MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006087	GCA	2	6	300911	300916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954141
5002	NC_006087	CCG	2	6	300931	300936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954141
5003	NC_006087	ACC	2	6	300961	300966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954141
5004	NC_006087	AGC	2	6	301006	301011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954141
5005	NC_006087	CAG	2	6	301095	301100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954141
5006	NC_006087	GGC	2	6	301149	301154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954141
5007	NC_006087	GGT	2	6	301167	301172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954141
5008	NC_006087	TGG	2	6	301229	301234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954142
5009	NC_006087	CGGTGG	4	24	301235	301258	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	50954142
5010	NC_006087	GGCG	2	8	301310	301317	0 %	0 %	75 %	25 %	50954142
5011	NC_006087	GGC	2	6	301326	301331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954142
5012	NC_006087	GC	3	6	301345	301350	0 %	0 %	50 %	50 %	50954142
5013	NC_006087	GCGA	2	8	301357	301364	25 %	0 %	50 %	25 %	50954142
5014	NC_006087	ACG	2	6	301420	301425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5015	NC_006087	CGG	2	6	301448	301453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954142
5016	NC_006087	CTC	2	6	301473	301478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954142
5017	NC_006087	GCC	2	6	301542	301547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5018	NC_006087	TCG	2	6	301576	301581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5019	NC_006087	CGG	2	6	301583	301588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954142
5020	NC_006087	GCC	2	6	301597	301602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5021	NC_006087	GAT	2	6	301617	301622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954142
5022	NC_006087	GCC	3	9	301626	301634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5023	NC_006087	GCA	3	9	301643	301651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5024	NC_006087	GCC	2	6	301710	301715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5025	NC_006087	CCG	2	6	301748	301753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5026	NC_006087	CCG	2	6	301834	301839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5027	NC_006087	CAGC	2	8	301893	301900	25 %	0 %	25 %	50 %	50954142
5028	NC_006087	CG	5	10	301902	301911	0 %	0 %	50 %	50 %	50954142
5029	NC_006087	CGGC	2	8	301917	301924	0 %	0 %	50 %	50 %	50954142
5030	NC_006087	TCC	2	6	301928	301933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954142
5031	NC_006087	CGT	2	6	301934	301939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5032	NC_006087	CGC	2	6	301967	301972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954142
5033	NC_006087	CGG	2	6	301975	301980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954142
5034	NC_006087	GCG	2	6	302020	302025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954142
5035	NC_006087	CCA	2	6	302027	302032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954142
5036	NC_006087	CGATCG	2	12	302105	302116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5037	NC_006087	CGA	2	6	302171	302176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5038	NC_006087	CGG	2	6	302197	302202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954142
5039	NC_006087	GC	3	6	302230	302235	0 %	0 %	50 %	50 %	50954142
5040	NC_006087	TCC	2	6	302242	302247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954142
5041	NC_006087	CGA	2	6	302261	302266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5042	NC_006087	TGC	2	6	302302	302307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5043	NC_006087	GGCC	2	8	302309	302316	0 %	0 %	50 %	50 %	50954142
5044	NC_006087	CGA	2	6	302327	302332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954142
5045	NC_006087	GGT	2	6	302358	302363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954142
5046	NC_006087	GAG	2	6	302473	302478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954143
5047	NC_006087	CG	3	6	302485	302490	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5048	NC_006087	CCG	2	6	302548	302553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954143
5049	NC_006087	TGC	2	6	302587	302592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5050	NC_006087	GGT	2	6	302612	302617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954143
5051	NC_006087	GAC	2	6	302619	302624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5052	NC_006087	GCC	2	6	302670	302675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954143
5053	NC_006087	GAGG	2	8	302685	302692	25 %	0 %	75 %	0 %	50954143
5054	NC_006087	CGGC	2	8	302737	302744	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5055	NC_006087	GAA	2	6	302759	302764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954143
5056	NC_006087	CGG	2	6	302765	302770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5057	NC_006087	GC	3	6	302781	302786	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5058	NC_006087	CGA	2	6	302792	302797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5059	NC_006087	CGT	2	6	302798	302803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5060	NC_006087	CGG	2	6	302813	302818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5061	NC_006087	CGCC	2	8	302822	302829	0 %	0 %	25 %	75 %	50954143
