MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006814	TTAA	2	8	27832	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	58336383
502	NC_006814	TAA	2	6	27842	27847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336383
503	NC_006814	A	6	6	27846	27851	100 %	0 %	0 %	0 %	58336383
504	NC_006814	TGA	2	6	27861	27866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336383
505	NC_006814	TAA	2	6	27870	27875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336383
506	NC_006814	A	7	7	28035	28041	100 %	0 %	0 %	0 %	58336383
507	NC_006814	CCA	2	6	28656	28661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336384
508	NC_006814	CAT	2	6	28681	28686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336384
509	NC_006814	TTG	2	6	28743	28748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336384
510	NC_006814	ATC	2	6	28761	28766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336384
511	NC_006814	CAT	2	6	28767	28772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336384
512	NC_006814	TGA	2	6	28805	28810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336384
513	NC_006814	GAA	2	6	28839	28844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336384
514	NC_006814	TGA	2	6	28883	28888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336384
515	NC_006814	AAG	2	6	28944	28949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336384
516	NC_006814	GAT	2	6	29381	29386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336385
517	NC_006814	TCA	2	6	29392	29397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336385
518	NC_006814	CTA	2	6	29428	29433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336385
519	NC_006814	TCA	2	6	29479	29484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336385
520	NC_006814	TCG	2	6	29524	29529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336385
521	NC_006814	AAT	2	6	29682	29687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336385
522	NC_006814	GTT	2	6	29694	29699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336385
523	NC_006814	AAT	2	6	29708	29713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336385
524	NC_006814	GTCG	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	58336385
525	NC_006814	TGC	2	6	29813	29818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336385
526	NC_006814	GGC	2	6	29896	29901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336385
527	NC_006814	TTG	2	6	29972	29977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336385
528	NC_006814	CAT	2	6	29991	29996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336385
529	NC_006814	TTC	2	6	30018	30023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336385
530	NC_006814	ACC	2	6	30048	30053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336385
531	NC_006814	CT	3	6	30104	30109	0 %	50 %	0 %	50 %	58336385
532	NC_006814	TCT	2	6	30133	30138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336385
533	NC_006814	T	6	6	30145	30150	0 %	100 %	0 %	0 %	58336385
534	NC_006814	AT	3	6	30344	30349	50 %	50 %	0 %	0 %	58336386
535	NC_006814	ACA	2	6	30357	30362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336386
536	NC_006814	A	6	6	30573	30578	100 %	0 %	0 %	0 %	58336386
537	NC_006814	TGG	2	6	30585	30590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336386
538	NC_006814	ACT	2	6	30645	30650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336386
539	NC_006814	GAA	2	6	30699	30704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336386
540	NC_006814	TGG	2	6	30851	30856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336386
541	NC_006814	GAT	2	6	30885	30890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336386
542	NC_006814	GAT	2	6	30963	30968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336386
543	NC_006814	GAT	2	6	30977	30982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336386
544	NC_006814	TGA	2	6	31133	31138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336386
545	NC_006814	TACT	2	8	31174	31181	25 %	50 %	0 %	25 %	58336386
546	NC_006814	TCA	2	6	31206	31211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336386
547	NC_006814	AC	3	6	31220	31225	50 %	0 %	0 %	50 %	58336386
548	NC_006814	ATG	2	6	31330	31335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336386
549	NC_006814	TAC	2	6	31496	31501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336386
550	NC_006814	TGA	2	6	31508	31513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336386
551	NC_006814	AAGCA	2	10	31551	31560	60 %	0 %	20 %	20 %	58336386
552	NC_006814	GCT	2	6	31566	31571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336386
553	NC_006814	GTC	2	6	31573	31578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336386
554	NC_006814	AAG	2	6	31600	31605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336386
555	NC_006814	GAA	2	6	31623	31628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336386
556	NC_006814	GCT	2	6	31671	31676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336386
557	NC_006814	ATT	2	6	31741	31746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336386
558	NC_006814	A	6	6	31968	31973	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
559	NC_006814	TGAT	2	8	32022	32029	25 %	50 %	25 %	0 %	58336387
560	NC_006814	AAT	2	6	32039	32044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
561	NC_006814	TAA	2	6	32050	32055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
562	NC_006814	A	7	7	32094	32100	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
563	NC_006814	TTA	2	6	32132	32137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336387
