MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006087	CAC	2	6	233585	233590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954098
4002	NC_006087	GC	3	6	233617	233622	0 %	0 %	50 %	50 %	50954098
4003	NC_006087	GCC	2	6	233675	233680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954098
4004	NC_006087	GAGC	2	8	233683	233690	25 %	0 %	50 %	25 %	50954098
4005	NC_006087	CG	4	8	233695	233702	0 %	0 %	50 %	50 %	50954098
4006	NC_006087	GAC	2	6	233705	233710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954098
4007	NC_006087	CGA	2	6	233725	233730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954098
4008	NC_006087	ATC	2	6	233733	233738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954098
4009	NC_006087	CAG	2	6	233756	233761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954098
4010	NC_006087	CGG	2	6	233785	233790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954098
4011	NC_006087	CTC	2	6	233813	233818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954098
4012	NC_006087	GCA	2	6	234002	234007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4013	NC_006087	TCG	2	6	234065	234070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4014	NC_006087	TG	3	6	234080	234085	0 %	50 %	50 %	0 %	50954099
4015	NC_006087	GGC	2	6	234118	234123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954099
4016	NC_006087	GA	4	8	234151	234158	50 %	0 %	50 %	0 %	50954099
4017	NC_006087	CCGG	2	8	234159	234166	0 %	0 %	50 %	50 %	50954099
4018	NC_006087	GTCG	2	8	234202	234209	0 %	25 %	50 %	25 %	50954099
4019	NC_006087	TGG	2	6	234306	234311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954099
4020	NC_006087	GTT	2	6	234316	234321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954099
4021	NC_006087	TCG	2	6	234348	234353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4022	NC_006087	CTG	2	6	234439	234444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4023	NC_006087	CGCC	2	8	234534	234541	0 %	0 %	25 %	75 %	50954099
4024	NC_006087	CGA	2	6	234567	234572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4025	NC_006087	CCG	2	6	234599	234604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4026	NC_006087	CAGGC	2	10	234698	234707	20 %	0 %	40 %	40 %	50954099
4027	NC_006087	GTT	2	6	234724	234729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954099
4028	NC_006087	TCT	2	6	234732	234737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954099
4029	NC_006087	GCC	2	6	234760	234765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4030	NC_006087	ACG	2	6	234780	234785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4031	NC_006087	CGA	2	6	234792	234797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4032	NC_006087	GAC	2	6	234817	234822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4033	NC_006087	GCA	3	9	234852	234860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4034	NC_006087	C	6	6	234882	234887	0 %	0 %	0 %	100 %	50954099
4035	NC_006087	GCC	3	9	234907	234915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4036	NC_006087	GAG	2	6	234931	234936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954099
4037	NC_006087	CGA	2	6	234996	235001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4038	NC_006087	GCC	2	6	235021	235026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4039	NC_006087	CGC	2	6	235039	235044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4040	NC_006087	CGC	2	6	235048	235053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4041	NC_006087	GCC	2	6	235091	235096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954099
4042	NC_006087	GAC	2	6	235137	235142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954099
4043	NC_006087	GGGTGG	2	12	235197	235208	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	50954099
4044	NC_006087	TTCA	2	8	235217	235224	25 %	50 %	0 %	25 %	50954099
4045	NC_006087	GAG	2	6	235341	235346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954100
4046	NC_006087	TCC	2	6	235360	235365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954100
4047	NC_006087	ACG	2	6	235366	235371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4048	NC_006087	GC	3	6	235386	235391	0 %	0 %	50 %	50 %	50954100
4049	NC_006087	CGC	3	9	235389	235397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954100
4050	NC_006087	CGG	2	6	235406	235411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954100
4051	NC_006087	GCCC	2	8	235446	235453	0 %	0 %	25 %	75 %	50954100
4052	NC_006087	GCA	2	6	235457	235462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4053	NC_006087	ACG	2	6	235495	235500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4054	NC_006087	CTC	3	9	235647	235655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954100
4055	NC_006087	TGC	2	6	235660	235665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4056	NC_006087	ACG	4	12	235672	235683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4057	NC_006087	CTC	2	6	235707	235712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954100
4058	NC_006087	GCG	2	6	235767	235772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954100
4059	NC_006087	GCA	2	6	235832	235837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4060	NC_006087	ACG	2	6	235930	235935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954100
4061	NC_006087	CTC	2	6	235956	235961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954100
4062	NC_006087	CG	3	6	235972	235977	0 %	0 %	50 %	50 %	50954100
4063	NC_006087	GCCC	2	8	236053	236060	0 %	0 %	25 %	75 %	50954100
4064	NC_006087	CGTCC	2	10	236085	236094	0 %	20 %	20 %	60 %	50954100
4065	NC_006087	GCCC	2	8	236167	236174	0 %	0 %	25 %	75 %	50954101
