MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005824	CA	3	6	25342	25347	50 %	0 %	0 %	50 %	45655608
502	NC_005824	AGA	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655608
503	NC_005824	TAAGT	2	10	25769	25778	40 %	40 %	20 %	0 %	45655609
504	NC_005824	TCT	2	6	25781	25786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
505	NC_005824	ATC	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655609
506	NC_005824	A	7	7	25901	25907	100 %	0 %	0 %	0 %	45655609
507	NC_005824	AGA	2	6	25912	25917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655609
508	NC_005824	TCT	2	6	25925	25930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
509	NC_005824	CTT	2	6	25956	25961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
510	NC_005824	GGT	2	6	26021	26026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655609
511	NC_005824	CTA	2	6	26058	26063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655609
512	NC_005824	CTT	2	6	26064	26069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
513	NC_005824	TGG	2	6	26074	26079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655609
514	NC_005824	AAG	2	6	26080	26085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655609
515	NC_005824	TTC	2	6	26151	26156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
516	NC_005824	GCTA	2	8	26234	26241	25 %	25 %	25 %	25 %	45655609
517	NC_005824	TTC	3	9	26242	26250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655609
518	NC_005824	GAG	2	6	26286	26291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655609
519	NC_005824	AAT	2	6	26354	26359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655609
520	NC_005824	A	6	6	26406	26411	100 %	0 %	0 %	0 %	45655609
521	NC_005824	TGTC	2	8	26589	26596	0 %	50 %	25 %	25 %	45655610
522	NC_005824	T	6	6	26634	26639	0 %	100 %	0 %	0 %	45655610
523	NC_005824	CTTC	2	8	26669	26676	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
524	NC_005824	TAG	2	6	26678	26683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655610
525	NC_005824	ATATC	2	10	26703	26712	40 %	40 %	0 %	20 %	45655610
526	NC_005824	CG	3	6	26745	26750	0 %	0 %	50 %	50 %	45655610
527	NC_005824	AACT	2	8	26765	26772	50 %	25 %	0 %	25 %	45655610
528	NC_005824	AGA	2	6	26791	26796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655610
529	NC_005824	TC	3	6	26860	26865	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
530	NC_005824	GAAA	2	8	26881	26888	75 %	0 %	25 %	0 %	45655610
531	NC_005824	A	7	7	26886	26892	100 %	0 %	0 %	0 %	45655610
532	NC_005824	T	6	6	26908	26913	0 %	100 %	0 %	0 %	45655610
533	NC_005824	A	7	7	26925	26931	100 %	0 %	0 %	0 %	45655610
534	NC_005824	GAA	2	6	26977	26982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655610
535	NC_005824	AGA	2	6	27009	27014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655610
536	NC_005824	AGT	2	6	27113	27118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655611
537	NC_005824	A	6	6	27156	27161	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
538	NC_005824	CAC	2	6	27210	27215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655611
539	NC_005824	CAAAA	2	10	27350	27359	80 %	0 %	0 %	20 %	45655611
540	NC_005824	TAT	2	6	27366	27371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655611
541	NC_005824	GGT	3	9	27585	27593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655611
542	NC_005824	ATT	2	6	27642	27647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655611
543	NC_005824	TGA	2	6	27718	27723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655611
544	NC_005824	CTT	2	6	27733	27738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655611
545	NC_005824	A	7	7	27752	27758	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
546	NC_005824	AGAA	2	8	27764	27771	75 %	0 %	25 %	0 %	45655611
547	NC_005824	TGAT	2	8	27802	27809	25 %	50 %	25 %	0 %	45655611
548	NC_005824	AACG	2	8	27813	27820	50 %	0 %	25 %	25 %	45655611
549	NC_005824	GCG	2	6	27870	27875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655611
550	NC_005824	GAG	2	6	27925	27930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655611
551	NC_005824	TC	3	6	28077	28082	0 %	50 %	0 %	50 %	45655611
552	NC_005824	A	6	6	28097	28102	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
553	NC_005824	A	6	6	28104	28109	100 %	0 %	0 %	0 %	45655611
554	NC_005824	TA	3	6	28125	28130	50 %	50 %	0 %	0 %	45655611
555	NC_005824	TGGT	2	8	28208	28215	0 %	50 %	50 %	0 %	45655611
556	NC_005824	TGGCT	2	10	28216	28225	0 %	40 %	40 %	20 %	45655611
557	NC_005824	GGC	2	6	28378	28383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655612
558	NC_005824	T	7	7	28407	28413	0 %	100 %	0 %	0 %	45655612
559	NC_005824	T	6	6	28423	28428	0 %	100 %	0 %	0 %	45655612
560	NC_005824	AT	3	6	28441	28446	50 %	50 %	0 %	0 %	45655612
561	NC_005824	TTG	2	6	28487	28492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655612
562	NC_005824	A	6	6	28498	28503	100 %	0 %	0 %	0 %	45655612
563	NC_005824	AACG	2	8	28525	28532	50 %	0 %	25 %	25 %	45655612
564	NC_005824	CTT	2	6	28551	28556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655612
565	NC_005824	A	8	8	28569	28576	100 %	0 %	0 %	0 %	45655612
566	NC_005824	AAAC	2	8	28646	28653	75 %	0 %	0 %	25 %	45655612
567	NC_005824	TAC	2	6	28752	28757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655612
