MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005362	A	6	6	149986	149991	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3002	NC_005362	ACA	2	6	150043	150048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518215
3003	NC_005362	GTT	2	6	150051	150056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518215
3004	NC_005362	A	6	6	150072	150077	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3005	NC_005362	ACC	2	6	150095	150100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518215
3006	NC_005362	GCT	2	6	150132	150137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3007	NC_005362	TGG	2	6	150179	150184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518215
3008	NC_005362	TAA	2	6	150194	150199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518215
3009	NC_005362	AAG	2	6	150234	150239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518215
3010	NC_005362	CTT	2	6	150301	150306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518215
3011	NC_005362	CAG	2	6	150307	150312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3012	NC_005362	AGTT	2	8	150373	150380	25 %	50 %	25 %	0 %	42518215
3013	NC_005362	GCA	2	6	150435	150440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518215
3014	NC_005362	A	6	6	150471	150476	100 %	0 %	0 %	0 %	42518215
3015	NC_005362	AAG	2	6	150627	150632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518215
3016	NC_005362	ATT	2	6	150714	150719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518215
3017	NC_005362	TAAAT	2	10	150837	150846	60 %	40 %	0 %	0 %	42518216
3018	NC_005362	CTA	2	6	150852	150857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518216
3019	NC_005362	GAT	2	6	150865	150870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3020	NC_005362	A	6	6	150877	150882	100 %	0 %	0 %	0 %	42518216
3021	NC_005362	TAG	4	12	150957	150968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3022	NC_005362	TACTT	2	10	150991	151000	20 %	60 %	0 %	20 %	42518216
3023	NC_005362	TAT	2	6	151039	151044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518216
3024	NC_005362	CTA	2	6	151183	151188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518216
3025	NC_005362	AAC	2	6	151201	151206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518216
3026	NC_005362	ACA	2	6	151312	151317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518216
3027	NC_005362	ATT	2	6	151361	151366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518216
3028	NC_005362	TGA	2	6	151372	151377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3029	NC_005362	GAA	2	6	151442	151447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518216
3030	NC_005362	ATG	2	6	151542	151547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518216
3031	NC_005362	TGG	2	6	151594	151599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518216
3032	NC_005362	GAA	2	6	151616	151621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518216
3033	NC_005362	TCTT	2	8	151717	151724	0 %	75 %	0 %	25 %	42518217
3034	NC_005362	TAA	2	6	151763	151768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518217
3035	NC_005362	AAT	2	6	151967	151972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518217
3036	NC_005362	TTG	2	6	152020	152025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518217
3037	NC_005362	GTT	2	6	152088	152093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518217
3038	NC_005362	ATT	2	6	152096	152101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3039	NC_005362	ATT	2	6	152175	152180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3040	NC_005362	TACT	3	12	152203	152214	25 %	50 %	0 %	25 %	42518217
3041	NC_005362	AT	3	6	152273	152278	50 %	50 %	0 %	0 %	42518217
3042	NC_005362	GGT	2	6	152286	152291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518217
3043	NC_005362	ACA	2	6	152306	152311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518217
3044	NC_005362	TTA	2	6	152359	152364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3045	NC_005362	TTA	2	6	152377	152382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518217
3046	NC_005362	CTA	2	6	152395	152400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518217
3047	NC_005362	TGA	2	6	152416	152421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518217
3048	NC_005362	AAT	2	6	152422	152427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518217
3049	NC_005362	TAC	2	6	152431	152436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518218
3050	NC_005362	A	6	6	152441	152446	100 %	0 %	0 %	0 %	42518218
3051	NC_005362	CCT	2	6	152450	152455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518218
3052	NC_005362	AAG	3	9	152471	152479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518218
3053	NC_005362	ATT	2	6	152519	152524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3054	NC_005362	TTG	2	6	152589	152594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518218
3055	NC_005362	TA	3	6	152625	152630	50 %	50 %	0 %	0 %	42518218
3056	NC_005362	GTG	2	6	152637	152642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518218
3057	NC_005362	ATT	2	6	152708	152713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3058	NC_005362	TTA	2	6	152835	152840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3059	NC_005362	TGCT	2	8	152901	152908	0 %	50 %	25 %	25 %	42518218
3060	NC_005362	GAA	2	6	152939	152944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518218
3061	NC_005362	TGG	2	6	152971	152976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518218
3062	NC_005362	ATT	2	6	152990	152995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3063	NC_005362	CTA	2	6	153003	153008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518218
3064	NC_005362	TGG	2	6	153100	153105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518218
3065	NC_005362	TAT	2	6	153175	153180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518218
3066	NC_005362	GTT	3	9	153188	153196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518218
3067	NC_005362	CTGG	2	8	153210	153217	0 %	25 %	50 %	25 %	42518218
3068	NC_005362	GAAA	2	8	153222	153229	75 %	0 %	25 %	0 %	42518218
3069	NC_005362	TAAT	2	8	153236	153243	50 %	50 %	0 %	0 %	42518218
3070	NC_005362	CAA	2	6	153460	153465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518219
3071	NC_005362	GAA	2	6	153529	153534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518219
3072	NC_005362	TAC	2	6	153559	153564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518219
3073	NC_005362	TAC	2	6	153593	153598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518219
