MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	GAAA	2	8	1983	1990	75 %	0 %	25 %	0 %	56707137
2	NC_006530	TAAC	2	8	2043	2050	50 %	25 %	0 %	25 %	56707137
3	NC_006530	TGAG	2	8	2065	2072	25 %	25 %	50 %	0 %	56707137
4	NC_006530	AGTA	2	8	2079	2086	50 %	25 %	25 %	0 %	56707137
5	NC_006530	TAAA	2	8	3245	3252	75 %	25 %	0 %	0 %	56707139
6	NC_006530	AGTA	2	8	3426	3433	50 %	25 %	25 %	0 %	56707139
7	NC_006530	ATAA	2	8	3673	3680	75 %	25 %	0 %	0 %	56707139
8	NC_006530	AAAT	2	8	3846	3853	75 %	25 %	0 %	0 %	56707139
9	NC_006530	AATG	2	8	4239	4246	50 %	25 %	25 %	0 %	56707140
10	NC_006530	ATTA	2	8	4303	4310	50 %	50 %	0 %	0 %	56707140
11	NC_006530	AAAT	2	8	4346	4353	75 %	25 %	0 %	0 %	56707140
12	NC_006530	AAAT	2	8	4572	4579	75 %	25 %	0 %	0 %	56707140
13	NC_006530	ATTT	2	8	6759	6766	25 %	75 %	0 %	0 %	56707144
14	NC_006530	TCAG	2	8	7004	7011	25 %	25 %	25 %	25 %	56707145
15	NC_006530	TGAT	2	8	7391	7398	25 %	50 %	25 %	0 %	56707146
16	NC_006530	ATTT	2	8	9394	9401	25 %	75 %	0 %	0 %	56707148
17	NC_006530	AGCG	2	8	10258	10265	25 %	0 %	50 %	25 %	56707148
18	NC_006530	AGCA	2	8	10511	10518	50 %	0 %	25 %	25 %	56707149
19	NC_006530	AAGA	2	8	10589	10596	75 %	0 %	25 %	0 %	56707149
20	NC_006530	GTGG	2	8	10888	10895	0 %	25 %	75 %	0 %	56707150
21	NC_006530	TTAA	2	8	11049	11056	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
22	NC_006530	GAAC	2	8	11267	11274	50 %	0 %	25 %	25 %	56707150
23	NC_006530	CAAA	2	8	11362	11369	75 %	0 %	0 %	25 %	56707150
24	NC_006530	AAGG	2	8	12428	12435	50 %	0 %	50 %	0 %	56707153
25	NC_006530	AAAG	2	8	12544	12551	75 %	0 %	25 %	0 %	56707153
26	NC_006530	AGAA	2	8	12624	12631	75 %	0 %	25 %	0 %	56707153
27	NC_006530	CGCA	2	8	12717	12724	25 %	0 %	25 %	50 %	56707153
28	NC_006530	GCAA	2	8	12810	12817	50 %	0 %	25 %	25 %	56707153
29	NC_006530	TGGT	2	8	12857	12864	0 %	50 %	50 %	0 %	56707153
30	NC_006530	TCAA	2	8	12978	12985	50 %	25 %	0 %	25 %	56707153
31	NC_006530	AGTT	2	8	13575	13582	25 %	50 %	25 %	0 %	56707153
32	NC_006530	ATTA	2	8	14183	14190	50 %	50 %	0 %	0 %	56707153
33	NC_006530	GAAA	2	8	16332	16339	75 %	0 %	25 %	0 %	56707156
34	NC_006530	TTAA	2	8	16348	16355	50 %	50 %	0 %	0 %	56707156
35	NC_006530	AAAG	2	8	16422	16429	75 %	0 %	25 %	0 %	56707156
36	NC_006530	TGGT	2	8	16625	16632	0 %	50 %	50 %	0 %	56707156
37	NC_006530	AGAT	2	8	16985	16992	50 %	25 %	25 %	0 %	56707157
38	NC_006530	ATTA	2	8	17047	17054	50 %	50 %	0 %	0 %	56707157
39	NC_006530	CAGT	2	8	17586	17593	25 %	25 %	25 %	25 %	56707158
40	NC_006530	TTCA	2	8	17644	17651	25 %	50 %	0 %	25 %	56707158
41	NC_006530	AATT	2	8	18305	18312	50 %	50 %	0 %	0 %	56707159
42	NC_006530	GATT	2	8	18893	18900	25 %	50 %	25 %	0 %	56707159
43	NC_006530	TATT	2	8	19094	19101	25 %	75 %	0 %	0 %	56707160
44	NC_006530	CCAG	2	8	19150	19157	25 %	0 %	25 %	50 %	56707160
45	NC_006530	GTTA	2	8	19372	19379	25 %	50 %	25 %	0 %	56707160
46	NC_006530	AATT	2	8	19728	19735	50 %	50 %	0 %	0 %	56707160
