MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006087	TGGCA	2	10	253	262	20 %	20 %	40 %	20 %	50953926
2	NC_006087	CGAGG	2	10	6604	6613	20 %	0 %	60 %	20 %	50953931
3	NC_006087	CCGCG	2	10	6837	6846	0 %	0 %	40 %	60 %	50953931
4	NC_006087	CGCGA	2	10	9719	9728	20 %	0 %	40 %	40 %	50953932
5	NC_006087	CGTGA	2	10	14322	14331	20 %	20 %	40 %	20 %	50953934
6	NC_006087	AGCCG	2	10	17178	17187	20 %	0 %	40 %	40 %	50953938
7	NC_006087	GCTCT	2	10	17213	17222	0 %	40 %	20 %	40 %	50953938
8	NC_006087	CCGGT	2	10	21290	21299	0 %	20 %	40 %	40 %	50953943
9	NC_006087	AGCGA	2	10	23703	23712	40 %	0 %	40 %	20 %	50953944
10	NC_006087	GACCG	2	10	25779	25788	20 %	0 %	40 %	40 %	50953945
11	NC_006087	CGGCG	2	10	26290	26299	0 %	0 %	60 %	40 %	50953946
12	NC_006087	GAACG	2	10	26592	26601	40 %	0 %	40 %	20 %	50953946
13	NC_006087	GATCG	2	10	27289	27298	20 %	20 %	40 %	20 %	50953947
14	NC_006087	GCCGC	2	10	30103	30112	0 %	0 %	40 %	60 %	50953950
15	NC_006087	CGAAC	2	10	32037	32046	40 %	0 %	20 %	40 %	50953951
16	NC_006087	CGACC	2	10	35132	35141	20 %	0 %	20 %	60 %	50953953
17	NC_006087	AGGCT	2	10	37423	37432	20 %	20 %	40 %	20 %	50953954
18	NC_006087	CGTGC	2	10	37689	37698	0 %	20 %	40 %	40 %	50953954
19	NC_006087	CTCAA	2	10	38041	38050	40 %	20 %	0 %	40 %	50953954
20	NC_006087	GTCGT	2	10	38205	38214	0 %	40 %	40 %	20 %	50953954
21	NC_006087	GCAGC	2	10	40026	40035	20 %	0 %	40 %	40 %	50953955
22	NC_006087	TCGGA	2	10	41387	41396	20 %	20 %	40 %	20 %	50953956
23	NC_006087	GTGCG	2	10	41842	41851	0 %	20 %	60 %	20 %	50953957
24	NC_006087	CCGTC	2	10	41872	41881	0 %	20 %	20 %	60 %	50953957
25	NC_006087	CGTAC	2	10	47717	47726	20 %	20 %	20 %	40 %	50953961
26	NC_006087	GCGCC	2	10	48633	48642	0 %	0 %	40 %	60 %	50953962
27	NC_006087	TAAAC	2	10	48979	48988	60 %	20 %	0 %	20 %	50953962
28	NC_006087	TCGGC	2	10	50552	50561	0 %	20 %	40 %	40 %	50953964
29	NC_006087	GAGCG	2	10	50634	50643	20 %	0 %	60 %	20 %	50953964
30	NC_006087	CGGAC	2	10	50794	50803	20 %	0 %	40 %	40 %	50953964
31	NC_006087	GTCCG	2	10	54732	54741	0 %	20 %	40 %	40 %	50953967
32	NC_006087	TCGGC	2	10	55009	55018	0 %	20 %	40 %	40 %	50953967
33	NC_006087	GCACG	2	10	55172	55181	20 %	0 %	40 %	40 %	50953967
34	NC_006087	ACGGC	2	10	55561	55570	20 %	0 %	40 %	40 %	50953967
35	NC_006087	GCGGT	2	10	60392	60401	0 %	20 %	60 %	20 %	50953970
36	NC_006087	CGCTC	2	10	61960	61969	0 %	20 %	20 %	60 %	50953971