4066	NC_006087	TGG	2	6	236223	236228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954101
4067	NC_006087	CGA	2	6	236242	236247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4068	NC_006087	GTG	2	6	236256	236261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954101
4069	NC_006087	GCC	2	6	236329	236334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954101
4070	NC_006087	CGT	2	6	236410	236415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4071	NC_006087	GC	3	6	236420	236425	0 %	0 %	50 %	50 %	50954101
4072	NC_006087	CGG	3	9	236446	236454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954101
4073	NC_006087	CAT	2	6	236489	236494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954101
4074	NC_006087	CTC	2	6	236495	236500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954101
4075	NC_006087	AGC	2	6	236511	236516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4076	NC_006087	TGG	2	6	236580	236585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954101
4077	NC_006087	GAT	2	6	236591	236596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954101
4078	NC_006087	CCG	2	6	236614	236619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954101
4079	NC_006087	CCG	2	6	236630	236635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954101
4080	NC_006087	TCG	2	6	236688	236693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4081	NC_006087	GTC	2	6	236741	236746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4082	NC_006087	GGT	2	6	236755	236760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954101
4083	NC_006087	TCG	2	6	236766	236771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4084	NC_006087	CG	3	6	236898	236903	0 %	0 %	50 %	50 %	50954101
4085	NC_006087	CG	3	6	236928	236933	0 %	0 %	50 %	50 %	50954101
4086	NC_006087	CG	3	6	236950	236955	0 %	0 %	50 %	50 %	50954101
4087	NC_006087	GGT	2	6	236992	236997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954101
4088	NC_006087	GCC	2	6	237026	237031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954101
4089	NC_006087	CCT	2	6	237034	237039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954101
4090	NC_006087	GTC	2	6	237053	237058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4091	NC_006087	CCG	2	6	237063	237068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954101
4092	NC_006087	CGG	4	12	237130	237141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954101
4093	NC_006087	CTG	2	6	237146	237151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4094	NC_006087	CCT	2	6	237154	237159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954101
4095	NC_006087	GCT	2	6	237175	237180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4096	NC_006087	CTT	2	6	237200	237205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954101
4097	NC_006087	CTC	2	6	237263	237268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954101
4098	NC_006087	CCA	2	6	237319	237324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954101
4099	NC_006087	CGC	2	6	237337	237342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954101
4100	NC_006087	GC	3	6	237341	237346	0 %	0 %	50 %	50 %	50954101
4101	NC_006087	ACG	2	6	237356	237361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954101
4102	NC_006087	GATC	2	8	237394	237401	25 %	25 %	25 %	25 %	50954101
4103	NC_006087	CGGC	2	8	237691	237698	0 %	0 %	50 %	50 %	50954102
4104	NC_006087	TCG	2	6	237700	237705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4105	NC_006087	GAGG	2	8	237708	237715	25 %	0 %	75 %	0 %	50954102
4106	NC_006087	GC	3	6	237787	237792	0 %	0 %	50 %	50 %	50954102
4107	NC_006087	TCG	2	6	237862	237867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4108	NC_006087	CGGG	2	8	237924	237931	0 %	0 %	75 %	25 %	50954102
4109	NC_006087	GAG	2	6	237975	237980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954102
4110	NC_006087	AGC	2	6	237985	237990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4111	NC_006087	GC	3	6	237989	237994	0 %	0 %	50 %	50 %	50954102
4112	NC_006087	GTC	2	6	238002	238007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4113	NC_006087	GTC	2	6	238104	238109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4114	NC_006087	ACG	3	9	238129	238137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4115	NC_006087	GTG	2	6	238140	238145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954102
4116	NC_006087	CGGG	2	8	238157	238164	0 %	0 %	75 %	25 %	50954102
4117	NC_006087	GCC	2	6	238185	238190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954102
4118	NC_006087	AG	3	6	238205	238210	50 %	0 %	50 %	0 %	50954102
4119	NC_006087	CGGCCG	2	12	238211	238222	0 %	0 %	50 %	50 %	50954102
4120	NC_006087	GGC	2	6	238233	238238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954102
4121	NC_006087	CGT	2	6	238335	238340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4122	NC_006087	CCGGG	2	10	238342	238351	0 %	0 %	60 %	40 %	50954102
4123	NC_006087	CGA	2	6	238352	238357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4124	NC_006087	CGA	2	6	238388	238393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4125	NC_006087	C	6	6	238441	238446	0 %	0 %	0 %	100 %	50954102
4126	NC_006087	TCG	2	6	238618	238623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954102
4127	NC_006087	GGC	2	6	238656	238661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954102
4128	NC_006087	TCGACG	2	12	238783	238794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50954103
4129	NC_006087	GCG	2	6	238799	238804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954103
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4131	NC_006087	TAC	2	6	238809	238814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954103
