MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Paris plasmid pLPP

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006365	TC	3	6	681	686	0 %	50 %	0 %	50 %	54295844
2	NC_006365	AT	3	6	2292	2297	50 %	50 %	0 %	0 %	54295845
3	NC_006365	TG	3	6	2312	2317	0 %	50 %	50 %	0 %	54295845
4	NC_006365	CT	3	6	3224	3229	0 %	50 %	0 %	50 %	54295846
5	NC_006365	GA	3	6	4390	4395	50 %	0 %	50 %	0 %	54295847
6	NC_006365	CA	3	6	5186	5191	50 %	0 %	0 %	50 %	54295848
7	NC_006365	TG	3	6	5547	5552	0 %	50 %	50 %	0 %	54295848
8	NC_006365	TC	3	6	6037	6042	0 %	50 %	0 %	50 %	54295849
9	NC_006365	AG	3	6	6182	6187	50 %	0 %	50 %	0 %	54295849
10	NC_006365	AT	3	6	6313	6318	50 %	50 %	0 %	0 %	54295849
11	NC_006365	AT	3	6	7124	7129	50 %	50 %	0 %	0 %	54295850
12	NC_006365	TC	3	6	7683	7688	0 %	50 %	0 %	50 %	54295850
13	NC_006365	AC	3	6	8724	8729	50 %	0 %	0 %	50 %	54295852
14	NC_006365	AT	3	6	8803	8808	50 %	50 %	0 %	0 %	54295852
15	NC_006365	AT	4	8	9283	9290	50 %	50 %	0 %	0 %	54295852
16	NC_006365	AG	3	6	9582	9587	50 %	0 %	50 %	0 %	54295852
17	NC_006365	TA	3	6	9904	9909	50 %	50 %	0 %	0 %	54295853
18	NC_006365	AT	3	6	10227	10232	50 %	50 %	0 %	0 %	54295853
19	NC_006365	AT	3	6	10292	10297	50 %	50 %	0 %	0 %	54295853
20	NC_006365	AT	3	6	10858	10863	50 %	50 %	0 %	0 %	54295853
21	NC_006365	AT	3	6	11162	11167	50 %	50 %	0 %	0 %	54295854
22	NC_006365	GT	3	6	11235	11240	0 %	50 %	50 %	0 %	54295854
23	NC_006365	GA	3	6	11511	11516	50 %	0 %	50 %	0 %	54295855
24	NC_006365	GT	3	6	11813	11818	0 %	50 %	50 %	0 %	54295855
25	NC_006365	GA	3	6	12101	12106	50 %	0 %	50 %	0 %	54295855
26	NC_006365	TG	3	6	13518	13523	0 %	50 %	50 %	0 %	54295857
27	NC_006365	TA	3	6	13638	13643	50 %	50 %	0 %	0 %	54295857
28	NC_006365	TA	3	6	13882	13887	50 %	50 %	0 %	0 %	54295857
29	NC_006365	TA	3	6	14202	14207	50 %	50 %	0 %	0 %	54295857
30	NC_006365	AG	3	6	14224	14229	50 %	0 %	50 %	0 %	54295857
31	NC_006365	AG	3	6	14524	14529	50 %	0 %	50 %	0 %	54295858
32	NC_006365	AT	3	6	14603	14608	50 %	50 %	0 %	0 %	54295858
33	NC_006365	TC	3	6	15598	15603	0 %	50 %	0 %	50 %	54295860
34	NC_006365	CG	3	6	15643	15648	0 %	0 %	50 %	50 %	54295860
35	NC_006365	CT	3	6	16375	16380	0 %	50 %	0 %	50 %	54295862
36	NC_006365	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	54295863
37	NC_006365	GA	3	6	16956	16961	50 %	0 %	50 %	0 %	54295863
38	NC_006365	AT	3	6	17005	17010	50 %	50 %	0 %	0 %	54295863
39	NC_006365	GT	3	6	17366	17371	0 %	50 %	50 %	0 %	54295863
40	NC_006365	AC	3	6	20901	20906	50 %	0 %	0 %	50 %	54295869
41	NC_006365	GT	3	6	23892	23897	0 %	50 %	50 %	0 %	54295871
42	NC_006365	AT	3	6	25262	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	54295873
43	NC_006365	AC	3	6	26772	26777	50 %	0 %	0 %	50 %	54295874
44	NC_006365	CA	3	6	28541	28546	50 %	0 %	0 %	50 %	54295876
45	NC_006365	TG	4	8	28643	28650	0 %	50 %	50 %	0 %	54295876
46	NC_006365	GC	3	6	30214	30219	0 %	0 %	50 %	50 %	54295878
47	NC_006365	TA	3	6	30270	30275	50 %	50 %	0 %	0 %	54295878
48	NC_006365	TG	3	6	31085	31090	0 %	50 %	50 %	0 %	54295879
