MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006087	ATGG	2	8	170469	170476	25 %	25 %	50 %	0 %	50954056
3002	NC_006087	ACC	2	6	170477	170482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954056
3003	NC_006087	GCC	3	9	170483	170491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954056
3004	NC_006087	ATC	2	6	170557	170562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954056
3005	NC_006087	AGT	2	6	170651	170656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954056
3006	NC_006087	CGA	2	6	170726	170731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954056
3007	NC_006087	AGC	2	6	170791	170796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954056
3008	NC_006087	TCGC	2	8	170848	170855	0 %	25 %	25 %	50 %	50954056
3009	NC_006087	GC	3	6	170869	170874	0 %	0 %	50 %	50 %	50954056
3010	NC_006087	CAG	2	6	170961	170966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954056
3011	NC_006087	GAG	2	6	171082	171087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954056
3012	NC_006087	GCG	2	6	171127	171132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954056
3013	NC_006087	CG	3	6	171186	171191	0 %	0 %	50 %	50 %	50954056
3014	NC_006087	CCGAC	2	10	171338	171347	20 %	0 %	20 %	60 %	50954057
3015	NC_006087	GCG	2	6	171348	171353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954057
3016	NC_006087	TGC	2	6	171368	171373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954057
3017	NC_006087	GTC	2	6	171393	171398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954057
3018	NC_006087	CAGC	2	8	171447	171454	25 %	0 %	25 %	50 %	50954057
3019	NC_006087	TGC	2	6	171479	171484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954057
3020	NC_006087	TCG	2	6	171497	171502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954057
3021	NC_006087	GAG	2	6	171511	171516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954057
3022	NC_006087	CTA	2	6	171528	171533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954057
3023	NC_006087	CGC	2	6	171548	171553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954057
3024	NC_006087	GGA	2	6	171564	171569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954057
3025	NC_006087	GCC	2	6	171589	171594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954057
3026	NC_006087	CGA	2	6	171723	171728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954057
3027	NC_006087	GAT	2	6	171899	171904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954058
3028	NC_006087	CGTT	2	8	171972	171979	0 %	50 %	25 %	25 %	50954058
3029	NC_006087	CTG	2	6	171994	171999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954058
3030	NC_006087	CCT	2	6	172342	172347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954059
3031	NC_006087	GAT	2	6	172382	172387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954059
3032	NC_006087	GTC	2	6	172397	172402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954059
3033	NC_006087	GGT	2	6	172408	172413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954059
3034	NC_006087	GGA	2	6	172426	172431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954059
3035	NC_006087	GAA	2	6	172451	172456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954059
3036	NC_006087	GAG	2	6	172499	172504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954059
3037	NC_006087	CG	3	6	172558	172563	0 %	0 %	50 %	50 %	50954059
3038	NC_006087	GGA	2	6	172582	172587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954059
3039	NC_006087	CGT	2	6	172605	172610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954060
3040	NC_006087	CG	3	6	172659	172664	0 %	0 %	50 %	50 %	50954060
3041	NC_006087	CTGC	2	8	172687	172694	0 %	25 %	25 %	50 %	50954060
3042	NC_006087	GGT	2	6	172695	172700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954060
3043	NC_006087	GTC	2	6	172762	172767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954060
3044	NC_006087	CGCGGA	2	12	172782	172793	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	50954060
3045	NC_006087	GTC	2	6	172855	172860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954060
3046	NC_006087	CGG	2	6	172871	172876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954060
3047	NC_006087	GAT	2	6	172967	172972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954061
3048	NC_006087	TCG	2	6	172980	172985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3049	NC_006087	CGA	2	6	173014	173019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3050	NC_006087	TGA	2	6	173050	173055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954061
3051	NC_006087	CTTTGG	2	12	173077	173088	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	50954061
3052	NC_006087	TCC	2	6	173124	173129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954061
3053	NC_006087	GCA	2	6	173164	173169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3054	NC_006087	AGC	2	6	173199	173204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3055	NC_006087	GAA	2	6	173237	173242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954061
3056	NC_006087	TCT	2	6	173290	173295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954061
3057	NC_006087	GGC	2	6	173320	173325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954061
3058	NC_006087	CCG	2	6	173353	173358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954061
3059	NC_006087	GCG	2	6	173364	173369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954061
3060	NC_006087	GCA	2	6	173377	173382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3061	NC_006087	TCG	2	6	173403	173408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3062	NC_006087	CG	3	6	173411	173416	0 %	0 %	50 %	50 %	50954061
3063	NC_006087	CCA	2	6	173461	173466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954061
3064	NC_006087	TCA	2	6	173485	173490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954061
3065	NC_006087	GGT	2	6	173528	173533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954061
3066	NC_006087	TCG	2	6	173541	173546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3067	NC_006087	GAC	2	6	173606	173611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954061
3068	NC_006087	GC	3	6	173638	173643	0 %	0 %	50 %	50 %	50954061
3069	NC_006087	ACG	2	6	173699	173704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954062
3070	NC_006087	TGA	2	6	173706	173711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954062
3071	NC_006087	GAC	2	6	173822	173827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954062
3072	NC_006087	CGA	2	6	173832	173837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954062
