MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Paris plasmid pLPP

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006365	AGAT	2	8	189	196	50 %	25 %	25 %	0 %	54295844
2	NC_006365	TGCA	2	8	332	339	25 %	25 %	25 %	25 %	54295844
3	NC_006365	GAAT	2	8	885	892	50 %	25 %	25 %	0 %	54295844
4	NC_006365	TAAT	2	8	1403	1410	50 %	50 %	0 %	0 %	54295845
5	NC_006365	GAAA	2	8	1706	1713	75 %	0 %	25 %	0 %	54295845
6	NC_006365	AATT	2	8	2679	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	54295846
7	NC_006365	CAGC	2	8	2795	2802	25 %	0 %	25 %	50 %	54295846
8	NC_006365	AATA	2	8	3578	3585	75 %	25 %	0 %	0 %	54295847
9	NC_006365	ATTG	2	8	3828	3835	25 %	50 %	25 %	0 %	54295847
10	NC_006365	TGAT	2	8	4348	4355	25 %	50 %	25 %	0 %	54295847
11	NC_006365	TTGA	2	8	4461	4468	25 %	50 %	25 %	0 %	54295847
12	NC_006365	TAAT	2	8	4513	4520	50 %	50 %	0 %	0 %	54295847
13	NC_006365	AAGA	2	8	4557	4564	75 %	0 %	25 %	0 %	54295847
14	NC_006365	TAAA	2	8	4603	4610	75 %	25 %	0 %	0 %	54295847
15	NC_006365	AACA	2	8	5464	5471	75 %	0 %	0 %	25 %	54295848
16	NC_006365	ATTG	2	8	5541	5548	25 %	50 %	25 %	0 %	54295848
17	NC_006365	ATGC	2	8	5591	5598	25 %	25 %	25 %	25 %	54295849
18	NC_006365	GTTT	2	8	5904	5911	0 %	75 %	25 %	0 %	54295849
19	NC_006365	GATA	2	8	6077	6084	50 %	25 %	25 %	0 %	54295849
20	NC_006365	AAGT	2	8	6099	6106	50 %	25 %	25 %	0 %	54295849
21	NC_006365	TATT	2	8	7372	7379	25 %	75 %	0 %	0 %	54295850
22	NC_006365	TTAA	2	8	8095	8102	50 %	50 %	0 %	0 %	54295851
23	NC_006365	AATT	2	8	9187	9194	50 %	50 %	0 %	0 %	54295852
24	NC_006365	ATAA	2	8	9465	9472	75 %	25 %	0 %	0 %	54295852
25	NC_006365	ATTG	2	8	9754	9761	25 %	50 %	25 %	0 %	54295853
26	NC_006365	TGTT	2	8	9929	9936	0 %	75 %	25 %	0 %	54295853
27	NC_006365	ATTG	2	8	10065	10072	25 %	50 %	25 %	0 %	54295853
28	NC_006365	ATCA	2	8	10089	10096	50 %	25 %	0 %	25 %	54295853
29	NC_006365	AAGA	2	8	10207	10214	75 %	0 %	25 %	0 %	54295853
30	NC_006365	AATT	2	8	10397	10404	50 %	50 %	0 %	0 %	54295853
31	NC_006365	TTGT	2	8	10592	10599	0 %	75 %	25 %	0 %	54295853
32	NC_006365	AAAT	2	8	10811	10818	75 %	25 %	0 %	0 %	54295853
33	NC_006365	GCTT	2	8	11721	11728	0 %	50 %	25 %	25 %	54295855
34	NC_006365	TTAC	2	8	11871	11878	25 %	50 %	0 %	25 %	54295855
35	NC_006365	TTGT	2	8	12226	12233	0 %	75 %	25 %	0 %	54295855
36	NC_006365	AGTT	2	8	12586	12593	25 %	50 %	25 %	0 %	54295856
37	NC_006365	CATG	2	8	13344	13351	25 %	25 %	25 %	25 %	54295856
38	NC_006365	TCAA	2	8	13429	13436	50 %	25 %	0 %	25 %	54295857
39	NC_006365	CTTT	2	8	13921	13928	0 %	75 %	0 %	25 %	54295857
40	NC_006365	TTCT	2	8	13943	13950	0 %	75 %	0 %	25 %	54295857
41	NC_006365	CAGA	2	8	14056	14063	50 %	0 %	25 %	25 %	54295857
42	NC_006365	TACT	2	8	14149	14156	25 %	50 %	0 %	25 %	54295857
43	NC_006365	GCAA	2	8	15290	15297	50 %	0 %	25 %	25 %	54295860
44	NC_006365	GTTA	2	8	15476	15483	25 %	50 %	25 %	0 %	54295860
45	NC_006365	ATTA	2	8	15489	15496	50 %	50 %	0 %	0 %	54295860
46	NC_006365	TTGG	2	8	15876	15883	0 %	50 %	50 %	0 %	54295861
47	NC_006365	AATG	2	8	15965	15972	50 %	25 %	25 %	0 %	54295861
