MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	45655586
2	NC_005824	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
3	NC_005824	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	45655586
4	NC_005824	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	45655586
5	NC_005824	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	45655586
6	NC_005824	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	45655586
7	NC_005824	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	45655586
8	NC_005824	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
9	NC_005824	GGCT	2	8	1129	1136	0 %	25 %	50 %	25 %	45655586
10	NC_005824	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	45655587
11	NC_005824	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	45655587
12	NC_005824	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	45655587
13	NC_005824	GTAT	2	8	4237	4244	25 %	50 %	25 %	0 %	45655588
14	NC_005824	TTCC	2	8	4310	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
15	NC_005824	GAAA	2	8	4718	4725	75 %	0 %	25 %	0 %	45655588
16	NC_005824	AGAA	2	8	5471	5478	75 %	0 %	25 %	0 %	45655589
17	NC_005824	TTTC	2	8	5712	5719	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
18	NC_005824	TTTC	2	8	5874	5881	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
19	NC_005824	TGGA	2	8	5893	5900	25 %	25 %	50 %	0 %	45655589
20	NC_005824	AAAT	2	8	6776	6783	75 %	25 %	0 %	0 %	45655591
21	NC_005824	TCAT	2	8	7467	7474	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
22	NC_005824	CTTT	2	8	7895	7902	0 %	75 %	0 %	25 %	45655592
23	NC_005824	CAAA	2	8	8227	8234	75 %	0 %	0 %	25 %	45655592
24	NC_005824	TTAC	2	8	8721	8728	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
25	NC_005824	TATC	2	8	8766	8773	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
26	NC_005824	GATA	2	8	9161	9168	50 %	25 %	25 %	0 %	45655593
27	NC_005824	TTCT	2	8	9508	9515	0 %	75 %	0 %	25 %	45655593
28	NC_005824	GTTC	2	8	9899	9906	0 %	50 %	25 %	25 %	45655594
29	NC_005824	ATTC	2	8	10883	10890	25 %	50 %	0 %	25 %	45655594
30	NC_005824	TTTC	2	8	11635	11642	0 %	75 %	0 %	25 %	45655595
31	NC_005824	TGTT	2	8	11696	11703	0 %	75 %	25 %	0 %	45655595
32	NC_005824	GAAA	2	8	12233	12240	75 %	0 %	25 %	0 %	45655596
33	NC_005824	GGCG	2	8	12278	12285	0 %	0 %	75 %	25 %	45655596
34	NC_005824	GAAA	2	8	12528	12535	75 %	0 %	25 %	0 %	45655596
35	NC_005824	ATTT	2	8	13187	13194	25 %	75 %	0 %	0 %	45655597
36	NC_005824	TTGG	2	8	13637	13644	0 %	50 %	50 %	0 %	45655597
37	NC_005824	CTTT	2	8	13881	13888	0 %	75 %	0 %	25 %	45655598
38	NC_005824	TACT	2	8	14078	14085	25 %	50 %	0 %	25 %	45655598
39	NC_005824	TATT	2	8	15224	15231	25 %	75 %	0 %	0 %	45655599
40	NC_005824	CAAA	2	8	15322	15329	75 %	0 %	0 %	25 %	45655599
41	NC_005824	GATG	2	8	15963	15970	25 %	25 %	50 %	0 %	45655599
42	NC_005824	TCCA	2	8	16386	16393	25 %	25 %	0 %	50 %	45655600
43	NC_005824	AGAA	2	8	16950	16957	75 %	0 %	25 %	0 %	45655600
44	NC_005824	AACC	2	8	17094	17101	50 %	0 %	0 %	50 %	45655600
45	NC_005824	GGAA	2	8	17432	17439	50 %	0 %	50 %	0 %	45655600
46	NC_005824	AAAT	2	8	18968	18975	75 %	25 %	0 %	0 %	45655601