5062	NC_006087	CG	3	6	302842	302847	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5063	NC_006087	CCG	2	6	302977	302982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954143
5064	NC_006087	TGA	2	6	302984	302989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954143
5065	NC_006087	CGG	2	6	303118	303123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5066	NC_006087	CGG	2	6	303165	303170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5067	NC_006087	CAGG	2	8	303176	303183	25 %	0 %	50 %	25 %	50954143
5068	NC_006087	GTC	2	6	303234	303239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5069	NC_006087	CGG	2	6	303240	303245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5070	NC_006087	CGC	2	6	303255	303260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954143
5071	NC_006087	CAG	2	6	303321	303326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5072	NC_006087	CTCG	2	8	303336	303343	0 %	25 %	25 %	50 %	50954143
5073	NC_006087	ATG	2	6	303346	303351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954143
5074	NC_006087	CGA	2	6	303374	303379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5075	NC_006087	CGATGG	2	12	303401	303412	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	50954143
5076	NC_006087	CG	3	6	303416	303421	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5077	NC_006087	GC	3	6	303441	303446	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5078	NC_006087	CGG	2	6	303447	303452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5079	NC_006087	CGT	2	6	303470	303475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5080	NC_006087	GCCG	2	8	303477	303484	0 %	0 %	50 %	50 %	50954143
5081	NC_006087	CGG	2	6	303500	303505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954143
5082	NC_006087	CAG	2	6	303603	303608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5083	NC_006087	CGA	2	6	303626	303631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954143
5084	NC_006087	CTTT	2	8	303932	303939	0 %	75 %	0 %	25 %	50954144
5085	NC_006087	CGC	2	6	303979	303984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954144
5086	NC_006087	CCA	2	6	303994	303999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954144
5087	NC_006087	CGG	2	6	304009	304014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954144
5088	NC_006087	GCC	2	6	304037	304042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954144
5089	NC_006087	CGC	2	6	304114	304119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954144
5090	NC_006087	CGC	2	6	304138	304143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954144
5091	NC_006087	CAC	2	6	304378	304383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954144
5092	NC_006087	CTCC	2	8	304417	304424	0 %	25 %	0 %	75 %	50954144
5093	NC_006087	ATC	2	6	304436	304441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954144
5094	NC_006087	GCC	2	6	304442	304447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954144
5095	NC_006087	CGA	2	6	304477	304482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954144
5096	NC_006087	GCG	3	9	304553	304561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954145
5097	NC_006087	GGCGTC	2	12	304567	304578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50954145
5098	NC_006087	TCA	2	6	304592	304597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954145
5099	NC_006087	ACCTC	2	10	304616	304625	20 %	20 %	0 %	60 %	50954145
5100	NC_006087	TCG	2	6	304649	304654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5101	NC_006087	GAG	2	6	304666	304671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954145
5102	NC_006087	GAA	2	6	304692	304697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954145
5103	NC_006087	GCT	2	6	304728	304733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5104	NC_006087	GAC	2	6	304738	304743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5105	NC_006087	TCG	2	6	304754	304759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5106	NC_006087	GTCGCC	2	12	304786	304797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	50954145
5107	NC_006087	TG	3	6	304824	304829	0 %	50 %	50 %	0 %	50954145
5108	NC_006087	GCT	2	6	304872	304877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5109	NC_006087	CGC	2	6	304954	304959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954145
5110	NC_006087	TGG	2	6	304961	304966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954145
5111	NC_006087	AGG	2	6	305060	305065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954145
5112	NC_006087	GGGC	2	8	305066	305073	0 %	0 %	75 %	25 %	50954145
5113	NC_006087	CTA	2	6	305094	305099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954145
5114	NC_006087	GTT	2	6	305118	305123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50954145
5115	NC_006087	TCG	2	6	305133	305138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5116	NC_006087	CG	3	6	305171	305176	0 %	0 %	50 %	50 %	50954145
5117	NC_006087	CG	3	6	305192	305197	0 %	0 %	50 %	50 %	50954145
5118	NC_006087	CCT	2	6	305376	305381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954145
5119	NC_006087	CGT	2	6	305448	305453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954145
5120	NC_006087	CTCG	2	8	305458	305465	0 %	25 %	25 %	50 %	50954145
5121	NC_006087	GC	3	6	305490	305495	0 %	0 %	50 %	50 %	50954145
5122	NC_006087	GGC	2	6	305532	305537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954145
5123	NC_006087	GGCG	2	8	305547	305554	0 %	0 %	75 %	25 %	50954145