48	NC_006365	CAAT	2	8	16154	16161	50 %	25 %	0 %	25 %	54295861
49	NC_006365	CAAA	2	8	17387	17394	75 %	0 %	0 %	25 %	54295863
50	NC_006365	CATG	2	8	19184	19191	25 %	25 %	25 %	25 %	54295866
51	NC_006365	TGGG	2	8	19421	19428	0 %	25 %	75 %	0 %	54295867
52	NC_006365	TTTA	2	8	19808	19815	25 %	75 %	0 %	0 %	54295867
53	NC_006365	TGCA	2	8	19924	19931	25 %	25 %	25 %	25 %	54295868
54	NC_006365	GCGA	2	8	20023	20030	25 %	0 %	50 %	25 %	54295868
55	NC_006365	CAAA	2	8	20907	20914	75 %	0 %	0 %	25 %	54295869
56	NC_006365	TATG	2	8	21206	21213	25 %	50 %	25 %	0 %	54295869
57	NC_006365	AATC	2	8	21854	21861	50 %	25 %	0 %	25 %	54295869
58	NC_006365	GTTT	2	8	22070	22077	0 %	75 %	25 %	0 %	54295870
59	NC_006365	AAAT	2	8	22278	22285	75 %	25 %	0 %	0 %	54295870
60	NC_006365	ATTT	2	8	22479	22486	25 %	75 %	0 %	0 %	54295871
61	NC_006365	TTCG	2	8	22713	22720	0 %	50 %	25 %	25 %	54295871
62	NC_006365	GAGT	2	8	23143	23150	25 %	25 %	50 %	0 %	54295871
63	NC_006365	TTCT	2	8	23970	23977	0 %	75 %	0 %	25 %	54295871
64	NC_006365	ATTT	2	8	25660	25667	25 %	75 %	0 %	0 %	54295873
65	NC_006365	AGCC	2	8	25774	25781	25 %	0 %	25 %	50 %	54295873
66	NC_006365	TTGT	2	8	25971	25978	0 %	75 %	25 %	0 %	54295874
67	NC_006365	CAAG	2	8	26536	26543	50 %	0 %	25 %	25 %	54295874
68	NC_006365	CAAT	2	8	27013	27020	50 %	25 %	0 %	25 %	54295875
69	NC_006365	TTGA	2	8	27041	27048	25 %	50 %	25 %	0 %	54295875
70	NC_006365	AACA	2	8	27803	27810	75 %	0 %	0 %	25 %	54295876
71	NC_006365	TCAA	2	8	27820	27827	50 %	25 %	0 %	25 %	54295876
72	NC_006365	CGTG	2	8	28479	28486	0 %	25 %	50 %	25 %	54295876
73	NC_006365	ATTG	2	8	28854	28861	25 %	50 %	25 %	0 %	54295876
74	NC_006365	GTTT	2	8	28995	29002	0 %	75 %	25 %	0 %	54295876
75	NC_006365	TCAG	2	8	29855	29862	25 %	25 %	25 %	25 %	54295877
76	NC_006365	TGAA	3	12	30090	30101	50 %	25 %	25 %	0 %	54295877
77	NC_006365	TGCC	2	8	30458	30465	0 %	25 %	25 %	50 %	54295878
78	NC_006365	GTAC	2	8	30804	30811	25 %	25 %	25 %	25 %	54295879
79	NC_006365	GAAT	2	8	31901	31908	50 %	25 %	25 %	0 %	54295879
80	NC_006365	GTTT	2	8	32182	32189	0 %	75 %	25 %	0 %	54295880
81	NC_006365	CTGC	2	8	32300	32307	0 %	25 %	25 %	50 %	54295880
82	NC_006365	TAAT	2	8	32820	32827	50 %	50 %	0 %	0 %	54295880
83	NC_006365	GCAT	2	8	33042	33049	25 %	25 %	25 %	25 %	54295880
84	NC_006365	GCCA	2	8	33620	33627	25 %	0 %	25 %	50 %	54295880
85	NC_006365	GCAG	2	8	34273	34280	25 %	0 %	50 %	25 %	54295880
86	NC_006365	TAAA	2	8	34512	34519	75 %	25 %	0 %	0 %	54295880
87	NC_006365	GCAA	2	8	34678	34685	50 %	0 %	25 %	25 %	54295880
88	NC_006365	AAGG	2	8	34724	34731	50 %	0 %	50 %	0 %	54295880
89	NC_006365	GTAT	2	8	35050	35057	25 %	50 %	25 %	0 %	54295881
90	NC_006365	TTAT	2	8	35990	35997	25 %	75 %	0 %	0 %	54295881
91	NC_006365	ATTT	2	8	36284	36291	25 %	75 %	0 %	0 %	54295881
92	NC_006365	GAAA	2	8	36361	36368	75 %	0 %	25 %	0 %	54295881
93	NC_006365	TAAA	2	8	36855	36862	75 %	25 %	0 %	0 %	54295882
94	NC_006365	GCTT	2	8	37158	37165	0 %	50 %	25 %	25 %	54295882
95	NC_006365	GGAT	2	8	37366	37373	25 %	25 %	50 %	0 %	54295882
96	NC_006365	AATT	2	8	37437	37444	50 %	50 %	0 %	0 %	54295882