47	NC_005824	TTGT	2	8	19234	19241	0 %	75 %	25 %	0 %	45655601
48	NC_005824	GTTT	2	8	20619	20626	0 %	75 %	25 %	0 %	45655602
49	NC_005824	CAGA	2	8	20865	20872	50 %	0 %	25 %	25 %	45655603
50	NC_005824	AAAC	2	8	21001	21008	75 %	0 %	0 %	25 %	45655603
51	NC_005824	GTTC	2	8	21346	21353	0 %	50 %	25 %	25 %	45655603
52	NC_005824	AAAG	2	8	21510	21517	75 %	0 %	25 %	0 %	45655603
53	NC_005824	TTAT	2	8	21629	21636	25 %	75 %	0 %	0 %	45655603
54	NC_005824	ATCC	2	8	21852	21859	25 %	25 %	0 %	50 %	45655604
55	NC_005824	GATT	2	8	21921	21928	25 %	50 %	25 %	0 %	45655604
56	NC_005824	TGTT	2	8	23999	24006	0 %	75 %	25 %	0 %	45655606
57	NC_005824	AAAG	2	8	24360	24367	75 %	0 %	25 %	0 %	45655606
58	NC_005824	TAAG	2	8	24559	24566	50 %	25 %	25 %	0 %	45655606
59	NC_005824	AATT	2	8	24580	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	45655606
60	NC_005824	AAAG	2	8	24827	24834	75 %	0 %	25 %	0 %	45655606
61	NC_005824	ATGT	2	8	25086	25093	25 %	50 %	25 %	0 %	45655608
62	NC_005824	GCTA	2	8	26234	26241	25 %	25 %	25 %	25 %	45655609
63	NC_005824	TGTC	2	8	26589	26596	0 %	50 %	25 %	25 %	45655610
64	NC_005824	CTTC	2	8	26669	26676	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
65	NC_005824	AACT	2	8	26765	26772	50 %	25 %	0 %	25 %	45655610
66	NC_005824	GAAA	2	8	26881	26888	75 %	0 %	25 %	0 %	45655610
67	NC_005824	AGAA	2	8	27764	27771	75 %	0 %	25 %	0 %	45655611
68	NC_005824	TGAT	2	8	27802	27809	25 %	50 %	25 %	0 %	45655611
69	NC_005824	AACG	2	8	27813	27820	50 %	0 %	25 %	25 %	45655611
70	NC_005824	TGGT	2	8	28208	28215	0 %	50 %	50 %	0 %	45655611
71	NC_005824	AACG	2	8	28525	28532	50 %	0 %	25 %	25 %	45655612
72	NC_005824	AAAC	2	8	28646	28653	75 %	0 %	0 %	25 %	45655612
73	NC_005824	TTGG	2	8	30269	30276	0 %	50 %	50 %	0 %	45655614
74	NC_005824	AAAG	2	8	30398	30405	75 %	0 %	25 %	0 %	45655614
75	NC_005824	GAAA	2	8	30452	30459	75 %	0 %	25 %	0 %	45655614
76	NC_005824	ACTT	2	8	31573	31580	25 %	50 %	0 %	25 %	45655616
77	NC_005824	TCAT	2	8	31775	31782	25 %	50 %	0 %	25 %	45655616
78	NC_005824	TCTT	2	8	32549	32556	0 %	75 %	0 %	25 %	45655617
79	NC_005824	GAGT	2	8	32791	32798	25 %	25 %	50 %	0 %	45655617
80	NC_005824	ATTT	2	8	33284	33291	25 %	75 %	0 %	0 %	45655617
81	NC_005824	TTTG	2	8	34586	34593	0 %	75 %	25 %	0 %	45655618
82	NC_005824	AAAG	2	8	34869	34876	75 %	0 %	25 %	0 %	45655618
83	NC_005824	GGTT	2	8	35820	35827	0 %	50 %	50 %	0 %	45655618
84	NC_005824	TGTA	2	8	39268	39275	25 %	50 %	25 %	0 %	45655621
85	NC_005824	AAAG	2	8	39294	39301	75 %	0 %	25 %	0 %	45655621
86	NC_005824	AAAT	2	8	39706	39713	75 %	25 %	0 %	0 %	45655621
87	NC_005824	GGAA	2	8	40659	40666	50 %	0 %	50 %	0 %	45655622
88	NC_005824	TTCT	2	8	41288	41295	0 %	75 %	0 %	25 %	45655623
89	NC_005824	TTCT	2	8	41549	41556	0 %	75 %	0 %	25 %	45655623
90	NC_005824	TCGA	2	8	41557	41564	25 %	25 %	25 %	25 %	45655623
91	NC_005824	TATG	2	8	41695	41702	25 %	50 %	25 %	0 %	45655623
92	NC_005824	GATA	2	8	42014	42021	50 %	25 %	25 %	0 %	45655624
93	NC_005824	TCAT	2	8	42469	42476	25 %	50 %	0 %	25 %	45655624
94	NC_005824	TCTT	2	8	44379	44386	0 %	75 %	0 %	25 %	45655626