3074	NC_005362	TAAC	2	8	153638	153645	50 %	25 %	0 %	25 %	42518219
3075	NC_005362	TA	3	6	153752	153757	50 %	50 %	0 %	0 %	42518219
3076	NC_005362	AAT	2	6	153865	153870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518219
3077	NC_005362	TGAT	2	8	153954	153961	25 %	50 %	25 %	0 %	42518220
3078	NC_005362	GAT	2	6	153985	153990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3079	NC_005362	GAAA	2	8	153993	154000	75 %	0 %	25 %	0 %	42518220
3080	NC_005362	GAA	2	6	154085	154090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518220
3081	NC_005362	TAA	2	6	154222	154227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518220
3082	NC_005362	CGT	2	6	154238	154243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518220
3083	NC_005362	TAG	2	6	154272	154277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
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3085	NC_005362	AC	3	6	154340	154345	50 %	0 %	0 %	50 %	42518220
3086	NC_005362	TGGA	3	12	154460	154471	25 %	25 %	50 %	0 %	42518220
3087	NC_005362	A	7	7	154532	154538	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3088	NC_005362	TCA	2	6	154551	154556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518220
3089	NC_005362	TGA	2	6	154585	154590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3090	NC_005362	GTAT	2	8	154650	154657	25 %	50 %	25 %	0 %	42518220
3091	NC_005362	GAT	2	6	154715	154720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518220
3092	NC_005362	A	6	6	154781	154786	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3093	NC_005362	ATT	2	6	154871	154876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518220
3094	NC_005362	TCAA	2	8	154965	154972	50 %	25 %	0 %	25 %	42518220
3095	NC_005362	TCC	2	6	155005	155010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518220
3096	NC_005362	A	6	6	155050	155055	100 %	0 %	0 %	0 %	42518220
3097	NC_005362	AT	4	8	155125	155132	50 %	50 %	0 %	0 %	42518220
3098	NC_005362	T	6	6	155132	155137	0 %	100 %	0 %	0 %	42518220
3099	NC_005362	TAC	2	6	155173	155178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518220
3100	NC_005362	CAATA	2	10	155180	155189	60 %	20 %	0 %	20 %	42518220
3101	NC_005362	AGC	2	6	155224	155229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518220
3102	NC_005362	AT	3	6	155233	155238	50 %	50 %	0 %	0 %	42518220
3103	NC_005362	TTA	2	6	155264	155269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518220
3104	NC_005362	GCT	2	6	155288	155293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518220
3105	NC_005362	TG	3	6	155382	155387	0 %	50 %	50 %	0 %	42518221
3106	NC_005362	T	6	6	155399	155404	0 %	100 %	0 %	0 %	42518221
3107	NC_005362	ATG	2	6	155444	155449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3108	NC_005362	ATT	2	6	155531	155536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518221
3109	NC_005362	GTG	2	6	155544	155549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518221
3110	NC_005362	ATT	2	6	155588	155593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518221
3111	NC_005362	AAGAA	2	10	155626	155635	80 %	0 %	20 %	0 %	42518221
3112	NC_005362	TAC	2	6	155659	155664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518221
3113	NC_005362	GAA	2	6	155699	155704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
3114	NC_005362	ATGG	2	8	155711	155718	25 %	25 %	50 %	0 %	42518221
3115	NC_005362	GAA	2	6	155725	155730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
3116	NC_005362	CTT	2	6	155797	155802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518221
3117	NC_005362	TAC	2	6	155819	155824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518221
3118	NC_005362	TTG	2	6	155847	155852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518221
3119	NC_005362	CTT	2	6	155869	155874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518221
3120	NC_005362	CTTT	2	8	155958	155965	0 %	75 %	0 %	25 %	42518221
3121	NC_005362	CAG	2	6	155985	155990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518221
3122	NC_005362	TCA	2	6	156028	156033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518221
3123	NC_005362	GAA	2	6	156074	156079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
3124	NC_005362	TTC	2	6	156175	156180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518221
3125	NC_005362	TCT	2	6	156213	156218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518221
3126	NC_005362	TGA	2	6	156229	156234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3127	NC_005362	TAT	2	6	156382	156387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518221
3128	NC_005362	TGA	2	6	156454	156459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3129	NC_005362	ATT	2	6	156460	156465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518221
3130	NC_005362	ATG	2	6	156501	156506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3131	NC_005362	CTG	2	6	156522	156527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518221
3132	NC_005362	AAG	2	6	156578	156583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
3133	NC_005362	AAG	2	6	156762	156767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
3134	NC_005362	TGA	2	6	156790	156795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3135	NC_005362	AT	3	6	156811	156816	50 %	50 %	0 %	0 %	42518221
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3138	NC_005362	AAG	2	6	156911	156916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
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3141	NC_005362	AGA	2	6	157143	157148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
3142	NC_005362	TGA	2	6	157162	157167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
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3146	NC_005362	ATG	2	6	157254	157259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518221
3147	NC_005362	AAG	2	6	157268	157273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518221
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3149	NC_005362	GCTC	2	8	157420	157427	0 %	25 %	25 %	50 %	42518222
3150	NC_005362	GCT	2	6	157465	157470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518222
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3154	NC_005362	GAA	2	6	157573	157578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518222
3155	NC_005362	ATC	2	6	157586	157591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518222
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3163	NC_005362	TAG	2	6	157928	157933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518222