5124	NC_006087	GCC	2	6	308307	308312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954146
5125	NC_006087	CGG	2	6	308331	308336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954146
5126	NC_006087	AGG	2	6	308390	308395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954146
5127	NC_006087	GAG	2	6	308449	308454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954146
5128	NC_006087	TTC	2	6	308465	308470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954146
5129	NC_006087	GCT	3	9	308496	308504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954146
5130	NC_006087	GGT	2	6	308529	308534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954146
5131	NC_006087	CG	3	6	308575	308580	0 %	0 %	50 %	50 %	50954146
5132	NC_006087	TCGC	2	8	308690	308697	0 %	25 %	25 %	50 %	50954146
5133	NC_006087	CGAG	2	8	308748	308755	25 %	0 %	50 %	25 %	50954146
5134	NC_006087	GCC	3	9	308812	308820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954146
5135	NC_006087	CGA	2	6	308838	308843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954146
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5139	NC_006087	CCG	2	6	309010	309015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954147
5140	NC_006087	CCG	2	6	309034	309039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954147
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5142	NC_006087	CGA	3	9	309053	309061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954147
5143	NC_006087	CGG	2	6	309095	309100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954147
5144	NC_006087	GGC	2	6	309111	309116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954147
5145	NC_006087	GCC	2	6	309147	309152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954147
5146	NC_006087	GCCGGG	2	12	309171	309182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954147
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5148	NC_006087	C	6	6	309203	309208	0 %	0 %	0 %	100 %	50954147
5149	NC_006087	GAGCCG	2	12	309226	309237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	50954147
5150	NC_006087	TGC	2	6	309239	309244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954147
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5152	NC_006087	GAG	2	6	309285	309290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954147
5153	NC_006087	CCG	2	6	309313	309318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954147
5154	NC_006087	CGAC	2	8	309332	309339	25 %	0 %	25 %	50 %	50954147
5155	NC_006087	CGA	2	6	309356	309361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954147
5156	NC_006087	GCG	2	6	309363	309368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954147
5157	NC_006087	CGAG	2	8	309521	309528	25 %	0 %	50 %	25 %	50954147
5158	NC_006087	TGATC	2	10	309602	309611	20 %	40 %	20 %	20 %	50954147
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5160	NC_006087	GGC	2	6	309627	309632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954147
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5167	NC_006087	GAAC	2	8	309957	309964	50 %	0 %	25 %	25 %	50954147
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5230	NC_006087	TC	3	6	312525	312530	0 %	50 %	0 %	50 %	50954149
5231	NC_006087	GCT	3	9	312531	312539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954149
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5236	NC_006087	CGA	2	6	312695	312700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954149
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5239	NC_006087	CG	4	8	312813	312820	0 %	0 %	50 %	50 %	50954149
5240	NC_006087	GAC	2	6	312840	312845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954149
5241	NC_006087	GTG	2	6	312886	312891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954149
5242	NC_006087	ACG	2	6	312896	312901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954149
5243	NC_006087	GCCG	2	8	312920	312927	0 %	0 %	50 %	50 %	50954149
5244	NC_006087	CGC	2	6	312966	312971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954149
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5246	NC_006087	TGGA	2	8	312989	312996	25 %	25 %	50 %	0 %	50954149
5247	NC_006087	TCC	2	6	313098	313103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954150
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5361	NC_006087	GAGG	2	8	318447	318454	25 %	0 %	75 %	0 %	50954156
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5369	NC_006087	CG	3	6	319231	319236	0 %	0 %	50 %	50 %	50954157
5370	NC_006087	GGC	2	6	319249	319254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954157
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5489	NC_006087	GCC	2	6	324590	324595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954163
5490	NC_006087	GCT	2	6	324601	324606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954163
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5492	NC_006087	GAC	2	6	324620	324625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954163
5493	NC_006087	TTC	2	6	324632	324637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954163
5494	NC_006087	CGA	2	6	324706	324711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954163
5495	NC_006087	TGC	2	6	324765	324770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954163
5496	NC_006087	CG	3	6	324787	324792	0 %	0 %	50 %	50 %	50954163
5497	NC_006087	GCG	2	6	324832	324837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954163
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