MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS101

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006375	GATC	2	8	187	194	25 %	25 %	25 %	25 %	54307229
2	NC_006375	ATT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307229
3	NC_006375	GTG	2	6	302	307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54307229
4	NC_006375	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	54307229
5	NC_006375	GGC	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54307229
6	NC_006375	GAA	2	6	498	503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307229
7	NC_006375	TAC	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307229
8	NC_006375	TTG	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307229
9	NC_006375	A	6	6	574	579	100 %	0 %	0 %	0 %	54307229
10	NC_006375	TTG	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307229
11	NC_006375	CAC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307229
12	NC_006375	TAA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307229
13	NC_006375	TGA	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307229
14	NC_006375	TGG	2	6	963	968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54307229
15	NC_006375	GAAA	2	8	975	982	75 %	0 %	25 %	0 %	54307229
16	NC_006375	TGATT	2	10	1020	1029	20 %	60 %	20 %	0 %	54307229
17	NC_006375	TGA	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307229
18	NC_006375	GTG	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54307229
19	NC_006375	TTG	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307229
20	NC_006375	ATT	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307229
21	NC_006375	TAT	2	6	1289	1294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307230
22	NC_006375	AC	3	6	1311	1316	50 %	0 %	0 %	50 %	54307230
23	NC_006375	GTTGT	2	10	1325	1334	0 %	60 %	40 %	0 %	54307230
24	NC_006375	TCT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.