MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_006814	AGT	2	6	86556	86561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336431
1503	NC_006814	TAA	2	6	86646	86651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336431
1504	NC_006814	AAG	2	6	86713	86718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336431
1505	NC_006814	TGA	2	6	86721	86726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336431
1506	NC_006814	CAT	2	6	86732	86737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336431
1507	NC_006814	TAAT	2	8	86835	86842	50 %	50 %	0 %	0 %	58336431
1508	NC_006814	TTGT	2	8	87325	87332	0 %	75 %	25 %	0 %	58336432
1509	NC_006814	TGA	2	6	87428	87433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336432
1510	NC_006814	TAAAGA	2	12	87512	87523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58336432
1511	NC_006814	AAG	2	6	87557	87562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336432
1512	NC_006814	GAA	2	6	87567	87572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336432
1513	NC_006814	GGA	2	6	87633	87638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336432
1514	NC_006814	TAA	2	6	87662	87667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336432
1515	NC_006814	TTGA	2	8	87732	87739	25 %	50 %	25 %	0 %	58336432
1516	NC_006814	AGT	2	6	87787	87792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336432
1517	NC_006814	A	6	6	87838	87843	100 %	0 %	0 %	0 %	58336433
1518	NC_006814	AGA	2	6	87866	87871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336433
1519	NC_006814	GGAA	2	8	87908	87915	50 %	0 %	50 %	0 %	58336433
1520	NC_006814	TGA	2	6	88013	88018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336433
1521	NC_006814	ATAAA	2	10	88027	88036	80 %	20 %	0 %	0 %	58336433
1522	NC_006814	A	6	6	88065	88070	100 %	0 %	0 %	0 %	58336433
1523	NC_006814	GAA	3	9	88080	88088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336433
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1527	NC_006814	AGA	2	6	88205	88210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336433
1528	NC_006814	GAA	2	6	88218	88223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336433
1529	NC_006814	TAG	2	6	88280	88285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336433
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1531	NC_006814	TGA	2	6	88334	88339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336433
1532	NC_006814	TGT	2	6	88363	88368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336433
1533	NC_006814	GAA	2	6	88379	88384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336433
1534	NC_006814	ATG	2	6	88408	88413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336433
1535	NC_006814	AAC	2	6	88434	88439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336433
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1538	NC_006814	A	6	6	88581	88586	100 %	0 %	0 %	0 %	58336433
1539	NC_006814	AAT	2	6	88610	88615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336433
1540	NC_006814	A	6	6	88640	88645	100 %	0 %	0 %	0 %	58336433
1541	NC_006814	A	6	6	88843	88848	100 %	0 %	0 %	0 %	58336434
1542	NC_006814	TAT	2	6	88853	88858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336434
1543	NC_006814	GCA	2	6	88864	88869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336434
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1546	NC_006814	TAA	2	6	88974	88979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336434
1547	NC_006814	T	6	6	89000	89005	0 %	100 %	0 %	0 %	58336434
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1550	NC_006814	GAGTA	2	10	89061	89070	40 %	20 %	40 %	0 %	58336434
1551	NC_006814	AAAT	2	8	89166	89173	75 %	25 %	0 %	0 %	58336435
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1553	NC_006814	TTTC	2	8	89239	89246	0 %	75 %	0 %	25 %	58336435
1554	NC_006814	T	6	6	89252	89257	0 %	100 %	0 %	0 %	58336435
1555	NC_006814	AATTGC	2	12	89286	89297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58336435
1556	NC_006814	ATT	2	6	89325	89330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336435
1557	NC_006814	GAA	2	6	89350	89355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336435
1558	NC_006814	TGA	2	6	89390	89395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336435
1559	NC_006814	T	7	7	89403	89409	0 %	100 %	0 %	0 %	58336435
1560	NC_006814	AGG	2	6	89414	89419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336435
1561	NC_006814	TTGGAA	2	12	89442	89453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336435
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1563	NC_006814	TGT	2	6	89558	89563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336435
1564	NC_006814	ATT	2	6	89569	89574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336435
1565	NC_006814	ATT	2	6	89580	89585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336435
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1568	NC_006814	TCATT	2	10	89675	89684	20 %	60 %	0 %	20 %	58336435
1569	NC_006814	ATT	2	6	89716	89721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336435
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1582	NC_006814	TGT	2	6	90413	90418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336435
1583	NC_006814	GGTA	2	8	90450	90457	25 %	25 %	50 %	0 %	58336435
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1588	NC_006814	A	6	6	90805	90810	100 %	0 %	0 %	0 %	58336436
1589	NC_006814	AAT	2	6	90834	90839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336436
1590	NC_006814	A	7	7	90864	90870	100 %	0 %	0 %	0 %	58336436
1591	NC_006814	AAG	2	6	91012	91017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336437
1592	NC_006814	A	6	6	91033	91038	100 %	0 %	0 %	0 %	58336437
1593	NC_006814	TTTGGT	2	12	91050	91061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336437
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1597	NC_006814	A	7	7	91298	91304	100 %	0 %	0 %	0 %	58336438
1598	NC_006814	T	6	6	91372	91377	0 %	100 %	0 %	0 %	58336438
1599	NC_006814	TG	3	6	91387	91392	0 %	50 %	50 %	0 %	58336438
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1602	NC_006814	ATT	2	6	91475	91480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336438
1603	NC_006814	AGA	2	6	91492	91497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336438
1604	NC_006814	TAA	2	6	91534	91539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336438
1605	NC_006814	TAT	2	6	91550	91555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336438
1606	NC_006814	CTTG	2	8	91581	91588	0 %	50 %	25 %	25 %	58336438
1607	NC_006814	T	6	6	91604	91609	0 %	100 %	0 %	0 %	58336438
1608	NC_006814	AAT	2	6	91701	91706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336438
1609	NC_006814	ATT	2	6	91740	91745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336438
1610	NC_006814	GGT	2	6	91763	91768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336438
1611	NC_006814	TTG	2	6	91770	91775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336438
1612	NC_006814	TTA	2	6	91793	91798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336438
1613	NC_006814	ATTT	2	8	91800	91807	25 %	75 %	0 %	0 %	58336438
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1615	NC_006814	CTTA	2	8	91833	91840	25 %	50 %	0 %	25 %	58336438
1616	NC_006814	T	6	6	91844	91849	0 %	100 %	0 %	0 %	58336438
1617	NC_006814	GGT	2	6	91884	91889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336438
1618	NC_006814	AT	3	6	92024	92029	50 %	50 %	0 %	0 %	58336439
1619	NC_006814	T	6	6	92037	92042	0 %	100 %	0 %	0 %	58336439
1620	NC_006814	ATC	2	6	92137	92142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336439
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1622	NC_006814	T	6	6	92272	92277	0 %	100 %	0 %	0 %	58336439
1623	NC_006814	TCT	2	6	92304	92309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336439
1624	NC_006814	TTC	2	6	92410	92415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336439
1625	NC_006814	TGA	2	6	92467	92472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336439
1626	NC_006814	CA	3	6	92520	92525	50 %	0 %	0 %	50 %	58336439
1627	NC_006814	GAT	2	6	92646	92651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336439
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1629	NC_006814	CATA	2	8	92688	92695	50 %	25 %	0 %	25 %	58336439
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