MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 68420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005823	TGA	2	6	204078	204083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656081
3502	NC_005823	GC	3	6	204098	204103	0 %	0 %	50 %	50 %	45656081
3503	NC_005823	TCT	2	6	204316	204321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656081
3504	NC_005823	ACG	2	6	204354	204359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656081
3505	NC_005823	ACG	2	6	204363	204368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656081
3506	NC_005823	AGA	2	6	204434	204439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656081
3507	NC_005823	G	6	6	204520	204525	0 %	0 %	100 %	0 %	45656081
3508	NC_005823	ATT	2	6	204531	204536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656081
3509	NC_005823	AGAAA	2	10	204587	204596	80 %	0 %	20 %	0 %	45656081
3510	NC_005823	AGT	2	6	204754	204759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656082
3511	NC_005823	TAG	2	6	204885	204890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656082
3512	NC_005823	ACT	2	6	204896	204901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656082
3513	NC_005823	ATTT	2	8	204932	204939	25 %	75 %	0 %	0 %	45656082
3514	NC_005823	CTT	2	6	204962	204967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656082
3515	NC_005823	GCT	2	6	204968	204973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45656082
3516	NC_005823	TTGA	2	8	204986	204993	25 %	50 %	25 %	0 %	45656082
3517	NC_005823	CAG	2	6	205017	205022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656082
3518	NC_005823	CGCC	2	8	205062	205069	0 %	0 %	25 %	75 %	45656082
3519	NC_005823	GCTTT	2	10	205142	205151	0 %	60 %	20 %	20 %	45656082
3520	NC_005823	TA	3	6	205217	205222	50 %	50 %	0 %	0 %	45656083
3521	NC_005823	ATTA	2	8	205231	205238	50 %	50 %	0 %	0 %	45656083
3522	NC_005823	GAC	2	6	205298	205303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656083
3523	NC_005823	CAA	2	6	205318	205323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45656083
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3525	NC_005823	GAAA	2	8	205459	205466	75 %	0 %	25 %	0 %	45656083
3526	NC_005823	GTT	2	6	205503	205508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656083
3527	NC_005823	TAA	2	6	205576	205581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656083
3528	NC_005823	A	6	6	205621	205626	100 %	0 %	0 %	0 %	45656083
3529	NC_005823	GGA	2	6	208021	208026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45656084
3530	NC_005823	ACC	2	6	208032	208037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45656084
3531	NC_005823	TTCC	2	8	208127	208134	0 %	50 %	0 %	50 %	45656084
3532	NC_005823	AGG	2	6	208188	208193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45656084
3533	NC_005823	CTT	2	6	208258	208263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656084
3534	NC_005823	A	6	6	208328	208333	100 %	0 %	0 %	0 %	45656084
3535	NC_005823	GA	3	6	208335	208340	50 %	0 %	50 %	0 %	45656084
3536	NC_005823	AAG	2	6	208361	208366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656084
3537	NC_005823	ATC	2	6	208474	208479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656084
3538	NC_005823	T	6	6	208482	208487	0 %	100 %	0 %	0 %	45656084
3539	NC_005823	CGA	3	9	208491	208499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656084
3540	NC_005823	TCT	2	6	208549	208554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656084
3541	NC_005823	AAC	2	6	208581	208586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45656085
3542	NC_005823	TTA	2	6	208613	208618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656085
3543	NC_005823	AAC	2	6	208653	208658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45656085
3544	NC_005823	GAACA	2	10	208789	208798	60 %	0 %	20 %	20 %	45656085
3545	NC_005823	AAT	2	6	208821	208826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656085
3546	NC_005823	AAG	2	6	208910	208915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656085
3547	NC_005823	TGTT	2	8	208929	208936	0 %	75 %	25 %	0 %	45656086
3548	NC_005823	GA	3	6	209005	209010	50 %	0 %	50 %	0 %	45656086
3549	NC_005823	A	7	7	209059	209065	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3550	NC_005823	TA	3	6	209144	209149	50 %	50 %	0 %	0 %	45656086
3551	NC_005823	TG	3	6	209186	209191	0 %	50 %	50 %	0 %	45656086
3552	NC_005823	GAT	2	6	209218	209223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656086
3553	NC_005823	ATC	2	6	209235	209240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656086
3554	NC_005823	T	7	7	209256	209262	0 %	100 %	0 %	0 %	45656086
3555	NC_005823	TCGT	2	8	209307	209314	0 %	50 %	25 %	25 %	45656086
3556	NC_005823	AAAC	2	8	209327	209334	75 %	0 %	0 %	25 %	45656086