47	NC_006530	AAAT	2	8	19836	19843	75 %	25 %	0 %	0 %	56707160
48	NC_006530	AAAT	2	8	19860	19867	75 %	25 %	0 %	0 %	56707160
49	NC_006530	TTGT	2	8	20404	20411	0 %	75 %	25 %	0 %	56707162
50	NC_006530	ATTT	2	8	20641	20648	25 %	75 %	0 %	0 %	56707162
51	NC_006530	TTTA	2	8	22542	22549	25 %	75 %	0 %	0 %	56707165
52	NC_006530	CTTC	2	8	22966	22973	0 %	50 %	0 %	50 %	56707166
53	NC_006530	CATC	2	8	23056	23063	25 %	25 %	0 %	50 %	56707166
54	NC_006530	TTTC	2	8	23158	23165	0 %	75 %	0 %	25 %	56707166
55	NC_006530	CTGA	2	8	24550	24557	25 %	25 %	25 %	25 %	56707168
56	NC_006530	AACT	2	8	24587	24594	50 %	25 %	0 %	25 %	56707168
57	NC_006530	GTCG	2	8	24685	24692	0 %	25 %	50 %	25 %	56707168
58	NC_006530	GATC	2	8	24907	24914	25 %	25 %	25 %	25 %	56707168
59	NC_006530	AATT	2	8	28504	28511	50 %	50 %	0 %	0 %	56707169
60	NC_006530	AAAG	2	8	28744	28751	75 %	0 %	25 %	0 %	56707169
61	NC_006530	ATTT	2	8	28915	28922	25 %	75 %	0 %	0 %	56707169
62	NC_006530	TATC	2	8	28966	28973	25 %	50 %	0 %	25 %	56707169
63	NC_006530	AATG	2	8	29019	29026	50 %	25 %	25 %	0 %	56707169
64	NC_006530	GGTC	2	8	29448	29455	0 %	25 %	50 %	25 %	56707170
65	NC_006530	ATCA	2	8	29636	29643	50 %	25 %	0 %	25 %	56707170
66	NC_006530	ATTG	2	8	29769	29776	25 %	50 %	25 %	0 %	56707170
67	NC_006530	ATCA	2	8	30211	30218	50 %	25 %	0 %	25 %	56707171
68	NC_006530	ATTT	2	8	31071	31078	25 %	75 %	0 %	0 %	56707172
69	NC_006530	TTTA	2	8	31357	31364	25 %	75 %	0 %	0 %	56707172
70	NC_006530	GCCA	2	8	31814	31821	25 %	0 %	25 %	50 %	56707173
71	NC_006530	ACAA	2	8	33512	33519	75 %	0 %	0 %	25 %	56707174
72	NC_006530	TTGA	2	8	33520	33527	25 %	50 %	25 %	0 %	56707174
73	NC_006530	GCTA	2	8	33720	33727	25 %	25 %	25 %	25 %	56707174
74	NC_006530	ACTT	2	8	33742	33749	25 %	50 %	0 %	25 %	56707174
75	NC_006530	TACG	2	8	33771	33778	25 %	25 %	25 %	25 %	56707174
76	NC_006530	AACA	2	8	34117	34124	75 %	0 %	0 %	25 %	56707174
77	NC_006530	ATCA	2	8	34617	34624	50 %	25 %	0 %	25 %	56707175
78	NC_006530	GATG	2	8	34763	34770	25 %	25 %	50 %	0 %	56707175
79	NC_006530	GACC	2	8	35147	35154	25 %	0 %	25 %	50 %	56707175
80	NC_006530	GGCC	2	8	35583	35590	0 %	0 %	50 %	50 %	56707176
81	NC_006530	GTGG	2	8	35858	35865	0 %	25 %	75 %	0 %	56707176
82	NC_006530	CCAG	2	8	36650	36657	25 %	0 %	25 %	50 %	56707176
83	NC_006530	CTAG	2	8	36676	36683	25 %	25 %	25 %	25 %	56707176
84	NC_006530	GGGC	2	8	38212	38219	0 %	0 %	75 %	25 %	56707178
85	NC_006530	GTAG	2	8	38231	38238	25 %	25 %	50 %	0 %	56707178
86	NC_006530	TCTT	2	8	38870	38877	0 %	75 %	0 %	25 %	56707179
87	NC_006530	ATTT	2	8	39106	39113	25 %	75 %	0 %	0 %	56707179
88	NC_006530	TAAA	2	8	41522	41529	75 %	25 %	0 %	0 %	56707183
89	NC_006530	TACT	2	8	41569	41576	25 %	50 %	0 %	25 %	56707184
90	NC_006530	GGGC	2	8	42495	42502	0 %	0 %	75 %	25 %	56707185
91	NC_006530	CACT	2	8	42668	42675	25 %	25 %	0 %	50 %	56707185

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.