37	NC_006087	AACCG	2	10	62139	62148	40 %	0 %	20 %	40 %	50953971
38	NC_006087	CGAGC	2	10	65780	65789	20 %	0 %	40 %	40 %	50953974
39	NC_006087	GCCCC	2	10	66181	66190	0 %	0 %	20 %	80 %	50953974
40	NC_006087	CGACG	2	10	68079	68088	20 %	0 %	40 %	40 %	50953978
41	NC_006087	ACACG	2	10	69181	69190	40 %	0 %	20 %	40 %	50953980
42	NC_006087	GCCTC	2	10	69244	69253	0 %	20 %	20 %	60 %	50953980
43	NC_006087	GTCCG	2	10	70261	70270	0 %	20 %	40 %	40 %	50953981
44	NC_006087	ACTCG	2	10	70600	70609	20 %	20 %	20 %	40 %	50953981
45	NC_006087	CGGGA	2	10	71618	71627	20 %	0 %	60 %	20 %	50953982
46	NC_006087	GTGCG	2	10	71721	71730	0 %	20 %	60 %	20 %	50953982
47	NC_006087	AGCGA	2	10	72842	72851	40 %	0 %	40 %	20 %	50953983
48	NC_006087	GCCGC	2	10	73314	73323	0 %	0 %	40 %	60 %	50953983
49	NC_006087	GGCCG	2	10	76005	76014	0 %	0 %	60 %	40 %	50953985
50	NC_006087	CAGCG	2	10	76161	76170	20 %	0 %	40 %	40 %	50953985
51	NC_006087	ATCCC	2	10	77644	77653	20 %	20 %	0 %	60 %	50953987
52	NC_006087	CCGAG	2	10	79242	79251	20 %	0 %	40 %	40 %	50953988
53	NC_006087	AGCGC	2	10	79527	79536	20 %	0 %	40 %	40 %	50953988
54	NC_006087	GCGCG	2	10	80166	80175	0 %	0 %	60 %	40 %	50953988
55	NC_006087	GGGTG	2	10	80881	80890	0 %	20 %	80 %	0 %	50953990
56	NC_006087	CCCGT	2	10	84107	84116	0 %	20 %	20 %	60 %	50953991
57	NC_006087	GCGGG	2	10	84356	84365	0 %	0 %	80 %	20 %	50953991
58	NC_006087	TTCGG	2	10	85007	85016	0 %	40 %	40 %	20 %	50953991
59	NC_006087	GACCG	2	10	86040	86049	20 %	0 %	40 %	40 %	50953992
60	NC_006087	CCGGG	2	10	88401	88410	0 %	0 %	60 %	40 %	50953994
61	NC_006087	GCCGG	2	10	92286	92295	0 %	0 %	60 %	40 %	50953998
62	NC_006087	CCCGA	2	10	92645	92654	20 %	0 %	20 %	60 %	50953998
63	NC_006087	GTCCG	2	10	92815	92824	0 %	20 %	40 %	40 %	50953998
64	NC_006087	CGGCG	2	10	92949	92958	0 %	0 %	60 %	40 %	50953998
65	NC_006087	GGGGA	2	10	93589	93598	20 %	0 %	80 %	0 %	50953999
66	NC_006087	GCCCG	2	10	93964	93973	0 %	0 %	40 %	60 %	50953999
67	NC_006087	GCCTC	2	10	96997	97006	0 %	20 %	20 %	60 %	50954003
68	NC_006087	CCGCG	2	10	97748	97757	0 %	0 %	40 %	60 %	50954003
69	NC_006087	GCCGT	2	10	98363	98372	0 %	20 %	40 %	40 %	50954004
70	NC_006087	CGGCG	2	10	99576	99585	0 %	0 %	60 %	40 %	50954005
71	NC_006087	TGGAC	2	10	102841	102850	20 %	20 %	40 %	20 %	50954007
72	NC_006087	GCCGC	2	10	103276	103285	0 %	0 %	40 %	60 %	50954007
73	NC_006087	CCGAC	2	10	103422	103431	20 %	0 %	20 %	60 %	50954008
