MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_005824	AGA	2	6	151399	151404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655709
2503	NC_005824	CTT	2	6	151425	151430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655709
2504	NC_005824	CTT	2	6	151446	151451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655709
2505	NC_005824	CTAT	2	8	151457	151464	25 %	50 %	0 %	25 %	45655709
2506	NC_005824	TTC	2	6	151465	151470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655709
2507	NC_005824	TA	3	6	151525	151530	50 %	50 %	0 %	0 %	45655709
2508	NC_005824	CTT	2	6	151557	151562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655709
2509	NC_005824	ACCT	2	8	151629	151636	25 %	25 %	0 %	50 %	45655709
2510	NC_005824	T	6	6	151636	151641	0 %	100 %	0 %	0 %	45655709
2511	NC_005824	AAG	3	9	151758	151766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655710
2512	NC_005824	AAG	2	6	151785	151790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655710
2513	NC_005824	TTC	2	6	151875	151880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655710
2514	NC_005824	A	7	7	151886	151892	100 %	0 %	0 %	0 %	45655710
2515	NC_005824	CCCA	2	8	151901	151908	25 %	0 %	0 %	75 %	45655710
2516	NC_005824	TTC	2	6	151938	151943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655710
2517	NC_005824	T	7	7	151944	151950	0 %	100 %	0 %	0 %	45655710
2518	NC_005824	TATAA	2	10	152084	152093	60 %	40 %	0 %	0 %	45655710
2519	NC_005824	ATT	2	6	152184	152189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655710
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2521	NC_005824	AATA	2	8	152265	152272	75 %	25 %	0 %	0 %	45655710
2522	NC_005824	CCTA	2	8	152352	152359	25 %	25 %	0 %	50 %	45655710
2523	NC_005824	GTA	2	6	152398	152403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655710
2524	NC_005824	A	7	7	152445	152451	100 %	0 %	0 %	0 %	45655710
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2530	NC_005824	TTTTCG	2	12	152821	152832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45655711
2531	NC_005824	AAT	2	6	152856	152861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655711
2532	NC_005824	T	7	7	152959	152965	0 %	100 %	0 %	0 %	45655711
2533	NC_005824	TGT	2	6	153026	153031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655711
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2538	NC_005824	T	8	8	153259	153266	0 %	100 %	0 %	0 %	45655711
2539	NC_005824	GAA	2	6	153345	153350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655711
2540	NC_005824	AAT	2	6	153379	153384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655711
2541	NC_005824	T	6	6	153561	153566	0 %	100 %	0 %	0 %	45655712
2542	NC_005824	T	6	6	153672	153677	0 %	100 %	0 %	0 %	45655712
2543	NC_005824	TTA	2	6	153722	153727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655712
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2545	NC_005824	ACC	2	6	153795	153800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655712
2546	NC_005824	TCTGGA	2	12	153814	153825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45655712
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2549	NC_005824	TCT	2	6	154021	154026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655712
2550	NC_005824	CTT	2	6	154061	154066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655712
2551	NC_005824	T	6	6	154065	154070	0 %	100 %	0 %	0 %	45655712
2552	NC_005824	T	6	6	154083	154088	0 %	100 %	0 %	0 %	45655712
2553	NC_005824	AAT	2	6	154103	154108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655712
2554	NC_005824	TCT	2	6	154111	154116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655712
2555	NC_005824	GGT	2	6	154138	154143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655712
2556	NC_005824	TCT	3	9	154195	154203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655712
2557	NC_005824	TTCT	2	8	154235	154242	0 %	75 %	0 %	25 %	45655712
2558	NC_005824	TCC	2	6	154248	154253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655712
2559	NC_005824	AAG	2	6	154307	154312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655712
2560	NC_005824	TTTC	2	8	154316	154323	0 %	75 %	0 %	25 %	45655712
2561	NC_005824	TGAT	2	8	154327	154334	25 %	50 %	25 %	0 %	45655712
2562	NC_005824	TTA	2	6	154357	154362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655712
