MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005824	GCA	2	6	346039	346044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655848
5502	NC_005824	AAG	2	6	346133	346138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655848
5503	NC_005824	A	8	8	346143	346150	100 %	0 %	0 %	0 %	45655848
5504	NC_005824	TGA	2	6	346155	346160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655848
5505	NC_005824	GAA	2	6	346164	346169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655848
5506	NC_005824	T	8	8	346327	346334	0 %	100 %	0 %	0 %	45655848
5507	NC_005824	CCAGAA	2	12	346335	346346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	45655848
5508	NC_005824	CTT	2	6	346438	346443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655848
5509	NC_005824	CGAAGA	2	12	346463	346474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	45655848
5510	NC_005824	AAAGC	2	10	346528	346537	60 %	0 %	20 %	20 %	45655848
5511	NC_005824	TAA	2	6	346546	346551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655848
5512	NC_005824	A	7	7	346586	346592	100 %	0 %	0 %	0 %	45655848
5513	NC_005824	A	6	6	346599	346604	100 %	0 %	0 %	0 %	45655848
5514	NC_005824	CAAC	2	8	346632	346639	50 %	0 %	0 %	50 %	45655848
5515	NC_005824	AGA	2	6	346670	346675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655848
5516	NC_005824	A	7	7	346688	346694	100 %	0 %	0 %	0 %	45655848
5517	NC_005824	A	6	6	346740	346745	100 %	0 %	0 %	0 %	45655848
5518	NC_005824	A	7	7	346750	346756	100 %	0 %	0 %	0 %	45655848
5519	NC_005824	TTC	2	6	346787	346792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655848
5520	NC_005824	GAA	2	6	346902	346907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655848
5521	NC_005824	AAAG	2	8	346947	346954	75 %	0 %	25 %	0 %	45655848
5522	NC_005824	A	8	8	347306	347313	100 %	0 %	0 %	0 %	45655849
5523	NC_005824	TCG	2	6	347320	347325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655849
5524	NC_005824	T	7	7	347455	347461	0 %	100 %	0 %	0 %	45655849
5525	NC_005824	GGAA	2	8	347555	347562	50 %	0 %	50 %	0 %	45655849
5526	NC_005824	CAT	2	6	347573	347578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655849
5527	NC_005824	TTG	2	6	347620	347625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655849
5528	NC_005824	CAA	2	6	347691	347696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655849
5529	NC_005824	A	8	8	347711	347718	100 %	0 %	0 %	0 %	45655849
5530	NC_005824	A	6	6	347877	347882	100 %	0 %	0 %	0 %	45655849
5531	NC_005824	GAG	2	6	347940	347945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655849
5532	NC_005824	TC	3	6	347980	347985	0 %	50 %	0 %	50 %	45655850
5533	NC_005824	AACC	2	8	348061	348068	50 %	0 %	0 %	50 %	45655850
5534	NC_005824	A	7	7	348081	348087	100 %	0 %	0 %	0 %	45655850
5535	NC_005824	GAC	2	6	348094	348099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655850
5536	NC_005824	AAG	2	6	348105	348110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5537	NC_005824	AACAA	2	10	348147	348156	80 %	0 %	0 %	20 %	45655850
5538	NC_005824	AGA	2	6	348162	348167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5539	NC_005824	AGA	2	6	348196	348201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5540	NC_005824	GCA	2	6	348208	348213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655850
5541	NC_005824	GAA	2	6	348325	348330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5542	NC_005824	AGA	2	6	348450	348455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5543	NC_005824	AAG	2	6	348470	348475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5544	NC_005824	T	6	6	348534	348539	0 %	100 %	0 %	0 %	45655850
5545	NC_005824	ATTT	2	8	348551	348558	25 %	75 %	0 %	0 %	45655850
5546	NC_005824	GAA	3	9	348607	348615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655850
5547	NC_005824	CAAC	2	8	348638	348645	50 %	0 %	0 %	50 %	45655850
5548	NC_005824	A	6	6	348694	348699	100 %	0 %	0 %	0 %	45655850
5549	NC_005824	ACG	2	6	348725	348730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655850
5550	NC_005824	A	7	7	348762	348768	100 %	0 %	0 %	0 %	45655850
5551	NC_005824	A	6	6	348778	348783	100 %	0 %	0 %	0 %	45655850
5552	NC_005824	TAA	2	6	349254	349259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655851
5553	NC_005824	CATA	2	8	349295	349302	50 %	25 %	0 %	25 %	45655851
5554	NC_005824	CAG	2	6	349352	349357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655851
5555	NC_005824	A	6	6	349459	349464	100 %	0 %	0 %	0 %	45655851
5556	NC_005824	ACT	2	6	349503	349508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655851
5557	NC_005824	TTA	2	6	349545	349550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655851
5558	NC_005824	ATATAA	2	12	349685	349696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655851
5559	NC_005824	A	6	6	349727	349732	100 %	0 %	0 %	0 %	45655851
5560	NC_005824	A	7	7	349734	349740	100 %	0 %	0 %	0 %	45655851
5561	NC_005824	AAGT	2	8	349742	349749	50 %	25 %	25 %	0 %	45655851
5562	NC_005824	TGGAA	2	10	349818	349827	40 %	20 %	40 %	0 %	45655851
5563	NC_005824	AACAAA	2	12	349866	349877	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	45655851
5564	NC_005824	AAC	2	6	349932	349937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655851
5565	NC_005824	T	6	6	349947	349952	0 %	100 %	0 %	0 %	45655851
5566	NC_005824	A	6	6	350000	350005	100 %	0 %	0 %	0 %	45655851
5567	NC_005824	GAA	2	6	350024	350029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655851
5568	NC_005824	GAT	2	6	350067	350072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655851
5569	NC_005824	TCC	2	6	350103	350108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655851
5570	NC_005824	GAA	2	6	350137	350142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655851
5571	NC_005824	A	6	6	350168	350173	100 %	0 %	0 %	0 %	45655851

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.