568	NC_005824	T	6	6	29292	29297	0 %	100 %	0 %	0 %	45655613
569	NC_005824	CTT	2	6	29399	29404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655613
570	NC_005824	GA	3	6	29407	29412	50 %	0 %	50 %	0 %	45655613
571	NC_005824	GTT	2	6	29466	29471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655613
572	NC_005824	GTTTT	2	10	29483	29492	0 %	80 %	20 %	0 %	45655613
573	NC_005824	AT	3	6	29546	29551	50 %	50 %	0 %	0 %	45655613
574	NC_005824	TTC	3	9	29610	29618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655613
575	NC_005824	AG	3	6	29661	29666	50 %	0 %	50 %	0 %	45655613
576	NC_005824	GAATT	2	10	29696	29705	40 %	40 %	20 %	0 %	45655613
577	NC_005824	T	6	6	29749	29754	0 %	100 %	0 %	0 %	45655613
578	NC_005824	ATC	2	6	29821	29826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655613
579	NC_005824	AGA	2	6	29836	29841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655613
580	NC_005824	T	6	6	29856	29861	0 %	100 %	0 %	0 %	45655613
581	NC_005824	TTGG	2	8	30269	30276	0 %	50 %	50 %	0 %	45655614
582	NC_005824	TGG	2	6	30296	30301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655614
583	NC_005824	TTC	2	6	30302	30307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655614
584	NC_005824	AAAG	2	8	30398	30405	75 %	0 %	25 %	0 %	45655614
585	NC_005824	GAAA	2	8	30452	30459	75 %	0 %	25 %	0 %	45655614
586	NC_005824	A	7	7	30474	30480	100 %	0 %	0 %	0 %	45655614
587	NC_005824	CTA	2	6	30553	30558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655614
588	NC_005824	T	6	6	30593	30598	0 %	100 %	0 %	0 %	45655614
589	NC_005824	ATT	2	6	30623	30628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655614
590	NC_005824	GAA	2	6	30700	30705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655614
591	NC_005824	TTC	3	9	30713	30721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655614
592	NC_005824	TTC	2	6	30827	30832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655614
593	NC_005824	GACGGA	2	12	30840	30851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	45655614
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595	NC_005824	T	7	7	30974	30980	0 %	100 %	0 %	0 %	45655614
596	NC_005824	A	6	6	31018	31023	100 %	0 %	0 %	0 %	45655614
597	NC_005824	A	6	6	31032	31037	100 %	0 %	0 %	0 %	45655614
598	NC_005824	AAG	2	6	31076	31081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655615
599	NC_005824	GAA	2	6	31146	31151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655615
600	NC_005824	AAG	2	6	31192	31197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655615
601	NC_005824	CTTGGA	2	12	31210	31221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45655615
602	NC_005824	TAC	2	6	31291	31296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655615
603	NC_005824	ATC	2	6	31306	31311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655615
604	NC_005824	GCT	2	6	31428	31433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655615
605	NC_005824	GAA	2	6	31446	31451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655615
606	NC_005824	ACTT	2	8	31573	31580	25 %	50 %	0 %	25 %	45655616
607	NC_005824	T	6	6	31730	31735	0 %	100 %	0 %	0 %	45655616
608	NC_005824	GAA	2	6	31768	31773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655616
609	NC_005824	TCAT	2	8	31775	31782	25 %	50 %	0 %	25 %	45655616
610	NC_005824	AGA	2	6	31810	31815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655616
611	NC_005824	GAA	2	6	31855	31860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655616
612	NC_005824	TC	3	6	31895	31900	0 %	50 %	0 %	50 %	45655616
613	NC_005824	T	6	6	32289	32294	0 %	100 %	0 %	0 %	45655617
614	NC_005824	T	7	7	32299	32305	0 %	100 %	0 %	0 %	45655617
615	NC_005824	CTTTT	2	10	32316	32325	0 %	80 %	0 %	20 %	45655617
616	NC_005824	ACG	2	6	32374	32379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655617
617	NC_005824	A	6	6	32382	32387	100 %	0 %	0 %	0 %	45655617
618	NC_005824	A	7	7	32449	32455	100 %	0 %	0 %	0 %	45655617
619	NC_005824	TCT	2	6	32481	32486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655617
620	NC_005824	TCTT	2	8	32549	32556	0 %	75 %	0 %	25 %	45655617
621	NC_005824	TAC	2	6	32564	32569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655617
622	NC_005824	TTA	2	6	32576	32581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655617
623	NC_005824	A	6	6	32606	32611	100 %	0 %	0 %	0 %	45655617
624	NC_005824	TGATCG	2	12	32632	32643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45655617
625	NC_005824	TAA	2	6	32663	32668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655617
626	NC_005824	TAC	2	6	32675	32680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655617
627	NC_005824	A	6	6	32685	32690	100 %	0 %	0 %	0 %	45655617
628	NC_005824	GAAAA	2	10	32749	32758	80 %	0 %	20 %	0 %	45655617
629	NC_005824	ATT	2	6	32764	32769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655617
630	NC_005824	TTTTC	2	10	32780	32789	0 %	80 %	0 %	20 %	45655617
631	NC_005824	GAGT	2	8	32791	32798	25 %	25 %	50 %	0 %	45655617
632	NC_005824	CGG	2	6	32923	32928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655617
633	NC_005824	CTT	2	6	32998	33003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655617
634	NC_005824	TAC	2	6	33049	33054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655617
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