97	NC_006365	ATTT	2	8	38311	38318	25 %	75 %	0 %	0 %	54295882
98	NC_006365	CTTT	2	8	38456	38463	0 %	75 %	0 %	25 %	54295882
99	NC_006365	CATT	2	8	38590	38597	25 %	50 %	0 %	25 %	54295882
100	NC_006365	AACA	2	8	38735	38742	75 %	0 %	0 %	25 %	54295882
101	NC_006365	GTTT	2	8	38988	38995	0 %	75 %	25 %	0 %	54295882
102	NC_006365	ATGC	2	8	39629	39636	25 %	25 %	25 %	25 %	54295882
103	NC_006365	TGAT	2	8	40119	40126	25 %	50 %	25 %	0 %	54295882
104	NC_006365	TCAT	2	8	40426	40433	25 %	50 %	0 %	25 %	54295882
105	NC_006365	AATT	2	8	40444	40451	50 %	50 %	0 %	0 %	54295882
106	NC_006365	GGAA	2	8	40462	40469	50 %	0 %	50 %	0 %	54295882
107	NC_006365	CAAA	2	8	40794	40801	75 %	0 %	0 %	25 %	54295882
108	NC_006365	ATTT	2	8	41631	41638	25 %	75 %	0 %	0 %	54295882
109	NC_006365	TCAT	2	8	41856	41863	25 %	50 %	0 %	25 %	54295882
110	NC_006365	AAAC	2	8	42056	42063	75 %	0 %	0 %	25 %	54295882
111	NC_006365	GAAC	2	8	42298	42305	50 %	0 %	25 %	25 %	54295882
112	NC_006365	TCAA	2	8	42600	42607	50 %	25 %	0 %	25 %	54295882
113	NC_006365	ATTA	2	8	42610	42617	50 %	50 %	0 %	0 %	54295882
114	NC_006365	TACT	2	8	42974	42981	25 %	50 %	0 %	25 %	54295883
115	NC_006365	AAAT	2	8	43505	43512	75 %	25 %	0 %	0 %	54295884
116	NC_006365	TTTC	2	8	43760	43767	0 %	75 %	0 %	25 %	54295885
117	NC_006365	TTTA	2	8	44007	44014	25 %	75 %	0 %	0 %	54295885
118	NC_006365	TTTC	2	8	44060	44067	0 %	75 %	0 %	25 %	54295885
119	NC_006365	ATGG	2	8	44068	44075	25 %	25 %	50 %	0 %	54295885
120	NC_006365	GGAG	2	8	44772	44779	25 %	0 %	75 %	0 %	54295886
121	NC_006365	ATAG	2	8	44884	44891	50 %	25 %	25 %	0 %	54295886
122	NC_006365	TAAA	2	8	45134	45141	75 %	25 %	0 %	0 %	54295887
123	NC_006365	ATTT	2	8	45516	45523	25 %	75 %	0 %	0 %	54295888
124	NC_006365	TCAA	2	8	45984	45991	50 %	25 %	0 %	25 %	54295889
125	NC_006365	AATC	2	8	46329	46336	50 %	25 %	0 %	25 %	54295890
126	NC_006365	AATA	2	8	46385	46392	75 %	25 %	0 %	0 %	54295890
127	NC_006365	CTTT	2	8	46990	46997	0 %	75 %	0 %	25 %	54295891
128	NC_006365	ATTC	2	8	47021	47028	25 %	50 %	0 %	25 %	54295891
129	NC_006365	TAAT	2	8	47420	47427	50 %	50 %	0 %	0 %	54295891
130	NC_006365	ATTT	2	8	48077	48084	25 %	75 %	0 %	0 %	54295892
131	NC_006365	GCTT	2	8	48978	48985	0 %	50 %	25 %	25 %	54295893
132	NC_006365	CAAT	2	8	49011	49018	50 %	25 %	0 %	25 %	54295893
133	NC_006365	TCAT	2	8	49079	49086	25 %	50 %	0 %	25 %	54295893
134	NC_006365	TTGA	2	8	50238	50245	25 %	50 %	25 %	0 %	54295894
135	NC_006365	AAAT	2	8	50965	50972	75 %	25 %	0 %	0 %	54295894
136	NC_006365	TAAA	2	8	51205	51212	75 %	25 %	0 %	0 %	54295894
137	NC_006365	GATA	2	8	52347	52354	50 %	25 %	25 %	0 %	54295894
138	NC_006365	CTAC	2	8	53191	53198	25 %	25 %	0 %	50 %	54295896
139	NC_006365	AGGC	2	8	53609	53616	25 %	0 %	50 %	25 %	54295896
140	NC_006365	TGAA	2	8	54171	54178	50 %	25 %	25 %	0 %	54295896
141	NC_006365	TTCA	2	8	54226	54233	25 %	50 %	0 %	25 %	54295897
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143	NC_006365	AATG	2	8	54642	54649	50 %	25 %	25 %	0 %	54295897
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.