MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS102

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006376	AAAAG	2	10	107	116	80 %	0 %	20 %	0 %	54307233
2	NC_006376	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	54307233
3	NC_006376	CAAA	2	8	168	175	75 %	0 %	0 %	25 %	54307233
4	NC_006376	A	6	6	255	260	100 %	0 %	0 %	0 %	54307233
5	NC_006376	TTAT	2	8	274	281	25 %	75 %	0 %	0 %	54307233
6	NC_006376	CAG	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307233
7	NC_006376	TTG	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307233
8	NC_006376	AGCA	2	8	450	457	50 %	0 %	25 %	25 %	54307233
9	NC_006376	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307233
10	NC_006376	ATG	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307233
11	NC_006376	TGAT	2	8	550	557	25 %	50 %	25 %	0 %	54307233
12	NC_006376	ATTA	2	8	757	764	50 %	50 %	0 %	0 %	54307233
13	NC_006376	TCA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307234
14	NC_006376	TTC	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
15	NC_006376	CAA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307234
16	NC_006376	TCA	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307234
17	NC_006376	TAA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307234
18	NC_006376	A	8	8	1133	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	54307234
19	NC_006376	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307234
20	NC_006376	CT	3	6	1162	1167	0 %	50 %	0 %	50 %	54307234
21	NC_006376	CAAT	2	8	1201	1208	50 %	25 %	0 %	25 %	54307234
22	NC_006376	TTC	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
23	NC_006376	TTC	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307234
24	NC_006376	TAATTG	2	12	1298	1309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54307234
25	NC_006376	T	6	6	1313	1318	0 %	100 %	0 %	0 %	54307234
26	NC_006376	A	6	6	1334	1339	100 %	0 %	0 %	0 %	54307234
27	NC_006376	ACC	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307234
28	NC_006376	CTGT	2	8	1719	1726	0 %	50 %	25 %	25 %	54307235
29	NC_006376	TGA	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307235
30	NC_006376	GGC	2	6	1868	1873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54307235

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.