3557	NC_005823	A	7	7	209353	209359	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3558	NC_005823	A	8	8	209386	209393	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3559	NC_005823	T	8	8	209409	209416	0 %	100 %	0 %	0 %	45656086
3560	NC_005823	TGG	2	6	209430	209435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45656086
3561	NC_005823	TCT	2	6	209471	209476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656086
3562	NC_005823	A	8	8	209477	209484	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3563	NC_005823	A	6	6	209539	209544	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3564	NC_005823	TAT	2	6	209545	209550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656086
3565	NC_005823	AAGC	2	8	209575	209582	50 %	0 %	25 %	25 %	45656086
3566	NC_005823	ATT	2	6	209591	209596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656086
3567	NC_005823	GACA	2	8	209622	209629	50 %	0 %	25 %	25 %	45656086
3568	NC_005823	TTA	2	6	209662	209667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656086
3569	NC_005823	TGGAT	2	10	209677	209686	20 %	40 %	40 %	0 %	45656086
3570	NC_005823	A	6	6	209700	209705	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3571	NC_005823	TTTC	2	8	209760	209767	0 %	75 %	0 %	25 %	45656086
3572	NC_005823	ATT	2	6	209795	209800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656086
3573	NC_005823	GAT	2	6	209816	209821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656086
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3575	NC_005823	TAT	2	6	209909	209914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656086
3576	NC_005823	A	7	7	209950	209956	100 %	0 %	0 %	0 %	45656086
3577	NC_005823	CAT	2	6	209985	209990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656087
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3579	NC_005823	A	8	8	210071	210078	100 %	0 %	0 %	0 %	45656087
3580	NC_005823	ATG	2	6	210113	210118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656087
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3582	NC_005823	A	6	6	210188	210193	100 %	0 %	0 %	0 %	45656087
3583	NC_005823	T	6	6	210282	210287	0 %	100 %	0 %	0 %	45656087
3584	NC_005823	TAA	2	6	210294	210299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656087
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3588	NC_005823	CGA	2	6	210680	210685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656088
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3590	NC_005823	GA	3	6	210774	210779	50 %	0 %	50 %	0 %	45656088
3591	NC_005823	CGA	2	6	210830	210835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656088
3592	NC_005823	AGA	2	6	210840	210845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656088
3593	NC_005823	TGA	2	6	210895	210900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656088
3594	NC_005823	TTAAAT	2	12	210902	210913	50 %	50 %	0 %	0 %	45656088
3595	NC_005823	T	7	7	211272	211278	0 %	100 %	0 %	0 %	45656089
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3598	NC_005823	CGG	2	6	211329	211334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45656089
3599	NC_005823	TTC	2	6	211420	211425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656089
3600	NC_005823	AATC	2	8	211438	211445	50 %	25 %	0 %	25 %	45656089
3601	NC_005823	TAC	2	6	211471	211476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656089
3602	NC_005823	T	6	6	211505	211510	0 %	100 %	0 %	0 %	45656089
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3605	NC_005823	AATC	2	8	211684	211691	50 %	25 %	0 %	25 %	45656089
3606	NC_005823	CAA	2	6	211697	211702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45656089
3607	NC_005823	AG	3	6	211712	211717	50 %	0 %	50 %	0 %	45656089
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3609	NC_005823	ATGG	2	8	211856	211863	25 %	25 %	50 %	0 %	45656089
3610	NC_005823	CTT	2	6	211896	211901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656089
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3616	NC_005823	GAA	2	6	212102	212107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656089
3617	NC_005823	CCGGC	2	10	212226	212235	0 %	0 %	40 %	60 %	45656089
3618	NC_005823	TTCGA	2	10	212283	212292	20 %	40 %	20 %	20 %	45656090
3619	NC_005823	TC	3	6	212369	212374	0 %	50 %	0 %	50 %	45656090
3620	NC_005823	TCT	2	6	212565	212570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656090
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3624	NC_005823	TTTA	2	8	212711	212718	25 %	75 %	0 %	0 %	45656090
3625	NC_005823	TTTC	2	8	212729	212736	0 %	75 %	0 %	25 %	45656090
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3627	NC_005823	GGGA	2	8	212855	212862	25 %	0 %	75 %	0 %	45656090
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3752	NC_005823	A	7	7	220238	220244	100 %	0 %	0 %	0 %	45656095
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