95	NC_005824	ATTT	2	8	44617	44624	25 %	75 %	0 %	0 %	45655626
96	NC_005824	ATCA	2	8	45339	45346	50 %	25 %	0 %	25 %	45655627
97	NC_005824	AAAC	2	8	45702	45709	75 %	0 %	0 %	25 %	45655627
98	NC_005824	ATCA	2	8	45886	45893	50 %	25 %	0 %	25 %	45655627
99	NC_005824	AGAA	2	8	46122	46129	75 %	0 %	25 %	0 %	45655627
100	NC_005824	TGAC	2	8	46168	46175	25 %	25 %	25 %	25 %	45655627
101	NC_005824	AATC	2	8	47383	47390	50 %	25 %	0 %	25 %	45655628
102	NC_005824	TTGT	2	8	47844	47851	0 %	75 %	25 %	0 %	45655629
103	NC_005824	AGGA	2	8	47877	47884	50 %	0 %	50 %	0 %	45655629
104	NC_005824	GGAA	2	8	48453	48460	50 %	0 %	50 %	0 %	45655630
105	NC_005824	AAAG	2	8	48624	48631	75 %	0 %	25 %	0 %	45655630
106	NC_005824	TTCT	2	8	48797	48804	0 %	75 %	0 %	25 %	45655630
107	NC_005824	ACAA	2	8	49321	49328	75 %	0 %	0 %	25 %	45655630
108	NC_005824	ATTT	2	8	49343	49350	25 %	75 %	0 %	0 %	45655630
109	NC_005824	ACCA	2	8	49704	49711	50 %	0 %	0 %	50 %	45655630
110	NC_005824	TCCA	2	8	50063	50070	25 %	25 %	0 %	50 %	45655631
111	NC_005824	TTTC	2	8	50098	50105	0 %	75 %	0 %	25 %	45655631
112	NC_005824	AGAA	2	8	50650	50657	75 %	0 %	25 %	0 %	45655632
113	NC_005824	GATC	2	8	51867	51874	25 %	25 %	25 %	25 %	45655633
114	NC_005824	TTCT	2	8	52264	52271	0 %	75 %	0 %	25 %	45655634
115	NC_005824	CTTA	2	8	52328	52335	25 %	50 %	0 %	25 %	45655634
116	NC_005824	TTCG	2	8	55745	55752	0 %	50 %	25 %	25 %	45655636
117	NC_005824	TTGG	2	8	57588	57595	0 %	50 %	50 %	0 %	45655637
118	NC_005824	TTTC	2	8	58110	58117	0 %	75 %	0 %	25 %	45655638
119	NC_005824	TCCT	2	8	58140	58147	0 %	50 %	0 %	50 %	45655638
120	NC_005824	TTGG	2	8	58425	58432	0 %	50 %	50 %	0 %	45655638
121	NC_005824	AACT	2	8	58594	58601	50 %	25 %	0 %	25 %	45655638
122	NC_005824	AATC	2	8	58629	58636	50 %	25 %	0 %	25 %	45655638
123	NC_005824	AAGA	2	8	59350	59357	75 %	0 %	25 %	0 %	45655639
124	NC_005824	AAAG	2	8	60328	60335	75 %	0 %	25 %	0 %	45655640
125	NC_005824	CTGG	2	8	60465	60472	0 %	25 %	50 %	25 %	45655640
126	NC_005824	CGGG	2	8	60502	60509	0 %	0 %	75 %	25 %	45655640
127	NC_005824	AGAA	2	8	61093	61100	75 %	0 %	25 %	0 %	45655641
128	NC_005824	AAAG	2	8	62206	62213	75 %	0 %	25 %	0 %	45655641
129	NC_005824	TTTC	2	8	62258	62265	0 %	75 %	0 %	25 %	45655641
130	NC_005824	CATA	2	8	62403	62410	50 %	25 %	0 %	25 %	45655641
131	NC_005824	AGAA	2	8	63004	63011	75 %	0 %	25 %	0 %	45655642
132	NC_005824	ATCA	2	8	63211	63218	50 %	25 %	0 %	25 %	45655642
133	NC_005824	TCTT	2	8	63239	63246	0 %	75 %	0 %	25 %	45655642
134	NC_005824	ATTT	2	8	63259	63266	25 %	75 %	0 %	0 %	45655642
135	NC_005824	TTTA	2	8	63633	63640	25 %	75 %	0 %	0 %	45655642
136	NC_005824	CTGG	2	8	63674	63681	0 %	25 %	50 %	25 %	45655642
137	NC_005824	AATT	2	8	63883	63890	50 %	50 %	0 %	0 %	45655642
138	NC_005824	CAAA	2	8	64009	64016	75 %	0 %	0 %	25 %	45655642
139	NC_005824	TTAA	2	8	64160	64167	50 %	50 %	0 %	0 %	45655642
140	NC_005824	GAAA	2	8	65697	65704	75 %	0 %	25 %	0 %	45655643
141	NC_005824	TCCG	2	8	65745	65752	0 %	25 %	25 %	50 %	45655643
142	NC_005824	TCTT	2	8	65838	65845	0 %	75 %	0 %	25 %	45655643
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