MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	45655586
2	NC_005824	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	45655587
3	NC_005824	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	45655587
4	NC_005824	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
5	NC_005824	TC	3	6	5763	5768	0 %	50 %	0 %	50 %	45655589
6	NC_005824	TC	3	6	6699	6704	0 %	50 %	0 %	50 %	45655591
7	NC_005824	AT	4	8	7085	7092	50 %	50 %	0 %	0 %	45655591
8	NC_005824	AG	3	6	7191	7196	50 %	0 %	50 %	0 %	45655591
9	NC_005824	AT	3	6	9985	9990	50 %	50 %	0 %	0 %	45655594
10	NC_005824	CT	3	6	10105	10110	0 %	50 %	0 %	50 %	45655594
11	NC_005824	CT	3	6	10273	10278	0 %	50 %	0 %	50 %	45655594
12	NC_005824	AC	3	6	11425	11430	50 %	0 %	0 %	50 %	45655595
13	NC_005824	TA	3	6	11605	11610	50 %	50 %	0 %	0 %	45655595
14	NC_005824	TA	3	6	11924	11929	50 %	50 %	0 %	0 %	45655595
15	NC_005824	TA	4	8	12419	12426	50 %	50 %	0 %	0 %	45655596
16	NC_005824	GA	3	6	12721	12726	50 %	0 %	50 %	0 %	45655596
17	NC_005824	AG	3	6	13345	13350	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
18	NC_005824	AG	3	6	13612	13617	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
19	NC_005824	GA	3	6	13716	13721	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
20	NC_005824	TA	3	6	13977	13982	50 %	50 %	0 %	0 %	45655598
21	NC_005824	AG	3	6	14040	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
22	NC_005824	GA	3	6	14307	14312	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
23	NC_005824	GA	3	6	14903	14908	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
24	NC_005824	CT	3	6	14970	14975	0 %	50 %	0 %	50 %	45655598
25	NC_005824	TC	3	6	15775	15780	0 %	50 %	0 %	50 %	45655599
26	NC_005824	GT	3	6	15932	15937	0 %	50 %	50 %	0 %	45655599
27	NC_005824	TA	3	6	16272	16277	50 %	50 %	0 %	0 %	45655600
28	NC_005824	CT	3	6	16551	16556	0 %	50 %	0 %	50 %	45655600
29	NC_005824	GT	3	6	16573	16578	0 %	50 %	50 %	0 %	45655600
30	NC_005824	AT	3	6	16911	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	45655600
31	NC_005824	AT	3	6	21363	21368	50 %	50 %	0 %	0 %	45655603
32	NC_005824	CG	3	6	21567	21572	0 %	0 %	50 %	50 %	45655603
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36	NC_005824	CG	3	6	26745	26750	0 %	0 %	50 %	50 %	45655610
37	NC_005824	TC	3	6	26860	26865	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
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39	NC_005824	TA	3	6	28125	28130	50 %	50 %	0 %	0 %	45655611
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42	NC_005824	AT	3	6	29546	29551	50 %	50 %	0 %	0 %	45655613
43	NC_005824	AG	3	6	29661	29666	50 %	0 %	50 %	0 %	45655613
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46	NC_005824	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	45655618
47	NC_005824	AG	3	6	35470	35475	50 %	0 %	50 %	0 %	45655618
48	NC_005824	AT	3	6	39322	39327	50 %	50 %	0 %	0 %	45655621
49	NC_005824	TC	3	6	39837	39842	0 %	50 %	0 %	50 %	45655621
50	NC_005824	TA	3	6	40824	40829	50 %	50 %	0 %	0 %	45655623
51	NC_005824	AT	3	6	41024	41029	50 %	50 %	0 %	0 %	45655623
52	NC_005824	TA	3	6	41762	41767	50 %	50 %	0 %	0 %	45655624
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60	NC_005824	AG	3	6	46426	46431	50 %	0 %	50 %	0 %	45655627
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62	NC_005824	CT	3	6	47009	47014	0 %	50 %	0 %	50 %	45655628
63	NC_005824	GC	3	6	47136	47141	0 %	0 %	50 %	50 %	45655628
64	NC_005824	AT	3	6	47332	47337	50 %	50 %	0 %	0 %	45655628
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80	NC_005824	GA	3	6	63567	63572	50 %	0 %	50 %	0 %	45655642
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82	NC_005824	TA	3	6	65559	65564	50 %	50 %	0 %	0 %	45655643
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87	NC_005824	AT	3	6	69915	69920	50 %	50 %	0 %	0 %	45655646
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108	NC_005824	GA	3	6	95359	95364	50 %	0 %	50 %	0 %	45655668
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110	NC_005824	AT	3	6	96122	96127	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
111	NC_005824	AG	3	6	96969	96974	50 %	0 %	50 %	0 %	45655668
112	NC_005824	GA	3	6	97199	97204	50 %	0 %	50 %	0 %	45655668
113	NC_005824	AT	3	6	97259	97264	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
114	NC_005824	AT	3	6	98284	98289	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
115	NC_005824	TA	3	6	98430	98435	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
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126	NC_005824	AT	3	6	115478	115483	50 %	50 %	0 %	0 %	45655681
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133	NC_005824	AT	4	8	125161	125168	50 %	50 %	0 %	0 %	45655689
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135	NC_005824	AT	3	6	126223	126228	50 %	50 %	0 %	0 %	45655689
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.