564	NC_006814	A	6	6	32183	32188	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
565	NC_006814	TAA	2	6	32190	32195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
566	NC_006814	AT	3	6	32233	32238	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
567	NC_006814	CAAGTA	2	12	32252	32263	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58336387
568	NC_006814	AT	3	6	32295	32300	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
569	NC_006814	ACT	2	6	32339	32344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336387
570	NC_006814	A	6	6	32385	32390	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
571	NC_006814	TAA	2	6	32416	32421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
572	NC_006814	ATAAAA	2	12	32460	32471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	58336387
573	NC_006814	TAAAAA	2	12	32562	32573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	58336387
574	NC_006814	TAATT	2	10	32581	32590	40 %	60 %	0 %	0 %	58336387
575	NC_006814	ATA	2	6	32604	32609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
576	NC_006814	TAA	2	6	32617	32622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
577	NC_006814	GGTA	2	8	32641	32648	25 %	25 %	50 %	0 %	58336387
578	NC_006814	TTA	2	6	32658	32663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336387
579	NC_006814	AT	3	6	32665	32670	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
580	NC_006814	AGTT	2	8	32686	32693	25 %	50 %	25 %	0 %	58336387
581	NC_006814	AG	3	6	32822	32827	50 %	0 %	50 %	0 %	58336387
582	NC_006814	A	7	7	32828	32834	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
583	NC_006814	T	7	7	32843	32849	0 %	100 %	0 %	0 %	58336387
584	NC_006814	ATTA	2	8	32863	32870	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
585	NC_006814	A	6	6	32886	32891	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
586	NC_006814	ATG	2	6	32904	32909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336387
587	NC_006814	A	6	6	32910	32915	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
588	NC_006814	CAA	2	6	32961	32966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336387
589	NC_006814	ACATG	2	10	32968	32977	40 %	20 %	20 %	20 %	58336387
590	NC_006814	GAT	2	6	33005	33010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336387
591	NC_006814	ATA	2	6	33021	33026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
592	NC_006814	TGA	2	6	33028	33033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336387
593	NC_006814	AAG	2	6	33036	33041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336387
594	NC_006814	A	6	6	33091	33096	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
595	NC_006814	ATA	2	6	33138	33143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
596	NC_006814	ATT	2	6	33148	33153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336387
597	NC_006814	TAG	2	6	33162	33167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336387
598	NC_006814	T	7	7	33174	33180	0 %	100 %	0 %	0 %	58336387
599	NC_006814	T	7	7	33197	33203	0 %	100 %	0 %	0 %	58336387
600	NC_006814	A	6	6	33206	33211	100 %	0 %	0 %	0 %	58336387
601	NC_006814	ATA	2	6	33220	33225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336387
602	NC_006814	ATT	2	6	33341	33346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336388
603	NC_006814	T	6	6	33353	33358	0 %	100 %	0 %	0 %	58336388
604	NC_006814	TGGC	2	8	33373	33380	0 %	25 %	50 %	25 %	58336388
605	NC_006814	ATA	2	6	33510	33515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336388
606	NC_006814	TTG	3	9	33540	33548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336388
607	NC_006814	AT	3	6	33562	33567	50 %	50 %	0 %	0 %	58336388
608	NC_006814	A	6	6	33585	33590	100 %	0 %	0 %	0 %	58336388
609	NC_006814	ATT	2	6	33612	33617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336388
610	NC_006814	T	6	6	33666	33671	0 %	100 %	0 %	0 %	58336388
611	NC_006814	ATTT	2	8	33712	33719	25 %	75 %	0 %	0 %	58336388
612	NC_006814	ATT	2	6	33725	33730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336388
613	NC_006814	GAA	2	6	33737	33742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336388
614	NC_006814	TGT	2	6	33778	33783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336388
615	NC_006814	TAC	3	9	33832	33840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336388
616	NC_006814	CAT	2	6	33941	33946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336388
617	NC_006814	AGA	2	6	34001	34006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336388
618	NC_006814	A	6	6	34064	34069	100 %	0 %	0 %	0 %	58336388
619	NC_006814	A	6	6	34079	34084	100 %	0 %	0 %	0 %	58336388
620	NC_006814	CAAA	2	8	34095	34102	75 %	0 %	0 %	25 %	58336388
621	NC_006814	CTG	2	6	34107	34112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336388
622	NC_006814	T	7	7	34131	34137	0 %	100 %	0 %	0 %	58336389
623	NC_006814	ACTTT	2	10	34164	34173	20 %	60 %	0 %	20 %	58336389
624	NC_006814	T	9	9	34171	34179	0 %	100 %	0 %	0 %	58336389
625	NC_006814	AT	3	6	34245	34250	50 %	50 %	0 %	0 %	58336389
626	NC_006814	TAC	2	6	34433	34438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336389
627	NC_006814	ATG	2	6	34457	34462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336389
628	NC_006814	T	6	6	34464	34469	0 %	100 %	0 %	0 %	58336389
629	NC_006814	ATT	2	6	34541	34546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336389
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631	NC_006814	TA	3	6	34746	34751	50 %	50 %	0 %	0 %	58336390
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