74	NC_006087	GCCCG	2	10	103487	103496	0 %	0 %	40 %	60 %	50954008
75	NC_006087	CTCGC	2	10	106940	106949	0 %	20 %	20 %	60 %	50954010
76	NC_006087	GTCCG	2	10	107323	107332	0 %	20 %	40 %	40 %	50954010
77	NC_006087	GCTCA	2	10	108268	108277	20 %	20 %	20 %	40 %	50954011
78	NC_006087	GCATC	2	10	118713	118722	20 %	20 %	20 %	40 %	50954020
79	NC_006087	CCGTC	2	10	128473	128482	0 %	20 %	20 %	60 %	50954027
80	NC_006087	GCCGT	2	10	129294	129303	0 %	20 %	40 %	40 %	50954028
81	NC_006087	GGCGT	2	10	130436	130445	0 %	20 %	60 %	20 %	50954030
82	NC_006087	CCTCA	2	10	131369	131378	20 %	20 %	0 %	60 %	50954030
83	NC_006087	GCTTG	2	10	132972	132981	0 %	40 %	40 %	20 %	50954031
84	NC_006087	CGGTG	2	10	141782	141791	0 %	20 %	60 %	20 %	50954033
85	NC_006087	GCGAC	2	10	141799	141808	20 %	0 %	40 %	40 %	50954033
86	NC_006087	CGGAG	2	10	143353	143362	20 %	0 %	60 %	20 %	50954035
87	NC_006087	GCGGA	2	10	144672	144681	20 %	0 %	60 %	20 %	50954036
88	NC_006087	CTGCG	2	10	145021	145030	0 %	20 %	40 %	40 %	50954036
89	NC_006087	GGCCG	2	10	145053	145062	0 %	0 %	60 %	40 %	50954036
90	NC_006087	GTCGC	2	10	145955	145964	0 %	20 %	40 %	40 %	50954037
91	NC_006087	GCCGT	2	10	147846	147855	0 %	20 %	40 %	40 %	50954040
92	NC_006087	CGCGC	2	10	147931	147940	0 %	0 %	40 %	60 %	50954040
93	NC_006087	GTGCG	2	10	147984	147993	0 %	20 %	60 %	20 %	50954040
94	NC_006087	GTACG	2	10	149144	149153	20 %	20 %	40 %	20 %	50954041
95	NC_006087	TGAAC	2	10	149878	149887	40 %	20 %	20 %	20 %	50954041
96	NC_006087	TCGGT	2	10	151562	151571	0 %	40 %	40 %	20 %	50954043
97	NC_006087	CCGGC	2	10	152139	152148	0 %	0 %	40 %	60 %	50954044
98	NC_006087	GCGGG	2	10	162870	162879	0 %	0 %	80 %	20 %	50954047
99	NC_006087	CGACC	2	10	164176	164185	20 %	0 %	20 %	60 %	50954049
100	NC_006087	CGTCG	2	10	166331	166340	0 %	20 %	40 %	40 %	50954052
101	NC_006087	GGGCC	2	10	167479	167488	0 %	0 %	60 %	40 %	50954054
102	NC_006087	TCCTC	2	10	169823	169832	0 %	40 %	0 %	60 %	50954056
103	NC_006087	CCGAC	2	10	171338	171347	20 %	0 %	20 %	60 %	50954057
104	NC_006087	GCGCA	2	10	174968	174977	20 %	0 %	40 %	40 %	50954063
105	NC_006087	CCGTG	2	10	175395	175404	0 %	20 %	40 %	40 %	50954063
106	NC_006087	TGGTG	2	10	176256	176265	0 %	40 %	60 %	0 %	50954064
107	NC_006087	GTCGT	2	10	176699	176708	0 %	40 %	40 %	20 %	50954064
108	NC_006087	TTCGA	2	10	182757	182766	20 %	40 %	20 %	20 %	50954067
