MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 68420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005823	AAG	2	6	170790	170795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656051
3002	NC_005823	AAG	3	9	170841	170849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656051
3003	NC_005823	TCTAA	2	10	170855	170864	40 %	40 %	0 %	20 %	45656051
3004	NC_005823	GAA	3	9	170912	170920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656051
3005	NC_005823	GAAC	2	8	170986	170993	50 %	0 %	25 %	25 %	45656051
3006	NC_005823	AAT	2	6	171053	171058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656051
3007	NC_005823	TGG	2	6	171083	171088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45656051
3008	NC_005823	GTA	2	6	171120	171125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656051
3009	NC_005823	AT	3	6	171172	171177	50 %	50 %	0 %	0 %	45656051
3010	NC_005823	CGA	2	6	171187	171192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656051
3011	NC_005823	TAT	2	6	171269	171274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656051
3012	NC_005823	TGC	2	6	171306	171311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45656051
3013	NC_005823	TCAA	2	8	171334	171341	50 %	25 %	0 %	25 %	45656051
3014	NC_005823	GGT	2	6	171359	171364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45656051
3015	NC_005823	CGAA	2	8	171375	171382	50 %	0 %	25 %	25 %	45656051
3016	NC_005823	TTC	2	6	171396	171401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656051
3017	NC_005823	AGA	2	6	171448	171453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656051
3018	NC_005823	T	6	6	171484	171489	0 %	100 %	0 %	0 %	45656051
3019	NC_005823	ACT	2	6	171494	171499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656051
3020	NC_005823	ATCG	2	8	171574	171581	25 %	25 %	25 %	25 %	45656051
3021	NC_005823	GA	3	6	171588	171593	50 %	0 %	50 %	0 %	45656051
3022	NC_005823	TTA	2	6	171668	171673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656051
3023	NC_005823	GCC	2	6	171799	171804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45656051
3024	NC_005823	AGG	2	6	171870	171875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45656051
3025	NC_005823	GTA	2	6	171897	171902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656052
3026	NC_005823	GTC	2	6	171913	171918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45656052
3027	NC_005823	TTTTAT	2	12	171942	171953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45656052
3028	NC_005823	TTA	2	6	171991	171996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656052
3029	NC_005823	GAAAA	2	10	172038	172047	80 %	0 %	20 %	0 %	45656052
3030	NC_005823	TGA	2	6	172091	172096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656052
3031	NC_005823	TGT	2	6	172128	172133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656052
3032	NC_005823	TA	3	6	172161	172166	50 %	50 %	0 %	0 %	45656052
3033	NC_005823	AGC	2	6	172169	172174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656052
3034	NC_005823	AGA	2	6	172208	172213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656052
3035	NC_005823	TAC	2	6	172243	172248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656052
3036	NC_005823	T	6	6	172255	172260	0 %	100 %	0 %	0 %	45656052
3037	NC_005823	TG	3	6	172267	172272	0 %	50 %	50 %	0 %	45656052
3038	NC_005823	AAAG	2	8	172356	172363	75 %	0 %	25 %	0 %	45656052
3039	NC_005823	ATG	2	6	172365	172370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656052
3040	NC_005823	ATC	2	6	172389	172394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656052
3041	NC_005823	CCG	2	6	172900	172905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45656053
3042	NC_005823	TAA	2	6	173014	173019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656053
3043	NC_005823	TCC	2	6	173027	173032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45656053
3044	NC_005823	AT	3	6	173079	173084	50 %	50 %	0 %	0 %	45656053
3045	NC_005823	T	7	7	173565	173571	0 %	100 %	0 %	0 %	45656054
3046	NC_005823	CTT	2	6	173594	173599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656054
3047	NC_005823	A	6	6	173625	173630	100 %	0 %	0 %	0 %	45656054
3048	NC_005823	A	6	6	173659	173664	100 %	0 %	0 %	0 %	45656054
3049	NC_005823	T	7	7	173744	173750	0 %	100 %	0 %	0 %	45656054
3050	NC_005823	A	6	6	173823	173828	100 %	0 %	0 %	0 %	45656054
3051	NC_005823	TAT	2	6	173955	173960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656055
3052	NC_005823	TGAAT	2	10	174021	174030	40 %	40 %	20 %	0 %	45656055
3053	NC_005823	CTT	2	6	174049	174054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656055
3054	NC_005823	ATTCT	2	10	174113	174122	20 %	60 %	0 %	20 %	45656055
3055	NC_005823	AAAC	2	8	174145	174152	75 %	0 %	0 %	25 %	45656055
3056	NC_005823	CGG	2	6	174239	174244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45656055
3057	NC_005823	GA	3	6	174374	174379	50 %	0 %	50 %	0 %	45656055
3058	NC_005823	TTC	2	6	174507	174512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656055
3059	NC_005823	ATTCA	2	10	174545	174554	40 %	40 %	0 %	20 %	45656055