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4136	NC_006087	TGG	2	6	239062	239067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954103
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4139	NC_006087	TCG	2	6	239158	239163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954103
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4143	NC_006087	CGG	2	6	239219	239224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954103
4144	NC_006087	CGG	2	6	239227	239232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954103
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4148	NC_006087	GCG	2	6	239317	239322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954103
4149	NC_006087	CGA	2	6	239354	239359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954103
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4165	NC_006087	CG	3	6	239985	239990	0 %	0 %	50 %	50 %	50954103
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4233	NC_006087	TCCGA	2	10	246531	246540	20 %	20 %	20 %	40 %	50954108
4234	NC_006087	AGCA	2	8	246607	246614	50 %	0 %	25 %	25 %	50954108
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4240	NC_006087	CTCG	2	8	250095	250102	0 %	25 %	25 %	50 %	50954110
4241	NC_006087	GGT	2	6	250223	250228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954110
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4246	NC_006087	TGG	2	6	250467	250472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954110
4247	NC_006087	ACG	2	6	250525	250530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954110
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4249	NC_006087	CCG	2	6	250745	250750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954110
4250	NC_006087	CGG	2	6	250786	250791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954110
4251	NC_006087	GCG	2	6	250962	250967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954110
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4254	NC_006087	TCG	2	6	251143	251148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954110
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4344	NC_006087	GC	4	8	255537	255544	0 %	0 %	50 %	50 %	50954114
4345	NC_006087	GAGG	2	8	255583	255590	25 %	0 %	75 %	0 %	50954114
4346	NC_006087	CGGCG	2	10	255591	255600	0 %	0 %	60 %	40 %	50954114
4347	NC_006087	GCT	2	6	255619	255624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954114
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4350	NC_006087	GTC	2	6	255716	255721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954114
4351	NC_006087	CGC	2	6	255732	255737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954114
4352	NC_006087	CGT	2	6	255753	255758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954114
4353	NC_006087	CGCCGA	2	12	255759	255770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	50954114
4354	NC_006087	TCA	2	6	255774	255779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954114
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4357	NC_006087	ACG	2	6	255943	255948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954114
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4359	NC_006087	CAG	2	6	256051	256056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954114
4360	NC_006087	CGAC	2	8	256065	256072	25 %	0 %	25 %	50 %	50954114
4361	NC_006087	CTC	2	6	256178	256183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954114
4362	NC_006087	TGC	2	6	256224	256229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954114
4363	NC_006087	GCT	3	9	256279	256287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954114
4364	NC_006087	GGT	2	6	256297	256302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954114
4365	NC_006087	CCG	2	6	256342	256347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954114
4366	NC_006087	GGA	2	6	256351	256356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954114
4367	NC_006087	CGG	2	6	256383	256388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954114
4368	NC_006087	CCTCG	2	10	256441	256450	0 %	20 %	20 %	60 %	50954114
4369	NC_006087	AGC	2	6	256486	256491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954114
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4371	NC_006087	GGA	2	6	256531	256536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954114
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4373	NC_006087	CGG	2	6	256566	256571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954114
4374	NC_006087	GTG	2	6	256613	256618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954114
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4378	NC_006087	GCC	2	6	256758	256763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954114
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4491	NC_006087	ACGCG	2	10	261869	261878	20 %	0 %	40 %	40 %	50954117
4492	NC_006087	TCG	2	6	261881	261886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954117
4493	NC_006087	ACG	2	6	261896	261901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954117
4494	NC_006087	TCT	2	6	261935	261940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954117
4495	NC_006087	GCT	2	6	261975	261980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954117
4496	NC_006087	GGC	2	6	262029	262034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954117
4497	NC_006087	CTCG	2	8	262065	262072	0 %	25 %	25 %	50 %	50954117
4498	NC_006087	TCA	2	6	262199	262204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954117
4499	NC_006087	TCG	2	6	262244	262249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954117
4500	NC_006087	GCG	2	6	262295	262300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954117

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