49	NC_006365	CT	3	6	32462	32467	0 %	50 %	0 %	50 %	54295880
50	NC_006365	CT	3	6	33695	33700	0 %	50 %	0 %	50 %	54295880
51	NC_006365	GT	3	6	36190	36195	0 %	50 %	50 %	0 %	54295881
52	NC_006365	CG	3	6	36608	36613	0 %	0 %	50 %	50 %	54295881
53	NC_006365	CA	3	6	38499	38504	50 %	0 %	0 %	50 %	54295882
54	NC_006365	CA	3	6	39262	39267	50 %	0 %	0 %	50 %	54295882
55	NC_006365	AG	3	6	39385	39390	50 %	0 %	50 %	0 %	54295882
56	NC_006365	CA	3	6	40975	40980	50 %	0 %	0 %	50 %	54295882
57	NC_006365	AT	3	6	41701	41706	50 %	50 %	0 %	0 %	54295882
58	NC_006365	GT	3	6	42183	42188	0 %	50 %	50 %	0 %	54295882
59	NC_006365	GT	3	6	42633	42638	0 %	50 %	50 %	0 %	54295882
60	NC_006365	TA	3	6	45000	45005	50 %	50 %	0 %	0 %	54295887
61	NC_006365	AC	3	6	45718	45723	50 %	0 %	0 %	50 %	54295889
62	NC_006365	AG	4	8	45850	45857	50 %	0 %	50 %	0 %	54295889
63	NC_006365	AT	3	6	46513	46518	50 %	50 %	0 %	0 %	54295890
64	NC_006365	TA	3	6	47037	47042	50 %	50 %	0 %	0 %	54295891
65	NC_006365	GT	4	8	47129	47136	0 %	50 %	50 %	0 %	54295891
66	NC_006365	AT	3	6	47367	47372	50 %	50 %	0 %	0 %	54295891
67	NC_006365	AT	3	6	47437	47442	50 %	50 %	0 %	0 %	54295891
68	NC_006365	AG	3	6	47994	47999	50 %	0 %	50 %	0 %	54295892
69	NC_006365	TG	3	6	49736	49741	0 %	50 %	50 %	0 %	54295894
70	NC_006365	TG	3	6	49829	49834	0 %	50 %	50 %	0 %	54295894
71	NC_006365	AG	3	6	50051	50056	50 %	0 %	50 %	0 %	54295894
72	NC_006365	CA	3	6	50370	50375	50 %	0 %	0 %	50 %	54295894
73	NC_006365	TG	3	6	51457	51462	0 %	50 %	50 %	0 %	54295894
74	NC_006365	AC	3	6	52061	52066	50 %	0 %	0 %	50 %	54295894
75	NC_006365	AG	4	8	54515	54522	50 %	0 %	50 %	0 %	54295897
76	NC_006365	CT	3	6	55659	55664	0 %	50 %	0 %	50 %	54295897
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79	NC_006365	GA	3	6	57833	57838	50 %	0 %	50 %	0 %	54295902
80	NC_006365	CA	3	6	61030	61035	50 %	0 %	0 %	50 %	54295907
81	NC_006365	AT	3	6	61458	61463	50 %	50 %	0 %	0 %	54295908
82	NC_006365	GA	3	6	62595	62600	50 %	0 %	50 %	0 %	54295909
83	NC_006365	TC	3	6	63195	63200	0 %	50 %	0 %	50 %	54295909
84	NC_006365	CA	3	6	63835	63840	50 %	0 %	0 %	50 %	54295910
85	NC_006365	AG	3	6	64699	64704	50 %	0 %	50 %	0 %	54295910
86	NC_006365	AG	4	8	66023	66030	50 %	0 %	50 %	0 %	54295911
87	NC_006365	GA	3	6	66965	66970	50 %	0 %	50 %	0 %	54295912
88	NC_006365	CA	3	6	68146	68151	50 %	0 %	0 %	50 %	54295913
89	NC_006365	TA	3	6	68228	68233	50 %	50 %	0 %	0 %	54295913
90	NC_006365	GA	3	6	68651	68656	50 %	0 %	50 %	0 %	54295914
91	NC_006365	TA	3	6	69153	69158	50 %	50 %	0 %	0 %	54295915
92	NC_006365	CT	3	6	69534	69539	0 %	50 %	0 %	50 %	54295916
93	NC_006365	TA	3	6	69700	69705	50 %	50 %	0 %	0 %	54295916
94	NC_006365	TG	3	6	74483	74488	0 %	50 %	50 %	0 %	54295919
95	NC_006365	CT	3	6	76784	76789	0 %	50 %	0 %	50 %	54295920
96	NC_006365	TA	3	6	76888	76893	50 %	50 %	0 %	0 %	54295920
97	NC_006365	CT	4	8	79343	79350	0 %	50 %	0 %	50 %	54295922
98	NC_006365	AG	3	6	83672	83677	50 %	0 %	50 %	0 %	54295927
99	NC_006365	AT	3	6	86050	86055	50 %	50 %	0 %	0 %	54295931
