MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006814	A	6	6	253840	253845	100 %	0 %	0 %	0 %	58336602
5002	NC_006814	TAAT	2	8	253865	253872	50 %	50 %	0 %	0 %	58336602
5003	NC_006814	AGT	2	6	253947	253952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336602
5004	NC_006814	AAT	2	6	253956	253961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336602
5005	NC_006814	AGCAC	2	10	253978	253987	40 %	0 %	20 %	40 %	58336602
5006	NC_006814	ATC	2	6	254031	254036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336602
5007	NC_006814	CTGC	2	8	254044	254051	0 %	25 %	25 %	50 %	58336602
5008	NC_006814	GAC	2	6	254054	254059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336602
5009	NC_006814	AAT	2	6	254067	254072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336602
5010	NC_006814	T	6	6	254136	254141	0 %	100 %	0 %	0 %	58336602
5011	NC_006814	GTT	2	6	254192	254197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336602
5012	NC_006814	TGG	2	6	254328	254333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336603
5013	NC_006814	TGT	2	6	254342	254347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336603
5014	NC_006814	ATT	2	6	254412	254417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336603
5015	NC_006814	GATAT	2	10	254500	254509	40 %	40 %	20 %	0 %	58336603
5016	NC_006814	CAT	2	6	254586	254591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336603
5017	NC_006814	A	6	6	254658	254663	100 %	0 %	0 %	0 %	58336603
5018	NC_006814	ATT	2	6	254686	254691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336603
5019	NC_006814	TGA	2	6	254711	254716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5020	NC_006814	ATG	2	6	254767	254772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5021	NC_006814	AAG	2	6	254774	254779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336603
5022	NC_006814	ACA	2	6	254860	254865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336603
5023	NC_006814	TGA	2	6	254866	254871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5024	NC_006814	GTGAT	2	10	255016	255025	20 %	40 %	40 %	0 %	58336603
5025	NC_006814	GAA	2	6	255066	255071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336603
5026	NC_006814	CTGATC	2	12	255076	255087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58336603
5027	NC_006814	AATC	2	8	255120	255127	50 %	25 %	0 %	25 %	58336603
5028	NC_006814	CAA	2	6	255135	255140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336603
5029	NC_006814	A	6	6	255189	255194	100 %	0 %	0 %	0 %	58336603
5030	NC_006814	CAAA	2	8	255210	255217	75 %	0 %	0 %	25 %	58336603
5031	NC_006814	GTTT	2	8	255244	255251	0 %	75 %	25 %	0 %	58336603
5032	NC_006814	ATT	2	6	255336	255341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336603
5033	NC_006814	ATG	2	6	255348	255353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5034	NC_006814	GAA	2	6	255381	255386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336603
5035	NC_006814	TGA	2	6	255419	255424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5036	NC_006814	AACG	2	8	255456	255463	50 %	0 %	25 %	25 %	58336603
5037	NC_006814	ATG	2	6	255478	255483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5038	NC_006814	AAG	2	6	255484	255489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336603
5039	NC_006814	CAAT	2	8	255502	255509	50 %	25 %	0 %	25 %	58336603
5040	NC_006814	CAATG	2	10	255538	255547	40 %	20 %	20 %	20 %	58336603
5041	NC_006814	ATG	2	6	255550	255555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336603
5042	NC_006814	A	7	7	255556	255562	100 %	0 %	0 %	0 %	58336603
5043	NC_006814	T	6	6	255655	255660	0 %	100 %	0 %	0 %	58336603
5044	NC_006814	TGCT	2	8	255751	255758	0 %	50 %	25 %	25 %	58336603
5045	NC_006814	TAT	2	6	255759	255764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336603
5046	NC_006814	A	6	6	255780	255785	100 %	0 %	0 %	0 %	58336603
5047	NC_006814	TGGT	2	8	255786	255793	0 %	50 %	50 %	0 %	58336603
5048	NC_006814	GAG	2	6	255813	255818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336603
5049	NC_006814	AGAA	2	8	255869	255876	75 %	0 %	25 %	0 %	58336603
5050	NC_006814	AGA	2	6	256140	256145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336604
5051	NC_006814	TCA	2	6	256195	256200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336604
5052	NC_006814	GCAA	2	8	256223	256230	50 %	0 %	25 %	25 %	58336604
5053	NC_006814	TCGAA	2	10	256251	256260	40 %	20 %	20 %	20 %	58336604
5054	NC_006814	CAA	2	6	256266	256271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336604
5055	NC_006814	GAA	2	6	256284	256289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336604
5056	NC_006814	TTA	2	6	256487	256492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336605
5057	NC_006814	TGG	2	6	256527	256532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336605
5058	NC_006814	ATT	2	6	256533	256538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336605
5059	NC_006814	TGA	2	6	256665	256670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336605
5060	NC_006814	TTA	2	6	256701	256706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336605
5061	NC_006814	ACT	2	6	256762	256767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336605
5062	NC_006814	TAA	2	6	256830	256835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336605
5063	NC_006814	TTC	2	6	256996	257001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336605
5064	NC_006814	ATTT	2	8	257067	257074	25 %	75 %	0 %	0 %	58336605
5065	NC_006814	TGA	2	6	257082	257087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336605
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5067	NC_006814	AAG	2	6	257110	257115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336605
5068	NC_006814	GAT	2	6	257149	257154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336605
5069	NC_006814	CAT	2	6	257191	257196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336605
5070	NC_006814	GCT	2	6	257275	257280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336605
5071	NC_006814	TGA	2	6	257310	257315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336605
5072	NC_006814	TTA	2	6	257441	257446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336605
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5074	NC_006814	TGAAA	2	10	257601	257610	60 %	20 %	20 %	0 %	58336605
5075	NC_006814	ATG	2	6	257618	257623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336605
5076	NC_006814	TACTA	2	10	257659	257668	40 %	40 %	0 %	20 %	58336605
5077	NC_006814	TGAT	2	8	257687	257694	25 %	50 %	25 %	0 %	58336605
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5083	NC_006814	ACTGGT	2	12	257939	257950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58336606
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5093	NC_006814	TGC	2	6	258598	258603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336606
5094	NC_006814	TGC	2	6	258697	258702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336606
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5107	NC_006814	A	7	7	259363	259369	100 %	0 %	0 %	0 %	58336607
5108	NC_006814	A	7	7	259414	259420	100 %	0 %	0 %	0 %	58336607
5109	NC_006814	A	6	6	259447	259452	100 %	0 %	0 %	0 %	58336607
5110	NC_006814	AAAAG	2	10	259498	259507	80 %	0 %	20 %	0 %	58336607
5111	NC_006814	GAT	2	6	259612	259617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336607
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5119	NC_006814	A	6	6	259822	259827	100 %	0 %	0 %	0 %	58336608
5120	NC_006814	GAA	2	6	259890	259895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336608
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5124	NC_006814	AAG	2	6	260062	260067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336608
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5243	NC_006814	GGC	2	6	265141	265146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336612
5244	NC_006814	TCAA	2	8	265176	265183	50 %	25 %	0 %	25 %	58336612
5245	NC_006814	GAT	2	6	265201	265206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336612
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5247	NC_006814	GAT	3	9	265261	265269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336612
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5366	NC_006814	ATTT	2	8	270265	270272	25 %	75 %	0 %	0 %	58336617
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5368	NC_006814	ATC	2	6	270300	270305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336617
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