MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005362	AGA	2	6	172985	172990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518232
3502	NC_005362	TTTG	2	8	173000	173007	0 %	75 %	25 %	0 %	42518232
3503	NC_005362	AAC	2	6	173010	173015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518232
3504	NC_005362	A	6	6	173017	173022	100 %	0 %	0 %	0 %	42518232
3505	NC_005362	TAA	2	6	173405	173410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518233
3506	NC_005362	GAA	2	6	173460	173465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3507	NC_005362	CTTAA	2	10	173493	173502	40 %	40 %	0 %	20 %	42518233
3508	NC_005362	AGC	2	6	173504	173509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518233
3509	NC_005362	GT	3	6	173545	173550	0 %	50 %	50 %	0 %	42518233
3510	NC_005362	TGT	2	6	173585	173590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518233
3511	NC_005362	TAC	3	9	173624	173632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518233
3512	NC_005362	GCA	2	6	173646	173651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518233
3513	NC_005362	ACTT	2	8	173689	173696	25 %	50 %	0 %	25 %	42518233
3514	NC_005362	TGGC	2	8	173701	173708	0 %	25 %	50 %	25 %	42518233
3515	NC_005362	GAA	2	6	173715	173720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3516	NC_005362	AAG	2	6	173727	173732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3517	NC_005362	GAA	2	6	173790	173795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3518	NC_005362	CTT	2	6	173876	173881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518233
3519	NC_005362	ATTT	2	8	173887	173894	25 %	75 %	0 %	0 %	42518233
3520	NC_005362	ATT	2	6	173913	173918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518233
3521	NC_005362	TGA	2	6	173975	173980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518233
3522	NC_005362	GTT	2	6	173997	174002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518233
3523	NC_005362	TTA	2	6	174007	174012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518233
3524	NC_005362	GCT	2	6	174051	174056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518233
3525	NC_005362	TCT	2	6	174096	174101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518233
3526	NC_005362	AAGC	2	8	174108	174115	50 %	0 %	25 %	25 %	42518233
3527	NC_005362	AGT	2	6	174146	174151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518233
3528	NC_005362	TAC	2	6	174159	174164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518233
3529	NC_005362	ACTT	2	8	174171	174178	25 %	50 %	0 %	25 %	42518233
3530	NC_005362	AGA	2	6	174203	174208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3531	NC_005362	GAT	2	6	174221	174226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518233
3532	NC_005362	AAT	2	6	174255	174260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518233
3533	NC_005362	A	6	6	174282	174287	100 %	0 %	0 %	0 %	42518233
3534	NC_005362	GAA	2	6	174342	174347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3535	NC_005362	GGT	2	6	174384	174389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518233
3536	NC_005362	GCT	2	6	174414	174419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518233
3537	NC_005362	GGT	2	6	174600	174605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518233
3538	NC_005362	GTT	2	6	174612	174617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518233
3539	NC_005362	AAC	2	6	174648	174653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518233
3540	NC_005362	TGA	2	6	174665	174670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518233
3541	NC_005362	GAA	2	6	174683	174688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3542	NC_005362	TGG	2	6	174690	174695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518233
3543	NC_005362	ATTT	2	8	174745	174752	25 %	75 %	0 %	0 %	42518233
3544	NC_005362	GGT	2	6	174822	174827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518233
3545	NC_005362	CTG	3	9	174832	174840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518233
3546	NC_005362	TAA	2	6	174848	174853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518233
3547	NC_005362	GAAG	2	8	174872	174879	50 %	0 %	50 %	0 %	42518233
3548	NC_005362	AAG	2	6	175000	175005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3549	NC_005362	AGA	2	6	175034	175039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518233
3550	NC_005362	A	6	6	175081	175086	100 %	0 %	0 %	0 %	42518233
3551	NC_005362	A	6	6	175231	175236	100 %	0 %	0 %	0 %	42518234
3552	NC_005362	ATC	2	6	175281	175286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518234
3553	NC_005362	CAC	2	6	175309	175314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518234
3554	NC_005362	CA	3	6	175324	175329	50 %	0 %	0 %	50 %	42518234
3555	NC_005362	TGA	2	6	175343	175348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518234
3556	NC_005362	CTG	2	6	175351	175356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518234
3557	NC_005362	ATG	2	6	175384	175389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518234
3558	NC_005362	CAG	2	6	175446	175451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518234
3559	NC_005362	GAA	2	6	175456	175461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518234
3560	NC_005362	TTA	2	6	175462	175467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518234
3561	NC_005362	GTAT	2	8	175585	175592	25 %	50 %	25 %	0 %	42518234
3562	NC_005362	CCT	2	6	175595	175600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518234
3563	NC_005362	AGGT	2	8	175606	175613	25 %	25 %	50 %	0 %	42518234
3564	NC_005362	TAA	2	6	175616	175621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518234
3565	NC_005362	GAT	2	6	175664	175669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518234
3566	NC_005362	TGGG	2	8	175700	175707	0 %	25 %	75 %	0 %	42518234
3567	NC_005362	GTT	2	6	175728	175733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518234
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3570	NC_005362	TGA	2	6	175798	175803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518234
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3573	NC_005362	A	6	6	175899	175904	100 %	0 %	0 %	0 %	42518234