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3185	NC_005362	ACT	2	6	159219	159224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518223
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3204	NC_005362	CTA	2	6	159997	160002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518223
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3206	NC_005362	GTTA	2	8	160023	160030	25 %	50 %	25 %	0 %	42518223
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3223	NC_005362	AAT	2	6	161129	161134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518224
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3229	NC_005362	ACA	3	9	161248	161256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518224
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3232	NC_005362	TTG	2	6	161343	161348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518224
3233	NC_005362	GTT	2	6	161406	161411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518224
3234	NC_005362	AGC	2	6	161419	161424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518224
3235	NC_005362	ATT	2	6	161474	161479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518224
3236	NC_005362	TTA	2	6	161516	161521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518224
3237	NC_005362	T	6	6	161533	161538	0 %	100 %	0 %	0 %	42518224
3238	NC_005362	ATTA	2	8	161560	161567	50 %	50 %	0 %	0 %	42518224
3239	NC_005362	TTGGTC	2	12	161605	161616	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	42518224
3240	NC_005362	AAGA	2	8	161657	161664	75 %	0 %	25 %	0 %	42518224
3241	NC_005362	GAT	2	6	161708	161713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518224
3242	NC_005362	ATT	2	6	161759	161764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518224
3243	NC_005362	ATCA	2	8	161776	161783	50 %	25 %	0 %	25 %	42518224
3244	NC_005362	TAA	2	6	161788	161793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518224
3245	NC_005362	GTT	2	6	161795	161800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518224
3246	NC_005362	AAGAA	2	10	161883	161892	80 %	0 %	20 %	0 %	42518225
3247	NC_005362	TAG	2	6	161901	161906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518225
3248	NC_005362	GTT	2	6	161947	161952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518225
3249	NC_005362	CAA	2	6	162009	162014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518225
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3251	NC_005362	AGTT	2	8	162120	162127	25 %	50 %	25 %	0 %	42518225
3252	NC_005362	GCT	2	6	162164	162169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518225
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3354	NC_005362	CAA	2	6	167069	167074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518229
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3356	NC_005362	AGC	2	6	167122	167127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518229
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3361	NC_005362	TGA	2	6	167434	167439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518229
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3365	NC_005362	GAA	2	6	167492	167497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518229
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3367	NC_005362	AT	3	6	167563	167568	50 %	50 %	0 %	0 %	42518229
3368	NC_005362	GCT	2	6	167588	167593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518229
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3370	NC_005362	ATG	2	6	167753	167758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518229
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3372	NC_005362	CAAT	2	8	167796	167803	50 %	25 %	0 %	25 %	42518229
3373	NC_005362	AAG	2	6	167862	167867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518229
3374	NC_005362	GCA	2	6	167921	167926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518229
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3399	NC_005362	AAG	2	6	168615	168620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518229
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3401	NC_005362	TGT	2	6	168673	168678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518229
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3445	NC_005362	ATT	2	6	170536	170541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518231
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3450	NC_005362	A	6	6	170741	170746	100 %	0 %	0 %	0 %	42518231
3451	NC_005362	TTA	2	6	170747	170752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518231
3452	NC_005362	CTAG	2	8	170755	170762	25 %	25 %	25 %	25 %	42518231
3453	NC_005362	TGAT	2	8	170768	170775	25 %	50 %	25 %	0 %	42518231
3454	NC_005362	TC	3	6	170798	170803	0 %	50 %	0 %	50 %	42518231
3455	NC_005362	TCA	2	6	170873	170878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518231
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3463	NC_005362	A	6	6	171420	171425	100 %	0 %	0 %	0 %	42518232
3464	NC_005362	TCT	2	6	171426	171431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518232
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3469	NC_005362	CAGT	2	8	171581	171588	25 %	25 %	25 %	25 %	42518232
3470	NC_005362	GTA	2	6	171622	171627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518232
3471	NC_005362	CGA	2	6	171628	171633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518232
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3478	NC_005362	T	7	7	171853	171859	0 %	100 %	0 %	0 %	42518232
3479	NC_005362	ATG	2	6	171939	171944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518232
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3482	NC_005362	TGG	2	6	172022	172027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518232
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3490	NC_005362	TGC	2	6	172247	172252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518232
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3492	NC_005362	TAT	2	6	172396	172401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518232
3493	NC_005362	TTCA	2	8	172415	172422	25 %	50 %	0 %	25 %	42518232
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3496	NC_005362	GAA	3	9	172512	172520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518232
3497	NC_005362	A	7	7	172546	172552	100 %	0 %	0 %	0 %	42518232
3498	NC_005362	CTA	2	6	172681	172686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518232
3499	NC_005362	AAG	2	6	172899	172904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518232
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