT	2	6	180337	180342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336529
3499	NC_006814	TTTA	2	8	180377	180384	25 %	75 %	0 %	0 %	58336529
3500	NC_006814	TTC	2	6	180390	180395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336529

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