MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 68420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005823	TCG	2	6	29158	29163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655937
502	NC_005823	TTA	2	6	29273	29278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655938
503	NC_005823	CATA	2	8	29288	29295	50 %	25 %	0 %	25 %	45655938
504	NC_005823	TAA	2	6	29357	29362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655938
505	NC_005823	AGAT	2	8	29403	29410	50 %	25 %	25 %	0 %	45655938
506	NC_005823	A	6	6	29442	29447	100 %	0 %	0 %	0 %	45655938
507	NC_005823	A	6	6	29449	29454	100 %	0 %	0 %	0 %	45655938
508	NC_005823	ATTA	2	8	29517	29524	50 %	50 %	0 %	0 %	45655938
509	NC_005823	T	6	6	29552	29557	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
510	NC_005823	ATTC	2	8	29611	29618	25 %	50 %	0 %	25 %	45655938
511	NC_005823	AAC	2	6	29645	29650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655938
512	NC_005823	ATTT	2	8	29659	29666	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
513	NC_005823	GAAAA	2	10	29717	29726	80 %	0 %	20 %	0 %	45655938
514	NC_005823	AAAC	2	8	29734	29741	75 %	0 %	0 %	25 %	45655938
515	NC_005823	AAG	2	6	29819	29824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655938
516	NC_005823	AT	4	8	29842	29849	50 %	50 %	0 %	0 %	45655938
517	NC_005823	TGT	2	6	29972	29977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655938
518	NC_005823	ATTT	2	8	30013	30020	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
519	NC_005823	GAA	2	6	30032	30037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655938
520	NC_005823	TAT	2	6	30046	30051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655938
521	NC_005823	T	7	7	30073	30079	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
522	NC_005823	T	8	8	30090	30097	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
523	NC_005823	CTT	2	6	30098	30103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655938
524	NC_005823	AAATCC	2	12	30129	30140	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45655938
525	NC_005823	T	8	8	30158	30165	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
526	NC_005823	TTC	2	6	30177	30182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655938
527	NC_005823	CTT	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655938
528	NC_005823	TAT	2	6	30208	30213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655938
529	NC_005823	T	6	6	30213	30218	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
530	NC_005823	ATT	2	6	30224	30229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655938
531	NC_005823	TC	3	6	30230	30235	0 %	50 %	0 %	50 %	45655938
532	NC_005823	CTT	2	6	30260	30265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655938
533	NC_005823	T	7	7	30264	30270	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
534	NC_005823	T	7	7	30275	30281	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
535	NC_005823	GTT	2	6	30288	30293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655938
536	NC_005823	T	6	6	30292	30297	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
537	NC_005823	TATTT	2	10	30378	30387	20 %	80 %	0 %	0 %	45655938
538	NC_005823	T	7	7	30385	30391	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
539	NC_005823	A	6	6	30408	30413	100 %	0 %	0 %	0 %	45655938
540	NC_005823	TGG	2	6	30437	30442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655938
541	NC_005823	GTAT	2	8	30451	30458	25 %	50 %	25 %	0 %	45655938
542	NC_005823	T	6	6	30461	30466	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
543	NC_005823	T	7	7	30519	30525	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
544	NC_005823	TTTA	2	8	30533	30540	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
545	NC_005823	T	6	6	30541	30546	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
546	NC_005823	TAAA	2	8	30611	30618	75 %	25 %	0 %	0 %	45655938
547	NC_005823	AGAA	2	8	30632	30639	75 %	0 %	25 %	0 %	45655938
548	NC_005823	TTA	2	6	30668	30673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655938
549	NC_005823	TAGA	2	8	30680	30687	50 %	25 %	25 %	0 %	45655938
550	NC_005823	TCGG	2	8	30706	30713	0 %	25 %	50 %	25 %	45655938
551	NC_005823	CTT	2	6	30746	30751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655938
552	NC_005823	GAA	2	6	30835	30840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655938
553	NC_005823	AT	3	6	30873	30878	50 %	50 %	0 %	0 %	45655938
554	NC_005823	ACG	2	6	30911	30916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655938
555	NC_005823	AGC	2	6	30921	30926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655938
556	NC_005823	CGATC	2	10	30986	30995	20 %	20 %	20 %	40 %	45655938
557	NC_005823	A	6	6	31008	31013	100 %	0 %	0 %	0 %	45655938
558	NC_005823	T	6	6	31014	31019	0 %	100 %	0 %	0 %	45655938
559	NC_005823	AGA	2	6	31099	31104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655938
560	NC_005823	CAT	2	6	31195	31200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655938
561	NC_005823	AAAG	2	8	31264	31271	75 %	0 %	25 %	0 %	45655938
562	NC_005823	AATC	2	8	31316	31323	50 %	25 %	0 %	25 %	45655938
563	NC_005823	GAA	2	6	31429	31434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655938