3073	NC_006087	CGG	2	6	173846	173851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954062
3074	NC_006087	GGCG	2	8	173877	173884	0 %	0 %	75 %	25 %	50954062
3075	NC_006087	TTG	2	6	173891	173896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954062
3076	NC_006087	TGA	2	6	173919	173924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954062
3077	NC_006087	CGGTCG	2	12	173942	173953	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50954062
3078	NC_006087	GCC	2	6	173965	173970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954062
3079	NC_006087	CAG	2	6	174052	174057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954062
3080	NC_006087	GCG	2	6	174152	174157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954062
3081	NC_006087	ACCC	2	8	174196	174203	25 %	0 %	0 %	75 %	50954062
3082	NC_006087	CGT	2	6	174219	174224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954062
3083	NC_006087	GTT	2	6	174228	174233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954062
3084	NC_006087	CGA	2	6	174255	174260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954062
3085	NC_006087	AAG	2	6	174268	174273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954062
3086	NC_006087	TGA	2	6	174294	174299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954062
3087	NC_006087	CGA	2	6	174915	174920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3088	NC_006087	CCGGCG	2	12	174923	174934	0 %	0 %	50 %	50 %	50954063
3089	NC_006087	GCGCA	2	10	174968	174977	20 %	0 %	40 %	40 %	50954063
3090	NC_006087	TCGCCG	2	12	174992	175003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	50954063
3091	NC_006087	CCG	2	6	175007	175012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954063
3092	NC_006087	TCG	2	6	175086	175091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3093	NC_006087	GCGG	2	8	175248	175255	0 %	0 %	75 %	25 %	50954063
3094	NC_006087	GCC	2	6	175328	175333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954063
3095	NC_006087	CCGTG	2	10	175395	175404	0 %	20 %	40 %	40 %	50954063
3096	NC_006087	GAG	2	6	175430	175435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954063
3097	NC_006087	CAG	2	6	175463	175468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3098	NC_006087	GA	3	6	175535	175540	50 %	0 %	50 %	0 %	50954063
3099	NC_006087	CGG	2	6	175590	175595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954063
3100	NC_006087	GAGC	2	8	175627	175634	25 %	0 %	50 %	25 %	50954063
3101	NC_006087	GGA	2	6	175638	175643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954063
3102	NC_006087	TCGCGG	2	12	175686	175697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50954063
3103	NC_006087	CGG	2	6	175719	175724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954063
3104	NC_006087	TTC	2	6	175725	175730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954063
3105	NC_006087	CGG	2	6	175737	175742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954063
3106	NC_006087	CGA	2	6	175800	175805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3107	NC_006087	GTC	2	6	175843	175848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3108	NC_006087	GCGAAC	2	12	175850	175861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3109	NC_006087	GGC	2	6	175915	175920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954063
3110	NC_006087	CG	3	6	175930	175935	0 %	0 %	50 %	50 %	50954063
3111	NC_006087	CGGC	2	8	176038	176045	0 %	0 %	50 %	50 %	50954063
3112	NC_006087	TGG	2	6	176069	176074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954063
3113	NC_006087	CGT	2	6	176076	176081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954063
3114	NC_006087	GA	3	6	176102	176107	50 %	0 %	50 %	0 %	50954063
3115	NC_006087	TGGTG	2	10	176256	176265	0 %	40 %	60 %	0 %	50954064
3116	NC_006087	AGC	2	6	176285	176290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954064
3117	NC_006087	GTC	2	6	176299	176304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954064
3118	NC_006087	CCAC	2	8	176324	176331	25 %	0 %	0 %	75 %	50954064
3119	NC_006087	GCG	2	6	176383	176388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954064
3120	NC_006087	CGC	2	6	176436	176441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954064
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3122	NC_006087	CGT	2	6	176487	176492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954064
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3245	NC_006087	TCCC	2	8	189484	189491	0 %	25 %	0 %	75 %	50954068
3246	NC_006087	TCGC	2	8	189661	189668	0 %	25 %	25 %	50 %	50954068
3247	NC_006087	TAC	2	6	189673	189678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954068
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3249	NC_006087	CAC	2	6	189714	189719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954068
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3253	NC_006087	TCG	2	6	189959	189964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954068
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3353	NC_006087	ACG	2	6	197167	197172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954076
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3359	NC_006087	CGG	2	6	197413	197418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954076
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3364	NC_006087	GAA	2	6	198787	198792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954077
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3489	NC_006087	GCA	2	6	204609	204614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
3490	NC_006087	AACA	2	8	204649	204656	75 %	0 %	0 %	25 %	50954082
3491	NC_006087	CCCGA	2	10	204658	204667	20 %	0 %	20 %	60 %	50954082
3492	NC_006087	AGA	2	6	204686	204691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954082
3493	NC_006087	AGC	2	6	204692	204697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
3494	NC_006087	GCT	2	6	204713	204718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954082
3495	NC_006087	ACG	2	6	204722	204727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
3496	NC_006087	GAC	2	6	204802	204807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082
3497	NC_006087	TCC	2	6	204809	204814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954082
3498	NC_006087	CGG	2	6	204840	204845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954082
3499	NC_006087	TAC	2	6	204877	204882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954082
3500	NC_006087	GCA	2	6	204912	204917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954082

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