109	NC_006087	CTGCG	2	10	190748	190757	0 %	20 %	40 %	40 %	50954069
110	NC_006087	TTCCT	2	10	191332	191341	0 %	60 %	0 %	40 %	50954070
111	NC_006087	ACGGC	2	10	197098	197107	20 %	0 %	40 %	40 %	50954076
112	NC_006087	CGGCG	2	10	198777	198786	0 %	0 %	60 %	40 %	50954077
113	NC_006087	CGGCG	2	10	199057	199066	0 %	0 %	60 %	40 %	50954077
114	NC_006087	CCGGG	2	10	201997	202006	0 %	0 %	60 %	40 %	50954078
115	NC_006087	CACTC	2	10	202223	202232	20 %	20 %	0 %	60 %	50954079
116	NC_006087	CCCGA	2	10	204658	204667	20 %	0 %	20 %	60 %	50954082
117	NC_006087	CGGCG	2	10	204990	204999	0 %	0 %	60 %	40 %	50954082
118	NC_006087	ACACG	2	10	205080	205089	40 %	0 %	20 %	40 %	50954082
119	NC_006087	AGCGC	2	10	205297	205306	20 %	0 %	40 %	40 %	50954082
120	NC_006087	CCGAA	2	10	206591	206600	40 %	0 %	20 %	40 %	50954083
121	NC_006087	ACGCG	2	10	209334	209343	20 %	0 %	40 %	40 %	50954084
122	NC_006087	GAGCG	2	10	209560	209569	20 %	0 %	60 %	20 %	50954084
123	NC_006087	GCCGC	2	10	210049	210058	0 %	0 %	40 %	60 %	50954085
124	NC_006087	CACGA	2	10	211306	211315	40 %	0 %	20 %	40 %	50954085
125	NC_006087	CCGGC	2	10	212629	212638	0 %	0 %	40 %	60 %	50954086
126	NC_006087	GGCGC	2	10	213433	213442	0 %	0 %	60 %	40 %	50954086
127	NC_006087	GAACT	2	10	218465	218474	40 %	20 %	20 %	20 %	50954090
128	NC_006087	CCGGC	2	10	219129	219138	0 %	0 %	40 %	60 %	50954090
129	NC_006087	CCGCG	2	10	221334	221343	0 %	0 %	40 %	60 %	50954091
130	NC_006087	ACCTC	2	10	223317	223326	20 %	20 %	0 %	60 %	50954092
131	NC_006087	GCCGA	2	10	232761	232770	20 %	0 %	40 %	40 %	50954098
132	NC_006087	CAGGC	2	10	234698	234707	20 %	0 %	40 %	40 %	50954099
133	NC_006087	CGTCC	2	10	236085	236094	0 %	20 %	20 %	60 %	50954100
134	NC_006087	CCGGG	2	10	238342	238351	0 %	0 %	60 %	40 %	50954102
135	NC_006087	GGGCG	2	10	239426	239435	0 %	0 %	80 %	20 %	50954103
136	NC_006087	CGGCA	2	10	239643	239652	20 %	0 %	40 %	40 %	50954103
137	NC_006087	GGCCG	2	10	240509	240518	0 %	0 %	60 %	40 %	50954104
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258	NC_006087	GGCCA	2	10	481312	481321	20 %	0 %	40 %	40 %	50954283
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265	NC_006087	GCGCG	2	10	489812	489821	0 %	0 %	60 %	40 %	50954291
266	NC_006087	GCGAG	2	10	490623	490632	20 %	0 %	60 %	20 %	50954291
267	NC_006087	GCTCG	2	10	491844	491853	0 %	20 %	40 %	40 %	50954293
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