3060	NC_005823	TGGA	2	8	174683	174690	25 %	25 %	50 %	0 %	45656055
3061	NC_005823	A	6	6	174728	174733	100 %	0 %	0 %	0 %	45656055
3062	NC_005823	TAAA	2	8	174863	174870	75 %	25 %	0 %	0 %	45656055
3063	NC_005823	A	6	6	174884	174889	100 %	0 %	0 %	0 %	45656055
3064	NC_005823	GAA	2	6	174895	174900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656055
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3067	NC_005823	A	7	7	175018	175024	100 %	0 %	0 %	0 %	45656055
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3069	NC_005823	AGA	2	6	175059	175064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656055
3070	NC_005823	ATA	2	6	175145	175150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656055
3071	NC_005823	TA	3	6	175239	175244	50 %	50 %	0 %	0 %	45656055
3072	NC_005823	TTC	2	6	175265	175270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656055
3073	NC_005823	ATG	2	6	175277	175282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656055
3074	NC_005823	GA	3	6	176279	176284	50 %	0 %	50 %	0 %	45656056
3075	NC_005823	ATTTT	2	10	176309	176318	20 %	80 %	0 %	0 %	45656056
3076	NC_005823	GTT	2	6	176355	176360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656056
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3081	NC_005823	GAT	2	6	178063	178068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656057
3082	NC_005823	ATG	2	6	178180	178185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656057
3083	NC_005823	CCTT	2	8	178221	178228	0 %	50 %	0 %	50 %	45656057
3084	NC_005823	TTA	2	6	178267	178272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656057
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3088	NC_005823	GAT	2	6	178417	178422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656057
3089	NC_005823	AAG	2	6	178457	178462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656057
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3091	NC_005823	T	6	6	178513	178518	0 %	100 %	0 %	0 %	45656057
3092	NC_005823	GAATC	2	10	178555	178564	40 %	20 %	20 %	20 %	45656057
3093	NC_005823	T	7	7	178565	178571	0 %	100 %	0 %	0 %	45656057
3094	NC_005823	AAAC	2	8	179831	179838	75 %	0 %	0 %	25 %	161621780
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3096	NC_005823	TTGT	2	8	179887	179894	0 %	75 %	25 %	0 %	161621780
3097	NC_005823	GGA	2	6	179900	179905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161621780
3098	NC_005823	GA	4	8	179941	179948	50 %	0 %	50 %	0 %	161621780
3099	NC_005823	AGG	2	6	179992	179997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161621780
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3101	NC_005823	T	6	6	180136	180141	0 %	100 %	0 %	0 %	161621780
3102	NC_005823	A	8	8	180169	180176	100 %	0 %	0 %	0 %	161621780
3103	NC_005823	TTC	2	6	180189	180194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621780
3104	NC_005823	T	6	6	180238	180243	0 %	100 %	0 %	0 %	161621780
3105	NC_005823	AGA	2	6	180271	180276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161621780
3106	NC_005823	ATTCC	2	10	180315	180324	20 %	40 %	0 %	40 %	161621780
3107	NC_005823	AGG	2	6	180336	180341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161621780
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3109	NC_005823	A	6	6	180496	180501	100 %	0 %	0 %	0 %	161621780
3110	NC_005823	TCAT	2	8	180507	180514	25 %	50 %	0 %	25 %	161621780
3111	NC_005823	TGC	2	6	180609	180614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621780
3112	NC_005823	TG	3	6	180705	180710	0 %	50 %	50 %	0 %	161621780
3113	NC_005823	AAT	2	6	180715	180720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161621780
3114	NC_005823	A	7	7	180736	180742	100 %	0 %	0 %	0 %	161621780
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3118	NC_005823	TTTGGG	2	12	180828	180839	0 %	50 %	50 %	0 %	161621780
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3122	NC_005823	AGA	2	6	180985	180990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161621780
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3124	NC_005823	GAACAG	2	12	181151	181162	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	45656059
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3126	NC_005823	A	7	7	181304	181310	100 %	0 %	0 %	0 %	45656059
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3232	NC_005823	CCGAAG	2	12	187365	187376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656064
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3235	NC_005823	A	6	6	187521	187526	100 %	0 %	0 %	0 %	45656064
3236	NC_005823	TCAT	2	8	187527	187534	25 %	50 %	0 %	25 %	45656064
3237	NC_005823	TGGT	2	8	187581	187588	0 %	50 %	50 %	0 %	45656064
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3240	NC_005823	CTTT	2	8	187772	187779	0 %	75 %	0 %	25 %	45656064
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3245	NC_005823	A	6	6	187934	187939	100 %	0 %	0 %	0 %	45656064
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3249	NC_005823	ATC	2	6	188082	188087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656065
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