3574	NC_005362	TTA	2	6	175918	175923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518234
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3578	NC_005362	AT	3	6	176084	176089	50 %	50 %	0 %	0 %	42518234
3579	NC_005362	ATT	2	6	176112	176117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518234
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3588	NC_005362	TA	3	6	176587	176592	50 %	50 %	0 %	0 %	42518234
3589	NC_005362	GTT	2	6	176601	176606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518234
3590	NC_005362	TAT	2	6	176656	176661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518234
3591	NC_005362	TAA	2	6	176672	176677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518234
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3593	NC_005362	TGT	2	6	176699	176704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518234
3594	NC_005362	A	6	6	176901	176906	100 %	0 %	0 %	0 %	42518234
3595	NC_005362	ATA	2	6	176914	176919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518234
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3597	NC_005362	A	6	6	177176	177181	100 %	0 %	0 %	0 %	42518235
3598	NC_005362	GTTC	2	8	177191	177198	0 %	50 %	25 %	25 %	42518235
3599	NC_005362	TTG	2	6	177405	177410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518235
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3601	NC_005362	ATG	2	6	177545	177550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518235
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3603	NC_005362	ACTT	2	8	177570	177577	25 %	50 %	0 %	25 %	42518235
3604	NC_005362	AT	3	6	177580	177585	50 %	50 %	0 %	0 %	42518235
3605	NC_005362	TGA	2	6	177604	177609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518235
3606	NC_005362	ATG	2	6	177645	177650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518235
3607	NC_005362	TGC	2	6	177739	177744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518235
3608	NC_005362	AAG	2	6	177776	177781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518235
3609	NC_005362	CTTG	2	8	177794	177801	0 %	50 %	25 %	25 %	42518235
3610	NC_005362	GGT	2	6	177839	177844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518235
3611	NC_005362	TAAGGA	2	12	177862	177873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42518235
3612	NC_005362	ATG	2	6	177939	177944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518235
3613	NC_005362	GAT	2	6	177971	177976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518235
3614	NC_005362	TAT	2	6	177982	177987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518235
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3617	NC_005362	TAC	2	6	178076	178081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518235
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3622	NC_005362	ACC	2	6	178261	178266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518235
3623	NC_005362	TGA	2	6	178279	178284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518235
3624	NC_005362	ACTT	2	8	178309	178316	25 %	50 %	0 %	25 %	42518235
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3748	NC_005362	GTTAGA	2	12	184062	184073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518239
3749	NC_005362	GTT	2	6	184080	184085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518239
3750	NC_005362	TAC	2	6	184091	184096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518239
3751	NC_005362	TGA	2	6	184101	184106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518239
3752	NC_005362	AGT	2	6	184140	184145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518239
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3758	NC_005362	CTG	2	6	184319	184324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518239
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3761	NC_005362	TTG	2	6	184465	184470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518239
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3776	NC_005362	GCA	2	6	185294	185299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518240
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3787	NC_005362	TAA	3	9	185928	185936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518241
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3852	NC_005362	ATT	2	6	188665	188670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518242
3853	NC_005362	ATA	3	9	188699	188707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518242
3854	NC_005362	CAAC	2	8	188725	188732	50 %	0 %	0 %	50 %	42518242
3855	NC_005362	CAG	2	6	188744	188749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518242
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3859	NC_005362	AAG	2	6	189008	189013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518242
3860	NC_005362	AGCC	2	8	189032	189039	25 %	0 %	25 %	50 %	42518242
3861	NC_005362	TAA	2	6	189054	189059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518242
3862	NC_005362	CAAC	2	8	189067	189074	50 %	0 %	0 %	50 %	42518242
3863	NC_005362	GGC	2	6	189142	189147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518242
3864	NC_005362	AGTAA	2	10	189181	189190	60 %	20 %	20 %	0 %	42518242
3865	NC_005362	CAA	2	6	189203	189208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518242
3866	NC_005362	TACCG	2	10	189232	189241	20 %	20 %	20 %	40 %	42518242
3867	NC_005362	TAG	2	6	189296	189301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518242
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3993	NC_005362	T	6	6	195000	195005	0 %	100 %	0 %	0 %	42518248
3994	NC_005362	TTA	2	6	195045	195050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518248
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3996	NC_005362	CTT	2	6	195161	195166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518248
3997	NC_005362	TCT	2	6	195196	195201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518248
3998	NC_005362	GTTA	2	8	195224	195231	25 %	50 %	25 %	0 %	42518248
3999	NC_005362	TTCAT	2	10	195276	195285	20 %	60 %	0 %	20 %	42518248
4000	NC_005362	TAG	2	6	195292	195297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518248

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