564	NC_005823	ATTT	2	8	31456	31463	25 %	75 %	0 %	0 %	45655938
565	NC_005823	TTC	2	6	31482	31487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655938
566	NC_005823	T	6	6	32234	32239	0 %	100 %	0 %	0 %	45655939
567	NC_005823	ATA	2	6	32240	32245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655939
568	NC_005823	T	7	7	32266	32272	0 %	100 %	0 %	0 %	45655939
569	NC_005823	T	6	6	32340	32345	0 %	100 %	0 %	0 %	45655939
570	NC_005823	A	6	6	32401	32406	100 %	0 %	0 %	0 %	45655939
571	NC_005823	GAA	2	6	32475	32480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655939
572	NC_005823	CGA	2	6	32509	32514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655939
573	NC_005823	GAA	2	6	32602	32607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655939
574	NC_005823	TCT	2	6	32645	32650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655939
575	NC_005823	T	6	6	32682	32687	0 %	100 %	0 %	0 %	45655939
576	NC_005823	A	6	6	32696	32701	100 %	0 %	0 %	0 %	45655939
577	NC_005823	TTA	2	6	32716	32721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655939
578	NC_005823	GAT	2	6	32732	32737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655939
579	NC_005823	A	7	7	32775	32781	100 %	0 %	0 %	0 %	45655939
580	NC_005823	TCT	2	6	32954	32959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
581	NC_005823	ATA	2	6	32971	32976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655940
582	NC_005823	A	6	6	33001	33006	100 %	0 %	0 %	0 %	45655940
583	NC_005823	A	6	6	33040	33045	100 %	0 %	0 %	0 %	45655940
584	NC_005823	CGT	2	6	33091	33096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655940
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586	NC_005823	T	6	6	33167	33172	0 %	100 %	0 %	0 %	45655940
587	NC_005823	CAT	2	6	33174	33179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655940
588	NC_005823	TTC	2	6	33199	33204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
589	NC_005823	CTT	2	6	33312	33317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
590	NC_005823	TCAA	2	8	33382	33389	50 %	25 %	0 %	25 %	45655940
591	NC_005823	T	6	6	33467	33472	0 %	100 %	0 %	0 %	45655940
592	NC_005823	TTC	2	6	33517	33522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
593	NC_005823	ATT	2	6	33536	33541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655940
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595	NC_005823	GAA	2	6	33726	33731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655940
596	NC_005823	CTT	2	6	33753	33758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
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598	NC_005823	TAA	2	6	33785	33790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655940
599	NC_005823	A	6	6	33818	33823	100 %	0 %	0 %	0 %	45655940
600	NC_005823	TTC	2	6	33884	33889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
601	NC_005823	TGA	2	6	33890	33895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655940
602	NC_005823	CTT	2	6	33910	33915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
603	NC_005823	AT	3	6	33922	33927	50 %	50 %	0 %	0 %	45655940
604	NC_005823	TATTT	2	10	34220	34229	20 %	80 %	0 %	0 %	45655941
605	NC_005823	TTCT	2	8	34300	34307	0 %	75 %	0 %	25 %	45655941
606	NC_005823	A	6	6	34334	34339	100 %	0 %	0 %	0 %	45655941
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610	NC_005823	CGG	2	6	34483	34488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655941
611	NC_005823	GTTTG	2	10	34520	34529	0 %	60 %	40 %	0 %	45655941
612	NC_005823	AGT	2	6	34549	34554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655941
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615	NC_005823	TACTT	2	10	34633	34642	20 %	60 %	0 %	20 %	45655941
616	NC_005823	CTT	2	6	34880	34885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655941
617	NC_005823	T	6	6	34944	34949	0 %	100 %	0 %	0 %	45655942
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619	NC_005823	A	6	6	35001	35006	100 %	0 %	0 %	0 %	45655942
620	NC_005823	ATT	2	6	35116	35121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655942
621	NC_005823	TCC	2	6	35149	35154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655942
622	NC_005823	ACG	2	6	35205	35210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655942
623	NC_005823	GTA	2	6	35220	35225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655942
624	NC_005823	ATA	2	6	35282	35287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655943
625	NC_005823	GAAA	2	8	35342	35349	75 %	0 %	25 %	0 %	45655943
626	NC_005823	GCTG	2	8	35404	35411	0 %	25 %	50 %	25 %	45655943
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628	NC_005823	TTC	2	6	35499	35504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655943
629	NC_005823	TTTCT	2	10	35562	35571	0 %	80 %	0 %	20 %	45655943
630	NC_005823	TTG	2	6	35574	35579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655943
631	NC_005823	ATCG	2	8	35791	35798	25 %	25 %	25 %	25 %	45655943
632	NC_005823	ATT	2	6	35821	35826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655943
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634	NC_005823	GGAA	2	8	35866	35873	50 %	0 %	50 %	0 %	45655943
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