100	NC_006365	AT	3	6	89866	89871	50 %	50 %	0 %	0 %	54295937
101	NC_006365	TC	3	6	89885	89890	0 %	50 %	0 %	50 %	54295937
102	NC_006365	TC	3	6	90243	90248	0 %	50 %	0 %	50 %	54295937
103	NC_006365	CA	3	6	92119	92124	50 %	0 %	0 %	50 %	54295939
104	NC_006365	AG	3	6	92465	92470	50 %	0 %	50 %	0 %	54295939
105	NC_006365	TA	3	6	92643	92648	50 %	50 %	0 %	0 %	54295939
106	NC_006365	AT	3	6	92849	92854	50 %	50 %	0 %	0 %	54295939
107	NC_006365	AT	3	6	94094	94099	50 %	50 %	0 %	0 %	54295941
108	NC_006365	AG	3	6	94134	94139	50 %	0 %	50 %	0 %	54295941
109	NC_006365	AT	3	6	94311	94316	50 %	50 %	0 %	0 %	54295941
110	NC_006365	AT	3	6	95900	95905	50 %	50 %	0 %	0 %	54295942
111	NC_006365	AT	3	6	96977	96982	50 %	50 %	0 %	0 %	54295942
112	NC_006365	GT	3	6	97702	97707	0 %	50 %	50 %	0 %	54295943
113	NC_006365	AG	3	6	97915	97920	50 %	0 %	50 %	0 %	54295943
114	NC_006365	GC	3	6	98144	98149	0 %	0 %	50 %	50 %	54295943
115	NC_006365	TC	3	6	98349	98354	0 %	50 %	0 %	50 %	54295944
116	NC_006365	CT	3	6	98637	98642	0 %	50 %	0 %	50 %	54295945
117	NC_006365	CT	3	6	99177	99182	0 %	50 %	0 %	50 %	54295946
118	NC_006365	GA	3	6	99674	99679	50 %	0 %	50 %	0 %	54295946
119	NC_006365	GC	3	6	100243	100248	0 %	0 %	50 %	50 %	54295947
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121	NC_006365	CA	3	6	101949	101954	50 %	0 %	0 %	50 %	54295950
122	NC_006365	TA	3	6	102136	102141	50 %	50 %	0 %	0 %	54295950
123	NC_006365	TG	3	6	102708	102713	0 %	50 %	50 %	0 %	54295951
124	NC_006365	TC	4	8	103176	103183	0 %	50 %	0 %	50 %	54295952
125	NC_006365	TC	3	6	105060	105065	0 %	50 %	0 %	50 %	54295953
126	NC_006365	CA	3	6	105845	105850	50 %	0 %	0 %	50 %	54295954
127	NC_006365	TG	3	6	106704	106709	0 %	50 %	50 %	0 %	54295955
128	NC_006365	TC	3	6	108484	108489	0 %	50 %	0 %	50 %	54295956
129	NC_006365	TA	4	8	108490	108497	50 %	50 %	0 %	0 %	54295956
130	NC_006365	AT	3	6	108877	108882	50 %	50 %	0 %	0 %	54295957
131	NC_006365	TA	3	6	109068	109073	50 %	50 %	0 %	0 %	54295957
132	NC_006365	TC	3	6	109109	109114	0 %	50 %	0 %	50 %	54295957
133	NC_006365	GT	3	6	111257	111262	0 %	50 %	50 %	0 %	54295959
134	NC_006365	AG	3	6	111667	111672	50 %	0 %	50 %	0 %	54295959
135	NC_006365	AT	3	6	112470	112475	50 %	50 %	0 %	0 %	54295960
136	NC_006365	AT	3	6	113860	113865	50 %	50 %	0 %	0 %	54295961
137	NC_006365	AC	3	6	114481	114486	50 %	0 %	0 %	50 %	54295962
138	NC_006365	CT	3	6	115976	115981	0 %	50 %	0 %	50 %	54295964
139	NC_006365	GA	3	6	116148	116153	50 %	0 %	50 %	0 %	54295964
140	NC_006365	TA	3	6	119525	119530	50 %	50 %	0 %	0 %	54295969
141	NC_006365	CT	3	6	120071	120076	0 %	50 %	0 %	50 %	54295969
142	NC_006365	AC	3	6	122555	122560	50 %	0 %	0 %	50 %	54295972
143	NC_006365	AT	3	6	123264	123269	50 %	50 %	0 %	0 %	54295972
144	NC_006365	AG	3	6	123570	123575	50 %	0 %	50 %	0 %	54295973
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146	NC_006365	GA	3	6	124042	124047	50 %	0 %	50 %	0 %	54295974
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.