2563	NC_005824	CGT	2	6	154424	154429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655712
2564	NC_005824	T	6	6	154509	154514	0 %	100 %	0 %	0 %	45655712
2565	NC_005824	TTCCGA	2	12	154526	154537	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45655712
2566	NC_005824	AAAG	2	8	154582	154589	75 %	0 %	25 %	0 %	45655712
2567	NC_005824	ATC	2	6	154620	154625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655712
2568	NC_005824	T	6	6	154637	154642	0 %	100 %	0 %	0 %	45655712
2569	NC_005824	A	7	7	154659	154665	100 %	0 %	0 %	0 %	45655712
2570	NC_005824	ACA	2	6	154762	154767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655712
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2572	NC_005824	AT	3	6	154869	154874	50 %	50 %	0 %	0 %	45655713
2573	NC_005824	CTTT	2	8	154914	154921	0 %	75 %	0 %	25 %	45655713
2574	NC_005824	CTT	2	6	154981	154986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655713
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2577	NC_005824	TCGAT	2	10	155083	155092	20 %	40 %	20 %	20 %	45655713
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2581	NC_005824	ATCG	2	8	155261	155268	25 %	25 %	25 %	25 %	45655713
2582	NC_005824	TTC	2	6	155326	155331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655713
2583	NC_005824	TTC	2	6	155345	155350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655713
2584	NC_005824	CTT	2	6	155374	155379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655713
2585	NC_005824	TTC	2	6	155413	155418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655713
2586	NC_005824	TCAT	2	8	155442	155449	25 %	50 %	0 %	25 %	45655713
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2590	NC_005824	ACA	2	6	155706	155711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655714
2591	NC_005824	GTA	2	6	155714	155719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655714
2592	NC_005824	GAA	2	6	155726	155731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655714
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2595	NC_005824	TGAA	2	8	155861	155868	50 %	25 %	25 %	0 %	45655714
2596	NC_005824	TTCA	2	8	155875	155882	25 %	50 %	0 %	25 %	45655714
2597	NC_005824	ACC	2	6	155920	155925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655714
2598	NC_005824	TTCA	2	8	156070	156077	25 %	50 %	0 %	25 %	45655714
2599	NC_005824	T	7	7	156081	156087	0 %	100 %	0 %	0 %	45655714
2600	NC_005824	ACC	2	6	156100	156105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655714
2601	NC_005824	TTC	2	6	156154	156159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655714
2602	NC_005824	ATC	2	6	156164	156169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655714
2603	NC_005824	T	6	6	156179	156184	0 %	100 %	0 %	0 %	45655714
2604	NC_005824	GT	3	6	156322	156327	0 %	50 %	50 %	0 %	45655714
2605	NC_005824	ATC	2	6	156337	156342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655714
2606	NC_005824	AAC	2	6	156355	156360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655714
2607	NC_005824	TTG	2	6	156422	156427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655714
2608	NC_005824	TAA	2	6	156466	156471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655714
2609	NC_005824	GCA	3	9	156494	156502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655714
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2611	NC_005824	CCT	2	6	156525	156530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655714
2612	NC_005824	T	7	7	156535	156541	0 %	100 %	0 %	0 %	45655714
2613	NC_005824	T	7	7	156574	156580	0 %	100 %	0 %	0 %	45655715
2614	NC_005824	A	6	6	156589	156594	100 %	0 %	0 %	0 %	45655715
2615	NC_005824	ATCCA	2	10	156619	156628	40 %	20 %	0 %	40 %	45655715
2616	NC_005824	AAAG	2	8	156636	156643	75 %	0 %	25 %	0 %	45655715
2617	NC_005824	AAG	2	6	156680	156685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655715
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2620	NC_005824	GAT	2	6	156756	156761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655715
2621	NC_005824	GAA	2	6	156909	156914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655715
2622	NC_005824	T	6	6	156967	156972	0 %	100 %	0 %	0 %	45655715
2623	NC_005824	CTGG	2	8	157077	157084	0 %	25 %	50 %	25 %	45655715
2624	NC_005824	TTC	2	6	157099	157104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655715
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