MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006814	CAA	2	6	277399	277404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336622
5502	NC_006814	AAAG	2	8	277425	277432	75 %	0 %	25 %	0 %	58336622
5503	NC_006814	CAT	2	6	277480	277485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336622
5504	NC_006814	GAA	2	6	277498	277503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336622
5505	NC_006814	AGA	2	6	277509	277514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336622
5506	NC_006814	AT	3	6	277536	277541	50 %	50 %	0 %	0 %	58336622
5507	NC_006814	TGC	2	6	277593	277598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5508	NC_006814	AAT	2	6	277612	277617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336622
5509	NC_006814	TGA	2	6	277626	277631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336622
5510	NC_006814	TAA	2	6	277647	277652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336622
5511	NC_006814	A	7	7	277676	277682	100 %	0 %	0 %	0 %	58336622
5512	NC_006814	AGC	3	9	277686	277694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5513	NC_006814	GCT	2	6	277714	277719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5514	NC_006814	AAT	2	6	277738	277743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336622
5515	NC_006814	TCG	2	6	277752	277757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5516	NC_006814	A	6	6	277784	277789	100 %	0 %	0 %	0 %	58336622
5517	NC_006814	AGT	2	6	277830	277835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336622
5518	NC_006814	GTAGAA	2	12	277970	277981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	58336622
5519	NC_006814	CGT	2	6	277999	278004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5520	NC_006814	TGC	2	6	278070	278075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5521	NC_006814	GAA	2	6	278185	278190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336622
5522	NC_006814	TCG	2	6	278214	278219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5523	NC_006814	CCAT	2	8	278220	278227	25 %	25 %	0 %	50 %	58336622
5524	NC_006814	GGAA	2	8	278326	278333	50 %	0 %	50 %	0 %	58336622
5525	NC_006814	ATT	2	6	278356	278361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336622
5526	NC_006814	ATT	2	6	278388	278393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336622
5527	NC_006814	CAA	2	6	278461	278466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336622
5528	NC_006814	TTC	2	6	278479	278484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336622
5529	NC_006814	TGA	2	6	278508	278513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336622
5530	NC_006814	TGA	2	6	278526	278531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336622
5531	NC_006814	AAC	2	6	278543	278548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336622
5532	NC_006814	TACT	2	8	278567	278574	25 %	50 %	0 %	25 %	58336622
5533	NC_006814	TGC	2	6	278628	278633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336622
5534	NC_006814	AG	3	6	278690	278695	50 %	0 %	50 %	0 %	58336622
5535	NC_006814	ATG	2	6	278705	278710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336622
5536	NC_006814	TTAA	2	8	278734	278741	50 %	50 %	0 %	0 %	58336622
5537	NC_006814	GTG	2	6	278756	278761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336622
5538	NC_006814	GTT	2	6	278806	278811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336622
5539	NC_006814	A	6	6	278818	278823	100 %	0 %	0 %	0 %	58336622
5540	NC_006814	TAACT	2	10	279148	279157	40 %	40 %	0 %	20 %	58336623
5541	NC_006814	AAG	2	6	279204	279209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5542	NC_006814	TGA	2	6	279214	279219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
5543	NC_006814	TGA	2	6	279301	279306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
5544	NC_006814	ATG	2	6	279318	279323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
5545	NC_006814	TGC	2	6	279331	279336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
5546	NC_006814	TTCA	2	8	279436	279443	25 %	50 %	0 %	25 %	58336623
5547	NC_006814	TTAG	2	8	279479	279486	25 %	50 %	25 %	0 %	58336623
5548	NC_006814	TAC	2	6	279500	279505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
5549	NC_006814	GTC	2	6	279528	279533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
5550	NC_006814	TAC	2	6	279544	279549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
5551	NC_006814	GTG	2	6	279564	279569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336623
5552	NC_006814	ATT	2	6	279686	279691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336623
5553	NC_006814	ACT	2	6	279821	279826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
5554	NC_006814	TCA	2	6	279830	279835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
5555	NC_006814	CGT	2	6	279869	279874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
5556	NC_006814	AAG	2	6	279911	279916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5557	NC_006814	ATT	2	6	279986	279991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336623
5558	NC_006814	AAG	2	6	279995	280000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5559	NC_006814	AAG	2	6	280089	280094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5560	NC_006814	AATT	2	8	280234	280241	50 %	50 %	0 %	0 %	58336623
5561	NC_006814	CTT	2	6	280243	280248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336623
5562	NC_006814	AAGAT	2	10	280257	280266	60 %	20 %	20 %	0 %	58336623
5563	NC_006814	TAC	2	6	280270	280275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
5564	NC_006814	TGA	2	6	280276	280281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
5565	NC_006814	CGT	2	6	280301	280306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
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5568	NC_006814	GTT	2	6	280370	280375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336623
5569	NC_006814	CAA	2	6	280418	280423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336623
5570	NC_006814	TTG	2	6	280443	280448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336623
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5572	NC_006814	TCA	2	6	280472	280477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
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5580	NC_006814	ATT	2	6	280799	280804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336623
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5589	NC_006814	CGT	2	6	281204	281209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
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5591	NC_006814	TGA	2	6	281266	281271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
5592	NC_006814	CAT	2	6	281380	281385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
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5594	NC_006814	TA	3	6	281415	281420	50 %	50 %	0 %	0 %	58336623
5595	NC_006814	AGA	2	6	281476	281481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5596	NC_006814	TCGT	2	8	281544	281551	0 %	50 %	25 %	25 %	58336623
5597	NC_006814	ATG	2	6	281568	281573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
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5599	NC_006814	CTG	2	6	281622	281627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
5600	NC_006814	AAGA	2	8	281628	281635	75 %	0 %	25 %	0 %	58336623
5601	NC_006814	ACTTC	2	10	281681	281690	20 %	40 %	0 %	40 %	58336623
5602	NC_006814	TGG	3	9	281701	281709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336623
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5604	NC_006814	TGC	2	6	281863	281868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
5605	NC_006814	AGA	3	9	281878	281886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5606	NC_006814	TTTG	2	8	281922	281929	0 %	75 %	25 %	0 %	58336623
5607	NC_006814	CTT	2	6	281969	281974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336623
5608	NC_006814	TGC	3	9	281989	281997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336623
5609	NC_006814	ATG	2	6	282051	282056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336623
5610	NC_006814	TTAT	2	8	282105	282112	25 %	75 %	0 %	0 %	58336623
5611	NC_006814	GT	3	6	282144	282149	0 %	50 %	50 %	0 %	58336623
5612	NC_006814	ACT	2	6	282165	282170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336623
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5618	NC_006814	AGA	2	6	282580	282585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
5619	NC_006814	AAGAA	2	10	282588	282597	80 %	0 %	20 %	0 %	58336623
5620	NC_006814	GAA	2	6	282608	282613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336623
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5991	NC_006814	ACT	2	6	300545	300550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336649
5992	NC_006814	ATC	2	6	300560	300565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336649
5993	NC_006814	ATT	2	6	300578	300583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336649
5994	NC_006814	TCT	2	6	300594	300599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336649
5995	NC_006814	CTA	2	6	300777	300782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336649
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5999	NC_006814	TCA	2	6	300906	300911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336649
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